MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. CT18

Total Repeats: 101023

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_003198	GCC	2	6	516398	516403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759446
11002	NC_003198	GCTG	2	8	516440	516447	0 %	25 %	50 %	25 %	16759446
11003	NC_003198	GTAC	2	8	516480	516487	25 %	25 %	25 %	25 %	16759446
11004	NC_003198	CG	3	6	516551	516556	0 %	0 %	50 %	50 %	16759446
11005	NC_003198	TTC	2	6	516559	516564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16759446
11006	NC_003198	TATT	2	8	516598	516605	25 %	75 %	0 %	0 %	16759446
11007	NC_003198	GGC	2	6	516636	516641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759446
11008	NC_003198	CGG	2	6	516679	516684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759446
11009	NC_003198	GCG	2	6	516700	516705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759446
11010	NC_003198	CGA	3	9	516709	516717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759446
11011	NC_003198	TCT	2	6	516753	516758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16759446
11012	NC_003198	ACC	2	6	516867	516872	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16759447
11013	NC_003198	CAC	2	6	516947	516952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16759447
11014	NC_003198	TGC	2	6	516970	516975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759447
11015	NC_003198	CCG	2	6	516999	517004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759447
11016	NC_003198	CGC	2	6	517013	517018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759447
11017	NC_003198	CGA	2	6	517084	517089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759447
11018	NC_003198	ATA	2	6	517128	517133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16759447
11019	NC_003198	G	6	6	517171	517176	0 %	0 %	100 %	0 %	16759447
11020	NC_003198	CAGGT	2	10	517324	517333	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
11021	NC_003198	GGAA	2	8	517336	517343	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11022	NC_003198	CCCA	2	8	517391	517398	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
11023	NC_003198	CTG	2	6	517425	517430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11024	NC_003198	AAT	2	6	517603	517608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16759448
11025	NC_003198	GCG	2	6	517611	517616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759448
11026	NC_003198	ACATCC	2	12	517667	517678	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	16759448
11027	NC_003198	TCA	2	6	517721	517726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759448
11028	NC_003198	GC	3	6	517770	517775	0 %	0 %	50 %	50 %	16759448
11029	NC_003198	CAG	2	6	517849	517854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759448
11030	NC_003198	GATT	2	8	517905	517912	25 %	50 %	25 %	0 %	16759448
11031	NC_003198	TGT	2	6	517919	517924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16759448
11032	NC_003198	GAT	2	6	517972	517977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759448
11033	NC_003198	CAGC	2	8	518013	518020	25 %	0 %	25 %	50 %	16759448
11034	NC_003198	GAAAG	2	10	518039	518048	60 %	0 %	40 %	0 %	16759448
11035	NC_003198	GCT	2	6	518101	518106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759448
11036	NC_003198	CAGC	2	8	518217	518224	25 %	0 %	25 %	50 %	16759448
11037	NC_003198	CCG	2	6	518241	518246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759448
11038	NC_003198	AGCGG	2	10	518285	518294	20 %	0 %	60 %	20 %	16759448
11039	NC_003198	GAA	2	6	518400	518405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16759448
11040	NC_003198	GCT	2	6	518425	518430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759448
11041	NC_003198	AAT	2	6	518458	518463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16759448
11042	NC_003198	ATC	2	6	518522	518527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759448
11043	NC_003198	GCC	2	6	518552	518557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759448
11044	NC_003198	CT	3	6	518654	518659	0 %	50 %	0 %	50 %	16759448
11045	NC_003198	GAG	2	6	518669	518674	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16759448
11046	NC_003198	GCG	2	6	518737	518742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759448
11047	NC_003198	GCT	2	6	518761	518766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759448
11048	NC_003198	AGG	2	6	518784	518789	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16759448
11049	NC_003198	T	6	6	518883	518888	0 %	100 %	0 %	0 %	16759448
11050	NC_003198	GCCA	2	8	518903	518910	25 %	0 %	25 %	50 %	16759448
11051	NC_003198	GACA	2	8	518935	518942	50 %	0 %	25 %	25 %	16759448
11052	NC_003198	GCC	2	6	519119	519124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11053	NC_003198	TGTTA	2	10	519182	519191	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
11054	NC_003198	GA	3	6	519202	519207	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11055	NC_003198	CGT	2	6	519245	519250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759449
11056	NC_003198	TCA	2	6	519360	519365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759449
11057	NC_003198	AAATG	2	10	519472	519481	60 %	20 %	20 %	0 %	16759449
11058	NC_003198	AAC	2	6	519510	519515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16759450
11059	NC_003198	A	7	7	519605	519611	100 %	0 %	0 %	0 %	16759450
11060	NC_003198	A	6	6	519618	519623	100 %	0 %	0 %	0 %	16759450
11061	NC_003198	AGGG	2	8	519653	519660	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
11062	NC_003198	T	6	6	519668	519673	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11063	NC_003198	GGCT	2	8	519680	519687	0 %	25 %	50 %	25 %	16759451
11064	NC_003198	T	6	6	519746	519751	0 %	100 %	0 %	0 %	16759451
11065	NC_003198	GAA	2	6	519791	519796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16759451
11066	NC_003198	G	6	6	519813	519818	0 %	0 %	100 %	0 %	16759451
11067	NC_003198	AGA	2	6	519914	519919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16759451
11068	NC_003198	ATAA	2	8	519934	519941	75 %	25 %	0 %	0 %	16759451
11069	NC_003198	CAC	2	6	519942	519947	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16759451
