MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sulfolobus tokodaii str. 7 chromosome

Total Repeats: 65471

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_003106	TGG	2	6	133637	133642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15920288
3002	NC_003106	AAT	2	6	133645	133650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920288
3003	NC_003106	ATA	2	6	133665	133670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920289
3004	NC_003106	T	7	7	133674	133680	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_003106	CAT	2	6	133682	133687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3006	NC_003106	AC	3	6	133693	133698	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3007	NC_003106	T	6	6	133701	133706	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_003106	ACT	2	6	133713	133718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3009	NC_003106	AAG	2	6	133746	133751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_003106	A	6	6	133763	133768	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_003106	TCA	2	6	133843	133848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920290
3012	NC_003106	ACT	2	6	133873	133878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920290
3013	NC_003106	GTG	3	9	133898	133906	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15920290
3014	NC_003106	AT	3	6	133929	133934	50 %	50 %	0 %	0 %	15920290
3015	NC_003106	CTA	2	6	133958	133963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920290
3016	NC_003106	ATT	2	6	133977	133982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920290
3017	NC_003106	T	6	6	133997	134002	0 %	100 %	0 %	0 %	15920290
3018	NC_003106	TAC	3	9	134022	134030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920290
3019	NC_003106	T	6	6	134040	134045	0 %	100 %	0 %	0 %	15920290
3020	NC_003106	TAATG	2	10	134062	134071	40 %	40 %	20 %	0 %	15920290
3021	NC_003106	ATT	2	6	134202	134207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920291
3022	NC_003106	TCT	2	6	134263	134268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920291
3023	NC_003106	GGA	2	6	134296	134301	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15920291
3024	NC_003106	TTA	2	6	134326	134331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920291
3025	NC_003106	ATA	2	6	134344	134349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920291
3026	NC_003106	ATA	2	6	134354	134359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920291
3027	NC_003106	TATC	2	8	134378	134385	25 %	50 %	0 %	25 %	15920291
3028	NC_003106	TTA	2	6	134407	134412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920291
3029	NC_003106	TTA	2	6	134486	134491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920291
3030	NC_003106	ATT	2	6	134515	134520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920291
3031	NC_003106	ATT	2	6	134560	134565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920291
3032	NC_003106	TTA	2	6	134599	134604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920291
3033	NC_003106	TCT	2	6	134608	134613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920291
3034	NC_003106	TA	3	6	134631	134636	50 %	50 %	0 %	0 %	15920291
3035	NC_003106	GTAT	2	8	134733	134740	25 %	50 %	25 %	0 %	15920291
3036	NC_003106	TA	3	6	134777	134782	50 %	50 %	0 %	0 %	15920291
3037	NC_003106	GAA	2	6	134788	134793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15920291
3038	NC_003106	TA	3	6	134910	134915	50 %	50 %	0 %	0 %	15920292
3039	NC_003106	T	6	6	134971	134976	0 %	100 %	0 %	0 %	15920292
3040	NC_003106	TA	3	6	135030	135035	50 %	50 %	0 %	0 %	15920292
3041	NC_003106	TAT	2	6	135039	135044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920292
3042	NC_003106	TAA	2	6	135137	135142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920292
3043	NC_003106	CTA	2	6	135158	135163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920292
3044	NC_003106	TAA	2	6	135189	135194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920292
3045	NC_003106	TTA	2	6	135205	135210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920292
3046	NC_003106	TCT	2	6	135241	135246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920292
3047	NC_003106	CCT	2	6	135365	135370	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15920293
3048	NC_003106	TTCT	2	8	135382	135389	0 %	75 %	0 %	25 %	15920293
3049	NC_003106	GATAA	2	10	135412	135421	60 %	20 %	20 %	0 %	15920293
3050	NC_003106	TAG	2	6	135454	135459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920293
3051	NC_003106	GCA	2	6	135465	135470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15920293
3052	NC_003106	AAT	2	6	135509	135514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920293
3053	NC_003106	TCT	2	6	135519	135524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920293
3054	NC_003106	TTC	2	6	135557	135562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920293
