MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. CT18

Total Repeats: 101023

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_003198	CGA	2	6	187320	187325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759154
4002	NC_003198	CTG	2	6	187326	187331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759154
4003	NC_003198	ATT	2	6	187358	187363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16759154
4004	NC_003198	CTG	2	6	187385	187390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759154
4005	NC_003198	CTGT	2	8	187406	187413	0 %	50 %	25 %	25 %	16759154
4006	NC_003198	TGC	2	6	187515	187520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759154
4007	NC_003198	CGC	2	6	187534	187539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759154
4008	NC_003198	TGG	2	6	187546	187551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759154
4009	NC_003198	TAT	2	6	187573	187578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16759154
4010	NC_003198	TGC	2	6	187614	187619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759154
4011	NC_003198	ATT	2	6	187667	187672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16759154
4012	NC_003198	ACC	2	6	187715	187720	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16759154
4013	NC_003198	ATG	2	6	187721	187726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759154
4014	NC_003198	ATC	3	9	187730	187738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759154
4015	NC_003198	ATG	2	6	187739	187744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759154
4016	NC_003198	GTC	3	9	187745	187753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759154
4017	NC_003198	TGG	2	6	187755	187760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759154
4018	NC_003198	TGA	2	6	187761	187766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759154
4019	NC_003198	TCG	2	6	187767	187772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759154
4020	NC_003198	TGC	2	6	187786	187791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759154
4021	NC_003198	AAC	2	6	187794	187799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16759154
4022	NC_003198	GGT	2	6	187805	187810	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759154
4023	NC_003198	CTG	2	6	187859	187864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759154
4024	NC_003198	CGG	2	6	187889	187894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759154
4025	NC_003198	CGT	2	6	187925	187930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759154
4026	NC_003198	ACC	2	6	187953	187958	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16759154
4027	NC_003198	TGA	2	6	187981	187986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759154
4028	NC_003198	TGG	2	6	188020	188025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759154
4029	NC_003198	GTC	2	6	188028	188033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759154
4030	NC_003198	CGG	2	6	188038	188043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759154
4031	NC_003198	GAGC	2	8	188113	188120	25 %	0 %	50 %	25 %	16759154
4032	NC_003198	CATC	2	8	188140	188147	25 %	25 %	0 %	50 %	16759154
4033	NC_003198	TGGC	2	8	188268	188275	0 %	25 %	50 %	25 %	16759154
4034	NC_003198	GCC	2	6	188502	188507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759154
4035	NC_003198	CA	3	6	188577	188582	50 %	0 %	0 %	50 %	16759154
4036	NC_003198	TC	3	6	188622	188627	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4037	NC_003198	TGCC	2	8	188657	188664	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4038	NC_003198	T	6	6	188834	188839	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_003198	T	6	6	188847	188852	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_003198	CTA	2	6	188917	188922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4041	NC_003198	ACT	2	6	188923	188928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4042	NC_003198	CAA	2	6	188960	188965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4043	NC_003198	GAG	2	6	188992	188997	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_003198	TCG	2	6	189001	189006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759155
4045	NC_003198	AGA	2	6	189011	189016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16759155
4046	NC_003198	TGC	2	6	189041	189046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759155
4047	NC_003198	GCT	2	6	189101	189106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759155
4048	NC_003198	GAA	3	9	189126	189134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16759155
4049	NC_003198	TCC	2	6	189164	189169	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16759155
4050	NC_003198	GCT	2	6	189210	189215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759155
4051	NC_003198	ACC	2	6	189231	189236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16759155
4052	NC_003198	CTG	2	6	189270	189275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759155
4053	NC_003198	ACA	2	6	189295	189300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16759155
4054	NC_003198	CTG	2	6	189372	189377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759155
4055	NC_003198	ACG	2	6	189394	189399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759155
4056	NC_003198	AGA	2	6	189401	189406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16759155
4057	NC_003198	CCG	2	6	189483	189488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759155
4058	NC_003198	A	6	6	189496	189501	100 %	0 %	0 %	0 %	16759155
4059	NC_003198	TCACCG	2	12	189502	189513	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	16759155
4060	NC_003198	CGA	2	6	189542	189547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759155
4061	NC_003198	TC	4	8	189548	189555	0 %	50 %	0 %	50 %	16759155
4062	NC_003198	CAAA	2	8	189665	189672	75 %	0 %	0 %	25 %	16759155
4063	NC_003198	A	6	6	189687	189692	100 %	0 %	0 %	0 %	16759155
4064	NC_003198	GTG	2	6	189720	189725	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759155
4065	NC_003198	TTC	2	6	189734	189739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16759155
4066	NC_003198	GCG	3	9	189808	189816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759155
4067	NC_003198	CGG	2	6	189827	189832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759155
4068	NC_003198	TCT	2	6	189847	189852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16759155
4069	NC_003198	GC	3	6	189874	189879	0 %	0 %	50 %	50 %	16759155
4070	NC_003198	CTG	2	6	189975	189980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759155
4071	NC_003198	CGA	2	6	190013	190018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759155
4072	NC_003198	ACC	2	6	190065	190070	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16759155
