MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. CT18

Total Repeats: 101023

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_003198	CCG	2	6	45610	45615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759032
1003	NC_003198	GTG	2	6	45643	45648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759032
1004	NC_003198	ATGA	2	8	45652	45659	50 %	25 %	25 %	0 %	16759032
1005	NC_003198	GC	3	6	45701	45706	0 %	0 %	50 %	50 %	16759032
1006	NC_003198	CAG	2	6	45742	45747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759032
1007	NC_003198	TGA	2	6	45786	45791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759032
1008	NC_003198	GCT	2	6	45867	45872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759032
1009	NC_003198	TAC	2	6	45937	45942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759032
1010	NC_003198	AACG	2	8	45954	45961	50 %	0 %	25 %	25 %	16759032
1011	NC_003198	ATC	2	6	46030	46035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_003198	TGAC	2	8	46038	46045	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1013	NC_003198	A	6	6	46052	46057	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_003198	A	6	6	46086	46091	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_003198	TCA	2	6	46100	46105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_003198	TA	3	6	46106	46111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_003198	TAG	2	6	46146	46151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_003198	GAA	2	6	46156	46161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_003198	GA	3	6	46173	46178	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_003198	T	6	6	46204	46209	0 %	100 %	0 %	0 %	16759033
1021	NC_003198	AGC	2	6	46210	46215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759033
1022	NC_003198	CAT	2	6	46230	46235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759033
1023	NC_003198	TCA	2	6	46238	46243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759033
1024	NC_003198	CGC	2	6	46245	46250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759033
1025	NC_003198	CAA	2	6	46350	46355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16759033
1026	NC_003198	TGT	2	6	46364	46369	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16759033
1027	NC_003198	GCC	2	6	46483	46488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759033
1028	NC_003198	CGG	2	6	46491	46496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759033
1029	NC_003198	GAT	2	6	46497	46502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759033
1030	NC_003198	ACT	2	6	46532	46537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759033
1031	NC_003198	GGGCT	2	10	46557	46566	0 %	20 %	60 %	20 %	16759033
1032	NC_003198	ATC	2	6	46666	46671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759033
1033	NC_003198	CAT	2	6	46686	46691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759033
1034	NC_003198	TAT	2	6	46692	46697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16759033
1035	NC_003198	GGC	2	6	46743	46748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759033
1036	NC_003198	GCT	2	6	46770	46775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759033
1037	NC_003198	GCG	2	6	46784	46789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759033
1038	NC_003198	TA	3	6	46805	46810	50 %	50 %	0 %	0 %	16759033
1039	NC_003198	CGG	2	6	46835	46840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759033
1040	NC_003198	CTT	2	6	46887	46892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16759033
1041	NC_003198	GAAA	2	8	46902	46909	75 %	0 %	25 %	0 %	16759033
1042	NC_003198	TGC	2	6	47045	47050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759033
1043	NC_003198	ATT	2	6	47059	47064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16759033
1044	NC_003198	CTG	2	6	47071	47076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759033
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1046	NC_003198	TG	3	6	47186	47191	0 %	50 %	50 %	0 %	16759033
1047	NC_003198	TTA	2	6	47255	47260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16759033
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1049	NC_003198	GC	4	8	47325	47332	0 %	0 %	50 %	50 %	16759033
1050	NC_003198	GAAGG	2	10	47360	47369	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_003198	GA	3	6	47407	47412	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_003198	TAT	2	6	47447	47452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16759034
1053	NC_003198	AAG	2	6	47469	47474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16759034
1054	NC_003198	CGC	2	6	47511	47516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759034
1055	NC_003198	TGT	2	6	47697	47702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16759034
1056	NC_003198	CAG	2	6	47743	47748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759034
1057	NC_003198	GCG	2	6	47759	47764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759034
1058	NC_003198	GTG	3	9	47765	47773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759034
1059	NC_003198	CACG	2	8	47806	47813	25 %	0 %	25 %	50 %	16759034
1060	NC_003198	CAGC	2	8	47833	47840	25 %	0 %	25 %	50 %	16759034
1061	NC_003198	GCA	2	6	47884	47889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759034
1062	NC_003198	CCTG	3	12	47969	47980	0 %	25 %	25 %	50 %	16759034
