MICAS: Microsatellite Analysis Server

Penta-nucleotide Repeats of Streptococcus pneumoniae R6 chromosome

Total Repeats: 1533

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003098	AAAAG	2	10	345	354	80 %	0 %	20 %	0 %	15902045
2	NC_003098	GAAAT	2	10	506	515	60 %	20 %	20 %	0 %	15902045
3	NC_003098	AAAAT	2	10	1288	1297	80 %	20 %	0 %	0 %	15902045
4	NC_003098	GTAAA	2	10	2446	2455	60 %	20 %	20 %	0 %	15902046
5	NC_003098	GAAAA	2	10	2702	2711	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_003098	AAAAT	2	10	2833	2842	80 %	20 %	0 %	0 %	15902047
7	NC_003098	TGAAA	2	10	2974	2983	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_003098	AAACA	2	10	4235	4244	80 %	0 %	0 %	20 %	15902049
9	NC_003098	TCAAT	2	10	5862	5871	40 %	40 %	0 %	20 %	15902050
10	NC_003098	TTTTC	2	10	5902	5911	0 %	80 %	0 %	20 %	15902050
11	NC_003098	TAAAT	2	10	6420	6429	60 %	40 %	0 %	0 %	15902050
12	NC_003098	ACTCT	2	10	6501	6510	20 %	40 %	0 %	40 %	15902050
13	NC_003098	AAACG	2	10	7744	7753	60 %	0 %	20 %	20 %	15902050
14	NC_003098	TTGGT	2	10	7973	7982	0 %	60 %	40 %	0 %	15902050
15	NC_003098	CAATT	2	10	8042	8051	40 %	40 %	0 %	20 %	15902050
16	NC_003098	AGGAA	2	10	9058	9067	60 %	0 %	40 %	0 %	15902053
17	NC_003098	ATTGA	2	10	10476	10485	40 %	40 %	20 %	0 %	15902054
18	NC_003098	ATTCT	2	10	12609	12618	20 %	60 %	0 %	20 %	15902056
19	NC_003098	ATGCT	2	10	13837	13846	20 %	40 %	20 %	20 %	15902056
20	NC_003098	TCGTG	2	10	16225	16234	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
21	NC_003098	GTTAA	2	10	16946	16955	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_003098	GGGAG	2	10	17464	17473	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
23	NC_003098	AGGGA	2	10	19675	19684	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
24	NC_003098	ATGGT	2	10	22843	22852	20 %	40 %	40 %	0 %	15902065
25	NC_003098	CTTTT	2	10	24011	24020	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_003098	TATTT	2	10	27720	27729	20 %	80 %	0 %	0 %	15902071
27	NC_003098	TTTTA	2	10	27732	27741	20 %	80 %	0 %	0 %	15902071
28	NC_003098	AGCAG	2	10	31680	31689	40 %	0 %	40 %	20 %	15902076
29	NC_003098	TAAAG	2	10	34891	34900	60 %	20 %	20 %	0 %	15902078
30	NC_003098	CAGAT	2	10	42494	42503	40 %	20 %	20 %	20 %	15902087
31	NC_003098	TTTAC	2	10	43196	43205	20 %	60 %	0 %	20 %	15902087
32	NC_003098	AGAGG	2	10	44058	44067	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
33	NC_003098	GTGAC	2	10	46827	46836	20 %	20 %	40 %	20 %	15902090
34	NC_003098	GTGAT	2	10	47817	47826	20 %	40 %	40 %	0 %	15902090
35	NC_003098	CCTAC	2	10	49768	49777	20 %	20 %	0 %	60 %	15902090
36	NC_003098	TGGCT	2	10	50637	50646	0 %	40 %	40 %	20 %	15902091
37	NC_003098	AAATG	2	10	51243	51252	60 %	20 %	20 %	0 %	15902091
38	NC_003098	AGCTA	2	10	52137	52146	40 %	20 %	20 %	20 %	15902092
39	NC_003098	GACGT	2	10	54311	54320	20 %	20 %	40 %	20 %	15902095
40	NC_003098	CCTTG	2	10	55027	55036	0 %	40 %	20 %	40 %	15902095
