MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. LT2 chromosome

Total Repeats: 102725

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_003197	T	6	6	209772	209777	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4502	NC_003197	AT	3	6	209791	209796	50 %	50 %	0 %	0 %	16763569
4503	NC_003197	GTT	2	6	209807	209812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16763569
4504	NC_003197	ACG	2	6	209876	209881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763569
4505	NC_003197	GCC	2	6	209888	209893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763569
4506	NC_003197	ATT	2	6	209979	209984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16763569
4507	NC_003197	TGG	2	6	210174	210179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16763569
4508	NC_003197	ATT	2	6	210197	210202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16763569
4509	NC_003197	GGCT	2	8	210258	210265	0 %	25 %	50 %	25 %	16763569
4510	NC_003197	ATC	2	6	210318	210323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16763569
4511	NC_003197	TGA	2	6	210334	210339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16763569
4512	NC_003197	CCA	2	6	210366	210371	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16763569
4513	NC_003197	TTCGG	2	10	210376	210385	0 %	40 %	40 %	20 %	16763569
4514	NC_003197	GGA	2	6	210451	210456	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16763569
4515	NC_003197	GC	4	8	210485	210492	0 %	0 %	50 %	50 %	16763569
4516	NC_003197	TGA	2	6	210508	210513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16763569
4517	NC_003197	TAT	2	6	210583	210588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16763569
4518	NC_003197	T	6	6	210703	210708	0 %	100 %	0 %	0 %	16763569
4519	NC_003197	CGC	2	6	210728	210733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763569
4520	NC_003197	TA	3	6	210741	210746	50 %	50 %	0 %	0 %	16763569
4521	NC_003197	ATA	2	6	210759	210764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16763569
4522	NC_003197	CGG	2	6	210788	210793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763569
4523	NC_003197	TCTT	2	8	210826	210833	0 %	75 %	0 %	25 %	16763569
4524	NC_003197	AGC	2	6	210868	210873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763569
4525	NC_003197	TGC	2	6	210942	210947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763569
4526	NC_003197	CTT	2	6	211120	211125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16763570
4527	NC_003197	GCC	2	6	211185	211190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763570
4528	NC_003197	GAT	2	6	211205	211210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16763570
4529	NC_003197	CTTGC	2	10	211385	211394	0 %	40 %	20 %	40 %	16763570
4530	NC_003197	CTT	2	6	211414	211419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4531	NC_003197	GGC	2	6	211560	211565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763571
4532	NC_003197	CAG	2	6	211605	211610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763571
4533	NC_003197	GTC	2	6	211635	211640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763571
4534	NC_003197	TTCA	2	8	211656	211663	25 %	50 %	0 %	25 %	16763571
4535	NC_003197	GGCAAT	2	12	211674	211685	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	16763571
4536	NC_003197	TCA	2	6	211736	211741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16763571
4537	NC_003197	GCT	2	6	211769	211774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763571
4538	NC_003197	TGAGC	2	10	211797	211806	20 %	20 %	40 %	20 %	16763571
4539	NC_003197	AAT	2	6	211827	211832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16763571
4540	NC_003197	CGA	2	6	211841	211846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763571
4541	NC_003197	CCA	2	6	211871	211876	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16763571
4542	NC_003197	CGC	2	6	211973	211978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763571
4543	NC_003197	AG	3	6	212016	212021	50 %	0 %	50 %	0 %	16763571
4544	NC_003197	ACGT	2	8	212035	212042	25 %	25 %	25 %	25 %	16763571
4545	NC_003197	CAC	2	6	212208	212213	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16763571
4546	NC_003197	CGT	2	6	212255	212260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763571
4547	NC_003197	TGG	2	6	212273	212278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16763571
4548	NC_003197	GAC	2	6	212312	212317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763571
4549	NC_003197	GCA	2	6	212330	212335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763571
4550	NC_003197	CAA	2	6	212360	212365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16763571
4551	NC_003197	TGA	2	6	212382	212387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4552	NC_003197	GCGCT	2	10	212400	212409	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4553	NC_003197	CGCGT	2	10	212452	212461	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4554	NC_003197	TTC	2	6	212501	212506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16763572
4555	NC_003197	CTG	2	6	212543	212548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763572
4556	NC_003197	CGG	2	6	212551	212556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763572
4557	NC_003197	CCG	2	6	212610	212615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763572
4558	NC_003197	GCCGAT	2	12	212672	212683	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16763572
4559	NC_003197	GCAC	2	8	212731	212738	25 %	0 %	25 %	50 %	16763572
4560	NC_003197	CCAGCA	2	12	212740	212751	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	16763572
4561	NC_003197	CAG	2	6	212789	212794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763572