1063	NC_003198	GTT	2	6	48031	48036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16759034
1064	NC_003198	TGA	2	6	48085	48090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759034
1065	NC_003198	ATG	2	6	48123	48128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759034
1066	NC_003198	GAA	2	6	48215	48220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16759034
1067	NC_003198	GA	3	6	48239	48244	50 %	0 %	50 %	0 %	16759034
1068	NC_003198	CGG	2	6	48258	48263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759034
1069	NC_003198	ACT	2	6	48285	48290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759034
1070	NC_003198	TACC	2	8	48317	48324	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1071	NC_003198	GCGTA	2	10	48433	48442	20 %	20 %	40 %	20 %	16759035
1072	NC_003198	CCT	2	6	48456	48461	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16759035
1073	NC_003198	CATG	2	8	48538	48545	25 %	25 %	25 %	25 %	16759035
1074	NC_003198	CAG	2	6	48557	48562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759035
1075	NC_003198	TCC	2	6	48666	48671	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16759035
1076	NC_003198	CCG	2	6	48936	48941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759035
1077	NC_003198	CGT	2	6	48947	48952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759035
1078	NC_003198	CCA	2	6	48953	48958	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16759035
1079	NC_003198	CGG	2	6	48988	48993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759035
1080	NC_003198	GAG	2	6	49020	49025	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16759035
1081	NC_003198	GACCA	2	10	49038	49047	40 %	0 %	20 %	40 %	16759035
1082	NC_003198	A	6	6	49130	49135	100 %	0 %	0 %	0 %	16759035
1083	NC_003198	GTCGTA	2	12	49205	49216	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16759035
1084	NC_003198	CG	4	8	49306	49313	0 %	0 %	50 %	50 %	16759035
1085	NC_003198	AAGT	2	8	49332	49339	50 %	25 %	25 %	0 %	16759035
1086	NC_003198	CCAG	2	8	49390	49397	25 %	0 %	25 %	50 %	16759035
1087	NC_003198	CG	3	6	49519	49524	0 %	0 %	50 %	50 %	16759035
1088	NC_003198	AAG	2	6	49560	49565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16759035
1089	NC_003198	GCG	2	6	49595	49600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759035
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1091	NC_003198	CAT	2	6	49685	49690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759035
1092	NC_003198	CGG	2	6	49691	49696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759035
1093	NC_003198	AGT	2	6	49759	49764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759035
1094	NC_003198	GTT	2	6	49835	49840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16759035
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1097	NC_003198	TG	3	6	50137	50142	0 %	50 %	50 %	0 %	16759035
1098	NC_003198	TTGA	2	8	50171	50178	25 %	50 %	25 %	0 %	16759035
1099	NC_003198	TGG	2	6	50214	50219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759035
1100	NC_003198	TGC	2	6	50364	50369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759035
1101	NC_003198	CAGAC	2	10	50370	50379	40 %	0 %	20 %	40 %	16759035
1102	NC_003198	TTG	2	6	50390	50395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16759035
1103	NC_003198	TGG	2	6	50407	50412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759035
1104	NC_003198	CCT	2	6	50415	50420	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1105	NC_003198	TCT	2	6	50479	50484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16759036
1106	NC_003198	GAAA	2	8	50506	50513	75 %	0 %	25 %	0 %	16759036
1107	NC_003198	GCA	2	6	50589	50594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759036
1108	NC_003198	GGC	2	6	50639	50644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759036
1109	NC_003198	GGC	2	6	50816	50821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759036
1110	NC_003198	TGT	2	6	50836	50841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16759036
1111	NC_003198	GCCA	2	8	50847	50854	25 %	0 %	25 %	50 %	16759036
1112	NC_003198	CAT	2	6	50855	50860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759036
1113	NC_003198	CGC	2	6	50863	50868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759036
1114	NC_003198	CAG	2	6	50882	50887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759036
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1122	NC_003198	T	7	7	51124	51130	0 %	100 %	0 %	0 %	16759036
1123	NC_003198	GC	3	6	51205	51210	0 %	0 %	50 %	50 %	16759036
1124	NC_003198	TAAA	2	8	51240	51247	75 %	25 %	0 %	0 %	16759036
1125	NC_003198	ATC	2	6	51257	51262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759036
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1127	NC_003198	TAA	2	6	51308	51313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16759036
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1246	NC_003198	GTG	2	6	57253	57258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1247	NC_003198	TTCAC	2	10	57378	57387	20 %	40 %	0 %	40 %	16759042
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1253	NC_003198	AAAG	2	8	57517	57524	75 %	0 %	25 %	0 %	16759042
1254	NC_003198	CGC	2	6	57544	57549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759042
1255	NC_003198	GGC	2	6	57604	57609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759042
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