MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae R6 chromosome

Total Repeats: 41596

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_003098	GTT	2	6	23474	23479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15902065
502	NC_003098	TGA	2	6	23480	23485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902065
503	NC_003098	ACA	2	6	23526	23531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15902065
504	NC_003098	GTC	2	6	23536	23541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15902065
505	NC_003098	CGT	2	6	23544	23549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15902065
506	NC_003098	GGTT	2	8	23553	23560	0 %	50 %	50 %	0 %	15902065
507	NC_003098	CGT	2	6	23586	23591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15902065
508	NC_003098	CTTT	2	8	23610	23617	0 %	75 %	0 %	25 %	15902065
509	NC_003098	TG	3	6	23661	23666	0 %	50 %	50 %	0 %	15902065
510	NC_003098	ACT	2	6	23695	23700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15902065
511	NC_003098	CTAT	2	8	23737	23744	25 %	50 %	0 %	25 %	15902065
512	NC_003098	AGA	2	6	23765	23770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15902065
513	NC_003098	TCG	2	6	23825	23830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15902065
514	NC_003098	TTGG	2	8	23841	23848	0 %	50 %	50 %	0 %	15902065
515	NC_003098	AACA	2	8	23887	23894	75 %	0 %	0 %	25 %	15902065
516	NC_003098	AAG	2	6	23973	23978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
517	NC_003098	CCT	2	6	23980	23985	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
518	NC_003098	TTG	2	6	23989	23994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
519	NC_003098	CTTTT	2	10	24011	24020	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
520	NC_003098	ATA	2	6	24023	24028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_003098	T	7	7	24060	24066	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_003098	ATA	3	9	24084	24092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_003098	TAT	2	6	24125	24130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15902066
524	NC_003098	GAA	2	6	24137	24142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15902066
525	NC_003098	AAG	2	6	24144	24149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15902066
526	NC_003098	GAGG	2	8	24157	24164	25 %	0 %	75 %	0 %	15902066
527	NC_003098	GA	3	6	24169	24174	50 %	0 %	50 %	0 %	15902066
528	NC_003098	TG	3	6	24215	24220	0 %	50 %	50 %	0 %	15902066
529	NC_003098	AGCG	2	8	24276	24283	25 %	0 %	50 %	25 %	15902066
530	NC_003098	ATGC	2	8	24287	24294	25 %	25 %	25 %	25 %	15902066
531	NC_003098	TGAG	2	8	24324	24331	25 %	25 %	50 %	0 %	15902066
532	NC_003098	GCT	2	6	24458	24463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15902066
533	NC_003098	T	6	6	24563	24568	0 %	100 %	0 %	0 %	15902066
534	NC_003098	A	6	6	24581	24586	100 %	0 %	0 %	0 %	15902066
535	NC_003098	ATA	2	6	24620	24625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_003098	GGA	2	6	24663	24668	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
537	NC_003098	CAG	2	6	24672	24677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_003098	TG	3	6	24695	24700	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
539	NC_003098	T	7	7	24704	24710	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_003098	AATA	2	8	24724	24731	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_003098	AAT	2	6	24738	24743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_003098	ATA	2	6	24756	24761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_003098	GTT	2	6	24887	24892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15902067
544	NC_003098	GA	3	6	24900	24905	50 %	0 %	50 %	0 %	15902067
545	NC_003098	TTC	2	6	24973	24978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15902067
546	NC_003098	AAG	2	6	24989	24994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15902067
547	NC_003098	TTAA	2	8	25004	25011	50 %	50 %	0 %	0 %	15902067
548	NC_003098	ATT	2	6	25035	25040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15902067
549	NC_003098	GAA	2	6	25081	25086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15902067
550	NC_003098	GTT	2	6	25103	25108	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15902067
551	NC_003098	TGG	2	6	25192	25197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15902067
552	NC_003098	TA	3	6	25281	25286	50 %	50 %	0 %	0 %	15902068
553	NC_003098	GCA	2	6	25328	25333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15902068
554	NC_003098	AAT	2	6	25376	25381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15902068
555	NC_003098	TCT	2	6	25386	25391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15902068
556	NC_003098	TTA	2	6	25464	25469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15902068
557	NC_003098	AGA	2	6	25518	25523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15902068
558	NC_003098	ATGT	2	8	25610	25617	25 %	50 %	25 %	0 %	15902068
559	NC_003098	GTT	2	6	25647	25652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15902068
560	NC_003098	GATT	2	8	25694	25701	25 %	50 %	25 %	0 %	15902068
561	NC_003098	A	6	6	25759	25764	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_003098	TCT	2	6	25840	25845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_003098	AGGTTG	2	12	25856	25867	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	15902069
564	NC_003098	GT	3	6	25886	25891	0 %	50 %	50 %	0 %	15902069
565	NC_003098	GGA	2	6	25971	25976	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15902069
566	NC_003098	GAG	2	6	26119	26124	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15902069
567	NC_003098	CAG	2	6	26131	26136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15902069
