MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. LT2 plasmid pSLT

Total Repeats: 2049

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_003277	AGG	2	6	22340	22345	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	17233418
502	NC_003277	GGT	2	6	22349	22354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17233418
503	NC_003277	GCTG	2	8	22375	22382	0 %	25 %	50 %	25 %	17233418
504	NC_003277	CTG	2	6	22398	22403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233418
505	NC_003277	CGG	2	6	22445	22450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17233418
506	NC_003277	GCT	2	6	22454	22459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233418
507	NC_003277	CGA	2	6	22472	22477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233418
508	NC_003277	GCCG	2	8	22512	22519	0 %	0 %	50 %	50 %	17233418
509	NC_003277	TGA	3	9	22525	22533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233418
510	NC_003277	AGCCTG	2	12	22545	22556	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	17233418
511	NC_003277	CGC	2	6	22564	22569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17233418
512	NC_003277	TCCG	2	8	22573	22580	0 %	25 %	25 %	50 %	17233418
513	NC_003277	CTG	2	6	22584	22589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233418
514	NC_003277	GGC	2	6	22673	22678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17233418
515	NC_003277	GCC	2	6	22695	22700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17233418
516	NC_003277	G	6	6	22701	22706	0 %	0 %	100 %	0 %	17233418
517	NC_003277	GAC	2	6	22722	22727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233418
518	NC_003277	GAT	2	6	22772	22777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233418
519	NC_003277	GC	3	6	22779	22784	0 %	0 %	50 %	50 %	17233418
520	NC_003277	GGC	2	6	22850	22855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_003277	GC	3	6	22854	22859	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
522	NC_003277	G	6	6	22871	22876	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
523	NC_003277	GCG	2	6	22900	22905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_003277	A	6	6	22945	22950	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_003277	GTT	2	6	23006	23011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32441710
526	NC_003277	GGCA	2	8	23028	23035	25 %	0 %	50 %	25 %	32441710
527	NC_003277	CCCTGT	2	12	23086	23097	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	32441710
528	NC_003277	TGG	2	6	23112	23117	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32441710
529	NC_003277	CCG	2	6	23180	23185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32441710
530	NC_003277	GAC	3	9	23226	23234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32441710
531	NC_003277	GTG	2	6	23286	23291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32441710
532	NC_003277	CCCG	2	8	23311	23318	0 %	0 %	25 %	75 %	32441710
533	NC_003277	CCG	2	6	23327	23332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32441710
534	NC_003277	CCGG	2	8	23345	23352	0 %	0 %	50 %	50 %	32441710
535	NC_003277	GTGA	2	8	23361	23368	25 %	25 %	50 %	0 %	32441710
536	NC_003277	GCT	2	6	23399	23404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32441710
537	NC_003277	CCCG	2	8	23407	23414	0 %	0 %	25 %	75 %	32441710
538	NC_003277	CGG	2	6	23417	23422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32441710
539	NC_003277	GCC	2	6	23439	23444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32441710
540	NC_003277	GGCA	2	8	23446	23453	25 %	0 %	50 %	25 %	32441710
541	NC_003277	CAT	2	6	23473	23478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32441710
542	NC_003277	GGT	2	6	23568	23573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17233419
543	NC_003277	CGC	2	6	23583	23588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17233419
544	NC_003277	GGCA	2	8	23590	23597	25 %	0 %	50 %	25 %	17233419
545	NC_003277	TGC	2	6	23604	23609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233419
546	NC_003277	GGC	2	6	23611	23616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17233419
547	NC_003277	GCT	2	6	23689	23694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233419
548	NC_003277	AGG	2	6	23701	23706	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	17233419
549	NC_003277	CTGC	2	8	23746	23753	0 %	25 %	25 %	50 %	17233419
550	NC_003277	CAG	2	6	23794	23799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233419
551	NC_003277	GGC	2	6	23823	23828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17233419
552	NC_003277	CGA	2	6	23832	23837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233419
553	NC_003277	TC	3	6	23845	23850	0 %	50 %	0 %	50 %	17233419
554	NC_003277	GCGA	2	8	23856	23863	25 %	0 %	50 %	25 %	17233419
555	NC_003277	TG	3	6	23871	23876	0 %	50 %	50 %	0 %	17233419
556	NC_003277	CG	3	6	23896	23901	0 %	0 %	50 %	50 %	17233419
557	NC_003277	CGC	2	6	23947	23952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17233419
558	NC_003277	GC	3	6	23954	23959	0 %	0 %	50 %	50 %	17233419
559	NC_003277	GCT	2	6	23973	23978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_003277	GCCT	2	8	23996	24003	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
561	NC_003277	GCG	2	6	24010	24015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_003277	ATG	2	6	24025	24030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
563	NC_003277	CGC	2	6	24044	24049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
564	NC_003277	CAG	2	6	24057	24062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_003277	GAC	2	6	24066	24071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_003277	AC	3	6	24124	24129	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
567	NC_003277	TCC	2	6	24165	24170	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
