MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. CT18

Total Repeats: 101023

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_003198	CCG	2	6	140132	140137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759113
3002	NC_003198	TCG	2	6	140181	140186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759113
3003	NC_003198	CG	3	6	140195	140200	0 %	0 %	50 %	50 %	16759113
3004	NC_003198	GAT	2	6	140243	140248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759113
3005	NC_003198	CGG	2	6	140283	140288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759113
3006	NC_003198	GC	3	6	140307	140312	0 %	0 %	50 %	50 %	16759113
3007	NC_003198	CCGCA	2	10	140353	140362	20 %	0 %	20 %	60 %	16759113
3008	NC_003198	GCC	2	6	140420	140425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759113
3009	NC_003198	CAT	2	6	140484	140489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759113
3010	NC_003198	GCG	2	6	140524	140529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759113
3011	NC_003198	GCT	2	6	140581	140586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759113
3012	NC_003198	TGA	2	6	140674	140679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759113
3013	NC_003198	TCG	2	6	140728	140733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759113
3014	NC_003198	CGG	2	6	140761	140766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3015	NC_003198	CT	4	8	140774	140781	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3016	NC_003198	GCC	2	6	140785	140790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3017	NC_003198	CAAA	2	8	140793	140800	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3018	NC_003198	AAT	2	6	140826	140831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_003198	ATT	2	6	140836	140841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_003198	T	6	6	140864	140869	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_003198	CTTT	2	8	140875	140882	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3022	NC_003198	TTGTT	2	10	140939	140948	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_003198	TCG	2	6	140965	140970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3024	NC_003198	CGG	2	6	141145	141150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3025	NC_003198	T	7	7	141162	141168	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_003198	GC	3	6	141200	141205	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3027	NC_003198	T	6	6	141250	141255	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_003198	CTTG	2	8	141275	141282	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3029	NC_003198	TCC	2	6	141292	141297	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3030	NC_003198	AAG	2	6	141342	141347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_003198	G	6	6	141368	141373	0 %	0 %	100 %	0 %	16759114
3032	NC_003198	CATC	2	8	141477	141484	25 %	25 %	0 %	50 %	16759114
3033	NC_003198	CTG	2	6	141493	141498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759114
3034	NC_003198	CCTG	2	8	141507	141514	0 %	25 %	25 %	50 %	16759114
3035	NC_003198	ATT	2	6	141523	141528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16759114
3036	NC_003198	GATG	2	8	141615	141622	25 %	25 %	50 %	0 %	16759114
3037	NC_003198	AAG	2	6	141677	141682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16759114
3038	NC_003198	CAA	2	6	141702	141707	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16759114
3039	NC_003198	GAT	2	6	141820	141825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759115
3040	NC_003198	AC	3	6	141838	141843	50 %	0 %	0 %	50 %	16759115
3041	NC_003198	CGG	2	6	141922	141927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759115
3042	NC_003198	CGAT	2	8	141978	141985	25 %	25 %	25 %	25 %	16759115
3043	NC_003198	CAT	2	6	142039	142044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759115
3044	NC_003198	GCTG	2	8	142063	142070	0 %	25 %	50 %	25 %	16759115
3045	NC_003198	TCT	2	6	142133	142138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16759115
3046	NC_003198	CG	3	6	142212	142217	0 %	0 %	50 %	50 %	16759115
3047	NC_003198	GCC	2	6	142226	142231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759115
3048	NC_003198	CGG	2	6	142245	142250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759115
3049	NC_003198	AGG	2	6	142251	142256	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16759115
3050	NC_003198	GAG	2	6	142289	142294	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16759115
3051	NC_003198	TTG	2	6	142323	142328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16759115
3052	NC_003198	GCG	3	9	142382	142390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759115
3053	NC_003198	GGA	2	6	142468	142473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16759115
3054	NC_003198	GCTC	2	8	142494	142501	0 %	25 %	25 %	50 %	16759115
3055	NC_003198	GGCG	2	8	142517	142524	0 %	0 %	75 %	25 %	16759115