3055	NC_003106	GCA	2	6	135564	135569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15920293
3056	NC_003106	TAT	2	6	135572	135577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920293
3057	NC_003106	CTC	2	6	135616	135621	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15920293
3058	NC_003106	CTG	2	6	135628	135633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15920293
3059	NC_003106	ATT	2	6	135647	135652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920293
3060	NC_003106	TCCT	2	8	135673	135680	0 %	50 %	0 %	50 %	15920293
3061	NC_003106	CTT	2	6	135703	135708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920293
3062	NC_003106	AT	3	6	135722	135727	50 %	50 %	0 %	0 %	15920293
3063	NC_003106	TCA	2	6	135769	135774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920293
3064	NC_003106	T	6	6	135785	135790	0 %	100 %	0 %	0 %	15920293
3065	NC_003106	GAA	2	6	135810	135815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15920293
3066	NC_003106	GCA	2	6	135816	135821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15920293
3067	NC_003106	CTT	2	6	135958	135963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920293
3068	NC_003106	TAAT	2	8	136003	136010	50 %	50 %	0 %	0 %	15920293
3069	NC_003106	TTAA	2	8	136095	136102	50 %	50 %	0 %	0 %	15920293
3070	NC_003106	ATC	2	6	136136	136141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920293
3071	NC_003106	T	6	6	136165	136170	0 %	100 %	0 %	0 %	15920293
3072	NC_003106	TTC	2	6	136175	136180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920293
3073	NC_003106	TCT	2	6	136212	136217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920293
3074	NC_003106	TCC	2	6	136269	136274	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15920293
3075	NC_003106	TTCC	2	8	136342	136349	0 %	50 %	0 %	50 %	15920293
3076	NC_003106	CCTAAT	2	12	136383	136394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920293
3077	NC_003106	CTG	2	6	136434	136439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15920293
3078	NC_003106	GT	3	6	136501	136506	0 %	50 %	50 %	0 %	15920293
3079	NC_003106	ATAA	2	8	136596	136603	75 %	25 %	0 %	0 %	15920293
3080	NC_003106	ATGA	2	8	136647	136654	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3081	NC_003106	TTA	2	6	136661	136666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_003106	TA	3	6	136698	136703	50 %	50 %	0 %	0 %	15920294
3083	NC_003106	ATT	2	6	136704	136709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920294
3084	NC_003106	T	6	6	136778	136783	0 %	100 %	0 %	0 %	15920294
3085	NC_003106	AT	3	6	136788	136793	50 %	50 %	0 %	0 %	15920294
3086	NC_003106	TA	3	6	136794	136799	50 %	50 %	0 %	0 %	15920294
3087	NC_003106	TAAGT	2	10	136802	136811	40 %	40 %	20 %	0 %	15920294
3088	NC_003106	GTT	2	6	136887	136892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15920294
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3090	NC_003106	TA	4	8	136940	136947	50 %	50 %	0 %	0 %	15920294
3091	NC_003106	AAAT	2	8	137132	137139	75 %	25 %	0 %	0 %	15920294
3092	NC_003106	GAA	2	6	137154	137159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15920294
3093	NC_003106	AGA	2	6	137168	137173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15920294
3094	NC_003106	ATTAT	2	10	137209	137218	40 %	60 %	0 %	0 %	15920294
3095	NC_003106	CCT	2	6	137280	137285	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15920294
3096	NC_003106	AT	3	6	137327	137332	50 %	50 %	0 %	0 %	15920294
3097	NC_003106	ACT	2	6	137337	137342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920294
3098	NC_003106	TC	3	6	137363	137368	0 %	50 %	0 %	50 %	15920294
3099	NC_003106	CTC	2	6	137377	137382	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15920294
3100	NC_003106	ATA	2	6	137418	137423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920294
3101	NC_003106	GAT	2	6	137435	137440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920294
3102	NC_003106	GCT	2	6	137460	137465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15920294
3103	NC_003106	T	7	7	137508	137514	0 %	100 %	0 %	0 %	15920295
3104	NC_003106	TAT	2	6	137519	137524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920295
3105	NC_003106	AGA	2	6	137536	137541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15920295
3106	NC_003106	TAA	2	6	137547	137552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920295
3107	NC_003106	AT	3	6	137554	137559	50 %	50 %	0 %	0 %	15920295
3108	NC_003106	CAA	2	6	137583	137588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15920295
3109	NC_003106	TCA	2	6	137620	137625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920295
3110	NC_003106	TAA	2	6	137640	137645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920295
3111	NC_003106	TGA	2	6	137683	137688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920295
3112	NC_003106	TAGG	2	8	137694	137701	25 %	25 %	50 %	0 %	15920295