568	NC_003098	CCAG	2	8	26235	26242	25 %	0 %	25 %	50 %	15902069
569	NC_003098	ATT	2	6	26251	26256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15902069
570	NC_003098	TCCA	2	8	26260	26267	25 %	25 %	0 %	50 %	15902069
571	NC_003098	CAT	2	6	26271	26276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15902069
572	NC_003098	AAG	2	6	26396	26401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15902069
573	NC_003098	TGG	2	6	26435	26440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15902069
574	NC_003098	CAC	2	6	26470	26475	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15902069
575	NC_003098	GGC	2	6	26551	26556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15902069
576	NC_003098	AGA	2	6	26592	26597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15902069
577	NC_003098	TCC	2	6	26620	26625	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15902069
578	NC_003098	TAC	2	6	26712	26717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15902069
579	NC_003098	CTG	2	6	26813	26818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15902069
580	NC_003098	GTG	2	6	26819	26824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15902069
581	NC_003098	GA	3	6	26939	26944	50 %	0 %	50 %	0 %	15902069
582	NC_003098	GCT	2	6	26983	26988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15902069
583	NC_003098	AGG	2	6	27173	27178	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15902070
584	NC_003098	GGT	2	6	27364	27369	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15902070
585	NC_003098	TTCG	2	8	27389	27396	0 %	50 %	25 %	25 %	15902070
586	NC_003098	CAA	2	6	27412	27417	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15902070
587	NC_003098	AG	3	6	27427	27432	50 %	0 %	50 %	0 %	15902070
588	NC_003098	CTT	2	6	27537	27542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15902070
589	NC_003098	AGA	2	6	27558	27563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15902070
590	NC_003098	AGAA	2	8	27693	27700	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
591	NC_003098	GAA	2	6	27708	27713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15902071
592	NC_003098	TATTT	2	10	27720	27729	20 %	80 %	0 %	0 %	15902071
593	NC_003098	TTTTA	2	10	27732	27741	20 %	80 %	0 %	0 %	15902071
594	NC_003098	CTA	2	6	27774	27779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15902071
595	NC_003098	ACGG	2	8	27781	27788	25 %	0 %	50 %	25 %	15902071
596	NC_003098	CT	3	6	27839	27844	0 %	50 %	0 %	50 %	15902071
597	NC_003098	A	6	6	27886	27891	100 %	0 %	0 %	0 %	15902071
598	NC_003098	AAG	2	6	27904	27909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15902071
599	NC_003098	GGGA	2	8	27930	27937	25 %	0 %	75 %	0 %	15902071
600	NC_003098	TA	3	6	27976	27981	50 %	50 %	0 %	0 %	15902071
601	NC_003098	AGA	2	6	28059	28064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15902071
602	NC_003098	ATT	2	6	28074	28079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15902071
603	NC_003098	TTGTTT	2	12	28085	28096	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	15902071
604	NC_003098	AAAATT	2	12	28116	28127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15902071
605	NC_003098	ATC	2	6	28246	28251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15902071
606	NC_003098	GTA	2	6	28291	28296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902071
607	NC_003098	CT	3	6	28428	28433	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
608	NC_003098	TTA	2	6	28438	28443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_003098	TTG	2	6	28458	28463	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
610	NC_003098	TGA	2	6	28479	28484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
611	NC_003098	ATG	2	6	28506	28511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
612	NC_003098	CTT	2	6	28533	28538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_003098	TTGA	2	8	28545	28552	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
614	NC_003098	AT	3	6	28615	28620	50 %	50 %	0 %	0 %	15902072
615	NC_003098	GGA	2	6	28624	28629	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15902072
616	NC_003098	TCT	2	6	28667	28672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15902072
617	NC_003098	GA	3	6	28752	28757	50 %	0 %	50 %	0 %	15902072
618	NC_003098	GAA	2	6	28772	28777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15902072
619	NC_003098	TGT	2	6	28897	28902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15902072
620	NC_003098	TGC	2	6	29029	29034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15902072
621	NC_003098	CTC	2	6	29082	29087	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15902072
622	NC_003098	ATT	2	6	29097	29102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15902072
623	NC_003098	GCG	2	6	29107	29112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15902072
624	NC_003098	TGGT	2	8	29118	29125	0 %	50 %	50 %	0 %	15902072
625	NC_003098	TAT	2	6	29209	29214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15902072
626	NC_003098	CGT	2	6	29222	29227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15902072
627	NC_003098	CAT	2	6	29263	29268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15902072
628	NC_003098	TTGA	2	8	29297	29304	25 %	50 %	25 %	0 %	15902072
629	NC_003098	TGAT	2	8	29310	29317	25 %	50 %	25 %	0 %	15902072
630	NC_003098	TTCT	2	8	29400	29407	0 %	75 %	0 %	25 %	15902072
631	NC_003098	GTT	2	6	29453	29458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15902072
632	NC_003098	ATCT	2	8	29468	29475	25 %	50 %	0 %	25 %	15902072
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634	NC_003098	TGAT	2	8	29490	29497	25 %	50 %	25 %	0 %	15902072
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