MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. CT18

Total Repeats: 101023

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_003198	CGCC	2	8	22660	22667	0 %	0 %	25 %	75 %	16759013
502	NC_003198	GGC	2	6	22686	22691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759013
503	NC_003198	AGA	2	6	22706	22711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16759013
504	NC_003198	CGG	2	6	22748	22753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759013
505	NC_003198	T	6	6	22758	22763	0 %	100 %	0 %	0 %	16759013
506	NC_003198	CT	3	6	22800	22805	0 %	50 %	0 %	50 %	16759013
507	NC_003198	GGT	2	6	22953	22958	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759013
508	NC_003198	CTA	2	6	22960	22965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759013
509	NC_003198	CGG	2	6	23000	23005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759013
510	NC_003198	CTGG	2	8	23006	23013	0 %	25 %	50 %	25 %	16759013
511	NC_003198	TAT	2	6	23031	23036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16759013
512	NC_003198	GCT	2	6	23037	23042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759013
513	NC_003198	ATA	2	6	23057	23062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16759013
514	NC_003198	TTA	2	6	23172	23177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_003198	TCTTAA	2	12	23209	23220	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
516	NC_003198	TTAT	2	8	23271	23278	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_003198	A	7	7	23344	23350	100 %	0 %	0 %	0 %	16759014
518	NC_003198	TGA	2	6	23351	23356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759014
519	NC_003198	ACG	2	6	23357	23362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759014
520	NC_003198	ATA	2	6	23375	23380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16759014
521	NC_003198	TTA	2	6	23389	23394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16759014
522	NC_003198	CTTTT	2	10	23399	23408	0 %	80 %	0 %	20 %	16759014
523	NC_003198	T	6	6	23405	23410	0 %	100 %	0 %	0 %	16759014
524	NC_003198	CAG	2	6	23413	23418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759014
525	NC_003198	TTG	2	6	23458	23463	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16759014
526	NC_003198	TTTA	2	8	23504	23511	25 %	75 %	0 %	0 %	16759014
527	NC_003198	ATG	2	6	23519	23524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759014
528	NC_003198	TTTC	2	8	23558	23565	0 %	75 %	0 %	25 %	16759014
529	NC_003198	TGA	2	6	23571	23576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759014
530	NC_003198	AT	3	6	23588	23593	50 %	50 %	0 %	0 %	16759014
531	NC_003198	CG	3	6	23658	23663	0 %	0 %	50 %	50 %	16759014
532	NC_003198	ACG	2	6	23759	23764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759014
533	NC_003198	TGA	2	6	23795	23800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759014
534	NC_003198	GC	4	8	23801	23808	0 %	0 %	50 %	50 %	16759014
535	NC_003198	GCT	2	6	23853	23858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759014
536	NC_003198	TCTG	2	8	23961	23968	0 %	50 %	25 %	25 %	16759014
537	NC_003198	A	7	7	23973	23979	100 %	0 %	0 %	0 %	16759014
538	NC_003198	GGC	2	6	24005	24010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759014
539	NC_003198	AT	3	6	24062	24067	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_003198	TAA	2	6	24101	24106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_003198	AAG	2	6	24128	24133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
542	NC_003198	ATT	2	6	24134	24139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_003198	ACA	2	6	24201	24206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_003198	GAT	2	6	24238	24243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
545	NC_003198	TAA	2	6	24265	24270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_003198	TAA	2	6	24272	24277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_003198	ACG	2	6	24312	24317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_003198	AAG	2	6	24359	24364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
549	NC_003198	T	6	6	24369	24374	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_003198	GAA	2	6	24403	24408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
551	NC_003198	CAG	2	6	24413	24418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_003198	A	6	6	24429	24434	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_003198	TGAA	2	8	24470	24477	50 %	25 %	25 %	0 %	16759015
554	NC_003198	TGT	2	6	24525	24530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16759015
555	NC_003198	TAC	2	6	24547	24552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759015
556	NC_003198	CGGTA	2	10	24565	24574	20 %	20 %	40 %	20 %	16759015
557	NC_003198	CGC	2	6	24598	24603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759015
558	NC_003198	CTGTT	2	10	24604	24613	0 %	60 %	20 %	20 %	16759015
559	NC_003198	GGC	2	6	24685	24690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759015
560	NC_003198	AGA	2	6	24700	24705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16759015
561	NC_003198	CCAG	2	8	24741	24748	25 %	0 %	25 %	50 %	16759015
562	NC_003198	GCG	2	6	24752	24757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759015
563	NC_003198	CAG	2	6	24773	24778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759015
564	NC_003198	CGA	2	6	24828	24833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759015
565	NC_003198	T	7	7	25029	25035	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_003198	CG	3	6	25068	25073	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
567	NC_003198	A	8	8	25119	25126	100 %	0 %	0 %	0 %	16759016
568	NC_003198	ATT	2	6	25145	25150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16759016
569	NC_003198	CTG	2	6	25155	25160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759016
570	NC_003198	CGG	2	6	25162	25167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759016
571	NC_003198	CCT	2	6	25249	25254	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16759016
572	NC_003198	ATT	2	6	25260	25265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16759016
573	NC_003198	TTC	2	6	25268	25273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16759016
574	NC_003198	T	7	7	25285	25291	0 %	100 %	0 %	0 %	16759016
575	NC_003198	CGC	2	6	25348	25353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759016
576	NC_003198	CT	3	6	25354	25359	0 %	50 %	0 %	50 %	16759016