41	NC_003098	TCAAA	2	10	55221	55230	60 %	20 %	0 %	20 %	15902095
42	NC_003098	AGTGG	2	10	57588	57597	20 %	20 %	60 %	0 %	15902097
43	NC_003098	GGGTG	2	10	57626	57635	0 %	20 %	80 %	0 %	15902097
44	NC_003098	CTATT	2	10	58593	58602	20 %	60 %	0 %	20 %	15902098
45	NC_003098	GAAGC	2	10	58783	58792	40 %	0 %	40 %	20 %	15902098
46	NC_003098	GCTTG	2	10	59238	59247	0 %	40 %	40 %	20 %	15902100
47	NC_003098	GCTTT	2	10	60667	60676	0 %	60 %	20 %	20 %	15902101
48	NC_003098	TCTGG	2	10	61273	61282	0 %	40 %	40 %	20 %	15902101
49	NC_003098	AGCAT	2	10	62227	62236	40 %	20 %	20 %	20 %	15902101
50	NC_003098	TACCA	2	10	62925	62934	40 %	20 %	0 %	40 %	15902101
51	NC_003098	TTCCT	2	10	63942	63951	0 %	60 %	0 %	40 %	15902101
52	NC_003098	TTTAT	2	10	64522	64531	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_003098	TTGGT	2	10	67897	67906	0 %	60 %	40 %	0 %	15902104
54	NC_003098	CTTCA	2	10	68952	68961	20 %	40 %	0 %	40 %	15902105
55	NC_003098	AATCA	2	10	69064	69073	60 %	20 %	0 %	20 %	15902106
56	NC_003098	ATTCA	2	10	70442	70451	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_003098	AGCTC	2	10	71286	71295	20 %	20 %	20 %	40 %	15902108
58	NC_003098	GCTCC	2	10	75567	75576	0 %	20 %	20 %	60 %	15902112
59	NC_003098	GCTGT	2	10	75885	75894	0 %	40 %	40 %	20 %	15902112
60	NC_003098	TATCA	2	10	76209	76218	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_003098	TCTAT	2	10	77089	77098	20 %	60 %	0 %	20 %	15902114
62	NC_003098	AGAAA	2	10	78014	78023	80 %	0 %	20 %	0 %	15902114
63	NC_003098	GAAAG	2	10	78066	78075	60 %	0 %	40 %	0 %	15902115
64	NC_003098	GCGGT	2	10	79262	79271	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
65	NC_003098	TGACT	2	10	81016	81025	20 %	40 %	20 %	20 %	15902119
66	NC_003098	ATAAA	2	10	87609	87618	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_003098	TAACC	2	10	87707	87716	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
68	NC_003098	ATTCT	2	10	87882	87891	20 %	60 %	0 %	20 %	15902125
69	NC_003098	TTACT	2	10	91699	91708	20 %	60 %	0 %	20 %	15902128
70	NC_003098	TGGGA	2	10	92353	92362	20 %	20 %	60 %	0 %	15902128
71	NC_003098	CAACC	2	10	92409	92418	40 %	0 %	0 %	60 %	15902128
72	NC_003098	TGCTT	2	10	93073	93082	0 %	60 %	20 %	20 %	15902129
73	NC_003098	TGGCT	2	10	93256	93265	0 %	40 %	40 %	20 %	15902129
74	NC_003098	AGATA	2	10	97223	97232	60 %	20 %	20 %	0 %	15902134
75	NC_003098	GTTTG	2	10	97390	97399	0 %	60 %	40 %	0 %	15902134
76	NC_003098	AAAGC	2	10	102295	102304	60 %	0 %	20 %	20 %	15902138
77	NC_003098	GGCTT	2	10	103719	103728	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
78	NC_003098	CACAA	2	10	104058	104067	60 %	0 %	0 %	40 %	15902140
79	NC_003098	ATGAA	2	10	105110	105119	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_003098	GGAAT	2	10	105464	105473	40 %	20 %	40 %	0 %	15902142
81	NC_003098	AGGAT	2	10	106029	106038	40 %	20 %	40 %	0 %	15902143