11070	NC_003198	CCA	2	6	519965	519970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16759451
11071	NC_003198	GCA	2	6	519983	519988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759451
11072	NC_003198	ATAA	2	8	520027	520034	75 %	25 %	0 %	0 %	16759451
11073	NC_003198	TCA	2	6	520105	520110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759451
11074	NC_003198	GTA	2	6	520178	520183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11075	NC_003198	A	6	6	520214	520219	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11076	NC_003198	T	6	6	520269	520274	0 %	100 %	0 %	0 %	16759452
11077	NC_003198	ACG	2	6	520303	520308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759452
11078	NC_003198	T	6	6	520321	520326	0 %	100 %	0 %	0 %	16759452
11079	NC_003198	CAC	2	6	520329	520334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16759452
11080	NC_003198	CGA	3	9	520346	520354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759452
11081	NC_003198	ACG	2	6	520384	520389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759452
11082	NC_003198	GGAA	2	8	520616	520623	50 %	0 %	50 %	0 %	16759452
11083	NC_003198	TTAT	2	8	520681	520688	25 %	75 %	0 %	0 %	16759452
11084	NC_003198	TCA	2	6	520690	520695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759452
11085	NC_003198	GTA	2	6	520699	520704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759452
11086	NC_003198	GATG	2	8	520715	520722	25 %	25 %	50 %	0 %	16759452
11087	NC_003198	TCGG	2	8	520762	520769	0 %	25 %	50 %	25 %	16759452
11088	NC_003198	T	6	6	520793	520798	0 %	100 %	0 %	0 %	16759452
11089	NC_003198	CG	3	6	520815	520820	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11090	NC_003198	TGG	2	6	520828	520833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11091	NC_003198	AAT	2	6	520853	520858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11092	NC_003198	TTA	2	6	520930	520935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11093	NC_003198	GAG	2	6	520944	520949	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11094	NC_003198	GAAT	2	8	520998	521005	50 %	25 %	25 %	0 %	16759453
11095	NC_003198	CAGC	2	8	521088	521095	25 %	0 %	25 %	50 %	16759453
11096	NC_003198	ATTT	2	8	521115	521122	25 %	75 %	0 %	0 %	16759453
11097	NC_003198	AAT	2	6	521178	521183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16759453
11098	NC_003198	TAA	2	6	521230	521235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11099	NC_003198	TGG	2	6	521268	521273	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759454
11100	NC_003198	AAC	2	6	521283	521288	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16759454
11101	NC_003198	GCT	2	6	521347	521352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759454
11102	NC_003198	AAC	2	6	521354	521359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16759454
11103	NC_003198	GTC	2	6	521368	521373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759454
11104	NC_003198	ATCT	2	8	521383	521390	25 %	50 %	0 %	25 %	16759454
11105	NC_003198	CAAT	2	8	521394	521401	50 %	25 %	0 %	25 %	16759454
11106	NC_003198	CTG	2	6	521484	521489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759454
11107	NC_003198	TTC	2	6	521521	521526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16759454
11108	NC_003198	AACT	2	8	521668	521675	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11109	NC_003198	A	6	6	521724	521729	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11110	NC_003198	GT	3	6	521774	521779	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11111	NC_003198	GTCG	2	8	521811	521818	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11112	NC_003198	T	6	6	521866	521871	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11113	NC_003198	TTAA	2	8	521937	521944	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11114	NC_003198	TTA	2	6	522010	522015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11115	NC_003198	A	6	6	522023	522028	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11116	NC_003198	AATC	2	8	522030	522037	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11117	NC_003198	A	6	6	522069	522074	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11118	NC_003198	GCG	3	9	522163	522171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759455
11119	NC_003198	ACC	2	6	522173	522178	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16759455
11120	NC_003198	GAA	2	6	522181	522186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16759455
11121	NC_003198	GAA	2	6	522196	522201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16759455
11122	NC_003198	TACC	2	8	522246	522253	25 %	25 %	0 %	50 %	16759455
11123	NC_003198	GC	3	6	522261	522266	0 %	0 %	50 %	50 %	16759455
11124	NC_003198	TCA	2	6	522327	522332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759455
11125	NC_003198	CTT	2	6	522390	522395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16759455
11126	NC_003198	CGA	2	6	522420	522425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759455
11127	NC_003198	TTC	2	6	522437	522442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16759455
11128	NC_003198	CGT	2	6	522486	522491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759455
11129	NC_003198	AGTC	2	8	522493	522500	25 %	25 %	25 %	25 %	16759455
11130	NC_003198	CAG	2	6	522517	522522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759455
11131	NC_003198	AAC	2	6	522544	522549	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16759455
11132	NC_003198	GCC	2	6	522590	522595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759455
11133	NC_003198	GAC	2	6	522607	522612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759455
11134	NC_003198	CAGGG	2	10	522631	522640	20 %	0 %	60 %	20 %	16759455
11135	NC_003198	TTC	2	6	522721	522726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16759455
11136	NC_003198	CAT	2	6	522727	522732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759455
11137	NC_003198	GCC	2	6	522764	522769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759455
11138	NC_003198	ATC	2	6	522904	522909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759455
11139	NC_003198	TTC	2	6	522950	522955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16759455
11140	NC_003198	CGAT	2	8	522965	522972	25 %	25 %	25 %	25 %	16759455
