MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. CT18 plasmid pHCM1

Total Repeats: 4181

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_003384	T	7	7	133496	133502	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2502	NC_003384	AG	3	6	133507	133512	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2503	NC_003384	TC	3	6	133532	133537	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2504	NC_003384	AAC	2	6	133613	133618	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	18466575
2505	NC_003384	AGT	2	6	133624	133629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18466575
2506	NC_003384	GAA	2	6	133819	133824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18466575
2507	NC_003384	GCGG	2	8	133857	133864	0 %	0 %	75 %	25 %	18466575
2508	NC_003384	TC	3	6	133876	133881	0 %	50 %	0 %	50 %	18466575
2509	NC_003384	CGT	2	6	133901	133906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18466575
2510	NC_003384	GCA	2	6	133949	133954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18466575
2511	NC_003384	TTG	2	6	133973	133978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18466575
2512	NC_003384	A	7	7	134037	134043	100 %	0 %	0 %	0 %	18466576
2513	NC_003384	TAC	2	6	134048	134053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18466576
2514	NC_003384	ATG	2	6	134077	134082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18466576
2515	NC_003384	TCT	2	6	134111	134116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18466576
2516	NC_003384	GCA	2	6	134158	134163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18466576
2517	NC_003384	ATTT	2	8	134344	134351	25 %	75 %	0 %	0 %	18466576
2518	NC_003384	ATG	2	6	134382	134387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18466577
2519	NC_003384	TGA	2	6	134404	134409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18466577
2520	NC_003384	GAA	2	6	134483	134488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18466577
2521	NC_003384	G	7	7	134615	134621	0 %	0 %	100 %	0 %	18466577
2522	NC_003384	GGC	2	6	134648	134653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	18466577
2523	NC_003384	CG	3	6	134691	134696	0 %	0 %	50 %	50 %	18466577
2524	NC_003384	GAA	2	6	134853	134858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18466577
2525	NC_003384	CTG	2	6	134919	134924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18466577
2526	NC_003384	AGC	3	9	134926	134934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18466577
2527	NC_003384	AGA	2	6	134954	134959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18466577
2528	NC_003384	AGA	2	6	134975	134980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18466577
2529	NC_003384	CAG	2	6	135039	135044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18466577
2530	NC_003384	TGAG	2	8	135070	135077	25 %	25 %	50 %	0 %	18466577
2531	NC_003384	GCA	2	6	135098	135103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18466577
2532	NC_003384	AGC	2	6	135115	135120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18466577
2533	NC_003384	ATG	2	6	135124	135129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18466577
2534	NC_003384	GCA	2	6	135140	135145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18466577
2535	NC_003384	GTCAGT	2	12	135210	135221	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	18466577
2536	NC_003384	TGA	2	6	135377	135382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18466577
2537	NC_003384	A	6	6	135396	135401	100 %	0 %	0 %	0 %	18466577
2538	NC_003384	CAGA	2	8	135414	135421	50 %	0 %	25 %	25 %	18466577
2539	NC_003384	GAT	2	6	135446	135451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18466577
2540	NC_003384	AGC	2	6	135514	135519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18466577
2541	NC_003384	GAC	2	6	135593	135598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18466577
2542	NC_003384	TGT	2	6	135766	135771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18466578
2543	NC_003384	GCC	2	6	135805	135810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	18466578
2544	NC_003384	CTCA	2	8	135834	135841	25 %	25 %	0 %	50 %	18466578
2545	NC_003384	TCT	2	6	135942	135947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18466579
2546	NC_003384	CCA	2	6	135964	135969	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	18466579
2547	NC_003384	CTT	2	6	136003	136008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18466579
2548	NC_003384	TAAA	2	8	136090	136097	75 %	25 %	0 %	0 %	18466579
2549	NC_003384	TCGC	2	8	136112	136119	0 %	25 %	25 %	50 %	18466579
2550	NC_003384	AGG	2	6	136194	136199	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	18466579
2551	NC_003384	TCAC	2	8	136220	136227	25 %	25 %	0 %	50 %	18466579
2552	NC_003384	TGA	2	6	136244	136249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18466579
2553	NC_003384	ACA	2	6	136304	136309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	18466579
2554	NC_003384	GGC	2	6	136330	136335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	18466579
