MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. LT2 plasmid pSLT

Total Repeats: 2049

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_003277	AGG	2	6	91174	91179	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	17233470
2002	NC_003277	C	6	6	91228	91233	0 %	0 %	0 %	100 %	17233470
2003	NC_003277	AGC	2	6	91238	91243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233470
2004	NC_003277	CGG	2	6	91363	91368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17233470
2005	NC_003277	GTG	2	6	91413	91418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17233470
2006	NC_003277	AGC	2	6	91588	91593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233470
2007	NC_003277	CGA	2	6	91610	91615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233470
2008	NC_003277	GGGTT	2	10	91622	91631	0 %	40 %	60 %	0 %	17233470
2009	NC_003277	GAT	2	6	91700	91705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233470
2010	NC_003277	GCC	2	6	91752	91757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17233470
2011	NC_003277	GCCGT	2	10	91759	91768	0 %	20 %	40 %	40 %	17233470
2012	NC_003277	CCG	2	6	91882	91887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17233470
2013	NC_003277	CTG	2	6	92016	92021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233470
2014	NC_003277	GCG	2	6	92071	92076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17233470
2015	NC_003277	TGG	2	6	92077	92082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17233470
2016	NC_003277	CGG	2	6	92129	92134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17233470
2017	NC_003277	GGCA	2	8	92221	92228	25 %	0 %	50 %	25 %	17233470
2018	NC_003277	CCG	2	6	92240	92245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17233470
2019	NC_003277	GGA	2	6	92309	92314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	17233470
2020	NC_003277	TGC	2	6	92404	92409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233470
2021	NC_003277	GCA	2	6	92477	92482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233470
2022	NC_003277	ACGATG	2	12	92557	92568	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	17233471
2023	NC_003277	CTG	2	6	92626	92631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233471
2024	NC_003277	AG	3	6	92648	92653	50 %	0 %	50 %	0 %	17233471
2025	NC_003277	TCA	2	6	92657	92662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233471
2026	NC_003277	GCT	3	9	92673	92681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233471
2027	NC_003277	TGG	2	6	92684	92689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17233471
2028	NC_003277	GTG	2	6	92937	92942	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17233471
2029	NC_003277	AGC	2	6	92945	92950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233471
2030	NC_003277	CTG	2	6	92983	92988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233471
2031	NC_003277	GTGCTG	2	12	93034	93045	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	17233471
2032	NC_003277	GAA	2	6	93082	93087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17233471
2033	NC_003277	GCCT	2	8	93103	93110	0 %	25 %	25 %	50 %	17233471
2034	NC_003277	GTG	2	6	93112	93117	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17233471
2035	NC_003277	CGG	2	6	93155	93160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17233471
2036	NC_003277	T	6	6	93243	93248	0 %	100 %	0 %	0 %	17233471
2037	NC_003277	GCA	2	6	93343	93348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2038	NC_003277	ATT	2	6	93433	93438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17233472
2039	NC_003277	CAC	2	6	93444	93449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17233472
2040	NC_003277	GAA	2	6	93468	93473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17233472
2041	NC_003277	CAG	2	6	93475	93480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233472
2042	NC_003277	A	8	8	93518	93525	100 %	0 %	0 %	0 %	17233472
2043	NC_003277	TCAG	2	8	93564	93571	25 %	25 %	25 %	25 %	17233472
2044	NC_003277	GGA	2	6	93573	93578	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	17233472
2045	NC_003277	TGG	2	6	93601	93606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17233472
2046	NC_003277	GCGT	2	8	93650	93657	0 %	25 %	50 %	25 %	17233472
2047	NC_003277	CA	3	6	93701	93706	50 %	0 %	0 %	50 %	17233472
2048	NC_003277	GGA	2	6	93822	93827	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	17233472
2049	NC_003277	CG	3	6	93892	93897	0 %	0 %	50 %	50 %	17233472

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.