MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sulfolobus tokodaii str. 7 chromosome

Total Repeats: 65471

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_003106	AAGG	2	8	46724	46731	50 %	0 %	50 %	0 %	15920205
1002	NC_003106	ACA	2	6	46732	46737	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15920205
1003	NC_003106	TTG	2	6	46741	46746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15920205
1004	NC_003106	CTA	2	6	46768	46773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920205
1005	NC_003106	TA	3	6	46806	46811	50 %	50 %	0 %	0 %	15920205
1006	NC_003106	GAA	2	6	46869	46874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15920205
1007	NC_003106	A	6	6	46873	46878	100 %	0 %	0 %	0 %	15920205
1008	NC_003106	TAG	2	6	46904	46909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920205
1009	NC_003106	TTA	2	6	46910	46915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920205
1010	NC_003106	AAC	2	6	47015	47020	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15920206
1011	NC_003106	TA	3	6	47027	47032	50 %	50 %	0 %	0 %	15920206
1012	NC_003106	GA	3	6	47058	47063	50 %	0 %	50 %	0 %	15920206
1013	NC_003106	A	7	7	47128	47134	100 %	0 %	0 %	0 %	15920206
1014	NC_003106	TTATA	2	10	47173	47182	40 %	60 %	0 %	0 %	15920206
1015	NC_003106	AGC	2	6	47236	47241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15920206
1016	NC_003106	TCA	3	9	47248	47256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920206
1017	NC_003106	AG	4	8	47266	47273	50 %	0 %	50 %	0 %	15920206
1018	NC_003106	AAT	2	6	47291	47296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920206
1019	NC_003106	GAA	2	6	47330	47335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15920206
1020	NC_003106	ACTTA	2	10	47391	47400	40 %	40 %	0 %	20 %	15920206
1021	NC_003106	AAAC	2	8	47437	47444	75 %	0 %	0 %	25 %	15920206
1022	NC_003106	TAT	2	6	47459	47464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920206
1023	NC_003106	TAA	2	6	47550	47555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920206
1024	NC_003106	CTG	2	6	47606	47611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15920207
1025	NC_003106	AAT	2	6	47622	47627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920207
1026	NC_003106	C	6	6	47628	47633	0 %	0 %	0 %	100 %	15920207
1027	NC_003106	AT	3	6	47669	47674	50 %	50 %	0 %	0 %	15920207
1028	NC_003106	GGAA	2	8	47776	47783	50 %	0 %	50 %	0 %	15920207
1029	NC_003106	AAG	2	6	47859	47864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15920207
1030	NC_003106	TGAT	2	8	47870	47877	25 %	50 %	25 %	0 %	15920207
1031	NC_003106	GAA	2	6	47932	47937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15920207
1032	NC_003106	AT	3	6	47943	47948	50 %	50 %	0 %	0 %	15920207
1033	NC_003106	ACC	2	6	47997	48002	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15920207
1034	NC_003106	CTT	2	6	48048	48053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920207
1035	NC_003106	TAT	2	6	48056	48061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920207
1036	NC_003106	TAC	2	6	48165	48170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920207
1037	NC_003106	TA	3	6	48171	48176	50 %	50 %	0 %	0 %	15920207
1038	NC_003106	TTA	2	6	48348	48353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_003106	AAG	2	6	48386	48391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_003106	AAT	2	6	48396	48401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_003106	A	6	6	48436	48441	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_003106	TAA	2	6	48463	48468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_003106	TTTA	2	8	48493	48500	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_003106	CTTA	2	8	48541	48548	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1045	NC_003106	AAT	3	9	48598	48606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_003106	AGTAA	2	10	48625	48634	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_003106	ATC	2	6	48653	48658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_003106	TAT	2	6	48670	48675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_003106	ACT	2	6	48698	48703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_003106	GAGG	2	8	48746	48753	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_003106	TCA	2	6	48756	48761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_003106	TAT	2	6	48791	48796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_003106	CTT	2	6	48878	48883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_003106	CAA	2	6	48918	48923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_003106	AGT	2	6	48947	48952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_003106	AG	3	6	48965	48970	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_003106	TAAT	2	8	48976	48983	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_003106	CT	3	6	48991	48996	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1059	NC_003106	TAT	2	6	49039	49044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_003106	ATT	2	6	49137	49142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_003106	ACA	2	6	49212	49217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_003106	GAG	2	6	49316	49321	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_003106	TCT	2	6	49324	49329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_003106	CTAAA	2	10	49353	49362	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1065	NC_003106	GTA	2	6	49373	49378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_003106	AAC	2	6	49410	49415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_003106	T	6	6	49457	49462	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_003106	TAA	2	6	49566	49571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920208
1069	NC_003106	GAAA	2	8	49630	49637	75 %	0 %	25 %	0 %	15920208
1070	NC_003106	ATC	2	6	49700	49705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920208
1071	NC_003106	A	6	6	49710	49715	100 %	0 %	0 %	0 %	15920208