2555	NC_003384	CGC	2	6	136352	136357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	18466579
2556	NC_003384	AAG	2	6	136388	136393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18466579
2557	NC_003384	CCG	2	6	136406	136411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	18466579
2558	NC_003384	AGC	3	9	136481	136489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18466579
2559	NC_003384	CCG	2	6	136509	136514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	18466579
2560	NC_003384	CAG	2	6	136519	136524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18466579
2561	NC_003384	CAA	2	6	136708	136713	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	18466579
2562	NC_003384	GGAA	2	8	136777	136784	50 %	0 %	50 %	0 %	18466579
2563	NC_003384	CGG	2	6	136798	136803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	18466579
2564	NC_003384	TTG	2	6	136853	136858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18466579
2565	NC_003384	ACA	2	6	136865	136870	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	18466579
2566	NC_003384	AC	4	8	136920	136927	50 %	0 %	0 %	50 %	18466579
2567	NC_003384	GTGTG	2	10	137063	137072	0 %	40 %	60 %	0 %	18466579
2568	NC_003384	TTC	2	6	137075	137080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18466579
2569	NC_003384	CCT	2	6	137198	137203	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2570	NC_003384	TAGCC	2	10	137222	137231	20 %	20 %	20 %	40 %	18466580
2571	NC_003384	CTT	2	6	137241	137246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18466580
2572	NC_003384	A	7	7	137280	137286	100 %	0 %	0 %	0 %	18466580
2573	NC_003384	ACG	2	6	137306	137311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18466580
2574	NC_003384	CT	3	6	137337	137342	0 %	50 %	0 %	50 %	18466580
2575	NC_003384	TCT	2	6	137360	137365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18466580
2576	NC_003384	TCA	2	6	137382	137387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18466580
2577	NC_003384	CCT	2	6	137391	137396	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2578	NC_003384	TC	3	6	137425	137430	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2579	NC_003384	T	7	7	137441	137447	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2580	NC_003384	CA	3	6	137502	137507	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2581	NC_003384	GAA	2	6	137508	137513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2582	NC_003384	ATG	2	6	137519	137524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18466581
2583	NC_003384	CGA	2	6	137609	137614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18466581
2584	NC_003384	AAC	2	6	137853	137858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	18466581
2585	NC_003384	CAG	2	6	137988	137993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18466581
2586	NC_003384	CGT	2	6	138010	138015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18466581
2587	NC_003384	CAT	2	6	138053	138058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18466581
2588	NC_003384	CCAA	2	8	138082	138089	50 %	0 %	0 %	50 %	18466581
2589	NC_003384	ATT	2	6	138133	138138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18466581
2590	NC_003384	TCA	2	6	138190	138195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18466581
2591	NC_003384	ATG	3	9	138205	138213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18466581
2592	NC_003384	T	6	6	138247	138252	0 %	100 %	0 %	0 %	18466581
2593	NC_003384	GAT	2	6	138291	138296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18466581
2594	NC_003384	A	8	8	138309	138316	100 %	0 %	0 %	0 %	18466581
2595	NC_003384	CAT	2	6	138422	138427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18466581
2596	NC_003384	GATG	2	8	138435	138442	25 %	25 %	50 %	0 %	18466581
2597	NC_003384	CGG	2	6	138565	138570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	18466581
2598	NC_003384	CTG	2	6	138689	138694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18466581
2599	NC_003384	TTC	2	6	138729	138734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18466581
2600	NC_003384	CATT	2	8	138748	138755	25 %	50 %	0 %	25 %	18466581
2601	NC_003384	GCA	2	6	138811	138816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18466581
2602	NC_003384	TCA	2	6	138895	138900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18466581
2603	NC_003384	T	6	6	139005	139010	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2604	NC_003384	TAC	2	6	139137	139142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2605	NC_003384	CGG	2	6	139217	139222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	18466582
2606	NC_003384	TGC	2	6	139401	139406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18466582
2607	NC_003384	GA	3	6	139762	139767	50 %	0 %	50 %	0 %	18466583
2608	NC_003384	TAC	2	6	139799	139804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18466583
2609	NC_003384	GGA	2	6	139835	139840	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	18466583
2610	NC_003384	GGC	2	6	139842	139847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	18466583
