MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. CT18

Total Repeats: 101023

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_003198	AATA	2	8	279979	279986	75 %	25 %	0 %	0 %	16759232
6002	NC_003198	TCC	2	6	279987	279992	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6003	NC_003198	CT	3	6	280029	280034	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6004	NC_003198	TTAC	2	8	280088	280095	25 %	50 %	0 %	25 %	16759233
6005	NC_003198	ACT	2	6	280289	280294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759233
6006	NC_003198	AC	3	6	280324	280329	50 %	0 %	0 %	50 %	16759233
6007	NC_003198	CGG	2	6	280337	280342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759233
6008	NC_003198	CA	3	6	280411	280416	50 %	0 %	0 %	50 %	16759233
6009	NC_003198	TGC	2	6	280429	280434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759233
6010	NC_003198	TC	3	6	280450	280455	0 %	50 %	0 %	50 %	16759233
6011	NC_003198	TTG	2	6	280567	280572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6012	NC_003198	TAA	2	6	280625	280630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6013	NC_003198	CAA	2	6	280751	280756	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6014	NC_003198	ACG	2	6	280834	280839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759234
6015	NC_003198	TCG	2	6	280856	280861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759234
6016	NC_003198	GC	4	8	280977	280984	0 %	0 %	50 %	50 %	16759234
6017	NC_003198	AGC	2	6	281154	281159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759234
6018	NC_003198	CAA	2	6	281331	281336	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16759234
6019	NC_003198	AGT	2	6	281373	281378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759234
6020	NC_003198	GGC	2	6	281419	281424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759234
6021	NC_003198	CGAT	2	8	281432	281439	25 %	25 %	25 %	25 %	16759234
6022	NC_003198	ATTA	2	8	281488	281495	50 %	50 %	0 %	0 %	16759234
6023	NC_003198	TCT	2	6	281507	281512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16759234
6024	NC_003198	TTCA	2	8	281566	281573	25 %	50 %	0 %	25 %	16759234
6025	NC_003198	CGC	2	6	281583	281588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759234
6026	NC_003198	CAG	2	6	281593	281598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759234
6027	NC_003198	CCA	2	6	281601	281606	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16759234
6028	NC_003198	CAG	2	6	281638	281643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759234
6029	NC_003198	T	6	6	281655	281660	0 %	100 %	0 %	0 %	16759234
6030	NC_003198	CCA	2	6	281682	281687	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16759234
6031	NC_003198	CGC	2	6	281740	281745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759234
6032	NC_003198	GC	3	6	281747	281752	0 %	0 %	50 %	50 %	16759234
6033	NC_003198	GCG	2	6	281760	281765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759234
6034	NC_003198	CGC	2	6	281832	281837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759234
6035	NC_003198	GCC	2	6	281872	281877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759234
6036	NC_003198	CG	3	6	281902	281907	0 %	0 %	50 %	50 %	16759234
6037	NC_003198	TCA	2	6	282012	282017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759234
6038	NC_003198	CG	3	6	282024	282029	0 %	0 %	50 %	50 %	16759234
6039	NC_003198	TCA	2	6	282059	282064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759234
6040	NC_003198	GAA	2	6	282085	282090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16759234
6041	NC_003198	CTT	2	6	282147	282152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16759234
6042	NC_003198	GCA	2	6	282201	282206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759234
6043	NC_003198	CT	3	6	282236	282241	0 %	50 %	0 %	50 %	16759234
6044	NC_003198	GGCT	2	8	282253	282260	0 %	25 %	50 %	25 %	16759234
6045	NC_003198	GTT	2	6	282295	282300	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16759234
6046	NC_003198	CACG	2	8	282309	282316	25 %	0 %	25 %	50 %	16759234
6047	NC_003198	T	6	6	282328	282333	0 %	100 %	0 %	0 %	16759234
6048	NC_003198	TA	3	6	282363	282368	50 %	50 %	0 %	0 %	16759234
6049	NC_003198	ATC	2	6	282389	282394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759234
6050	NC_003198	GC	3	6	282398	282403	0 %	0 %	50 %	50 %	16759234
6051	NC_003198	TGG	2	6	282413	282418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759234
6052	NC_003198	TGT	2	6	282483	282488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16759234
6053	NC_003198	A	7	7	282536	282542	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6054	NC_003198	AAAT	2	8	282740	282747	75 %	25 %	0 %	0 %	16759235
6055	NC_003198	CGT	2	6	282777	282782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759235
6056	NC_003198	GGC	3	9	282852	282860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759235
6057	NC_003198	CCA	2	6	282902	282907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16759235
6058	NC_003198	CCA	2	6	282920	282925	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16759235
6059	NC_003198	CT	3	6	282955	282960	0 %	50 %	0 %	50 %	16759235
6060	NC_003198	GCC	2	6	283085	283090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759235
6061	NC_003198	GCC	2	6	283092	283097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759235
6062	NC_003198	TGA	2	6	283108	283113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759235
6063	NC_003198	CGC	2	6	283199	283204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759235
6064	NC_003198	GACCA	2	10	283215	283224	40 %	0 %	20 %	40 %	16759235