3113	NC_003106	TGT	2	6	137743	137748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15920295
3114	NC_003106	CTT	2	6	137763	137768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920295
3115	NC_003106	TTG	2	6	137784	137789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15920295
3116	NC_003106	GA	3	6	137801	137806	50 %	0 %	50 %	0 %	15920295
3117	NC_003106	AAG	2	6	137844	137849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15920295
3118	NC_003106	AGAT	2	8	137908	137915	50 %	25 %	25 %	0 %	15920295
3119	NC_003106	GTAT	2	8	137916	137923	25 %	50 %	25 %	0 %	15920295
3120	NC_003106	GAA	2	6	137935	137940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15920295
3121	NC_003106	GTAGA	2	10	137946	137955	40 %	20 %	40 %	0 %	15920295
3122	NC_003106	TCC	2	6	137959	137964	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15920295
3123	NC_003106	AAT	2	6	137982	137987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920295
3124	NC_003106	T	6	6	137987	137992	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_003106	TTA	2	6	138035	138040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920296
3126	NC_003106	TTC	2	6	138048	138053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920296
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3130	NC_003106	TA	3	6	138242	138247	50 %	50 %	0 %	0 %	15920296
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3242	NC_003106	TAAT	2	8	142266	142273	50 %	50 %	0 %	0 %	15920300
3243	NC_003106	ATC	2	6	142286	142291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920300
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3248	NC_003106	TTA	2	6	142524	142529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920300
3249	NC_003106	TAA	2	6	142707	142712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920300
3250	NC_003106	TAC	2	6	142741	142746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920300
3251	NC_003106	TCATTT	2	12	142773	142784	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	15920300
3252	NC_003106	TCC	2	6	142792	142797	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15920300
3253	NC_003106	ATAG	2	8	142856	142863	50 %	25 %	25 %	0 %	15920300
3254	NC_003106	ATA	2	6	142940	142945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920300
3255	NC_003106	AGT	2	6	142970	142975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920300
3256	NC_003106	ATT	2	6	142998	143003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920300
3257	NC_003106	AATA	2	8	143074	143081	75 %	25 %	0 %	0 %	15920300
3258	NC_003106	TTAT	2	8	143112	143119	25 %	75 %	0 %	0 %	15920300
3259	NC_003106	AGTA	2	8	143144	143151	50 %	25 %	25 %	0 %	15920300
3260	NC_003106	CCA	2	6	143224	143229	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15920300
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3263	NC_003106	TCA	2	6	143332	143337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920300
3264	NC_003106	TTG	2	6	143386	143391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15920300
3265	NC_003106	TCT	4	12	143397	143408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920300
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3268	NC_003106	TAA	2	6	143453	143458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920300
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3270	NC_003106	TAA	2	6	143481	143486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920300
3271	NC_003106	T	6	6	143553	143558	0 %	100 %	0 %	0 %	15920300
3272	NC_003106	TTA	2	6	143616	143621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920300
3273	NC_003106	TCA	2	6	143637	143642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920300
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3275	NC_003106	AGAATA	2	12	143712	143723	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	15920300
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3279	NC_003106	T	7	7	143765	143771	0 %	100 %	0 %	0 %	15920300
3280	NC_003106	AT	3	6	143809	143814	50 %	50 %	0 %	0 %	15920300
3281	NC_003106	CTAC	2	8	143883	143890	25 %	25 %	0 %	50 %	15920300
3282	NC_003106	TA	3	6	143915	143920	50 %	50 %	0 %	0 %	15920300
3283	NC_003106	TTC	2	6	143939	143944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920300
3284	NC_003106	CT	3	6	143957	143962	0 %	50 %	0 %	50 %	15920300
3285	NC_003106	T	6	6	143990	143995	0 %	100 %	0 %	0 %	15920300
3286	NC_003106	GAA	2	6	144016	144021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15920300
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3289	NC_003106	AAT	2	6	144048	144053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920300
3290	NC_003106	AG	3	6	144069	144074	50 %	0 %	50 %	0 %	15920300
3291	NC_003106	AT	3	6	144160	144165	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3292	NC_003106	GAAAA	2	10	144174	144183	80 %	0 %	20 %	0 %	15920301
3293	NC_003106	A	6	6	144180	144185	100 %	0 %	0 %	0 %	15920301
3294	NC_003106	ATTT	2	8	144238	144245	25 %	75 %	0 %	0 %	15920301
