MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. LT2 plasmid pSLT

Total Repeats: 1358

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003277	CAG	2	6	121	126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233404
2	NC_003277	CCA	2	6	221	226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17233404
3	NC_003277	AGT	2	6	262	267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233404
4	NC_003277	GCG	2	6	268	273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17233404
5	NC_003277	GCC	3	9	274	282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17233404
6	NC_003277	TGA	2	6	383	388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_003277	ATG	2	6	391	396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_003277	AGG	2	6	404	409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_003277	GAA	2	6	417	422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_003277	GCG	2	6	440	445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_003277	CCA	2	6	512	517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_003277	CCG	2	6	552	557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_003277	CGT	2	6	562	567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_003277	TAA	2	6	626	631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_003277	ACT	2	6	636	641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_003277	CTG	2	6	722	727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233405
17	NC_003277	AGC	2	6	791	796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233405
18	NC_003277	ATA	2	6	827	832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17233405
19	NC_003277	TTA	2	6	881	886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17233405
20	NC_003277	CAG	2	6	963	968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233405
21	NC_003277	CTG	2	6	982	987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233405
22	NC_003277	TTC	2	6	1031	1036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17233405
23	NC_003277	ATT	2	6	1088	1093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17233405
24	NC_003277	GCA	2	6	1099	1104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233405
25	NC_003277	GTC	2	6	1131	1136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233405
26	NC_003277	GTA	2	6	1307	1312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_003277	GAG	2	6	1343	1348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	17233406
28	NC_003277	GAA	2	6	1432	1437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17233406
29	NC_003277	GAC	2	6	1462	1467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233406
30	NC_003277	GCA	2	6	1516	1521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233406
31	NC_003277	ACT	2	6	1541	1546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233406
32	NC_003277	CTA	2	6	1565	1570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233406
33	NC_003277	AAG	2	6	1604	1609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_003277	TGA	2	6	1716	1721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_003277	TCT	2	6	1761	1766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17233407
36	NC_003277	CCA	2	6	1817	1822	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17233407
37	NC_003277	GCC	2	6	2114	2119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	228960845
38	NC_003277	TGC	2	6	2122	2127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	228960845
39	NC_003277	CGT	2	6	2130	2135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	228960845
40	NC_003277	GCT	2	6	2147	2152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	228960845
41	NC_003277	GCC	2	6	2424	2429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	228960845
42	NC_003277	CGC	2	6	2430	2435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	228960845
43	NC_003277	CAG	2	6	2457	2462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	228960845
44	NC_003277	GCG	2	6	2591	2596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	228960845
45	NC_003277	CAG	2	6	2640	2645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	228960845
46	NC_003277	CGG	2	6	2678	2683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	228960845
47	NC_003277	GCG	2	6	2711	2716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	228960845
48	NC_003277	ATG	3	9	2730	2738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	228960845
49	NC_003277	CCA	2	6	2791	2796	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_003277	GGA	2	6	2821	2826	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_003277	GCC	2	6	2849	2854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_003277	TTC	2	6	2877	2882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_003277	CTG	2	6	2903	2908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_003277	CTT	2	6	3076	3081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_003277	TCA	2	6	3123	3128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_003277	ACA	2	6	3198	3203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_003277	ACA	2	6	3252	3257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_003277	CAC	2	6	3312	3317	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_003277	GCC	3	9	3326	3334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_003277	TAA	2	6	3366	3371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_003277	ATG	2	6	3375	3380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_003277	CAG	2	6	3458	3463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_003277	CAG	2	6	3531	3536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_003277	CGG	2	6	3714	3719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_003277	GCG	2	6	3878	3883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_003277	ACG	2	6	3952	3957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_003277	ACT	2	6	4066	4071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233473
68	NC_003277	CCT	2	6	4107	4112	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	17233473
69	NC_003277	CAG	2	6	4153	4158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233473
70	NC_003277	CAC	2	6	4570	4575	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17233473
71	NC_003277	ATG	2	6	4576	4581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233473
72	NC_003277	ACC	2	6	4584	4589	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17233473
73	NC_003277	TCC	2	6	4684	4689	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	17233473
