MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. LT2 chromosome

Total Repeats: 102725

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_003197	CGG	2	6	22994	22999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763409
502	NC_003197	CTGG	2	8	23000	23007	0 %	25 %	50 %	25 %	16763409
503	NC_003197	TAT	2	6	23025	23030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16763409
504	NC_003197	ATA	2	6	23051	23056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16763409
505	NC_003197	TTA	2	6	23166	23171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_003197	TCTTAA	2	12	23203	23214	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
507	NC_003197	TTAT	2	8	23265	23272	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_003197	A	7	7	23338	23344	100 %	0 %	0 %	0 %	16763410
509	NC_003197	TGA	2	6	23345	23350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16763410
510	NC_003197	ACG	2	6	23351	23356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763410
511	NC_003197	ATA	2	6	23369	23374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16763410
512	NC_003197	CTTTT	2	10	23393	23402	0 %	80 %	0 %	20 %	16763410
513	NC_003197	T	6	6	23399	23404	0 %	100 %	0 %	0 %	16763410
514	NC_003197	CAG	2	6	23407	23412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763410
515	NC_003197	TTG	2	6	23452	23457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16763410
516	NC_003197	TTTA	2	8	23498	23505	25 %	75 %	0 %	0 %	16763410
517	NC_003197	GTT	2	6	23548	23553	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16763410
518	NC_003197	ATG	2	6	23564	23569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16763410
519	NC_003197	AT	3	6	23582	23587	50 %	50 %	0 %	0 %	16763410
520	NC_003197	CG	3	6	23652	23657	0 %	0 %	50 %	50 %	16763410
521	NC_003197	ACG	2	6	23753	23758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763410
522	NC_003197	TGA	2	6	23789	23794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16763410
523	NC_003197	GC	4	8	23795	23802	0 %	0 %	50 %	50 %	16763410
524	NC_003197	GCT	2	6	23847	23852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763410
525	NC_003197	TCTG	2	8	23955	23962	0 %	50 %	25 %	25 %	16763410
526	NC_003197	A	7	7	23967	23973	100 %	0 %	0 %	0 %	16763410
527	NC_003197	GGC	2	6	23999	24004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763410
528	NC_003197	AT	3	6	24056	24061	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_003197	GTT	2	6	24116	24121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
530	NC_003197	ACA	2	6	24195	24200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_003197	GAT	2	6	24232	24237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
532	NC_003197	TAA	2	6	24259	24264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_003197	TAA	2	6	24266	24271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_003197	ACG	2	6	24306	24311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_003197	AAG	2	6	24353	24358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
536	NC_003197	T	7	7	24363	24369	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_003197	GAA	2	6	24399	24404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
538	NC_003197	CAG	2	6	24409	24414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_003197	A	6	6	24425	24430	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_003197	TGAA	2	8	24466	24473	50 %	25 %	25 %	0 %	16763411
541	NC_003197	TGT	2	6	24521	24526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16763411
542	NC_003197	TAC	2	6	24543	24548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16763411
543	NC_003197	CGGTA	2	10	24561	24570	20 %	20 %	40 %	20 %	16763411
544	NC_003197	CGC	2	6	24594	24599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763411
545	NC_003197	CTGTT	2	10	24600	24609	0 %	60 %	20 %	20 %	16763411
546	NC_003197	TGG	2	6	24680	24685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16763411
547	NC_003197	AGA	2	6	24696	24701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16763411
548	NC_003197	CCAG	2	8	24737	24744	25 %	0 %	25 %	50 %	16763411
549	NC_003197	GCG	2	6	24748	24753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763411
550	NC_003197	CGA	2	6	24824	24829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763411
551	NC_003197	ATG	2	6	24905	24910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16763411
552	NC_003197	T	7	7	25025	25031	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_003197	CG	3	6	25064	25069	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
554	NC_003197	A	8	8	25115	25122	100 %	0 %	0 %	0 %	16763412
555	NC_003197	ATT	2	6	25141	25146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16763412
556	NC_003197	CTG	2	6	25151	25156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763412
557	NC_003197	CGG	2	6	25158	25163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763412
558	NC_003197	CCT	2	6	25245	25250	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16763412
559	NC_003197	ATT	2	6	25256	25261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16763412
560	NC_003197	TTC	2	6	25264	25269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16763412
561	NC_003197	T	7	7	25281	25287	0 %	100 %	0 %	0 %	16763412
562	NC_003197	CGC	2	6	25344	25349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763412
563	NC_003197	CT	3	6	25350	25355	0 %	50 %	0 %	50 %	16763412
564	NC_003197	A	6	6	25370	25375	100 %	0 %	0 %	0 %	16763412
565	NC_003197	AT	3	6	25380	25385	50 %	50 %	0 %	0 %	16763412
566	NC_003197	TAT	2	6	25390	25395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16763412
567	NC_003197	ACCG	2	8	25414	25421	25 %	0 %	25 %	50 %	16763412
568	NC_003197	TATTT	2	10	25434	25443	20 %	80 %	0 %	0 %	16763412
569	NC_003197	AAAT	2	8	25474	25481	75 %	25 %	0 %	0 %	16763412
