MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sulfolobus tokodaii str. 7 chromosome

Total Repeats: 65471

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_003106	TA	3	6	195666	195671	50 %	50 %	0 %	0 %	161751105
4502	NC_003106	TA	4	8	195762	195769	50 %	50 %	0 %	0 %	161751105
4503	NC_003106	ATA	2	6	195843	195848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161751105
4504	NC_003106	ATA	2	6	195857	195862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161751105
4505	NC_003106	A	6	6	195950	195955	100 %	0 %	0 %	0 %	161751105
4506	NC_003106	CTT	2	6	195996	196001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161751105
4507	NC_003106	AAT	2	6	196012	196017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161751105
4508	NC_003106	TTA	2	6	196138	196143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161751105
4509	NC_003106	GCA	2	6	196148	196153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161751105
4510	NC_003106	TTCC	2	8	196169	196176	0 %	50 %	0 %	50 %	161751105
4511	NC_003106	TGA	2	6	196240	196245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161751105
4512	NC_003106	AAT	2	6	196267	196272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161751105
4513	NC_003106	AATTG	2	10	196303	196312	40 %	40 %	20 %	0 %	161751105
4514	NC_003106	TGG	2	6	196324	196329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161751105
4515	NC_003106	TGA	2	6	196381	196386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161751105
4516	NC_003106	TAA	2	6	196387	196392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161751105
4517	NC_003106	AGA	3	9	196405	196413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161751105
4518	NC_003106	GAA	2	6	196484	196489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161751105
4519	NC_003106	AGA	2	6	196504	196509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161751105
4520	NC_003106	ATG	2	6	196539	196544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161751105
4521	NC_003106	AG	3	6	196556	196561	50 %	0 %	50 %	0 %	161751105
4522	NC_003106	GGA	2	6	196566	196571	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161751105
4523	NC_003106	AAT	2	6	196581	196586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161751105
4524	NC_003106	AGT	2	6	196601	196606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920349
4525	NC_003106	TAA	2	6	196679	196684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920349
4526	NC_003106	TCT	2	6	196696	196701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920349
4527	NC_003106	T	6	6	196711	196716	0 %	100 %	0 %	0 %	15920349
4528	NC_003106	TCAT	2	8	196765	196772	25 %	50 %	0 %	25 %	15920349
4529	NC_003106	TTC	2	6	196790	196795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920349
4530	NC_003106	ACT	2	6	196825	196830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920349
4531	NC_003106	CTT	2	6	196874	196879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920349
4532	NC_003106	TAT	2	6	196952	196957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920349
4533	NC_003106	T	6	6	196970	196975	0 %	100 %	0 %	0 %	15920349
4534	NC_003106	T	6	6	196998	197003	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4535	NC_003106	T	6	6	197028	197033	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4536	NC_003106	AAAT	2	8	197078	197085	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4537	NC_003106	TAAT	2	8	197121	197128	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4538	NC_003106	GAA	2	6	197129	197134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4539	NC_003106	AAGTT	2	10	197159	197168	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4540	NC_003106	ATA	2	6	197195	197200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4541	NC_003106	ATT	2	6	197220	197225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4542	NC_003106	AAG	2	6	197244	197249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4543	NC_003106	ATA	2	6	197258	197263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4544	NC_003106	AAT	2	6	197272	197277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4545	NC_003106	TTTA	2	8	197282	197289	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4546	NC_003106	CT	3	6	197307	197312	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4547	NC_003106	TAA	2	6	197313	197318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4548	NC_003106	A	6	6	197332	197337	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4549	NC_003106	AAT	2	6	197340	197345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4550	NC_003106	T	6	6	197368	197373	0 %	100 %	0 %	0 %	15920350
4551	NC_003106	TGC	2	6	197411	197416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15920350
4552	NC_003106	ATG	2	6	197439	197444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920350
4553	NC_003106	CTG	2	6	197503	197508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15920350
4554	NC_003106	TTC	2	6	197517	197522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920350
4555	NC_003106	ACTT	2	8	197529	197536	25 %	50 %	0 %	25 %	15920350
4556	NC_003106	T	6	6	197535	197540	0 %	100 %	0 %	0 %	15920350
4557	NC_003106	TAT	2	6	197546	197551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920350
4558	NC_003106	CTT	2	6	197554	197559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920350
4559	NC_003106	TCT	3	9	197569	197577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920350
4560	NC_003106	AGG	2	6	197585	197590	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15920350
4561	NC_003106	AT	3	6	197594	197599	50 %	50 %	0 %	0 %	15920350
4562	NC_003106	TTTA	2	8	197602	197609	25 %	75 %	0 %	0 %	15920350
