MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. LT2 plasmid pSLT

Total Repeats: 2049

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_003277	AGT	2	6	46133	46138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233501
1002	NC_003277	GCT	2	6	46233	46238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233501
1003	NC_003277	TCA	2	6	46262	46267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233501
1004	NC_003277	GCCT	2	8	46318	46325	0 %	25 %	25 %	50 %	17233501
1005	NC_003277	ATG	2	6	46382	46387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233501
1006	NC_003277	GTA	2	6	46438	46443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233501
1007	NC_003277	CGG	2	6	46524	46529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17233501
1008	NC_003277	CTGC	2	8	46551	46558	0 %	25 %	25 %	50 %	17233501
1009	NC_003277	CTG	2	6	46598	46603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233501
1010	NC_003277	CTG	2	6	46612	46617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233501
1011	NC_003277	G	6	6	46621	46626	0 %	0 %	100 %	0 %	17233501
1012	NC_003277	TCC	2	6	46634	46639	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	17233501
1013	NC_003277	TC	3	6	46678	46683	0 %	50 %	0 %	50 %	17233501
1014	NC_003277	TGA	2	6	46707	46712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233501
1015	NC_003277	CG	3	6	46723	46728	0 %	0 %	50 %	50 %	17233501
1016	NC_003277	CTT	2	6	46768	46773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17233501
1017	NC_003277	TCC	2	6	46802	46807	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	17233501
1018	NC_003277	CAG	2	6	46822	46827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233501
1019	NC_003277	CGTT	2	8	46834	46841	0 %	50 %	25 %	25 %	17233501
1020	NC_003277	GC	3	6	46905	46910	0 %	0 %	50 %	50 %	17233501
1021	NC_003277	GGTC	2	8	46927	46934	0 %	25 %	50 %	25 %	17233501
1022	NC_003277	GAAC	2	8	46967	46974	50 %	0 %	25 %	25 %	17233501
1023	NC_003277	T	7	7	47215	47221	0 %	100 %	0 %	0 %	17233501
1024	NC_003277	GC	3	6	47233	47238	0 %	0 %	50 %	50 %	17233501
1025	NC_003277	GTT	2	6	47254	47259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17233501
1026	NC_003277	ACC	2	6	47267	47272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17233501
1027	NC_003277	CAC	2	6	47388	47393	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17233502
1028	NC_003277	TTC	2	6	47409	47414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17233502
1029	NC_003277	GCA	2	6	47447	47452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233502
1030	NC_003277	TTTC	2	8	47582	47589	0 %	75 %	0 %	25 %	17233502
1031	NC_003277	GAA	2	6	47613	47618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17233502
1032	NC_003277	TCC	2	6	47662	47667	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	17233502
1033	NC_003277	CGG	2	6	47678	47683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17233502
1034	NC_003277	CCG	2	6	47699	47704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17233502
1035	NC_003277	TA	3	6	47801	47806	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_003277	ATT	2	6	47811	47816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_003277	TAA	2	6	47914	47919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_003277	GGA	2	6	47926	47931	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_003277	TCC	2	6	47961	47966	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1040	NC_003277	TGT	2	6	47989	47994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_003277	ACGGG	2	10	48064	48073	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1042	NC_003277	CGT	2	6	48080	48085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_003277	CGA	2	6	48155	48160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_003277	CGA	2	6	48213	48218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_003277	CCT	2	6	48257	48262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1046	NC_003277	GCG	2	6	48370	48375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17233427
1047	NC_003277	TGA	2	6	48464	48469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233427
1048	NC_003277	TGA	2	6	48572	48577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233427
1049	NC_003277	TGC	2	6	48585	48590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233427
1050	NC_003277	CTGG	2	8	48599	48606	0 %	25 %	50 %	25 %	17233427
1051	NC_003277	GCG	2	6	48657	48662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17233427
1052	NC_003277	ATG	2	6	48685	48690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233427
1053	NC_003277	ATA	2	6	48752	48757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17233427
1054	NC_003277	TTG	2	6	48782	48787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17233428
1055	NC_003277	ATG	2	6	48817	48822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233428
1056	NC_003277	TGG	2	6	48892	48897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17233428
1057	NC_003277	CAT	2	6	48966	48971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233428
1058	NC_003277	TGAA	2	8	49140	49147	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_003277	ATG	2	6	49150	49155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_003277	CTC	2	6	49164	49169	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1061	NC_003277	T	6	6	49170	49175	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_003277	CGG	2	6	49188	49193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_003277	CCGG	2	8	49231	49238	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1064	NC_003277	ACGGG	2	10	49241	49250	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1065	NC_003277	TAT	2	6	49282	49287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_003277	TGA	2	6	49307	49312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_003277	CCT	2	6	49461	49466	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1068	NC_003277	GC	3	6	49539	49544	0 %	0 %	50 %	50 %	17233429