6065	NC_003198	GCT	2	6	283293	283298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759235
6066	NC_003198	AGC	2	6	283348	283353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759236
6067	NC_003198	GCA	2	6	283384	283389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759236
6068	NC_003198	GC	3	6	283436	283441	0 %	0 %	50 %	50 %	16759236
6069	NC_003198	CGC	2	6	283489	283494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759236
6070	NC_003198	AAC	2	6	283654	283659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16759236
6071	NC_003198	ATA	2	6	283701	283706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16759236
6072	NC_003198	AATG	2	8	283714	283721	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6073	NC_003198	AAT	2	6	283787	283792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6074	NC_003198	CGC	2	6	283838	283843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759237
6075	NC_003198	TCA	2	6	283876	283881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759237
6076	NC_003198	T	6	6	283902	283907	0 %	100 %	0 %	0 %	16759237
6077	NC_003198	CTGG	2	8	284013	284020	0 %	25 %	50 %	25 %	16759237
6078	NC_003198	TGA	2	6	284033	284038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759237
6079	NC_003198	GCG	2	6	284081	284086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759237
6080	NC_003198	CAA	2	6	284096	284101	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16759237
6081	NC_003198	CGA	2	6	284123	284128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759237
6082	NC_003198	GCA	4	12	284189	284200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759237
6083	NC_003198	GGTCG	2	10	284217	284226	0 %	20 %	60 %	20 %	16759237
6084	NC_003198	GATTT	2	10	284269	284278	20 %	60 %	20 %	0 %	16759237
6085	NC_003198	T	7	7	284276	284282	0 %	100 %	0 %	0 %	16759237
6086	NC_003198	TTTC	2	8	284471	284478	0 %	75 %	0 %	25 %	16759237
6087	NC_003198	TGC	2	6	284506	284511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759237
6088	NC_003198	TTTGAA	2	12	284619	284630	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	16759237
6089	NC_003198	TGTGT	2	10	284659	284668	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
6090	NC_003198	TAAA	2	8	284723	284730	75 %	25 %	0 %	0 %	16759238
6091	NC_003198	TCA	2	6	284761	284766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759238
6092	NC_003198	GCC	2	6	284816	284821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759238
6093	NC_003198	GCC	2	6	284834	284839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759238
6094	NC_003198	ACCAG	2	10	284889	284898	40 %	0 %	20 %	40 %	16759238
6095	NC_003198	GCG	2	6	284938	284943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759238
6096	NC_003198	TCGC	2	8	284953	284960	0 %	25 %	25 %	50 %	16759238
6097	NC_003198	AAC	2	6	284991	284996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16759238
6098	NC_003198	GGCGC	2	10	285024	285033	0 %	0 %	60 %	40 %	16759238
6099	NC_003198	ATT	2	6	285084	285089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16759238
6100	NC_003198	ATC	2	6	285102	285107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759238
6101	NC_003198	GAT	2	6	285119	285124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759238
6102	NC_003198	ACC	2	6	285150	285155	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16759238
6103	NC_003198	AG	3	6	285158	285163	50 %	0 %	50 %	0 %	16759238
6104	NC_003198	GAA	2	6	285251	285256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16759238
6105	NC_003198	CAT	2	6	285311	285316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759238
6106	NC_003198	TCT	2	6	285388	285393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16759239
6107	NC_003198	TG	3	6	285394	285399	0 %	50 %	50 %	0 %	16759239
6108	NC_003198	CCGC	2	8	285436	285443	0 %	0 %	25 %	75 %	16759239
6109	NC_003198	ATA	2	6	285463	285468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16759239
6110	NC_003198	ACG	2	6	285486	285491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759239
6111	NC_003198	CG	3	6	285490	285495	0 %	0 %	50 %	50 %	16759239
6112	NC_003198	AGC	2	6	285505	285510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759239
6113	NC_003198	GCA	2	6	285545	285550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759239
6114	NC_003198	GCG	2	6	285647	285652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759239
6115	NC_003198	TGA	2	6	285710	285715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759239
6116	NC_003198	GAC	2	6	285785	285790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759239
6117	NC_003198	GTC	2	6	285826	285831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759239
6118	NC_003198	GC	3	6	285842	285847	0 %	0 %	50 %	50 %	16759239
6119	NC_003198	TGG	2	6	285848	285853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759239
6120	NC_003198	CG	3	6	285891	285896	0 %	0 %	50 %	50 %	16759239
6121	NC_003198	CCG	2	6	285922	285927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759239
6122	NC_003198	CAG	2	6	285978	285983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759239
6123	NC_003198	GT	3	6	286016	286021	0 %	50 %	50 %	0 %	16759239
6124	NC_003198	AG	3	6	286068	286073	50 %	0 %	50 %	0 %	16759239
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6126	NC_003198	AAGT	2	8	286191	286198	50 %	25 %	25 %	0 %	16759239
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6383	NC_003198	GTG	2	6	300279	300284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759248
6384	NC_003198	ATTG	2	8	300324	300331	25 %	50 %	25 %	0 %	16759248
6385	NC_003198	TCA	2	6	300347	300352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759248