82	NC_003098	CTTTG	2	10	107338	107347	0 %	60 %	20 %	20 %	15902143
83	NC_003098	TCCTC	2	10	107464	107473	0 %	40 %	0 %	60 %	15902143
84	NC_003098	ACAGT	2	10	116008	116017	40 %	20 %	20 %	20 %	15902151
85	NC_003098	AATAA	2	10	116752	116761	80 %	20 %	0 %	0 %	15902152
86	NC_003098	TTATT	2	10	120831	120840	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_003098	GCTTT	2	10	121005	121014	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
88	NC_003098	ATTTT	2	10	121140	121149	20 %	80 %	0 %	0 %	15902157
89	NC_003098	TTGGA	2	10	121587	121596	20 %	40 %	40 %	0 %	15902157
90	NC_003098	TAAAA	2	10	126865	126874	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_003098	TTCTA	2	10	127841	127850	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_003098	ATTAA	2	10	130220	130229	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_003098	CAGAT	2	10	130803	130812	40 %	20 %	20 %	20 %	15902166
94	NC_003098	CGTGG	2	10	131045	131054	0 %	20 %	60 %	20 %	15902166
95	NC_003098	GTTTG	2	10	137010	137019	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
96	NC_003098	ACATG	2	10	137155	137164	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
97	NC_003098	GAAAA	2	10	137747	137756	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_003098	TTGGA	2	10	138032	138041	20 %	40 %	40 %	0 %	15902173
99	NC_003098	ATGTT	2	10	148491	148500	20 %	60 %	20 %	0 %	15902183
100	NC_003098	ACAAA	2	10	149006	149015	80 %	0 %	0 %	20 %	15902183
101	NC_003098	TTTTC	2	10	150418	150427	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_003098	GAAAT	2	10	151907	151916	60 %	20 %	20 %	0 %	15902187
103	NC_003098	TTAGT	2	10	152779	152788	20 %	60 %	20 %	0 %	15902188
104	NC_003098	CTTGC	2	10	153135	153144	0 %	40 %	20 %	40 %	15902188
105	NC_003098	AGAAA	2	10	155531	155540	80 %	0 %	20 %	0 %	15902191
106	NC_003098	TATAC	2	10	157492	157501	40 %	40 %	0 %	20 %	15902192
107	NC_003098	AGATC	2	10	157797	157806	40 %	20 %	20 %	20 %	15902193
108	NC_003098	TTTGT	2	10	159806	159815	0 %	80 %	20 %	0 %	15902195
109	NC_003098	ACTAT	2	10	163812	163821	40 %	40 %	0 %	20 %	15902198
110	NC_003098	TGAAA	2	10	165213	165222	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_003098	TTGAG	2	10	166392	166401	20 %	40 %	40 %	0 %	15902201
112	NC_003098	ATTTC	2	10	166739	166748	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_003098	GCCTT	2	10	168366	168375	0 %	40 %	20 %	40 %	15902204
114	NC_003098	AAGTA	2	10	171148	171157	60 %	20 %	20 %	0 %	15902206
115	NC_003098	TTGAT	2	10	172307	172316	20 %	60 %	20 %	0 %	15902207
116	NC_003098	TCACT	2	10	172682	172691	20 %	40 %	0 %	40 %	15902208
117	NC_003098	ATTTT	2	10	173005	173014	20 %	80 %	0 %	0 %	15902208
118	NC_003098	TTAAG	2	10	173357	173366	40 %	40 %	20 %	0 %	15902208
119	NC_003098	CCCTG	2	10	173988	173997	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
120	NC_003098	TCAGG	2	10	174271	174280	20 %	20 %	40 %	20 %	15902209