2611	NC_003384	TGT	2	6	139871	139876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18466583
2612	NC_003384	ATT	2	6	139890	139895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18466583
2613	NC_003384	CAGC	2	8	140022	140029	25 %	0 %	25 %	50 %	18466583
2614	NC_003384	ATGA	2	8	140079	140086	50 %	25 %	25 %	0 %	18466583
2615	NC_003384	TAA	2	6	140102	140107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18466583
2616	NC_003384	TCAG	2	8	140150	140157	25 %	25 %	25 %	25 %	18466583
2617	NC_003384	GTG	2	6	140179	140184	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	18466583
2618	NC_003384	TGA	2	6	140189	140194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18466583
2619	NC_003384	A	6	6	140264	140269	100 %	0 %	0 %	0 %	18466583
2620	NC_003384	GAAA	2	8	140282	140289	75 %	0 %	25 %	0 %	18466583
2621	NC_003384	TAT	2	6	140316	140321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18466583
2622	NC_003384	CAG	2	6	140340	140345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18466583
2623	NC_003384	GCT	2	6	140346	140351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18466583
2624	NC_003384	ATA	2	6	140482	140487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18466583
2625	NC_003384	ATC	2	6	140529	140534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18466583
2626	NC_003384	GCAT	2	8	140538	140545	25 %	25 %	25 %	25 %	18466583
2627	NC_003384	TTC	2	6	140566	140571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18466583
2628	NC_003384	A	6	6	140617	140622	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2629	NC_003384	CAT	2	6	140640	140645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2630	NC_003384	A	6	6	140711	140716	100 %	0 %	0 %	0 %	18466584
2631	NC_003384	TG	3	6	140952	140957	0 %	50 %	50 %	0 %	18466584
2632	NC_003384	TAA	2	6	140988	140993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18466584
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2637	NC_003384	TAA	2	6	141150	141155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18466584
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2641	NC_003384	A	6	6	141264	141269	100 %	0 %	0 %	0 %	18466584
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2643	NC_003384	A	6	6	141298	141303	100 %	0 %	0 %	0 %	18466584
2644	NC_003384	AAGCC	2	10	141380	141389	40 %	0 %	20 %	40 %	18466584
2645	NC_003384	A	6	6	141400	141405	100 %	0 %	0 %	0 %	18466584
2646	NC_003384	CTGT	2	8	141579	141586	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2647	NC_003384	TCG	2	6	141599	141604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2650	NC_003384	CAA	2	6	141750	141755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2651	NC_003384	A	7	7	141754	141760	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2652	NC_003384	CAA	2	6	141773	141778	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2653	NC_003384	TGT	2	6	141809	141814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18466586
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2655	NC_003384	ATGGC	2	10	141876	141885	20 %	20 %	40 %	20 %	18466586
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2658	NC_003384	TATT	2	8	142068	142075	25 %	75 %	0 %	0 %	18466586
2659	NC_003384	TCT	2	6	142079	142084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18466586
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2663	NC_003384	CTG	2	6	142191	142196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2664	NC_003384	TGG	2	6	142306	142311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2665	NC_003384	T	7	7	142339	142345	0 %	100 %	0 %	0 %	18466587
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2680	NC_003384	TGA	2	6	142979	142984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2681	NC_003384	TTAAG	2	10	143012	143021	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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2683	NC_003384	ACA	2	6	143077	143082	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2705	NC_003384	ATA	2	6	144654	144659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18466589
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2743	NC_003384	CTT	2	6	146798	146803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18466589
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2749	NC_003384	AAC	2	6	147202	147207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	18466589
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2751	NC_003384	GAT	2	6	147314	147319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18466589
2752	NC_003384	GCT	3	9	147331	147339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18466589
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2757	NC_003384	GAT	3	9	147608	147616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18466589
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2774	NC_003384	ATG	2	6	148617	148622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2872	NC_003384	TGA	2	6	153413	153418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18466595
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