577	NC_003198	A	6	6	25374	25379	100 %	0 %	0 %	0 %	16759016
578	NC_003198	AT	3	6	25384	25389	50 %	50 %	0 %	0 %	16759016
579	NC_003198	TAT	2	6	25394	25399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16759016
580	NC_003198	ACCG	2	8	25418	25425	25 %	0 %	25 %	50 %	16759016
581	NC_003198	TTTA	2	8	25441	25448	25 %	75 %	0 %	0 %	16759016
582	NC_003198	TAC	2	6	25635	25640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759016
583	NC_003198	A	6	6	25671	25676	100 %	0 %	0 %	0 %	16759016
584	NC_003198	CCG	2	6	25695	25700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759016
585	NC_003198	ACG	2	6	25770	25775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759016
586	NC_003198	ATG	2	6	25799	25804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759016
587	NC_003198	GCGCCT	2	12	25891	25902	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
588	NC_003198	TCTG	2	8	25935	25942	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
589	NC_003198	GGC	2	6	25992	25997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_003198	GAC	2	6	26073	26078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_003198	GC	3	6	26087	26092	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
592	NC_003198	GCCT	2	8	26116	26123	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
593	NC_003198	GGC	3	9	26184	26192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_003198	GCC	2	6	26227	26232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
595	NC_003198	GCA	2	6	26253	26258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_003198	GGC	2	6	26283	26288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_003198	GGC	2	6	26401	26406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_003198	ACT	2	6	26474	26479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_003198	GCG	2	6	26498	26503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_003198	AGCGAC	2	12	26512	26523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_003198	GCA	2	6	26526	26531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_003198	ATT	2	6	26610	26615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_003198	CCTT	2	8	26622	26629	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
604	NC_003198	GAC	2	6	26653	26658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_003198	CAT	2	6	26751	26756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_003198	GCC	2	6	26772	26777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
607	NC_003198	CCG	2	6	26810	26815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
608	NC_003198	GCG	2	6	26819	26824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_003198	CCG	2	6	26885	26890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
610	NC_003198	GGC	2	6	26912	26917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_003198	GCG	2	6	26926	26931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_003198	TAG	2	6	26955	26960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
613	NC_003198	TCAG	2	8	26981	26988	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
614	NC_003198	GCG	2	6	27077	27082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_003198	ATA	2	6	27146	27151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_003198	GAT	2	6	27265	27270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
617	NC_003198	ATT	2	6	27347	27352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_003198	TAT	2	6	27361	27366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_003198	AGG	2	6	27370	27375	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
620	NC_003198	ATCA	2	8	27394	27401	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
621	NC_003198	TTA	2	6	27428	27433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_003198	TGA	2	6	27462	27467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
623	NC_003198	TTG	2	6	27478	27483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
624	NC_003198	ACA	2	6	27533	27538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_003198	ATG	3	9	27620	27628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
626	NC_003198	ACT	2	6	27720	27725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_003198	ACA	2	6	27746	27751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_003198	GCG	2	6	27788	27793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_003198	CAG	2	6	27868	27873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_003198	GCG	2	6	27890	27895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_003198	TGG	2	6	27899	27904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
632	NC_003198	AGCC	2	8	27928	27935	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
633	NC_003198	CG	3	6	28017	28022	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
634	NC_003198	GGT	2	6	28032	28037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
635	NC_003198	CGA	2	6	28046	28051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_003198	TGA	2	6	28095	28100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
637	NC_003198	TGA	2	6	28110	28115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
638	NC_003198	CCGA	2	8	28135	28142	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
639	NC_003198	GC	3	6	28145	28150	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
640	NC_003198	GCGT	2	8	28181	28188	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
641	NC_003198	ACGGTG	2	12	28237	28248	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
642	NC_003198	TTG	2	6	28271	28276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
643	NC_003198	GCGTC	2	10	28361	28370	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
644	NC_003198	ATC	2	6	28373	28378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
645	NC_003198	TC	3	6	28377	28382	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
646	NC_003198	TCC	2	6	28384	28389	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
647	NC_003198	CTG	2	6	28453	28458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759017
648	NC_003198	GT	3	6	28495	28500	0 %	50 %	50 %	0 %	16759017
649	NC_003198	ATTA	2	8	28528	28535	50 %	50 %	0 %	0 %	16759017
650	NC_003198	A	6	6	28595	28600	100 %	0 %	0 %	0 %	16759017
651	NC_003198	GT	3	6	28624	28629	0 %	50 %	50 %	0 %	16759017
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653	NC_003198	TTC	2	6	28764	28769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16759017
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