MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus N315 plasmid pN315

Total Repeats: 650

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_003140	A	6	6	19444	19449	100 %	0 %	0 %	0 %	16119222
502	NC_003140	ATA	2	6	19451	19456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16119222
503	NC_003140	AAAG	2	8	19464	19471	75 %	0 %	25 %	0 %	16119222
504	NC_003140	A	6	6	19479	19484	100 %	0 %	0 %	0 %	16119222
505	NC_003140	GGT	2	6	19531	19536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16119222
506	NC_003140	AAC	2	6	19538	19543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16119222
507	NC_003140	TGA	2	6	19596	19601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119222
508	NC_003140	TAT	2	6	19649	19654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16119222
509	NC_003140	TGA	2	6	19665	19670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119222
510	NC_003140	CATA	2	8	19779	19786	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
511	NC_003140	A	6	6	19790	19795	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_003140	T	7	7	19829	19835	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_003140	T	6	6	19861	19866	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_003140	TGA	2	6	19868	19873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
515	NC_003140	A	6	6	19875	19880	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_003140	TAA	2	6	19924	19929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_003140	TAT	2	6	19992	19997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16119223
518	NC_003140	ATT	2	6	20008	20013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16119223
519	NC_003140	GTT	2	6	20017	20022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16119223
520	NC_003140	TAAG	2	8	20096	20103	50 %	25 %	25 %	0 %	16119223
521	NC_003140	TAA	2	6	20148	20153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16119223
522	NC_003140	A	7	7	20152	20158	100 %	0 %	0 %	0 %	16119223
523	NC_003140	TGA	2	6	20160	20165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119223
524	NC_003140	A	7	7	20174	20180	100 %	0 %	0 %	0 %	16119223
525	NC_003140	ATTA	2	8	20232	20239	50 %	50 %	0 %	0 %	16119223
526	NC_003140	GAA	2	6	20271	20276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16119223
527	NC_003140	T	6	6	20289	20294	0 %	100 %	0 %	0 %	16119223
528	NC_003140	GAA	3	9	20316	20324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16119223
529	NC_003140	AAG	2	6	20431	20436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16119224
530	NC_003140	TAA	2	6	20444	20449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16119224
531	NC_003140	A	6	6	20448	20453	100 %	0 %	0 %	0 %	16119224
532	NC_003140	AGAT	2	8	20471	20478	50 %	25 %	25 %	0 %	16119224
533	NC_003140	TAA	2	6	20492	20497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16119224
534	NC_003140	A	6	6	20575	20580	100 %	0 %	0 %	0 %	16119224
535	NC_003140	AGC	2	6	20819	20824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119225
536	NC_003140	GAT	2	6	20828	20833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119225
537	NC_003140	GAT	2	6	20838	20843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119225
538	NC_003140	A	7	7	20873	20879	100 %	0 %	0 %	0 %	16119225
539	NC_003140	GAA	2	6	20949	20954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16119225
540	NC_003140	ATT	2	6	20980	20985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16119225
541	NC_003140	TGT	2	6	20986	20991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16119225
542	NC_003140	AAAG	2	8	21002	21009	75 %	0 %	25 %	0 %	16119225
543	NC_003140	TCAA	2	8	21040	21047	50 %	25 %	0 %	25 %	16119225
544	NC_003140	ATG	2	6	21069	21074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119225
545	NC_003140	AGA	2	6	21077	21082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16119225
546	NC_003140	TAA	2	6	21097	21102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16119225
547	NC_003140	GATA	2	8	21152	21159	50 %	25 %	25 %	0 %	16119225
548	NC_003140	ATG	2	6	21163	21168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119225
549	NC_003140	AAG	2	6	21180	21185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16119225
550	NC_003140	AGA	2	6	21221	21226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
551	NC_003140	AGA	2	6	21230	21235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
552	NC_003140	TTTG	2	8	21271	21278	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
553	NC_003140	ATT	2	6	21285	21290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_003140	T	6	6	21289	21294	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_003140	C	6	6	21313	21318	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
556	NC_003140	AT	3	6	21331	21336	50 %	50 %	0 %	0 %	16119226
557	NC_003140	CAA	2	6	21387	21392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16119226
558	NC_003140	ATA	2	6	21476	21481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16119226
559	NC_003140	AGT	2	6	21483	21488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119226
560	NC_003140	TAA	2	6	21550	21555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_003140	G	6	6	21557	21562	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
562	NC_003140	GA	3	6	21577	21582	50 %	0 %	50 %	0 %	16119227
563	NC_003140	TA	3	6	21589	21594	50 %	50 %	0 %	0 %	16119227
564	NC_003140	ATGAA	2	10	21598	21607	60 %	20 %	20 %	0 %	16119227
565	NC_003140	ATTT	2	8	21646	21653	25 %	75 %	0 %	0 %	16119227
566	NC_003140	T	6	6	21651	21656	0 %	100 %	0 %	0 %	16119227
567	NC_003140	TAA	2	6	21665	21670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16119227
568	NC_003140	TGA	2	6	21710	21715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119227
569	NC_003140	A	7	7	21719	21725	100 %	0 %	0 %	0 %	16119227
570	NC_003140	GAT	3	9	21825	21833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119227
571	NC_003140	CTT	2	6	21904	21909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16119227
572	NC_003140	TAA	2	6	21941	21946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16119227
573	NC_003140	GAT	2	6	22059	22064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119227
574	NC_003140	TAT	3	9	22133	22141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16119227
