MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. LT2 chromosome

Total Repeats: 102725

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_003197	ACG	2	6	186245	186250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763548
4002	NC_003197	AGA	2	6	186252	186257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16763548
4003	NC_003197	CCG	2	6	186334	186339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763548
4004	NC_003197	A	6	6	186347	186352	100 %	0 %	0 %	0 %	16763548
4005	NC_003197	TCACCG	2	12	186353	186364	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	16763548
4006	NC_003197	CGA	2	6	186393	186398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763548
4007	NC_003197	TC	4	8	186399	186406	0 %	50 %	0 %	50 %	16763548
4008	NC_003197	CAAA	2	8	186516	186523	75 %	0 %	0 %	25 %	16763548
4009	NC_003197	A	6	6	186538	186543	100 %	0 %	0 %	0 %	16763548
4010	NC_003197	GTG	2	6	186571	186576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16763548
4011	NC_003197	TTC	2	6	186585	186590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16763548
4012	NC_003197	GCG	3	9	186659	186667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763548
4013	NC_003197	CGG	2	6	186678	186683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763548
4014	NC_003197	TCT	2	6	186698	186703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16763548
4015	NC_003197	GC	3	6	186725	186730	0 %	0 %	50 %	50 %	16763548
4016	NC_003197	GTGC	2	8	186871	186878	0 %	25 %	50 %	25 %	16763548
4017	NC_003197	GGT	2	6	186880	186885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16763548
4018	NC_003197	ACC	2	6	186916	186921	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16763548
4019	NC_003197	AGC	2	6	186988	186993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763548
4020	NC_003197	GGTC	2	8	187020	187027	0 %	25 %	50 %	25 %	16763548
4021	NC_003197	TCCG	2	8	187049	187056	0 %	25 %	25 %	50 %	16763548
4022	NC_003197	TAC	2	6	187101	187106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16763548
4023	NC_003197	CGA	2	6	187122	187127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763548
4024	NC_003197	CCG	2	6	187157	187162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763548
4025	NC_003197	CAC	2	6	187218	187223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16763548
4026	NC_003197	CAC	2	6	187225	187230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16763548
4027	NC_003197	TC	3	6	187265	187270	0 %	50 %	0 %	50 %	16763548
4028	NC_003197	TGC	3	9	187313	187321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763548
4029	NC_003197	CGG	2	6	187338	187343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763548
4030	NC_003197	CGG	2	6	187382	187387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763548
4031	NC_003197	TCTGG	2	10	187390	187399	0 %	40 %	40 %	20 %	16763548
4032	NC_003197	GCC	2	6	187408	187413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763548
4033	NC_003197	CTG	2	6	187540	187545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763548
4034	NC_003197	GAA	2	6	187554	187559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16763548
4035	NC_003197	TCT	2	6	187574	187579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16763548
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4037	NC_003197	TTG	2	6	187703	187708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16763548
4038	NC_003197	CTG	2	6	187732	187737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763548
4039	NC_003197	GAT	2	6	187743	187748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16763548
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4041	NC_003197	CGT	2	6	187783	187788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763548
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4043	NC_003197	GCT	2	6	187824	187829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763548
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4045	NC_003197	GAC	2	6	187921	187926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763548
4046	NC_003197	CTG	2	6	187933	187938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763548
4047	NC_003197	CGA	2	6	187962	187967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763548
4048	NC_003197	GCT	2	6	188022	188027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763548
4049	NC_003197	GCC	2	6	188070	188075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763548
4050	NC_003197	CGC	2	6	188088	188093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763548
4051	NC_003197	GAA	2	6	188104	188109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16763548
4052	NC_003197	TAC	2	6	188113	188118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16763548
4053	NC_003197	GGT	2	6	188208	188213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16763548
4054	NC_003197	GGC	2	6	188286	188291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763548
4055	NC_003197	GCG	2	6	188296	188301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763548
4056	NC_003197	CGG	2	6	188363	188368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763548
4057	NC_003197	TATTTT	2	12	188536	188547	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	16763549
4058	NC_003197	CTT	2	6	188550	188555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16763549
4059	NC_003197	CT	3	6	188572	188577	0 %	50 %	0 %	50 %	16763549
4060	NC_003197	TA	3	6	188582	188587	50 %	50 %	0 %	0 %	16763549
4061	NC_003197	GTAT	2	8	188660	188667	25 %	50 %	25 %	0 %	16763549
4062	NC_003197	TGG	2	6	188678	188683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16763549
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4064	NC_003197	TCA	2	6	188855	188860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16763549
4065	NC_003197	T	6	6	188901	188906	0 %	100 %	0 %	0 %	16763549
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4070	NC_003197	ATT	2	6	189100	189105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16763549
4071	NC_003197	CAT	2	6	189114	189119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16763549
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4075	NC_003197	T	6	6	189250	189255	0 %	100 %	0 %	0 %	16763549
4076	NC_003197	TGTT	2	8	189284	189291	0 %	75 %	25 %	0 %	16763549
4077	NC_003197	AAG	2	6	189316	189321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16763549
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4079	NC_003197	TAA	2	6	189382	189387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_003197	TAC	2	6	189418	189423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4082	NC_003197	T	7	7	189522	189528	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_003197	GGT	2	6	189668	189673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16763550
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4089	NC_003197	AG	3	6	189887	189892	50 %	0 %	50 %	0 %	16763550
4090	NC_003197	GGA	2	6	189911	189916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16763550