570	NC_003197	TAC	2	6	25631	25636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16763412
571	NC_003197	A	6	6	25667	25672	100 %	0 %	0 %	0 %	16763412
572	NC_003197	CCG	2	6	25691	25696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763412
573	NC_003197	ACG	2	6	25766	25771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763412
574	NC_003197	ATG	2	6	25795	25800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16763412
575	NC_003197	TCTG	2	8	25931	25938	0 %	50 %	25 %	25 %	16763413
576	NC_003197	GGC	2	6	25988	25993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763413
577	NC_003197	ACG	2	6	26070	26075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763413
578	NC_003197	GC	3	6	26083	26088	0 %	0 %	50 %	50 %	16763413
579	NC_003197	GCCT	2	8	26112	26119	0 %	25 %	25 %	50 %	16763413
580	NC_003197	GGC	3	9	26180	26188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763413
581	NC_003197	GCC	2	6	26223	26228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763413
582	NC_003197	GCA	2	6	26249	26254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763413
583	NC_003197	GGC	2	6	26279	26284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763413
584	NC_003197	GGC	2	6	26397	26402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763413
585	NC_003197	ACT	2	6	26470	26475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16763413
586	NC_003197	GCG	2	6	26494	26499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763413
587	NC_003197	AGCGAC	2	12	26508	26519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763413
588	NC_003197	GCA	2	6	26522	26527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763413
589	NC_003197	ATT	2	6	26606	26611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16763413
590	NC_003197	CCTT	2	8	26618	26625	0 %	50 %	0 %	50 %	16763413
591	NC_003197	GAC	2	6	26649	26654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763413
592	NC_003197	CAT	2	6	26747	26752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16763413
593	NC_003197	GCC	2	6	26768	26773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763413
594	NC_003197	CCG	2	6	26806	26811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763413
595	NC_003197	GCG	2	6	26815	26820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763413
596	NC_003197	CCG	2	6	26881	26886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763413
597	NC_003197	GGC	2	6	26908	26913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763413
598	NC_003197	GCG	2	6	26922	26927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763413
599	NC_003197	TAG	2	6	26951	26956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16763413
600	NC_003197	TCAG	2	8	26977	26984	25 %	25 %	25 %	25 %	16763413
601	NC_003197	GCG	2	6	27073	27078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763413
602	NC_003197	ATA	2	6	27142	27147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16763413
603	NC_003197	GAT	2	6	27261	27266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16763413
604	NC_003197	ATT	2	6	27343	27348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16763413
605	NC_003197	TTA	2	6	27356	27361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16763413
606	NC_003197	AGG	2	6	27366	27371	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16763413
607	NC_003197	ATCA	2	8	27390	27397	50 %	25 %	0 %	25 %	16763413
608	NC_003197	TTA	2	6	27424	27429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16763413
609	NC_003197	CAGC	2	8	27434	27441	25 %	0 %	25 %	50 %	16763413
610	NC_003197	TGA	2	6	27458	27463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16763413
611	NC_003197	TTG	2	6	27474	27479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16763413
612	NC_003197	ACA	2	6	27529	27534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16763413
613	NC_003197	TGA	2	6	27620	27625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16763413
614	NC_003197	CTG	2	6	27717	27722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763413
615	NC_003197	ACA	2	6	27742	27747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16763413
616	NC_003197	GCG	2	6	27784	27789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763413
617	NC_003197	CAG	2	6	27864	27869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763413
618	NC_003197	GGC	2	6	27888	27893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763413
619	NC_003197	TGG	2	6	27895	27900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16763413
620	NC_003197	AGCC	2	8	27924	27931	25 %	0 %	25 %	50 %	16763413
621	NC_003197	CG	3	6	28013	28018	0 %	0 %	50 %	50 %	16763413
622	NC_003197	GGT	2	6	28028	28033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16763413
623	NC_003197	ACA	2	6	28044	28049	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16763413
624	NC_003197	GAT	2	6	28092	28097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16763413
625	NC_003197	TGA	2	6	28106	28111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16763413
626	NC_003197	CCGA	2	8	28131	28138	25 %	0 %	25 %	50 %	16763413
627	NC_003197	GC	3	6	28141	28146	0 %	0 %	50 %	50 %	16763413
628	NC_003197	GC	3	6	28177	28182	0 %	0 %	50 %	50 %	16763413
629	NC_003197	ACGGTG	2	12	28233	28244	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	16763413
630	NC_003197	TTG	2	6	28267	28272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16763413
631	NC_003197	GCGTC	2	10	28357	28366	0 %	20 %	40 %	40 %	16763413
632	NC_003197	ATC	2	6	28369	28374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16763413
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761	NC_003197	GCG	2	6	34158	34163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763420
762	NC_003197	TATAA	2	10	34165	34174	60 %	40 %	0 %	0 %	16763420
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