575	NC_003140	TAA	2	6	22160	22165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16119227
576	NC_003140	A	6	6	22191	22196	100 %	0 %	0 %	0 %	16119227
577	NC_003140	AGAT	2	8	22276	22283	50 %	25 %	25 %	0 %	16119227
578	NC_003140	AGA	2	6	22328	22333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16119227
579	NC_003140	AGAA	2	8	22381	22388	75 %	0 %	25 %	0 %	16119227
580	NC_003140	T	6	6	22397	22402	0 %	100 %	0 %	0 %	16119227
581	NC_003140	AAC	2	6	22405	22410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16119227
582	NC_003140	ATT	2	6	22480	22485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_003140	AG	3	6	22545	22550	50 %	0 %	50 %	0 %	16119228
584	NC_003140	AT	3	6	22584	22589	50 %	50 %	0 %	0 %	16119228
585	NC_003140	TCCT	2	8	22639	22646	0 %	50 %	0 %	50 %	16119228
586	NC_003140	ATTT	2	8	22671	22678	25 %	75 %	0 %	0 %	16119228
587	NC_003140	TTAA	2	8	22697	22704	50 %	50 %	0 %	0 %	16119228
588	NC_003140	A	6	6	22721	22726	100 %	0 %	0 %	0 %	16119228
589	NC_003140	AG	3	6	22748	22753	50 %	0 %	50 %	0 %	16119228
590	NC_003140	TGG	2	6	22794	22799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
591	NC_003140	TTTC	2	8	22802	22809	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
592	NC_003140	CATT	2	8	22835	22842	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
593	NC_003140	AGA	2	6	22941	22946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
594	NC_003140	AT	3	6	22968	22973	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_003140	T	6	6	23040	23045	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_003140	TAT	2	6	23069	23074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_003140	T	6	6	23074	23079	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_003140	TAACG	2	10	23107	23116	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
599	NC_003140	ATG	2	6	23141	23146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
600	NC_003140	TCAT	2	8	23159	23166	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
601	NC_003140	CCT	2	6	23175	23180	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
602	NC_003140	CT	3	6	23179	23184	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
603	NC_003140	GA	3	6	23202	23207	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
604	NC_003140	GAC	2	6	23210	23215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_003140	TCT	2	6	23235	23240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_003140	TAA	2	6	23262	23267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16119229
607	NC_003140	TGT	2	6	23269	23274	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16119229
608	NC_003140	TA	3	6	23275	23280	50 %	50 %	0 %	0 %	16119229
609	NC_003140	ATAA	2	8	23287	23294	75 %	25 %	0 %	0 %	16119229
610	NC_003140	AAG	2	6	23334	23339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16119229
611	NC_003140	AAG	2	6	23358	23363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16119229
612	NC_003140	ATTT	2	8	23375	23382	25 %	75 %	0 %	0 %	16119230
613	NC_003140	CAA	2	6	23386	23391	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16119230
614	NC_003140	TAT	2	6	23405	23410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16119230
615	NC_003140	AAG	2	6	23419	23424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16119230
616	NC_003140	ATT	2	6	23444	23449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16119230
617	NC_003140	TTTG	2	8	23624	23631	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
618	NC_003140	GAT	2	6	23644	23649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
619	NC_003140	TA	3	6	23666	23671	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_003140	ATT	2	6	23710	23715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_003140	CAAA	2	8	23724	23731	75 %	0 %	0 %	25 %	16119231
622	NC_003140	TTC	2	6	23761	23766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16119231
623	NC_003140	TCT	2	6	23774	23779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16119231
624	NC_003140	TCT	2	6	23816	23821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16119231
625	NC_003140	T	7	7	23821	23827	0 %	100 %	0 %	0 %	16119231
626	NC_003140	CTT	2	6	23829	23834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16119231
627	NC_003140	TCG	2	6	23849	23854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119231
628	NC_003140	AT	3	6	23868	23873	50 %	50 %	0 %	0 %	16119231
629	NC_003140	TTC	2	6	23902	23907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16119231
630	NC_003140	TAG	2	6	23934	23939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119231
631	NC_003140	T	6	6	23946	23951	0 %	100 %	0 %	0 %	16119231
632	NC_003140	TAG	2	6	23979	23984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119231
633	NC_003140	TTTTTC	2	12	24010	24021	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	16119231
634	NC_003140	CT	3	6	24056	24061	0 %	50 %	0 %	50 %	16119231
635	NC_003140	TCTT	2	8	24097	24104	0 %	75 %	0 %	25 %	16119231
636	NC_003140	TTG	2	6	24129	24134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16119231
637	NC_003140	GAC	2	6	24141	24146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119231
638	NC_003140	ATT	2	6	24166	24171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16119231
639	NC_003140	CTA	2	6	24201	24206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16119231
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641	NC_003140	AGT	2	6	24268	24273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119231
642	NC_003140	T	6	6	24321	24326	0 %	100 %	0 %	0 %	16119231
643	NC_003140	TCT	2	6	24338	24343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16119231
644	NC_003140	TAA	2	6	24345	24350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16119231
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647	NC_003140	ATC	2	6	24460	24465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
648	NC_003140	TAA	3	9	24522	24530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
649	NC_003140	TAA	2	6	24537	24542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
650	NC_003140	CATC	2	8	24554	24561	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding

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