4563	NC_003106	CTA	2	6	197644	197649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920350
4564	NC_003106	TGG	2	6	197709	197714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15920350
4565	NC_003106	CAA	2	6	197739	197744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15920350
4566	NC_003106	T	6	6	197768	197773	0 %	100 %	0 %	0 %	15920350
4567	NC_003106	ATT	2	6	197811	197816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920350
4568	NC_003106	GA	3	6	197827	197832	50 %	0 %	50 %	0 %	15920350
4569	NC_003106	AT	4	8	197886	197893	50 %	50 %	0 %	0 %	15920350
4570	NC_003106	AGA	2	6	198021	198026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15920351
4571	NC_003106	A	7	7	198033	198039	100 %	0 %	0 %	0 %	15920351
4572	NC_003106	AAG	2	6	198062	198067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15920351
4573	NC_003106	TTC	2	6	198140	198145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920351
4574	NC_003106	TTTA	2	8	198176	198183	25 %	75 %	0 %	0 %	15920351
4575	NC_003106	TAA	2	6	198192	198197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920351
4576	NC_003106	AGT	2	6	198252	198257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920351
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4579	NC_003106	AG	3	6	198523	198528	50 %	0 %	50 %	0 %	15920351
4580	NC_003106	GAA	2	6	198574	198579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15920351
4581	NC_003106	GAA	2	6	198591	198596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15920351
4582	NC_003106	AG	3	6	198608	198613	50 %	0 %	50 %	0 %	15920351
4583	NC_003106	T	6	6	198652	198657	0 %	100 %	0 %	0 %	15920352
4584	NC_003106	ATA	2	6	198691	198696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920352
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4587	NC_003106	T	6	6	198766	198771	0 %	100 %	0 %	0 %	15920352
4588	NC_003106	CTT	2	6	198837	198842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920352
4589	NC_003106	T	6	6	198927	198932	0 %	100 %	0 %	0 %	15920352
4590	NC_003106	T	6	6	198951	198956	0 %	100 %	0 %	0 %	15920352
4591	NC_003106	ACC	2	6	198957	198962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4592	NC_003106	ATC	2	6	198964	198969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4593	NC_003106	TAAA	2	8	198978	198985	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4594	NC_003106	T	6	6	198989	198994	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4595	NC_003106	TAA	2	6	199016	199021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4596	NC_003106	T	6	6	199023	199028	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4597	NC_003106	GTATT	2	10	199040	199049	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4598	NC_003106	A	7	7	199076	199082	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4599	NC_003106	TTA	2	6	199084	199089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4600	NC_003106	TGATA	2	10	199166	199175	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4601	NC_003106	AAAG	2	8	199220	199227	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4602	NC_003106	GCTA	2	8	199230	199237	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4603	NC_003106	GA	3	6	199239	199244	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4604	NC_003106	AAG	2	6	199245	199250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4605	NC_003106	TTTTA	2	10	199252	199261	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4606	NC_003106	CTG	2	6	199267	199272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15920353
4607	NC_003106	AAG	2	6	199352	199357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15920353
4608	NC_003106	CAA	2	6	199386	199391	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15920353
4609	NC_003106	TAA	2	6	199414	199419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920353
4610	NC_003106	TTC	2	6	199432	199437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920353
4611	NC_003106	TTTCCT	2	12	199448	199459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920353
4612	NC_003106	ATA	2	6	199471	199476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920353
4613	NC_003106	TAT	2	6	199482	199487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920353
4614	NC_003106	AAG	2	6	199499	199504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15920353
4615	NC_003106	CTT	2	6	199567	199572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920353
4616	NC_003106	TAT	2	6	199609	199614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920353
4617	NC_003106	TCA	2	6	199658	199663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920353
4618	NC_003106	CTC	2	6	199755	199760	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15920353
4619	NC_003106	ATC	2	6	199777	199782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920353
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4621	NC_003106	ATC	2	6	199855	199860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920353
4622	NC_003106	CTT	2	6	199940	199945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920353
4623	NC_003106	GCA	2	6	199949	199954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15920353
4624	NC_003106	TCATCT	2	12	200043	200054	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	15920353
4625	NC_003106	GCT	2	6	200069	200074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15920353
4626	NC_003106	TTG	2	6	200080	200085	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15920353
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4628	NC_003106	GAT	2	6	200129	200134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920353
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