1072	NC_003106	ATA	2	6	49763	49768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920208
1073	NC_003106	TAA	2	6	49915	49920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920208
1074	NC_003106	TAA	2	6	50002	50007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920208
1075	NC_003106	AG	3	6	50024	50029	50 %	0 %	50 %	0 %	15920208
1076	NC_003106	TAA	2	6	50104	50109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920208
1077	NC_003106	CTTA	2	8	50143	50150	25 %	50 %	0 %	25 %	15920208
1078	NC_003106	AGA	2	6	50194	50199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15920208
1079	NC_003106	GTA	2	6	50219	50224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920208
1080	NC_003106	GAT	2	6	50297	50302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920208
1081	NC_003106	TAAA	2	8	50319	50326	75 %	25 %	0 %	0 %	15920208
1082	NC_003106	TAT	2	6	50347	50352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920208
1083	NC_003106	TAA	2	6	50448	50453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920208
1084	NC_003106	TAAC	2	8	50469	50476	50 %	25 %	0 %	25 %	15920208
1085	NC_003106	AGG	2	6	50561	50566	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15920208
1086	NC_003106	TGT	2	6	50687	50692	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15920208
1087	NC_003106	GTG	2	6	50701	50706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15920208
1088	NC_003106	TGA	2	6	50734	50739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920208
1089	NC_003106	ACC	2	6	50824	50829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1090	NC_003106	TCA	2	6	50905	50910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_003106	TA	3	6	50998	51003	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_003106	TTA	2	6	51033	51038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_003106	CTT	2	6	51043	51048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_003106	AT	4	8	51058	51065	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_003106	TA	3	6	51071	51076	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_003106	CTT	2	6	51083	51088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1097	NC_003106	AT	3	6	51093	51098	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_003106	AAT	5	15	51135	51149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_003106	ATA	2	6	51155	51160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_003106	ATA	2	6	51249	51254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_003106	A	6	6	51289	51294	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_003106	ATA	3	9	51318	51326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_003106	T	6	6	51354	51359	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_003106	T	6	6	51384	51389	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_003106	TTAT	2	8	51401	51408	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_003106	ATA	2	6	51558	51563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920209
1107	NC_003106	TTAATT	2	12	51591	51602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920209
1108	NC_003106	GAA	2	6	51606	51611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15920209
1109	NC_003106	AACA	2	8	51682	51689	75 %	0 %	0 %	25 %	15920209
1110	NC_003106	T	6	6	51706	51711	0 %	100 %	0 %	0 %	15920209
1111	NC_003106	CCT	2	6	51712	51717	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15920209
1112	NC_003106	ATA	2	6	51729	51734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920209
1113	NC_003106	TCT	2	6	51767	51772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920209
1114	NC_003106	TAA	2	6	51787	51792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920209
1115	NC_003106	CT	3	6	51801	51806	0 %	50 %	0 %	50 %	15920209
1116	NC_003106	A	6	6	51825	51830	100 %	0 %	0 %	0 %	15920209
1117	NC_003106	AATC	2	8	51852	51859	50 %	25 %	0 %	25 %	15920209
1118	NC_003106	CCT	2	6	51880	51885	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15920210
1119	NC_003106	GTC	2	6	51932	51937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15920210
1120	NC_003106	TCAACT	2	12	51987	51998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920210
1121	NC_003106	TAT	2	6	52043	52048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920210
1122	NC_003106	TCA	2	6	52062	52067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920210
1123	NC_003106	AT	3	6	52077	52082	50 %	50 %	0 %	0 %	15920210
1124	NC_003106	TTAG	2	8	52123	52130	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_003106	ATC	2	6	52176	52181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_003106	TTCC	2	8	52198	52205	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1127	NC_003106	CTA	2	6	52215	52220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_003106	TCA	2	6	52255	52260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1129	NC_003106	TTG	2	6	52285	52290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15920211
1130	NC_003106	AAG	2	6	52364	52369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15920211
1131	NC_003106	AT	3	6	52453	52458	50 %	50 %	0 %	0 %	15920211
1132	NC_003106	CTAAG	2	10	52477	52486	40 %	20 %	20 %	20 %	15920211
1133	NC_003106	AAT	2	6	52517	52522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920211
1134	NC_003106	ACG	2	6	52525	52530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15920211
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1399	NC_003106	TTA	2	6	64511	64516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920224
1400	NC_003106	TCA	2	6	64588	64593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920224
1401	NC_003106	TACC	2	8	64647	64654	25 %	25 %	0 %	50 %	15920225
1402	NC_003106	AAG	2	6	64680	64685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15920225
1403	NC_003106	TAAG	2	8	64720	64727	50 %	25 %	25 %	0 %	15920225
1404	NC_003106	CT	3	6	64781	64786	0 %	50 %	0 %	50 %	15920225
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