6386	NC_003198	ACTGG	2	10	300453	300462	20 %	20 %	40 %	20 %	16759248
6387	NC_003198	AGGG	2	8	300527	300534	25 %	0 %	75 %	0 %	16759248
6388	NC_003198	CGCTTA	2	12	300605	300616	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16759248
6389	NC_003198	ATA	2	6	300629	300634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16759248
6390	NC_003198	GC	4	8	300748	300755	0 %	0 %	50 %	50 %	16759249
6391	NC_003198	TCA	2	6	300760	300765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759249
6392	NC_003198	ACCCAT	2	12	300802	300813	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	16759249
6393	NC_003198	GCA	2	6	300835	300840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759249
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6395	NC_003198	TTC	2	6	300904	300909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16759249
6396	NC_003198	CGA	2	6	301001	301006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759249
6397	NC_003198	CGC	2	6	301008	301013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759249
6398	NC_003198	TGG	2	6	301034	301039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759249
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6400	NC_003198	ACC	2	6	301101	301106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16759249
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6403	NC_003198	ATT	2	6	301314	301319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16759250
6404	NC_003198	CGT	2	6	301347	301352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759250
6405	NC_003198	CAA	2	6	301361	301366	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16759250
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6407	NC_003198	CTG	2	6	301443	301448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759250
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6409	NC_003198	GATA	2	8	301685	301692	50 %	25 %	25 %	0 %	16759250
6410	NC_003198	GA	3	6	301798	301803	50 %	0 %	50 %	0 %	16759250
6411	NC_003198	GCA	2	6	301811	301816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759250
6412	NC_003198	GCCAG	2	10	301846	301855	20 %	0 %	40 %	40 %	16759250
6413	NC_003198	GCTG	2	8	301889	301896	0 %	25 %	50 %	25 %	16759250
6414	NC_003198	ATC	2	6	301983	301988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6415	NC_003198	GCA	2	6	302004	302009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6416	NC_003198	CCTG	2	8	302119	302126	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6417	NC_003198	CCGT	2	8	302154	302161	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6418	NC_003198	A	7	7	302208	302214	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6419	NC_003198	T	8	8	302240	302247	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6420	NC_003198	AAG	2	6	302255	302260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6421	NC_003198	CTT	2	6	302331	302336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6422	NC_003198	CAT	2	6	302483	302488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759251
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6424	NC_003198	GCT	2	6	302599	302604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759251
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6426	NC_003198	CAT	2	6	302655	302660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759251
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6441	NC_003198	TG	3	6	303262	303267	0 %	50 %	50 %	0 %	16759252
6442	NC_003198	CTG	2	6	303297	303302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759252
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6445	NC_003198	G	6	6	303440	303445	0 %	0 %	100 %	0 %	16759252
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6449	NC_003198	GC	3	6	303648	303653	0 %	0 %	50 %	50 %	16759253
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6457	NC_003198	CAGC	2	8	304198	304205	25 %	0 %	25 %	50 %	16759253
6458	NC_003198	GAC	2	6	304248	304253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759253
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6460	NC_003198	TCG	2	6	304395	304400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759253
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6462	NC_003198	CTT	2	6	304706	304711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16759254
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6470	NC_003198	GCG	2	6	304979	304984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759254
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6482	NC_003198	GCG	2	6	305488	305493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759254
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6488	NC_003198	CCCTG	2	10	305686	305695	0 %	20 %	20 %	60 %	16759254
6489	NC_003198	AGC	2	6	305797	305802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759254
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6493	NC_003198	CGG	2	6	305970	305975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759254
6494	NC_003198	CGG	2	6	305978	305983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759254
6495	NC_003198	CCT	2	6	305993	305998	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16759254
6496	NC_003198	GCT	2	6	306030	306035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759254
6497	NC_003198	AACG	2	8	306078	306085	50 %	0 %	25 %	25 %	16759254
6498	NC_003198	CG	3	6	306092	306097	0 %	0 %	50 %	50 %	16759254
6499	NC_003198	GAC	2	6	306192	306197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759254
6500	NC_003198	TG	3	6	306211	306216	0 %	50 %	50 %	0 %	16759254

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