MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sulfolobus tokodaii str. 7 chromosome

Total Repeats: 65471

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_003106	AG	3	6	23343	23348	50 %	0 %	50 %	0 %	15920190
502	NC_003106	TTCTA	2	10	23368	23377	20 %	60 %	0 %	20 %	15920190
503	NC_003106	TA	4	8	23444	23451	50 %	50 %	0 %	0 %	15920190
504	NC_003106	TA	3	6	23534	23539	50 %	50 %	0 %	0 %	15920190
505	NC_003106	TGA	3	9	23541	23549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920190
506	NC_003106	ATA	2	6	23570	23575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920190
507	NC_003106	AAG	2	6	23593	23598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15920190
508	NC_003106	AGT	2	6	23599	23604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920190
509	NC_003106	A	6	6	23688	23693	100 %	0 %	0 %	0 %	15920190
510	NC_003106	AT	3	6	23721	23726	50 %	50 %	0 %	0 %	15920190
511	NC_003106	AAG	2	6	23740	23745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15920190
512	NC_003106	TAA	2	6	23771	23776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920190
513	NC_003106	TA	3	6	23815	23820	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_003106	CAAA	2	8	23821	23828	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
515	NC_003106	A	6	6	23826	23831	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_003106	T	6	6	23854	23859	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_003106	TA	3	6	23883	23888	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_003106	TAC	2	6	23894	23899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_003106	TATAT	2	10	23907	23916	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_003106	CCT	2	6	23933	23938	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
521	NC_003106	TTAAA	2	10	23974	23983	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_003106	CAG	2	6	24015	24020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_003106	TGTC	2	8	24107	24114	0 %	50 %	25 %	25 %	15920191
524	NC_003106	TAG	2	6	24156	24161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920191
525	NC_003106	ACG	2	6	24182	24187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15920191
526	NC_003106	TAA	2	6	24210	24215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920191
527	NC_003106	CTT	2	6	24235	24240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920191
528	NC_003106	ACA	2	6	24320	24325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15920191
529	NC_003106	TAG	2	6	24444	24449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920191
530	NC_003106	TAA	2	6	24450	24455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920191
531	NC_003106	ACA	2	6	24476	24481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15920191
532	NC_003106	CTC	2	6	24631	24636	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15920191
533	NC_003106	TCC	2	6	24653	24658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15920191
534	NC_003106	TTAA	2	8	24740	24747	50 %	50 %	0 %	0 %	15920191
535	NC_003106	TCT	2	6	24755	24760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920191
536	NC_003106	ATC	2	6	24845	24850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920191
537	NC_003106	TCC	2	6	24863	24868	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15920191
538	NC_003106	AAT	2	6	24886	24891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920191
539	NC_003106	GCTT	2	8	24899	24906	0 %	50 %	25 %	25 %	15920191
540	NC_003106	ACT	2	6	25004	25009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920191
541	NC_003106	CT	3	6	25038	25043	0 %	50 %	0 %	50 %	15920191
542	NC_003106	CTT	2	6	25101	25106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920191
543	NC_003106	CCGTA	2	10	25237	25246	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
544	NC_003106	ATT	2	6	25288	25293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_003106	GGA	2	6	25371	25376	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
546	NC_003106	GGA	2	6	25435	25440	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
547	NC_003106	TAC	2	6	25545	25550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_003106	AAT	2	6	25707	25712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_003106	TAA	2	6	25713	25718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_003106	TAG	2	6	25722	25727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
551	NC_003106	TTCCTA	2	12	25755	25766	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_003106	CAT	2	6	25807	25812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_003106	ACT	2	6	25867	25872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_003106	ACA	3	9	25877	25885	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_003106	TCA	2	6	26094	26099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_003106	TTTC	2	8	26101	26108	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
557	NC_003106	AT	3	6	26117	26122	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_003106	AG	3	6	26166	26171	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
559	NC_003106	TA	3	6	26180	26185	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_003106	TAA	2	6	26281	26286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_003106	TCA	2	6	26340	26345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_003106	TCA	2	6	26419	26424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_003106	TTC	2	6	26428	26433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_003106	TTC	2	6	26479	26484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_003106	TTC	2	6	26493	26498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_003106	TCA	2	6	26528	26533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_003106	AGG	2	6	26561	26566	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
568	NC_003106	TCA	2	6	26590	26595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_003106	ATCT	2	8	26690	26697	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
