MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. LT2 chromosome

Total Repeats: 102725

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_003197	ATA	2	6	116652	116657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2502	NC_003197	TAAA	2	8	116678	116685	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2503	NC_003197	TCG	2	6	116705	116710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2504	NC_003197	CT	3	6	116715	116720	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2505	NC_003197	TAATT	2	10	116724	116733	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2506	NC_003197	ATTTT	2	10	116750	116759	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2507	NC_003197	CGGGTG	2	12	116766	116777	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
2508	NC_003197	T	6	6	116912	116917	0 %	100 %	0 %	0 %	16763490
2509	NC_003197	ACAGA	2	10	116933	116942	60 %	0 %	20 %	20 %	16763490
2510	NC_003197	ATT	2	6	116957	116962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16763490
2511	NC_003197	T	7	7	116977	116983	0 %	100 %	0 %	0 %	16763490
2512	NC_003197	A	6	6	117004	117009	100 %	0 %	0 %	0 %	16763490
2513	NC_003197	ATT	2	6	117026	117031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16763490
2514	NC_003197	CAA	2	6	117063	117068	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16763490
2515	NC_003197	TTC	2	6	117083	117088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16763490
2516	NC_003197	GGAA	2	8	117097	117104	50 %	0 %	50 %	0 %	16763490
2517	NC_003197	ATT	2	6	117131	117136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16763490
2518	NC_003197	AT	3	6	117184	117189	50 %	50 %	0 %	0 %	16763490
2519	NC_003197	TCA	2	6	117202	117207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16763490
2520	NC_003197	C	6	6	117213	117218	0 %	0 %	0 %	100 %	16763490
2521	NC_003197	CAG	2	6	117292	117297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763491
2522	NC_003197	TGC	2	6	117302	117307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763491
2523	NC_003197	GCG	2	6	117321	117326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763491
2524	NC_003197	GGC	2	6	117333	117338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763491
2525	NC_003197	AGA	2	6	117339	117344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16763491
2526	NC_003197	CTT	2	6	117360	117365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16763491
2527	NC_003197	GCG	2	6	117455	117460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763491
2528	NC_003197	CAA	2	6	117486	117491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16763491
2529	NC_003197	GGT	2	6	117586	117591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16763491
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2531	NC_003197	GCC	2	6	117661	117666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763491
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2535	NC_003197	CGC	2	6	117825	117830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763491
2536	NC_003197	TCT	2	6	117926	117931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16763491
2537	NC_003197	CAGCG	2	10	118108	118117	20 %	0 %	40 %	40 %	16763492
2538	NC_003197	ATCA	2	8	118149	118156	50 %	25 %	0 %	25 %	16763492
2539	NC_003197	GC	3	6	118235	118240	0 %	0 %	50 %	50 %	16763492
2540	NC_003197	GCCA	2	8	118242	118249	25 %	0 %	25 %	50 %	16763492
2541	NC_003197	GCG	2	6	118331	118336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763492
2542	NC_003197	CAG	2	6	118362	118367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763492
2543	NC_003197	CGA	2	6	118400	118405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763492
2544	NC_003197	GCCGG	2	10	118408	118417	0 %	0 %	60 %	40 %	16763492
2545	NC_003197	GCC	2	6	118455	118460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763492
2546	NC_003197	GGAC	2	8	118509	118516	25 %	0 %	50 %	25 %	16763492
2547	NC_003197	AC	3	6	118515	118520	50 %	0 %	0 %	50 %	16763492
2548	NC_003197	CGAGC	2	10	118533	118542	20 %	0 %	40 %	40 %	16763492
2549	NC_003197	TCC	2	6	118579	118584	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16763492
2550	NC_003197	GCC	2	6	118596	118601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763492
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2552	NC_003197	TGC	2	6	118684	118689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763492
2553	NC_003197	GTA	2	6	118747	118752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16763492
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2555	NC_003197	CGC	2	6	118809	118814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763492
2556	NC_003197	GGCG	2	8	118854	118861	0 %	0 %	75 %	25 %	16763492
2557	NC_003197	GCT	2	6	118872	118877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763492
2558	NC_003197	TCGCCG	2	12	118906	118917	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	16763492
2559	NC_003197	CAC	2	6	118926	118931	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16763492
2560	NC_003197	ATTTG	2	10	118976	118985	20 %	60 %	20 %	0 %	16763492