11141	NC_003198	GCC	2	6	522991	522996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759455
11142	NC_003198	TGC	2	6	523000	523005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759455
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11145	NC_003198	TCAA	2	8	523202	523209	50 %	25 %	0 %	25 %	16759455
11146	NC_003198	CAA	2	6	523242	523247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16759455
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11148	NC_003198	TGCG	2	8	523496	523503	0 %	25 %	50 %	25 %	16759455
11149	NC_003198	CGG	2	6	523518	523523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759455
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11151	NC_003198	ACGA	2	8	523585	523592	50 %	0 %	25 %	25 %	16759455
11152	NC_003198	CGA	3	9	523608	523616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759455
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11156	NC_003198	TCG	2	6	523773	523778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759455
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11163	NC_003198	CTT	2	6	523989	523994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16759455
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11172	NC_003198	TAGCGG	2	12	524343	524354	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	16759455
11173	NC_003198	GCTG	2	8	524402	524409	0 %	25 %	50 %	25 %	16759455
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11186	NC_003198	CTG	2	6	525132	525137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759455
11187	NC_003198	TCG	2	6	525147	525152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759455
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11189	NC_003198	ATG	4	12	525200	525211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759455
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11191	NC_003198	TTAAG	2	10	525276	525285	40 %	40 %	20 %	0 %	16759456
11192	NC_003198	TGTT	2	8	525324	525331	0 %	75 %	25 %	0 %	16759456
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11194	NC_003198	GTCA	2	8	525422	525429	25 %	25 %	25 %	25 %	16759456
11195	NC_003198	CGA	2	6	525460	525465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759456
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11217	NC_003198	TAT	2	6	526545	526550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11218	NC_003198	TACA	2	8	526564	526571	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11219	NC_003198	ATGT	2	8	526579	526586	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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11233	NC_003198	CTG	2	6	527207	527212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759457
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11237	NC_003198	ATT	2	6	527347	527352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11238	NC_003198	TTA	2	6	527431	527436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16759458
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11240	NC_003198	CTG	2	6	527457	527462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759458
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11242	NC_003198	A	6	6	527686	527691	100 %	0 %	0 %	0 %	16759458
11243	NC_003198	ATG	3	9	527737	527745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759458
11244	NC_003198	GAT	2	6	527811	527816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759458
11245	NC_003198	CAGC	2	8	527852	527859	25 %	0 %	25 %	50 %	16759458
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11247	NC_003198	GCT	2	6	528014	528019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759458
11248	NC_003198	AGG	2	6	528148	528153	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16759458
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11250	NC_003198	AGG	2	6	528196	528201	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16759458
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11252	NC_003198	GCA	2	6	528323	528328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759458
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11353	NC_003198	TGAT	2	8	532911	532918	25 %	50 %	25 %	0 %	16759461
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11356	NC_003198	CTGA	2	8	533038	533045	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11357	NC_003198	AT	3	6	533084	533089	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11358	NC_003198	CAG	2	6	533107	533112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759462
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11360	NC_003198	TGGGC	2	10	533319	533328	0 %	20 %	60 %	20 %	16759462
11361	NC_003198	CTG	2	6	533473	533478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759462
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11365	NC_003198	TCA	3	9	533552	533560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759462
11366	NC_003198	GCG	2	6	533576	533581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759462
11367	NC_003198	AGC	2	6	533582	533587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759462
11368	NC_003198	AG	3	6	533673	533678	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11369	NC_003198	CGT	2	6	533807	533812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759463
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11372	NC_003198	CG	3	6	533893	533898	0 %	0 %	50 %	50 %	16759463
11373	NC_003198	CTG	2	6	533925	533930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759463
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11376	NC_003198	CTG	2	6	534075	534080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759463
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11383	NC_003198	CTGA	2	8	534414	534421	25 %	25 %	25 %	25 %	16759463
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11493	NC_003198	GAC	2	6	539524	539529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759467
11494	NC_003198	TGG	2	6	539568	539573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759467
11495	NC_003198	ATC	2	6	539577	539582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759467
11496	NC_003198	CGC	2	6	539592	539597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759467
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