121	NC_003098	GCCTT	2	10	175885	175894	0 %	40 %	20 %	40 %	15902211
122	NC_003098	TTCCC	2	10	176459	176468	0 %	40 %	0 %	60 %	15902212
123	NC_003098	TCTTT	2	10	180008	180017	0 %	80 %	0 %	20 %	15902215
124	NC_003098	GGCTA	2	10	181664	181673	20 %	20 %	40 %	20 %	15902215
125	NC_003098	GAAAG	2	10	182022	182031	60 %	0 %	40 %	0 %	15902215
126	NC_003098	AGTTA	2	10	183302	183311	40 %	40 %	20 %	0 %	15902217
127	NC_003098	TGGAG	2	10	183992	184001	20 %	20 %	60 %	0 %	15902218
128	NC_003098	AAATC	2	10	184534	184543	60 %	20 %	0 %	20 %	15902219
129	NC_003098	GCAGA	2	10	186350	186359	40 %	0 %	40 %	20 %	15902222
130	NC_003098	AAGGA	2	10	186612	186621	60 %	0 %	40 %	0 %	15902222
131	NC_003098	ATGAT	2	10	189362	189371	40 %	40 %	20 %	0 %	15902225
132	NC_003098	GTAGA	2	10	189533	189542	40 %	20 %	40 %	0 %	15902226
133	NC_003098	TTTAG	2	10	190018	190027	20 %	60 %	20 %	0 %	15902226
134	NC_003098	CTTTT	2	10	190492	190501	0 %	80 %	0 %	20 %	15902226
135	NC_003098	GTCTG	2	10	190969	190978	0 %	40 %	40 %	20 %	15902226
136	NC_003098	GTCTT	2	10	192315	192324	0 %	60 %	20 %	20 %	15902227
137	NC_003098	AGCAG	2	10	193998	194007	40 %	0 %	40 %	20 %	15902228
138	NC_003098	GGGAG	2	10	194337	194346	20 %	0 %	80 %	0 %	15902229
139	NC_003098	CCTTG	2	10	194939	194948	0 %	40 %	20 %	40 %	15902230
140	NC_003098	ACTTA	2	10	195279	195288	40 %	40 %	0 %	20 %	15902230
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155	NC_003098	TTTTA	2	10	212418	212427	20 %	80 %	0 %	0 %	15902263
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261	NC_003098	TTAAA	2	10	351072	351081	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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265	NC_003098	CTGGT	2	10	357204	357213	0 %	40 %	40 %	20 %	15902401
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270	NC_003098	TTTTA	2	10	363680	363689	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
271	NC_003098	CTCAG	2	10	365650	365659	20 %	20 %	20 %	40 %	15902410
272	NC_003098	TGTTT	2	10	369520	369529	0 %	80 %	20 %	0 %	15902413
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396	NC_003098	AGAAA	2	10	512021	512030	80 %	0 %	20 %	0 %	15902558
397	NC_003098	ATAAA	2	10	515205	515214	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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400	NC_003098	TCTGG	2	10	518285	518294	0 %	40 %	40 %	20 %	15902561
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403	NC_003098	AATCC	2	10	523653	523662	40 %	20 %	0 %	40 %	15902568
404	NC_003098	TTTTA	2	10	523703	523712	20 %	80 %	0 %	0 %	15902568
405	NC_003098	ATCTT	2	10	524808	524817	20 %	60 %	0 %	20 %	15902568
406	NC_003098	CCTTG	2	10	526925	526934	0 %	40 %	20 %	40 %	15902570
407	NC_003098	ATATA	2	10	527171	527180	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
408	NC_003098	TAGTA	2	10	530401	530410	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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