4091	NC_003197	GTC	2	6	189927	189932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763550
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4093	NC_003197	T	6	6	190064	190069	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_003197	T	6	6	190082	190087	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_003197	TTA	2	6	190093	190098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_003197	TTGA	2	8	190140	190147	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_003197	CAA	2	6	190176	190181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4098	NC_003197	A	6	6	190209	190214	100 %	0 %	0 %	0 %	16763551
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4101	NC_003197	CGG	2	6	190304	190309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763551
4102	NC_003197	CTG	2	6	190362	190367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763551
4103	NC_003197	GCG	2	6	190513	190518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763551
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4105	NC_003197	ATG	2	6	190627	190632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16763551
4106	NC_003197	CTTT	2	8	190636	190643	0 %	75 %	0 %	25 %	16763551
4107	NC_003197	GAT	2	6	190646	190651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16763551
4108	NC_003197	TGG	2	6	190696	190701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16763551
4109	NC_003197	T	6	6	190763	190768	0 %	100 %	0 %	0 %	16763551
4110	NC_003197	GGC	2	6	190776	190781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763551
4111	NC_003197	GCT	2	6	190784	190789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763551
4112	NC_003197	CTTT	2	8	190795	190802	0 %	75 %	0 %	25 %	16763551
4113	NC_003197	GGGC	2	8	190816	190823	0 %	0 %	75 %	25 %	16763551
4114	NC_003197	CGTT	2	8	190885	190892	0 %	50 %	25 %	25 %	16763551
4115	NC_003197	GCG	2	6	190950	190955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763551
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4119	NC_003197	CCGCT	2	10	191041	191050	0 %	20 %	20 %	60 %	16763551
4120	NC_003197	GCC	2	6	191055	191060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763551
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4122	NC_003197	CCT	2	6	191098	191103	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16763551
4123	NC_003197	A	6	6	191112	191117	100 %	0 %	0 %	0 %	16763551
4124	NC_003197	CTT	2	6	191131	191136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16763551
4125	NC_003197	GAT	2	6	191171	191176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16763552
4126	NC_003197	GAA	2	6	191212	191217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16763552
4127	NC_003197	CGC	2	6	191264	191269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763552
4128	NC_003197	GGC	2	6	191320	191325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763552
4129	NC_003197	GTG	2	6	191353	191358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16763552
4130	NC_003197	A	7	7	191387	191393	100 %	0 %	0 %	0 %	16763552
4131	NC_003197	CGG	2	6	191433	191438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763552
4132	NC_003197	GC	3	6	191443	191448	0 %	0 %	50 %	50 %	16763552
4133	NC_003197	CGC	3	9	191473	191481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763552
4134	NC_003197	ACG	2	6	191501	191506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763552
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4137	NC_003197	TCG	2	6	191715	191720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763552
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4142	NC_003197	CG	3	6	191959	191964	0 %	0 %	50 %	50 %	16763552
4143	NC_003197	GC	3	6	192018	192023	0 %	0 %	50 %	50 %	16763552
4144	NC_003197	AGA	2	6	192070	192075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16763552
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4146	NC_003197	CGT	2	6	192157	192162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763552
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4150	NC_003197	GCGG	2	8	192347	192354	0 %	0 %	75 %	25 %	16763552
4151	NC_003197	TG	3	6	192375	192380	0 %	50 %	50 %	0 %	16763552
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4156	NC_003197	TGG	2	6	192514	192519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16763553
4157	NC_003197	CAT	2	6	192626	192631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16763553
4158	NC_003197	TGAT	2	8	192637	192644	25 %	50 %	25 %	0 %	16763553
4159	NC_003197	CAGGCG	2	12	192687	192698	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	16763553
4160	NC_003197	GC	3	6	192725	192730	0 %	0 %	50 %	50 %	16763553
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4164	NC_003197	GCCA	2	8	193097	193104	25 %	0 %	25 %	50 %	16763553
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4187	NC_003197	GTG	2	6	194193	194198	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4221	NC_003197	A	6	6	196145	196150	100 %	0 %	0 %	0 %	16763557
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4237	NC_003197	CCG	3	9	197142	197150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763558
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4240	NC_003197	GCA	2	6	197197	197202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763558
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4242	NC_003197	GC	3	6	197252	197257	0 %	0 %	50 %	50 %	16763558
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4247	NC_003197	TGG	2	6	197382	197387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16763558
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4249	NC_003197	ATG	2	6	197612	197617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16763558
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4253	NC_003197	ATG	2	6	197909	197914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16763558
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4327	NC_003197	ATCCA	2	10	201949	201958	40 %	20 %	0 %	40 %	16763561
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4335	NC_003197	AAGT	2	8	202165	202172	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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4356	NC_003197	TAA	2	6	203038	203043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16763562
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4495	NC_003197	TGA	2	6	209525	209530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16763568
4496	NC_003197	GGA	2	6	209583	209588	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16763568
4497	NC_003197	GC	3	6	209651	209656	0 %	0 %	50 %	50 %	16763568
4498	NC_003197	CAG	3	9	209680	209688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763568
4499	NC_003197	TGC	2	6	209708	209713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763568
4500	NC_003197	GAC	2	6	209745	209750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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