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3303	NC_003106	ATT	2	6	144581	144586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920301
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3306	NC_003106	TTCT	2	8	144727	144734	0 %	75 %	0 %	25 %	15920301
3307	NC_003106	TAT	2	6	144751	144756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920301
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3314	NC_003106	ACAT	2	8	145119	145126	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3315	NC_003106	AT	3	6	145125	145130	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3316	NC_003106	ACT	2	6	145132	145137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3318	NC_003106	ATT	2	6	145204	145209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3319	NC_003106	ATTT	2	8	145221	145228	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3320	NC_003106	TAAG	2	8	145271	145278	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3321	NC_003106	CAA	2	6	145291	145296	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3322	NC_003106	ATT	2	6	145328	145333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3323	NC_003106	AT	3	6	145355	145360	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3324	NC_003106	TTAT	2	8	145384	145391	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3325	NC_003106	GAA	2	6	145392	145397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3326	NC_003106	AGTT	2	8	145404	145411	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3327	NC_003106	ATTTA	2	10	145440	145449	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3328	NC_003106	TCAC	2	8	145486	145493	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3329	NC_003106	CTT	2	6	145508	145513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3330	NC_003106	AT	3	6	145524	145529	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3331	NC_003106	A	6	6	145545	145550	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3332	NC_003106	GAA	2	6	145592	145597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3333	NC_003106	TTACG	2	10	145608	145617	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3334	NC_003106	TAT	2	6	145652	145657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920302
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3337	NC_003106	AT	3	6	145724	145729	50 %	50 %	0 %	0 %	15920302
3338	NC_003106	TA	3	6	145738	145743	50 %	50 %	0 %	0 %	15920302
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3350	NC_003106	A	6	6	146142	146147	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3351	NC_003106	ATA	2	6	146199	146204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3352	NC_003106	ATTT	2	8	146223	146230	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3353	NC_003106	AAG	2	6	146232	146237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3354	NC_003106	GAA	2	6	146240	146245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3355	NC_003106	ATA	2	6	146252	146257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3356	NC_003106	AT	3	6	146262	146267	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3357	NC_003106	AT	3	6	146312	146317	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3358	NC_003106	AAT	2	6	146338	146343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3359	NC_003106	ATA	2	6	146349	146354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3360	NC_003106	AAAT	2	8	146370	146377	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3361	NC_003106	GAT	2	6	146420	146425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3362	NC_003106	AATC	2	8	146464	146471	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3363	NC_003106	AGA	2	6	146473	146478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3364	NC_003106	ATT	2	6	146578	146583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3365	NC_003106	TAAT	2	8	146634	146641	50 %	50 %	0 %	0 %	15920303
3366	NC_003106	CTTA	2	8	146888	146895	25 %	50 %	0 %	25 %	15920303
3367	NC_003106	GTG	2	6	146902	146907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15920303
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3369	NC_003106	CTA	2	6	146983	146988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920303
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3373	NC_003106	TA	3	6	147043	147048	50 %	50 %	0 %	0 %	15920303
3374	NC_003106	A	6	6	147137	147142	100 %	0 %	0 %	0 %	15920303
3375	NC_003106	GAT	2	6	147210	147215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920303
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3377	NC_003106	ATTGAA	2	12	147378	147389	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	15920303
3378	NC_003106	ACA	2	6	147390	147395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15920303
3379	NC_003106	GAA	2	6	147496	147501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15920303
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