MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. LT2 chromosome

Total Repeats: 102725

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_003197	GC	3	6	254124	254129	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5502	NC_003197	AC	3	6	254155	254160	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5503	NC_003197	AAC	2	6	254193	254198	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5504	NC_003197	AC	4	8	254197	254204	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5505	NC_003197	GC	3	6	254394	254399	0 %	0 %	50 %	50 %	16763606
5506	NC_003197	CAT	2	6	254413	254418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16763606
5507	NC_003197	CTGAA	2	10	254460	254469	40 %	20 %	20 %	20 %	16763606
5508	NC_003197	AAGCG	2	10	254524	254533	40 %	0 %	40 %	20 %	16763606
5509	NC_003197	GCT	2	6	254543	254548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763606
5510	NC_003197	TTC	2	6	254564	254569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16763606
5511	NC_003197	GCTG	2	8	254580	254587	0 %	25 %	50 %	25 %	16763606
5512	NC_003197	AAGA	2	8	254687	254694	75 %	0 %	25 %	0 %	16763606
5513	NC_003197	AAC	2	6	254825	254830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16763606
5514	NC_003197	GAA	2	6	254996	255001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16763606
5515	NC_003197	TAA	2	6	255020	255025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16763606
5516	NC_003197	GGC	2	6	255064	255069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5517	NC_003197	GTA	2	6	255177	255182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5518	NC_003197	ATG	2	6	255337	255342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16763607
5519	NC_003197	A	6	6	255349	255354	100 %	0 %	0 %	0 %	16763607
5520	NC_003197	CTGA	2	8	255358	255365	25 %	25 %	25 %	25 %	16763607
5521	NC_003197	GCG	2	6	255424	255429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763607
5522	NC_003197	A	6	6	255430	255435	100 %	0 %	0 %	0 %	16763607
5523	NC_003197	GCT	2	6	255448	255453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763607
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5525	NC_003197	CGC	2	6	255573	255578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763607
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5528	NC_003197	GC	3	6	255727	255732	0 %	0 %	50 %	50 %	16763607
5529	NC_003197	GCAA	2	8	255802	255809	50 %	0 %	25 %	25 %	16763607
5530	NC_003197	CTG	2	6	255839	255844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763607
5531	NC_003197	GAAA	2	8	255903	255910	75 %	0 %	25 %	0 %	16763607
5532	NC_003197	GAA	2	6	255939	255944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16763607
5533	NC_003197	CTG	2	6	256012	256017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763607
5534	NC_003197	GACT	2	8	256086	256093	25 %	25 %	25 %	25 %	16763607
5535	NC_003197	GCA	2	6	256096	256101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763607
5536	NC_003197	TGC	2	6	256107	256112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763607
5537	NC_003197	GAG	2	6	256139	256144	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5538	NC_003197	CTT	2	6	256159	256164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5539	NC_003197	CT	3	6	256172	256177	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5540	NC_003197	GAAA	2	8	256267	256274	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5541	NC_003197	GCG	2	6	256325	256330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763608
5542	NC_003197	TGGTG	2	10	256428	256437	0 %	40 %	60 %	0 %	16763608
5543	NC_003197	GGT	2	6	256444	256449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16763608
5544	NC_003197	CGCC	2	8	256578	256585	0 %	0 %	25 %	75 %	16763608
5545	NC_003197	CTG	2	6	256648	256653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763608
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5548	NC_003197	TTC	2	6	256699	256704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16763608
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5550	NC_003197	GC	3	6	256946	256951	0 %	0 %	50 %	50 %	16763608
5551	NC_003197	CGT	2	6	256954	256959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763608
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5555	NC_003197	TTA	2	6	257050	257055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5556	NC_003197	TG	3	6	257100	257105	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5557	NC_003197	GTCTG	2	10	257109	257118	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5558	NC_003197	CTG	2	6	257253	257258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763609
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5564	NC_003197	CTG	2	6	257571	257576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763609
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5572	NC_003197	GCG	2	6	257801	257806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5595	NC_003197	GC	3	6	258753	258758	0 %	0 %	50 %	50 %	16763610
5596	NC_003197	GC	3	6	258768	258773	0 %	0 %	50 %	50 %	16763610
5597	NC_003197	GGC	2	6	258832	258837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763610
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5600	NC_003197	CG	3	6	258997	259002	0 %	0 %	50 %	50 %	16763610
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5604	NC_003197	CG	3	6	259259	259264	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5605	NC_003197	A	6	6	259343	259348	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5610	NC_003197	TGC	2	6	259519	259524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763611
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5620	NC_003197	ACTTT	2	10	259990	259999	20 %	60 %	0 %	20 %	16763611
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5995	NC_003197	GC	4	8	279249	279256	0 %	0 %	50 %	50 %	16763626
5996	NC_003197	CAG	2	6	279268	279273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763626
5997	NC_003197	GCG	2	6	279292	279297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763626
5998	NC_003197	GCT	2	6	279336	279341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763626
5999	NC_003197	ACTG	2	8	279367	279374	25 %	25 %	25 %	25 %	16763626
6000	NC_003197	CGG	2	6	279380	279385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763626

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