3056	NC_003198	ATC	2	6	142532	142537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759115
3057	NC_003198	CGG	2	6	142608	142613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759115
3058	NC_003198	A	6	6	142640	142645	100 %	0 %	0 %	0 %	16759115
3059	NC_003198	AGTTC	2	10	142724	142733	20 %	40 %	20 %	20 %	16759115
3060	NC_003198	AG	3	6	142744	142749	50 %	0 %	50 %	0 %	16759115
3061	NC_003198	CAG	2	6	142764	142769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759116
3062	NC_003198	TGCCT	2	10	142824	142833	0 %	40 %	20 %	40 %	16759116
3063	NC_003198	CAT	2	6	142893	142898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759116
3064	NC_003198	CGG	2	6	142904	142909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759116
3065	NC_003198	GGT	2	6	142914	142919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759116
3066	NC_003198	ACG	2	6	142921	142926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759116
3067	NC_003198	AAC	2	6	142961	142966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16759116
3068	NC_003198	GAA	2	6	143017	143022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16759116
3069	NC_003198	GCA	2	6	143079	143084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759116
3070	NC_003198	AGC	2	6	143145	143150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759117
3071	NC_003198	GAA	2	6	143179	143184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16759117
3072	NC_003198	TCA	2	6	143195	143200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759117
3073	NC_003198	T	7	7	143246	143252	0 %	100 %	0 %	0 %	16759117
3074	NC_003198	CG	3	6	143260	143265	0 %	0 %	50 %	50 %	16759117
3075	NC_003198	ACCG	2	8	143362	143369	25 %	0 %	25 %	50 %	16759117
3076	NC_003198	AAG	2	6	143426	143431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16759117
3077	NC_003198	CGG	2	6	143442	143447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759117
3078	NC_003198	TTTA	2	8	143545	143552	25 %	75 %	0 %	0 %	16759117
3079	NC_003198	GC	3	6	143557	143562	0 %	0 %	50 %	50 %	16759117
3080	NC_003198	A	6	6	143593	143598	100 %	0 %	0 %	0 %	16759117
3081	NC_003198	GAA	2	6	143626	143631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16759117
3082	NC_003198	CGC	2	6	143635	143640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759117
3083	NC_003198	TAC	2	6	143641	143646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759117
3084	NC_003198	GCGA	2	8	143753	143760	25 %	0 %	50 %	25 %	16759117
3085	NC_003198	TCC	2	6	143803	143808	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16759117
3086	NC_003198	TGA	2	6	143847	143852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759117
3087	NC_003198	AAC	2	6	143884	143889	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16759117
3088	NC_003198	TGGCGA	2	12	143957	143968	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	16759117
3089	NC_003198	CAA	2	6	143988	143993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16759117
3090	NC_003198	TGG	2	6	144074	144079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759117
3091	NC_003198	TGA	2	6	144080	144085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759117
3092	NC_003198	GC	3	6	144172	144177	0 %	0 %	50 %	50 %	16759117
3093	NC_003198	TAG	2	6	144266	144271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759117
3094	NC_003198	TACT	2	8	144273	144280	25 %	50 %	0 %	25 %	16759117
3095	NC_003198	GGT	2	6	144356	144361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759117
3096	NC_003198	AG	3	6	144369	144374	50 %	0 %	50 %	0 %	16759117
3097	NC_003198	GTG	2	6	144538	144543	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759117
3098	NC_003198	ATG	2	6	144547	144552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759117
3099	NC_003198	GCG	4	12	144572	144583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759117
3100	NC_003198	GGC	2	6	144588	144593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759117
3101	NC_003198	A	6	6	144634	144639	100 %	0 %	0 %	0 %	16759117
3102	NC_003198	CAA	2	6	144663	144668	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16759117
3103	NC_003198	TGG	2	6	144722	144727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759117
3104	NC_003198	TCA	2	6	144731	144736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759117
3105	NC_003198	TAC	2	6	144757	144762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759117
3106	NC_003198	GGC	2	6	144763	144768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759117
3107	NC_003198	CAT	2	6	144795	144800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759117
3108	NC_003198	GCG	2	6	144803	144808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759117
3109	NC_003198	A	7	7	144854	144860	100 %	0 %	0 %	0 %	16759117
3110	NC_003198	TAAT	2	8	144869	144876	50 %	50 %	0 %	0 %	16759117
3111	NC_003198	CTT	2	6	144917	144922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16759118
