MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. CT18

Total Repeats: 101023

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_003198	TGG	2	6	232597	232602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759192
5002	NC_003198	CCA	2	6	232646	232651	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16759192
5003	NC_003198	GCG	2	6	232711	232716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759192
5004	NC_003198	GCG	2	6	232744	232749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759192
5005	NC_003198	TTG	2	6	232764	232769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16759192
5006	NC_003198	GGC	2	6	232847	232852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759192
5007	NC_003198	GC	3	6	232876	232881	0 %	0 %	50 %	50 %	16759192
5008	NC_003198	GCT	2	6	232931	232936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759192
5009	NC_003198	CTG	2	6	232962	232967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759192
5010	NC_003198	GC	3	6	232968	232973	0 %	0 %	50 %	50 %	16759192
5011	NC_003198	ATGG	2	8	233048	233055	25 %	25 %	50 %	0 %	16759192
5012	NC_003198	GC	3	6	233089	233094	0 %	0 %	50 %	50 %	16759192
5013	NC_003198	GCT	2	6	233096	233101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759192
5014	NC_003198	GCT	2	6	233108	233113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759192
5015	NC_003198	GC	3	6	233134	233139	0 %	0 %	50 %	50 %	16759192
5016	NC_003198	GGC	2	6	233165	233170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759192
5017	NC_003198	GC	3	6	233209	233214	0 %	0 %	50 %	50 %	16759192
5018	NC_003198	CTG	3	9	233217	233225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759192
5019	NC_003198	CT	3	6	233241	233246	0 %	50 %	0 %	50 %	16759192
5020	NC_003198	GCT	2	6	233288	233293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759192
5021	NC_003198	GAA	2	6	233295	233300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16759192
5022	NC_003198	GGC	2	6	233330	233335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759192
5023	NC_003198	GGCG	2	8	233342	233349	0 %	0 %	75 %	25 %	16759192
5024	NC_003198	TGGCGG	2	12	233356	233367	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	16759192
5025	NC_003198	ATT	2	6	233373	233378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16759192
5026	NC_003198	GTG	2	6	233448	233453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759192
5027	NC_003198	CTGC	2	8	233496	233503	0 %	25 %	25 %	50 %	16759192
5028	NC_003198	GCG	3	9	233517	233525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759192
5029	NC_003198	CTG	2	6	233529	233534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759192
5030	NC_003198	ATT	2	6	233535	233540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16759192
5031	NC_003198	GCC	2	6	233547	233552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759192
5032	NC_003198	GCG	2	6	233557	233562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759192
5033	NC_003198	CGC	2	6	233569	233574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759192
5034	NC_003198	TGC	2	6	233620	233625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759192
5035	NC_003198	ATG	2	6	233628	233633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759192
5036	NC_003198	GCG	2	6	233644	233649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759192
5037	NC_003198	CGC	2	6	233769	233774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759192
5038	NC_003198	GCG	2	6	233797	233802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759192
5039	NC_003198	CG	5	10	233807	233816	0 %	0 %	50 %	50 %	16759192
5040	NC_003198	GCT	2	6	233849	233854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759192
5041	NC_003198	GGC	2	6	233861	233866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759192
5042	NC_003198	CGA	2	6	233884	233889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759192
5043	NC_003198	CGG	2	6	234058	234063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759192
5044	NC_003198	GC	3	6	234085	234090	0 %	0 %	50 %	50 %	16759192
5045	NC_003198	GGC	2	6	234140	234145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5046	NC_003198	GTAAGC	2	12	234187	234198	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5047	NC_003198	CG	3	6	234241	234246	0 %	0 %	50 %	50 %	16759193
5048	NC_003198	TAT	2	6	234257	234262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16759193
5049	NC_003198	GTC	2	6	234267	234272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759193
5050	NC_003198	TG	3	6	234278	234283	0 %	50 %	50 %	0 %	16759193
5051	NC_003198	CGAC	2	8	234284	234291	25 %	0 %	25 %	50 %	16759193
5052	NC_003198	TCC	2	6	234334	234339	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16759193
5053	NC_003198	GAA	2	6	234351	234356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16759193
5054	NC_003198	GAA	2	6	234423	234428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16759193
5055	NC_003198	GCC	2	6	234441	234446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759193
5056	NC_003198	ACC	2	6	234457	234462	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16759193
5057	NC_003198	CTT	2	6	234476	234481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16759193
5058	NC_003198	GTG	2	6	234514	234519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759193
5059	NC_003198	TTCA	2	8	234558	234565	25 %	50 %	0 %	25 %	16759193
5060	NC_003198	GCC	2	6	234580	234585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759193