1069	NC_003277	GACC	2	8	49560	49567	25 %	0 %	25 %	50 %	17233429
1070	NC_003277	CGA	2	6	49626	49631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233429
1071	NC_003277	A	6	6	49672	49677	100 %	0 %	0 %	0 %	17233429
1072	NC_003277	GCT	2	6	49683	49688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233429
1073	NC_003277	GGC	2	6	49728	49733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17233429
1074	NC_003277	ACT	2	6	49784	49789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233429
1075	NC_003277	CCA	2	6	49911	49916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17233429
1076	NC_003277	CA	4	8	49965	49972	50 %	0 %	0 %	50 %	17233429
1077	NC_003277	AT	3	6	50046	50051	50 %	50 %	0 %	0 %	17233429
1078	NC_003277	GC	3	6	50112	50117	0 %	0 %	50 %	50 %	17233429
1079	NC_003277	GCC	2	6	50131	50136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17233429
1080	NC_003277	ACG	2	6	50138	50143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233429
1081	NC_003277	GGC	2	6	50204	50209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17233430
1082	NC_003277	GC	3	6	50234	50239	0 %	0 %	50 %	50 %	17233430
1083	NC_003277	GCG	2	6	50315	50320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17233430
1084	NC_003277	CTG	2	6	50331	50336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233430
1085	NC_003277	GCG	2	6	50406	50411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_003277	GCC	2	6	50414	50419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1087	NC_003277	ATG	2	6	50443	50448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32441713
1088	NC_003277	GAACT	2	10	50464	50473	40 %	20 %	20 %	20 %	32441713
1089	NC_003277	ACG	2	6	50498	50503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32441713
1090	NC_003277	CTG	2	6	50515	50520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32441713
1091	NC_003277	CTG	2	6	50710	50715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32441713
1092	NC_003277	CGGG	2	8	50736	50743	0 %	0 %	75 %	25 %	32441713
1093	NC_003277	GGA	2	6	50754	50759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	32441713
1094	NC_003277	GGCCT	2	10	50766	50775	0 %	20 %	40 %	40 %	32441713
1095	NC_003277	CTGGCG	2	12	50839	50850	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	32441713
1096	NC_003277	ACC	2	6	50860	50865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1097	NC_003277	CGGG	2	8	50879	50886	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1098	NC_003277	ATCA	2	8	50889	50896	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1099	NC_003277	AAC	2	6	50919	50924	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_003277	GTG	2	6	51030	51035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17233431
1101	NC_003277	GGCT	2	8	51039	51046	0 %	25 %	50 %	25 %	17233431
1102	NC_003277	TGC	2	6	51068	51073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233431
1103	NC_003277	GAC	2	6	51089	51094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233431
1104	NC_003277	CTG	2	6	51132	51137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233431
1105	NC_003277	CTG	2	6	51288	51293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233431
1106	NC_003277	CGG	2	6	51358	51363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17233431
1107	NC_003277	AGGACG	2	12	51463	51474	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	17233431
1108	NC_003277	TGC	2	6	51529	51534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233431
1109	NC_003277	GGA	2	6	51554	51559	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	17233431
1110	NC_003277	GCC	2	6	51570	51575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17233431
1111	NC_003277	GAACC	2	10	51609	51618	40 %	0 %	20 %	40 %	17233431
1112	NC_003277	CCG	2	6	51632	51637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17233431
1113	NC_003277	TG	3	6	51699	51704	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_003277	GAAA	2	8	51735	51742	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_003277	T	6	6	51766	51771	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_003277	CGA	2	6	51793	51798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_003277	GAC	2	6	51806	51811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_003277	GCCG	2	8	51871	51878	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1119	NC_003277	CATC	2	8	51934	51941	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1120	NC_003277	CGG	2	6	51980	51985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_003277	TCCT	2	8	51994	52001	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1122	NC_003277	TTA	2	6	52219	52224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17233432
1123	NC_003277	GAA	2	6	52230	52235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17233432
1124	NC_003277	GCTG	2	8	52283	52290	0 %	25 %	50 %	25 %	17233432
1125	NC_003277	A	6	6	52314	52319	100 %	0 %	0 %	0 %	17233432
1126	NC_003277	GGT	2	6	52338	52343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17233432
1127	NC_003277	GGC	2	6	52371	52376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17233432
1128	NC_003277	ATG	2	6	52383	52388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233432
1129	NC_003277	ATT	2	6	52464	52469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17233432
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1131	NC_003277	CCG	2	6	52490	52495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17233432
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