2561	NC_003197	GTCA	2	8	119004	119011	25 %	25 %	25 %	25 %	16763492
2562	NC_003197	GAC	2	6	119139	119144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763492
2563	NC_003197	TGC	2	6	119149	119154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763492
2564	NC_003197	CG	3	6	119164	119169	0 %	0 %	50 %	50 %	16763492
2565	NC_003197	CCG	2	6	119191	119196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763492
2566	NC_003197	GGTTCA	2	12	119207	119218	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16763492
2567	NC_003197	GCG	2	6	119251	119256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763492
2568	NC_003197	AGT	2	6	119278	119283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16763492
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2571	NC_003197	TGT	2	6	119654	119659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16763493
2572	NC_003197	CTG	2	6	119677	119682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763493
2573	NC_003197	GCG	2	6	119686	119691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763493
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2577	NC_003197	CGA	2	6	119850	119855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763493
2578	NC_003197	GCA	2	6	119881	119886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763493
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2580	NC_003197	GC	5	10	119981	119990	0 %	0 %	50 %	50 %	16763493
2581	NC_003197	GCG	2	6	120094	120099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763493
2582	NC_003197	CAC	2	6	120118	120123	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16763493
2583	NC_003197	GCT	2	6	120180	120185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763493
2584	NC_003197	CTGG	2	8	120187	120194	0 %	25 %	50 %	25 %	16763493
2585	NC_003197	TGC	2	6	120221	120226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763493
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2588	NC_003197	CGG	2	6	120564	120569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763493
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2591	NC_003197	GGC	2	6	120644	120649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763493
2592	NC_003197	CGG	2	6	120704	120709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763493
2593	NC_003197	GTG	2	6	120725	120730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16763493
2594	NC_003197	AGC	2	6	120737	120742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763493
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2597	NC_003197	AGT	2	6	120870	120875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16763493
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2599	NC_003197	CGG	2	6	120927	120932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763493
2600	NC_003197	GCG	2	6	121076	121081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763493
2601	NC_003197	CG	3	6	121134	121139	0 %	0 %	50 %	50 %	16763493
2602	NC_003197	GAT	2	6	121140	121145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16763493
2603	NC_003197	GTT	2	6	121156	121161	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16763493
2604	NC_003197	CTT	2	6	121182	121187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16763493
2605	NC_003197	TGG	2	6	121212	121217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16763493
2606	NC_003197	TCG	2	6	121223	121228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763493
2607	NC_003197	GC	3	6	121253	121258	0 %	0 %	50 %	50 %	16763493
2608	NC_003197	CAATTG	2	12	121284	121295	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	16763493
2609	NC_003197	TCCA	2	8	121308	121315	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2610	NC_003197	AG	3	6	121340	121345	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2611	NC_003197	CAGG	2	8	121362	121369	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2612	NC_003197	AATGCT	2	12	121392	121403	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2613	NC_003197	TCA	2	6	121544	121549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2614	NC_003197	GTC	2	6	121580	121585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2615	NC_003197	TCT	2	6	121609	121614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2616	NC_003197	G	6	6	121624	121629	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2617	NC_003197	T	7	7	121738	121744	0 %	100 %	0 %	0 %	16763494
2618	NC_003197	ATCG	2	8	121745	121752	25 %	25 %	25 %	25 %	16763494
2619	NC_003197	AT	3	6	121771	121776	50 %	50 %	0 %	0 %	16763494
2620	NC_003197	TAA	3	9	121810	121818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16763494
2621	NC_003197	TGTC	2	8	121831	121838	0 %	50 %	25 %	25 %	16763494
2622	NC_003197	AT	3	6	121848	121853	50 %	50 %	0 %	0 %	16763494
2623	NC_003197	CCG	2	6	121862	121867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763494
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2625	NC_003197	GC	3	6	122012	122017	0 %	0 %	50 %	50 %	16763494
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