5061	NC_003198	CGA	2	6	234661	234666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759193
5062	NC_003198	CGC	2	6	234692	234697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759193
5063	NC_003198	GAT	2	6	234699	234704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759193
5064	NC_003198	CAGGT	2	10	234715	234724	20 %	20 %	40 %	20 %	16759193
5065	NC_003198	ACG	2	6	234730	234735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759193
5066	NC_003198	GTA	2	6	234738	234743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759193
5067	NC_003198	TCG	2	6	234787	234792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759193
5068	NC_003198	CAG	2	6	234798	234803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759193
5069	NC_003198	GCG	2	6	234854	234859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759193
5070	NC_003198	CGA	2	6	234890	234895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759193
5071	NC_003198	CGC	2	6	234930	234935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759193
5072	NC_003198	GC	3	6	234934	234939	0 %	0 %	50 %	50 %	16759193
5073	NC_003198	GC	3	6	235028	235033	0 %	0 %	50 %	50 %	16759193
5074	NC_003198	CAG	2	6	235050	235055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759193
5075	NC_003198	AGC	2	6	235076	235081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759193
5076	NC_003198	TCG	2	6	235142	235147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759193
5077	NC_003198	GC	3	6	235238	235243	0 %	0 %	50 %	50 %	16759193
5078	NC_003198	AT	3	6	235342	235347	50 %	50 %	0 %	0 %	16759193
5079	NC_003198	GCC	2	6	235407	235412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759193
5080	NC_003198	CGC	2	6	235445	235450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759193
5081	NC_003198	TCT	2	6	235662	235667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5082	NC_003198	TCG	2	6	235734	235739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759194
5083	NC_003198	CGC	2	6	235760	235765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759194
5084	NC_003198	GGC	2	6	235782	235787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759194
5085	NC_003198	GC	3	6	235865	235870	0 %	0 %	50 %	50 %	16759194
5086	NC_003198	T	6	6	235950	235955	0 %	100 %	0 %	0 %	16759194
5087	NC_003198	CGG	2	6	235980	235985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759194
5088	NC_003198	GC	3	6	236009	236014	0 %	0 %	50 %	50 %	16759194
5089	NC_003198	GGA	2	6	236016	236021	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16759194
5090	NC_003198	TGG	2	6	236038	236043	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759194
5091	NC_003198	CGG	2	6	236067	236072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759194
5092	NC_003198	CGGCG	2	10	236208	236217	0 %	0 %	60 %	40 %	16759194
5093	NC_003198	CT	3	6	236224	236229	0 %	50 %	0 %	50 %	16759194
5094	NC_003198	GCG	2	6	236230	236235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759194
5095	NC_003198	CGC	2	6	236243	236248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759194
5096	NC_003198	TAT	2	6	236265	236270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16759194
5097	NC_003198	TCA	2	6	236333	236338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759194
5098	NC_003198	ATT	2	6	236380	236385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16759194
5099	NC_003198	TAT	2	6	236445	236450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16759194
5100	NC_003198	TGC	2	6	236486	236491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759194
5101	NC_003198	GGC	2	6	236521	236526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759194
5102	NC_003198	A	6	6	236533	236538	100 %	0 %	0 %	0 %	16759194
5103	NC_003198	GCG	2	6	236552	236557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759194
5104	NC_003198	CGG	2	6	236562	236567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759194
5105	NC_003198	TTGA	2	8	236587	236594	25 %	50 %	25 %	0 %	16759194
5106	NC_003198	CGGCAG	2	12	236597	236608	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	16759194
5107	NC_003198	GCG	2	6	236609	236614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759194
5108	NC_003198	CGC	2	6	236634	236639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759194
5109	NC_003198	CTG	2	6	236665	236670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759194
5110	NC_003198	TTA	2	6	236678	236683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16759194
5111	NC_003198	ACG	2	6	236695	236700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759194
5112	NC_003198	TGCTT	2	10	236702	236711	0 %	60 %	20 %	20 %	16759194
5113	NC_003198	TTC	2	6	236712	236717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16759194
5114	NC_003198	GC	3	6	236720	236725	0 %	0 %	50 %	50 %	16759194
5115	NC_003198	G	6	6	236727	236732	0 %	0 %	100 %	0 %	16759194
5116	NC_003198	GCT	2	6	236763	236768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759194
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5118	NC_003198	GGC	2	6	236862	236867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759194
5119	NC_003198	GC	3	6	236874	236879	0 %	0 %	50 %	50 %	16759194
5120	NC_003198	TGCTGG	2	12	236897	236908	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	16759194
5121	NC_003198	GC	3	6	237016	237021	0 %	0 %	50 %	50 %	16759194
5122	NC_003198	GGC	2	6	237048	237053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759194