4562	NC_003197	GCC	2	6	212831	212836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763572
4563	NC_003197	CCAG	2	8	212920	212927	25 %	0 %	25 %	50 %	16763572
4564	NC_003197	GCC	2	6	212930	212935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763572
4565	NC_003197	CGCA	2	8	212960	212967	25 %	0 %	25 %	50 %	16763572
4566	NC_003197	GC	3	6	213049	213054	0 %	0 %	50 %	50 %	16763572
4567	NC_003197	CG	3	6	213065	213070	0 %	0 %	50 %	50 %	16763572
4568	NC_003197	CAGG	2	8	213100	213107	25 %	0 %	50 %	25 %	16763572
4569	NC_003197	AG	3	6	213138	213143	50 %	0 %	50 %	0 %	16763572
4570	NC_003197	TCG	2	6	213171	213176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763572
4571	NC_003197	T	6	6	213227	213232	0 %	100 %	0 %	0 %	16763572
4572	NC_003197	CTTG	2	8	213235	213242	0 %	50 %	25 %	25 %	16763572
4573	NC_003197	GCA	2	6	213250	213255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763572
4574	NC_003197	TGG	3	9	213262	213270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16763572
4575	NC_003197	G	6	6	213332	213337	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4576	NC_003197	GCA	2	6	213417	213422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763573
4577	NC_003197	AGATC	2	10	213466	213475	40 %	20 %	20 %	20 %	16763573
4578	NC_003197	CGGT	2	8	213546	213553	0 %	25 %	50 %	25 %	16763573
4579	NC_003197	TTC	2	6	213671	213676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16763573
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4582	NC_003197	CGA	2	6	213772	213777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763573
4583	NC_003197	GGC	2	6	213812	213817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763573
4584	NC_003197	CGCGG	2	10	213888	213897	0 %	0 %	60 %	40 %	16763574
4585	NC_003197	CG	3	6	213898	213903	0 %	0 %	50 %	50 %	16763574
4586	NC_003197	ACG	2	6	213919	213924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763574
4587	NC_003197	GCG	2	6	213925	213930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763574
4588	NC_003197	TCG	2	6	213941	213946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763574
4589	NC_003197	CGG	2	6	213976	213981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763574
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4591	NC_003197	TAT	2	6	214032	214037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16763574
4592	NC_003197	GC	3	6	214049	214054	0 %	0 %	50 %	50 %	16763574
4593	NC_003197	CGCGG	2	10	214072	214081	0 %	0 %	60 %	40 %	16763574
4594	NC_003197	CAT	2	6	214218	214223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16763574
4595	NC_003197	CGT	2	6	214242	214247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763574
4596	NC_003197	T	6	6	214275	214280	0 %	100 %	0 %	0 %	16763574
4597	NC_003197	CAG	2	6	214291	214296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763574
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4599	NC_003197	TTC	2	6	214370	214375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16763574
4600	NC_003197	ATG	2	6	214388	214393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16763574
4601	NC_003197	AAC	2	6	214445	214450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16763574
4602	NC_003197	GGT	2	6	214461	214466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16763574
4603	NC_003197	GTT	2	6	214476	214481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16763574
4604	NC_003197	GC	3	6	214537	214542	0 %	0 %	50 %	50 %	16763574
4605	NC_003197	GGA	2	6	214544	214549	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16763574
4606	NC_003197	GC	3	6	214637	214642	0 %	0 %	50 %	50 %	16763574
4607	NC_003197	CTT	2	6	214704	214709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16763574
4608	NC_003197	CCG	2	6	214724	214729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763574
4609	NC_003197	GTA	2	6	214762	214767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16763574
4610	NC_003197	TCT	2	6	214802	214807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16763574
4611	NC_003197	TGT	2	6	214824	214829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16763574
4612	NC_003197	GCA	3	9	214833	214841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763574
4613	NC_003197	ATG	2	6	214891	214896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16763574
4614	NC_003197	ACG	2	6	214957	214962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763574
4615	NC_003197	CCA	2	6	214965	214970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16763574
4616	NC_003197	AAT	2	6	214985	214990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16763574
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4619	NC_003197	TAA	2	6	215297	215302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4620	NC_003197	AG	3	6	215347	215352	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4621	NC_003197	CAT	2	6	215374	215379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4622	NC_003197	CGC	2	6	215383	215388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4624	NC_003197	CTC	2	6	215523	215528	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161353610
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4745	NC_003197	GTC	2	6	220863	220868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4746	NC_003197	GAA	2	6	220874	220879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4998	NC_003197	CTT	2	6	230522	230527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4999	NC_003197	ATATA	2	10	230561	230570	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5000	NC_003197	CTA	2	6	230574	230579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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