MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. CT18

Total Repeats: 101023

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_003198	TGG	2	6	210088	210093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759174
4502	NC_003198	GCA	2	6	210124	210129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759174
4503	NC_003198	TAG	2	6	210136	210141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759174
4504	NC_003198	ATA	2	6	210168	210173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4505	NC_003198	TGA	2	6	210175	210180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4506	NC_003198	TTGCG	2	10	210239	210248	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
4507	NC_003198	GATT	2	8	210311	210318	25 %	50 %	25 %	0 %	16759175
4508	NC_003198	TGG	2	6	210407	210412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759175
4509	NC_003198	ACT	2	6	210468	210473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759175
4510	NC_003198	TTG	2	6	210529	210534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16759175
4511	NC_003198	TAG	2	6	210537	210542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759175
4512	NC_003198	ATT	2	6	210564	210569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16759175
4513	NC_003198	ATT	2	6	210591	210596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16759175
4514	NC_003198	AGG	2	6	210608	210613	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16759175
4515	NC_003198	GGC	2	6	210759	210764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759175
4516	NC_003198	CTG	2	6	211040	211045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759175
4517	NC_003198	GAAG	2	8	211049	211056	50 %	0 %	50 %	0 %	16759175
4518	NC_003198	CAG	2	6	211127	211132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759175
4519	NC_003198	AGGT	2	8	211156	211163	25 %	25 %	50 %	0 %	16759175
4520	NC_003198	CAT	2	6	211319	211324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759175
4521	NC_003198	GTA	2	6	211357	211362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759175
4522	NC_003198	CAT	2	6	211392	211397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759175
4523	NC_003198	GGC	2	6	211407	211412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759175
4524	NC_003198	TGT	2	6	211419	211424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16759175
4525	NC_003198	T	6	6	211426	211431	0 %	100 %	0 %	0 %	16759175
4526	NC_003198	TAA	2	6	211460	211465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4527	NC_003198	ATT	2	6	211475	211480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16759176
4528	NC_003198	GCT	2	6	211506	211511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759176
4529	NC_003198	GTC	2	6	211522	211527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759176
4530	NC_003198	T	6	6	211547	211552	0 %	100 %	0 %	0 %	16759176
4531	NC_003198	GCA	2	6	211597	211602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759176
4532	NC_003198	GTG	2	6	211646	211651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759176
4533	NC_003198	GGT	2	6	211656	211661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759176
4534	NC_003198	CAC	2	6	211668	211673	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16759176
4535	NC_003198	CCA	2	6	211690	211695	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16759176
4536	NC_003198	TTG	2	6	211725	211730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16759176
4537	NC_003198	GTG	2	6	211757	211762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759176
4538	NC_003198	C	7	7	211836	211842	0 %	0 %	0 %	100 %	16759176
4539	NC_003198	GGCG	2	8	211881	211888	0 %	0 %	75 %	25 %	16759176
4540	NC_003198	TGG	2	6	211892	211897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759176
4541	NC_003198	ATCT	2	8	211920	211927	25 %	50 %	0 %	25 %	16759176
4542	NC_003198	GGT	2	6	212093	212098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759177
4543	NC_003198	CCG	2	6	212139	212144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759177
4544	NC_003198	CAT	2	6	212156	212161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759177
4545	NC_003198	GTT	2	6	212187	212192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16759177
4546	NC_003198	CAG	2	6	212235	212240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759177
4547	NC_003198	GTC	2	6	212277	212282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759177
4548	NC_003198	TGC	2	6	212303	212308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759177
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4553	NC_003198	TTTTA	2	10	212450	212459	20 %	80 %	0 %	0 %	16759177
4554	NC_003198	ACG	2	6	212655	212660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759177
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4556	NC_003198	TGC	2	6	212797	212802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759178
4557	NC_003198	GC	3	6	212801	212806	0 %	0 %	50 %	50 %	16759178
4558	NC_003198	TCG	2	6	212807	212812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759178
4559	NC_003198	TGAGCC	2	12	212827	212838	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16759178
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4561	NC_003198	GTG	3	9	212966	212974	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759178
4562	NC_003198	T	7	7	213040	213046	0 %	100 %	0 %	0 %	16759178
4563	NC_003198	TGG	2	6	213093	213098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759178
4564	NC_003198	CGC	2	6	213127	213132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759178
4565	NC_003198	TGC	2	6	213141	213146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759178
4566	NC_003198	GCT	2	6	213233	213238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759178
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4570	NC_003198	GTTGC	2	10	213343	213352	0 %	40 %	40 %	20 %	16759179
4571	NC_003198	GCTG	2	8	213381	213388	0 %	25 %	50 %	25 %	16759179
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4574	NC_003198	TCG	2	6	213700	213705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759179
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4579	NC_003198	GCT	2	6	213878	213883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759179
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4582	NC_003198	CCG	2	6	214059	214064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759179
4583	NC_003198	CCG	2	6	214119	214124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759179
4584	NC_003198	CAG	2	6	214127	214132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759179
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4592	NC_003198	TTA	2	6	214710	214715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16759179
4593	NC_003198	GTA	2	6	214721	214726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759179
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4595	NC_003198	CTGCAT	2	12	214817	214828	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16759179
4596	NC_003198	GAG	2	6	214833	214838	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16759179
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4598	NC_003198	CCT	2	6	214873	214878	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16759179
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4603	NC_003198	CGC	2	6	215279	215284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759179
4604	NC_003198	ATAC	2	8	215285	215292	50 %	25 %	0 %	25 %	16759179
4605	NC_003198	TCT	2	6	215511	215516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16759179
4606	NC_003198	TCC	2	6	215517	215522	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16759179
4607	NC_003198	T	6	6	215525	215530	0 %	100 %	0 %	0 %	16759179
4608	NC_003198	T	7	7	215586	215592	0 %	100 %	0 %	0 %	16759179
4609	NC_003198	CAGG	2	8	215597	215604	25 %	0 %	50 %	25 %	16759179
4610	NC_003198	TTC	2	6	215844	215849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4611	NC_003198	TTC	2	6	215886	215891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4612	NC_003198	TCAA	2	8	215933	215940	50 %	25 %	0 %	25 %	16759180
4613	NC_003198	GAT	2	6	216014	216019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759180
4614	NC_003198	TGG	2	6	216039	216044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759180
4615	NC_003198	GTAG	2	8	216076	216083	25 %	25 %	50 %	0 %	16759180
4616	NC_003198	GAGTT	2	10	216108	216117	20 %	40 %	40 %	0 %	16759180
4617	NC_003198	GTA	2	6	216126	216131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759180
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4619	NC_003198	GTT	2	6	216168	216173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16759180
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4622	NC_003198	AGA	2	6	216315	216320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16759180
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4624	NC_003198	G	7	7	216407	216413	0 %	0 %	100 %	0 %	16759180
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4997	NC_003198	GCC	2	6	232503	232508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759192
4998	NC_003198	TCG	2	6	232525	232530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759192
4999	NC_003198	GC	3	6	232531	232536	0 %	0 %	50 %	50 %	16759192
5000	NC_003198	GGCGT	2	10	232545	232554	0 %	20 %	60 %	20 %	16759192

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