568	NC_003277	CCA	2	6	24222	24227	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
569	NC_003277	GCC	2	6	24320	24325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
570	NC_003277	GGCGCA	2	12	24376	24387	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_003277	A	6	6	24410	24415	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_003277	ACC	2	6	24450	24455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
573	NC_003277	CGA	2	6	24466	24471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_003277	CGG	2	6	24483	24488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_003277	CGG	2	6	24499	24504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
576	NC_003277	TGC	2	6	24544	24549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
577	NC_003277	GCA	2	6	24577	24582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
578	NC_003277	GCCA	2	8	24620	24627	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
579	NC_003277	GCC	3	9	24641	24649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
580	NC_003277	CGG	2	6	24744	24749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_003277	GGA	2	6	24828	24833	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
582	NC_003277	CGT	2	6	24887	24892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_003277	AGA	2	6	24971	24976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
584	NC_003277	CCG	2	6	24992	24997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
585	NC_003277	GCT	2	6	25020	25025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_003277	AGC	2	6	25040	25045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_003277	GC	3	6	25044	25049	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
588	NC_003277	CAGC	2	8	25119	25126	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
589	NC_003277	CTGA	2	8	25180	25187	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
590	NC_003277	AGG	2	6	25223	25228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
591	NC_003277	ATC	2	6	25266	25271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_003277	T	6	6	25471	25476	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_003277	AT	3	6	25630	25635	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_003277	AT	3	6	25675	25680	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_003277	TATT	2	8	25683	25690	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_003277	CAC	2	6	25725	25730	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
597	NC_003277	TTC	2	6	25747	25752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_003277	GTAA	2	8	25767	25774	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
599	NC_003277	GATG	2	8	25897	25904	25 %	25 %	50 %	0 %	17233421
600	NC_003277	CTG	2	6	25925	25930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233421
601	NC_003277	AAT	2	6	25970	25975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17233421
602	NC_003277	TCG	2	6	25988	25993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233421
603	NC_003277	CAG	2	6	26006	26011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233421
604	NC_003277	GCT	2	6	26044	26049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233421
605	NC_003277	GGT	2	6	26081	26086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17233421
606	NC_003277	CAGA	2	8	26119	26126	50 %	0 %	25 %	25 %	17233421
607	NC_003277	CCCG	2	8	26178	26185	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
608	NC_003277	CT	3	6	26221	26226	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
609	NC_003277	A	6	6	26257	26262	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_003277	TCA	2	6	26280	26285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233489
611	NC_003277	TGA	3	9	26309	26317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233489
612	NC_003277	T	7	7	26324	26330	0 %	100 %	0 %	0 %	17233489
613	NC_003277	T	6	6	26393	26398	0 %	100 %	0 %	0 %	17233489
614	NC_003277	ATT	2	6	26448	26453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17233489
615	NC_003277	CAA	2	6	26593	26598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17233489
616	NC_003277	TTC	2	6	26634	26639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17233489
617	NC_003277	AT	3	6	26647	26652	50 %	50 %	0 %	0 %	17233489
618	NC_003277	ATGT	2	8	26663	26670	25 %	50 %	25 %	0 %	17233489
619	NC_003277	ATA	2	6	26689	26694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17233489
620	NC_003277	GTAT	2	8	26720	26727	25 %	50 %	25 %	0 %	17233489
621	NC_003277	TC	3	6	26789	26794	0 %	50 %	0 %	50 %	17233489
622	NC_003277	ATT	3	9	26846	26854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17233489
623	NC_003277	T	6	6	26859	26864	0 %	100 %	0 %	0 %	17233489
624	NC_003277	ATA	2	6	26961	26966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_003277	A	6	6	26973	26978	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_003277	G	6	6	27070	27075	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
627	NC_003277	TAA	2	6	27107	27112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_003277	TACT	2	8	27175	27182	25 %	50 %	0 %	25 %	17233490
629	NC_003277	TCA	2	6	27186	27191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233490
630	NC_003277	CCA	2	6	27236	27241	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17233490
631	NC_003277	ACG	2	6	27390	27395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233490
632	NC_003277	CTGGT	2	10	27415	27424	0 %	40 %	40 %	20 %	17233490
633	NC_003277	TA	3	6	27427	27432	50 %	50 %	0 %	0 %	17233490
634	NC_003277	TTG	2	6	27466	27471	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17233490
635	NC_003277	CGA	2	6	27632	27637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233490
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