5123	NC_003198	TGA	2	6	237177	237182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759195
5124	NC_003198	GCA	2	6	237211	237216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759195
5125	NC_003198	CGG	2	6	237285	237290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759195
5126	NC_003198	TGG	2	6	237377	237382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759195
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5230	NC_003198	CTG	2	6	242601	242606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759200
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5232	NC_003198	AGC	2	6	242649	242654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759200
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5234	NC_003198	AGC	2	6	242742	242747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759200
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5236	NC_003198	A	6	6	242784	242789	100 %	0 %	0 %	0 %	16759200
5237	NC_003198	CAG	2	6	242814	242819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759200
5238	NC_003198	GTG	2	6	242893	242898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759200
5239	NC_003198	TATT	2	8	242906	242913	25 %	75 %	0 %	0 %	16759200
5240	NC_003198	CCA	2	6	242945	242950	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5241	NC_003198	CTT	2	6	242996	243001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5242	NC_003198	TGCTC	2	10	243057	243066	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
5243	NC_003198	AGG	2	6	243069	243074	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5244	NC_003198	TGGC	3	12	243081	243092	0 %	25 %	50 %	25 %	16759201
5245	NC_003198	GC	3	6	243125	243130	0 %	0 %	50 %	50 %	16759201
5246	NC_003198	CAT	2	6	243139	243144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759201
5247	NC_003198	TAT	2	6	243181	243186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16759201
5248	NC_003198	GCG	2	6	243192	243197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759201
5249	NC_003198	GTT	2	6	243232	243237	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16759201
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5251	NC_003198	GT	3	6	243401	243406	0 %	50 %	50 %	0 %	16759201
5252	NC_003198	ATG	2	6	243419	243424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759201
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5261	NC_003198	ATC	2	6	243756	243761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759201
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5272	NC_003198	CGCTT	2	10	244247	244256	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
5273	NC_003198	AC	3	6	244317	244322	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5274	NC_003198	CTTA	2	8	244325	244332	25 %	50 %	0 %	25 %	16759202
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5281	NC_003198	CATA	2	8	244706	244713	50 %	25 %	0 %	25 %	16759202
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5284	NC_003198	CCA	2	6	244771	244776	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5285	NC_003198	A	7	7	244785	244791	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5286	NC_003198	AGA	2	6	244806	244811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5288	NC_003198	GTG	2	6	244992	244997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5289	NC_003198	TAT	2	6	245041	245046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5291	NC_003198	T	7	7	245080	245086	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5294	NC_003198	GC	3	6	245165	245170	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5295	NC_003198	T	6	6	245173	245178	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5316	NC_003198	GCT	2	6	245940	245945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5375	NC_003198	GGC	2	6	248609	248614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759204
5376	NC_003198	CGT	2	6	248637	248642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759204
5377	NC_003198	CAT	2	6	248676	248681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759204
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5379	NC_003198	GCAG	2	8	248797	248804	25 %	0 %	50 %	25 %	16759204
5380	NC_003198	AGC	2	6	248833	248838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759204
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5453	NC_003198	GCT	2	6	252332	252337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759207
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5486	NC_003198	TTA	2	6	253934	253939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5487	NC_003198	TG	3	6	253984	253989	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5488	NC_003198	GTCTG	2	10	253993	254002	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5489	NC_003198	CTG	2	6	254137	254142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759209
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5495	NC_003198	CCG	2	6	254424	254429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759209
5496	NC_003198	CTG	2	6	254455	254460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759209
5497	NC_003198	TCG	2	6	254490	254495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759209
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5499	NC_003198	GCG	2	6	254548	254553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759209
5500	NC_003198	AAG	2	6	254564	254569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16759209

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