4073	NC_003198	AGC	2	6	190137	190142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759155
4074	NC_003198	TC	3	6	190150	190155	0 %	50 %	0 %	50 %	16759155
4075	NC_003198	GGTC	2	8	190169	190176	0 %	25 %	50 %	25 %	16759155
4076	NC_003198	GCG	2	6	190183	190188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759155
4077	NC_003198	TAC	2	6	190250	190255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759155
4078	NC_003198	TGA	2	6	190271	190276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759155
4079	NC_003198	CCG	2	6	190306	190311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759155
4080	NC_003198	CAC	2	6	190367	190372	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16759155
4081	NC_003198	CAC	2	6	190374	190379	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16759155
4082	NC_003198	CGG	2	6	190406	190411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759155
4083	NC_003198	TGC	3	9	190462	190470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759155
4084	NC_003198	CGG	2	6	190487	190492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759155
4085	NC_003198	CGG	2	6	190531	190536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759155
4086	NC_003198	TCTGG	2	10	190539	190548	0 %	40 %	40 %	20 %	16759155
4087	NC_003198	GCC	2	6	190557	190562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759155
4088	NC_003198	CTG	2	6	190689	190694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759155
4089	NC_003198	GAA	2	6	190703	190708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16759155
4090	NC_003198	TCT	2	6	190723	190728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16759155
4091	NC_003198	CTG	2	6	190881	190886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759155
4092	NC_003198	GAT	2	6	190892	190897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759155
4093	NC_003198	CGT	2	6	190917	190922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759155
4094	NC_003198	CGT	2	6	190932	190937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759155
4095	NC_003198	TGGC	2	8	190956	190963	0 %	25 %	50 %	25 %	16759155
4096	NC_003198	GCT	2	6	190973	190978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759155
4097	NC_003198	GAC	2	6	191070	191075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759155
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4099	NC_003198	CGA	2	6	191111	191116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759155
4100	NC_003198	CG	3	6	191157	191162	0 %	0 %	50 %	50 %	16759155
4101	NC_003198	GCT	2	6	191171	191176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759155
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4103	NC_003198	GAA	2	6	191253	191258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16759155
4104	NC_003198	TAC	2	6	191262	191267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759155
4105	NC_003198	GTT	2	6	191308	191313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16759155
4106	NC_003198	GGT	2	6	191357	191362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759155
4107	NC_003198	GGC	2	6	191435	191440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759155
4108	NC_003198	CGG	2	6	191512	191517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759155
4109	NC_003198	TACC	2	8	191522	191529	25 %	25 %	0 %	50 %	16759155
4110	NC_003198	CT	3	6	191550	191555	0 %	50 %	0 %	50 %	16759155
4111	NC_003198	GGC	2	6	191654	191659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4112	NC_003198	CTG	2	6	191720	191725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4113	NC_003198	T	7	7	191733	191739	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_003198	GCT	2	6	191747	191752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4115	NC_003198	GGT	2	6	191856	191861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759156
4116	NC_003198	CG	3	6	191925	191930	0 %	0 %	50 %	50 %	16759156
4117	NC_003198	TGGA	2	8	191986	191993	25 %	25 %	50 %	0 %	16759156
4118	NC_003198	GAA	2	6	191998	192003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16759156
4119	NC_003198	TGA	2	6	192005	192010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759156
4120	NC_003198	TTA	2	6	192063	192068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16759156
4121	NC_003198	AG	3	6	192075	192080	50 %	0 %	50 %	0 %	16759156
4122	NC_003198	GGA	2	6	192099	192104	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16759156
4123	NC_003198	GTC	2	6	192115	192120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759156
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4125	NC_003198	CAC	2	6	192221	192226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4127	NC_003198	T	6	6	192270	192275	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_003198	TTA	2	6	192281	192286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_003198	TTGA	2	8	192328	192335	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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4151	NC_003198	GCT	2	6	193222	193227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759157
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4222	NC_003198	GTG	2	6	196381	196386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4223	NC_003198	GTA	2	6	196413	196418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759161
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4230	NC_003198	CA	3	6	196836	196841	50 %	0 %	0 %	50 %	16759161
4231	NC_003198	CCA	2	6	196865	196870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16759161
4232	NC_003198	CCT	2	6	197193	197198	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4233	NC_003198	CGG	2	6	197293	197298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759162
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4244	NC_003198	CAG	2	6	197846	197851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759162
4245	NC_003198	TCA	2	6	197863	197868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759162
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4247	NC_003198	TCG	2	6	197886	197891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759162
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4494	NC_003198	GCC	2	6	209804	209809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759174
4495	NC_003198	CGCA	2	8	209834	209841	25 %	0 %	25 %	50 %	16759174
4496	NC_003198	GGCGT	2	10	209874	209883	0 %	20 %	60 %	20 %	16759174
4497	NC_003198	AGC	2	6	209907	209912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759174
4498	NC_003198	GC	3	6	209923	209928	0 %	0 %	50 %	50 %	16759174
4499	NC_003198	CG	3	6	209939	209944	0 %	0 %	50 %	50 %	16759174
4500	NC_003198	CAGG	2	8	209974	209981	25 %	0 %	50 %	25 %	16759174

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