570	NC_003106	CTA	2	6	26739	26744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_003106	TCA	2	6	26842	26847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_003106	ACT	2	6	26871	26876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_003106	TTTC	2	8	26887	26894	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
574	NC_003106	TCA	2	6	26910	26915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_003106	AACTC	2	10	26931	26940	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
576	NC_003106	TCA	2	6	26973	26978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
577	NC_003106	TA	3	6	27007	27012	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_003106	AAT	2	6	27066	27071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_003106	CTT	2	6	27117	27122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_003106	TCC	2	6	27133	27138	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
581	NC_003106	AATTC	2	10	27142	27151	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
582	NC_003106	TAAATA	2	12	27174	27185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_003106	TCA	2	6	27227	27232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_003106	TTC	2	6	27314	27319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_003106	TCA	2	6	27420	27425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920192
586	NC_003106	TAA	2	6	27457	27462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920192
587	NC_003106	ATT	2	6	27496	27501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920192
588	NC_003106	ACC	2	6	27556	27561	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15920192
589	NC_003106	CCT	2	6	27587	27592	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15920192
590	NC_003106	TCA	2	6	27611	27616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920192
591	NC_003106	ACA	2	6	27622	27627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15920192
592	NC_003106	TAC	2	6	27631	27636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920192
593	NC_003106	TCA	2	6	27740	27745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_003106	T	6	6	27775	27780	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_003106	AAG	2	6	27901	27906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
596	NC_003106	TGT	2	6	27947	27952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
597	NC_003106	TAA	2	6	27955	27960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_003106	TCA	2	6	27999	28004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_003106	CAGA	2	8	28092	28099	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
600	NC_003106	CTT	2	6	28105	28110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_003106	TTC	2	6	28138	28143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_003106	TAC	2	6	28161	28166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_003106	A	6	6	28195	28200	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_003106	CCT	2	6	28219	28224	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
605	NC_003106	TCCT	2	8	28228	28235	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
606	NC_003106	TCA	2	6	28254	28259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_003106	AGA	2	6	28447	28452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
608	NC_003106	TAAA	2	8	28467	28474	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_003106	TTTC	2	8	28480	28487	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
610	NC_003106	CTTC	2	8	28517	28524	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
611	NC_003106	TCA	2	6	28563	28568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_003106	GAA	2	6	28584	28589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
613	NC_003106	TCT	2	6	28627	28632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_003106	T	6	6	28638	28643	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_003106	CTT	2	6	28644	28649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_003106	CCTTT	2	10	28664	28673	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
617	NC_003106	TCA	2	6	28690	28695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_003106	TCA	2	6	28754	28759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_003106	TCA	2	6	28818	28823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_003106	CTA	2	6	28826	28831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_003106	TCA	3	9	28883	28891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_003106	GTG	2	6	28906	28911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
623	NC_003106	TCA	2	6	28949	28954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_003106	AGA	2	6	28969	28974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
625	NC_003106	TCA	2	6	29012	29017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_003106	GGTGA	2	10	29037	29046	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
627	NC_003106	TCA	2	6	29077	29082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_003106	TAG	2	6	29096	29101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
629	NC_003106	TCA	2	6	29142	29147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_003106	GAT	2	6	29214	29219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920193
631	NC_003106	TCA	2	6	29268	29273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920193
632	NC_003106	GAA	2	6	29293	29298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15920193
633	NC_003106	AAG	2	6	29299	29304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15920193
634	NC_003106	ATA	2	6	29364	29369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920193
635	NC_003106	ATC	2	6	29420	29425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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637	NC_003106	GTT	2	6	29526	29531	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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