74	NC_003277	ATT	2	6	4724	4729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17233473
75	NC_003277	AGT	3	9	4821	4829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_003277	GCA	2	6	4833	4838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_003277	CAC	2	6	4879	4884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_003277	AAT	2	6	4892	4897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_003277	TCA	2	6	4932	4937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_003277	CAT	2	6	5288	5293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233474
81	NC_003277	ACG	2	6	5357	5362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233474
82	NC_003277	GCG	2	6	5375	5380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17233474
83	NC_003277	CAG	3	9	5517	5525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233474
84	NC_003277	CGC	2	6	5626	5631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_003277	TCC	2	6	5785	5790	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	17233475
86	NC_003277	GTT	2	6	5852	5857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17233475
87	NC_003277	CCA	2	6	5992	5997	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17233475
88	NC_003277	CGG	2	6	6089	6094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17233475
89	NC_003277	TGC	2	6	6106	6111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233475
90	NC_003277	CCG	2	6	6171	6176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17233475
91	NC_003277	GCA	2	6	6226	6231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233475
92	NC_003277	CCA	2	6	6253	6258	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17233475
93	NC_003277	GAG	2	6	6261	6266	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	17233475
94	NC_003277	CTG	2	6	6294	6299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233475
95	NC_003277	GCC	2	6	6326	6331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17233475
96	NC_003277	CAG	2	6	6446	6451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233475
97	NC_003277	TGC	2	6	6452	6457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233475
98	NC_003277	GTG	3	9	6486	6494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17233475
99	NC_003277	CAT	2	6	6533	6538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233475
100	NC_003277	CAG	3	9	6607	6615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_003277	GGA	2	6	6636	6641	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_003277	ATC	2	6	6667	6672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233476
103	NC_003277	CAG	2	6	6695	6700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233476
104	NC_003277	ACC	2	6	6708	6713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17233476
105	NC_003277	GCA	2	6	6714	6719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233476
106	NC_003277	GGC	2	6	6758	6763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17233476
107	NC_003277	TTG	2	6	6765	6770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17233476
108	NC_003277	CCA	2	6	6847	6852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17233476
109	NC_003277	CGG	2	6	6862	6867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17233476
110	NC_003277	CGG	2	6	6927	6932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17233476
111	NC_003277	CCA	2	6	6961	6966	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17233476
112	NC_003277	GAA	2	6	6977	6982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17233476
113	NC_003277	TCA	2	6	7009	7014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233476
114	NC_003277	CAG	2	6	7061	7066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233476
115	NC_003277	CCA	2	6	7183	7188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17233476
116	NC_003277	ACC	2	6	7203	7208	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17233476
117	NC_003277	ATA	2	6	7276	7281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17233476
118	NC_003277	CAG	3	9	7385	7393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_003277	TCA	2	6	7405	7410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_003277	GGC	2	6	7425	7430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_003277	TAA	2	6	7523	7528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_003277	CAT	2	6	7543	7548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_003277	CTT	2	6	7601	7606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17233477
124	NC_003277	CAT	2	6	7682	7687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233477
125	NC_003277	GCA	2	6	7759	7764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233477
126	NC_003277	GCA	3	9	7787	7795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233477
127	NC_003277	CCG	2	6	7828	7833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17233477
128	NC_003277	GCA	2	6	8016	8021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233478
129	NC_003277	AAT	2	6	8087	8092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17233478
130	NC_003277	TTA	2	6	8427	8432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_003277	TTA	2	6	8565	8570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17233479
132	NC_003277	AGT	2	6	8668	8673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233479
133	NC_003277	CCT	2	6	8846	8851	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	17233479
134	NC_003277	GAA	2	6	8906	8911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17233479
135	NC_003277	TCA	2	6	8981	8986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233479
136	NC_003277	CAA	2	6	9075	9080	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17233479
137	NC_003277	GCT	2	6	9266	9271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233479
138	NC_003277	TGA	2	6	9372	9377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233479
139	NC_003277	ATG	3	9	9389	9397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233479
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141	NC_003277	GCA	2	6	9564	9569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_003277	GAT	2	6	9607	9612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_003277	TCA	2	6	9651	9656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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267	NC_003277	CTG	2	6	18004	18009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
268	NC_003277	AAT	2	6	18038	18043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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