3112	NC_003198	GTGG	2	8	144928	144935	0 %	25 %	75 %	0 %	16759118
3113	NC_003198	CG	3	6	144946	144951	0 %	0 %	50 %	50 %	16759118
3114	NC_003198	GA	3	6	144960	144965	50 %	0 %	50 %	0 %	16759118
3115	NC_003198	GCG	2	6	144989	144994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759118
3116	NC_003198	GTG	2	6	145013	145018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759118
3117	NC_003198	TCA	2	6	145021	145026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759118
3118	NC_003198	CGT	2	6	145037	145042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759118
3119	NC_003198	ATT	2	6	145079	145084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16759118
3120	NC_003198	GTC	2	6	145142	145147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759118
3121	NC_003198	CAGC	2	8	145153	145160	25 %	0 %	25 %	50 %	16759118
3122	NC_003198	TGG	2	6	145224	145229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759118
3123	NC_003198	ACC	4	12	145253	145264	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16759118
3124	NC_003198	ACT	2	6	145267	145272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759118
3125	NC_003198	GGTA	2	8	145321	145328	25 %	25 %	50 %	0 %	16759118
3126	NC_003198	TCT	2	6	145445	145450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16759118
3127	NC_003198	GCA	2	6	145462	145467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759118
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3129	NC_003198	GCC	2	6	145490	145495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759118
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3135	NC_003198	CTG	2	6	145829	145834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759118
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3139	NC_003198	GGT	3	9	145951	145959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759118
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3243	NC_003198	ACG	2	6	150463	150468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759122
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3249	NC_003198	CAC	2	6	150747	150752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16759122
3250	NC_003198	CGG	2	6	150821	150826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759122
3251	NC_003198	CGTAT	2	10	150851	150860	20 %	40 %	20 %	20 %	16759122
3252	NC_003198	CGC	2	6	150862	150867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759122
3253	NC_003198	ATT	2	6	151033	151038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16759122
3254	NC_003198	GAA	2	6	151042	151047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16759122
3255	NC_003198	TCG	2	6	151091	151096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759122
3256	NC_003198	CG	3	6	151102	151107	0 %	0 %	50 %	50 %	16759122
3257	NC_003198	ACC	2	6	151139	151144	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16759122
3258	NC_003198	TGC	2	6	151226	151231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759122
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3262	NC_003198	CAT	2	6	151449	151454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759123
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3270	NC_003198	CGTTGC	2	12	151873	151884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759123
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3279	NC_003198	CGC	3	9	152177	152185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759123
3280	NC_003198	GCA	2	6	152228	152233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759123
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3282	NC_003198	CG	3	6	152335	152340	0 %	0 %	50 %	50 %	16759123
3283	NC_003198	GTT	2	6	152345	152350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16759123
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3285	NC_003198	AAT	2	6	152481	152486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3286	NC_003198	GAAT	2	8	152555	152562	50 %	25 %	25 %	0 %	16759124
3287	NC_003198	ACA	2	6	152565	152570	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16759124
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3355	NC_003198	GCGT	2	8	156225	156232	0 %	25 %	50 %	25 %	16759127
3356	NC_003198	A	6	6	156277	156282	100 %	0 %	0 %	0 %	16759127
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3364	NC_003198	GGCG	2	8	156614	156621	0 %	0 %	75 %	25 %	16759127
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3370	NC_003198	TGC	2	6	156805	156810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759127
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3498	NC_003198	ATT	2	6	163165	163170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16759132
3499	NC_003198	AAG	2	6	163257	163262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16759132
3500	NC_003198	CCG	2	6	163313	163318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759132

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