MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae TIGR4 chromosome

Total Repeats: 44298

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_003028	CTT	2	6	194791	194796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15900146
4002	NC_003028	CA	3	6	194799	194804	50 %	0 %	0 %	50 %	15900146
4003	NC_003028	AGC	2	6	194805	194810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15900146
4004	NC_003028	GAG	2	6	194824	194829	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15900146
4005	NC_003028	ATG	2	6	194851	194856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15900147
4006	NC_003028	A	6	6	194862	194867	100 %	0 %	0 %	0 %	15900147
4007	NC_003028	TCA	2	6	194872	194877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15900147
4008	NC_003028	CA	3	6	194938	194943	50 %	0 %	0 %	50 %	15900147
4009	NC_003028	CAAG	2	8	194954	194961	50 %	0 %	25 %	25 %	15900147
4010	NC_003028	GCT	2	6	194970	194975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15900147
4011	NC_003028	A	6	6	195069	195074	100 %	0 %	0 %	0 %	15900147
4012	NC_003028	ATC	2	6	195078	195083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15900147
4013	NC_003028	GTT	2	6	195113	195118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15900147
4014	NC_003028	TGC	2	6	195119	195124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15900147
4015	NC_003028	AAT	2	6	195133	195138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15900147
4016	NC_003028	AGG	2	6	195142	195147	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_003028	CAA	3	9	195177	195185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15900148
4018	NC_003028	CTT	2	6	195204	195209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15900148
4019	NC_003028	CAA	2	6	195228	195233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15900148
4020	NC_003028	TTG	2	6	195255	195260	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15900148
4021	NC_003028	AAC	3	9	195284	195292	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15900148
4022	NC_003028	GGT	2	6	195317	195322	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15900148
4023	NC_003028	TAA	2	6	195361	195366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15900148
4024	NC_003028	GTT	2	6	195383	195388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15900148
4025	NC_003028	TACAC	2	10	195435	195444	40 %	20 %	0 %	40 %	15900148
4026	NC_003028	CAT	2	6	195463	195468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15900148
4027	NC_003028	GTG	3	9	195603	195611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15900148
4028	NC_003028	TGC	2	6	195622	195627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15900148
4029	NC_003028	AAC	2	6	195747	195752	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15900148
4030	NC_003028	GGT	3	9	195851	195859	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15900148
4031	NC_003028	TCGT	2	8	195963	195970	0 %	50 %	25 %	25 %	15900148
4032	NC_003028	ATA	2	6	195985	195990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15900148
4033	NC_003028	ACA	2	6	196065	196070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4034	NC_003028	A	6	6	196107	196112	100 %	0 %	0 %	0 %	15900149
4035	NC_003028	TCG	2	6	196120	196125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15900149
4036	NC_003028	TGA	2	6	196135	196140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15900149
4037	NC_003028	A	6	6	196140	196145	100 %	0 %	0 %	0 %	15900149
4038	NC_003028	ACG	2	6	196162	196167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15900149
4039	NC_003028	A	6	6	196173	196178	100 %	0 %	0 %	0 %	15900149
4040	NC_003028	TTA	2	6	196180	196185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15900149
4041	NC_003028	CGT	2	6	196197	196202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15900149
4042	NC_003028	GACG	2	8	196248	196255	25 %	0 %	50 %	25 %	15900149
4043	NC_003028	AAG	2	6	196279	196284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15900149
4044	NC_003028	GAC	2	6	196347	196352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15900149
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4047	NC_003028	GCT	2	6	196523	196528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15900150
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4055	NC_003028	TTCAC	2	10	196936	196945	20 %	40 %	0 %	40 %	15900151
4056	NC_003028	GGT	2	6	196976	196981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15900151
4057	NC_003028	ACATCA	2	12	197037	197048	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	15900151
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4059	NC_003028	CGT	2	6	197129	197134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15900151
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4062	NC_003028	TAC	2	6	197308	197313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15900151
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4066	NC_003028	CGT	2	6	197426	197431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15900152
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4070	NC_003028	CA	3	6	197607	197612	50 %	0 %	0 %	50 %	15900152
4071	NC_003028	AAG	2	6	197874	197879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15900153
4072	NC_003028	A	6	6	197906	197911	100 %	0 %	0 %	0 %	15900153
4073	NC_003028	GCT	2	6	197936	197941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15900153
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4075	NC_003028	A	6	6	197981	197986	100 %	0 %	0 %	0 %	15900153
4076	NC_003028	TCGC	2	8	197991	197998	0 %	25 %	25 %	50 %	15900153
4077	NC_003028	ATA	2	6	198025	198030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15900153
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4081	NC_003028	ACC	2	6	198144	198149	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15900154
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4093	NC_003028	A	6	6	198495	198500	100 %	0 %	0 %	0 %	15900155
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4096	NC_003028	TCG	2	6	198545	198550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15900155
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4103	NC_003028	ATC	2	6	198950	198955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15900156
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4105	NC_003028	A	6	6	199046	199051	100 %	0 %	0 %	0 %	15900156
4106	NC_003028	ACA	2	6	199059	199064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15900156
4107	NC_003028	A	6	6	199064	199069	100 %	0 %	0 %	0 %	15900156
4108	NC_003028	AAGGA	2	10	199096	199105	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_003028	AGT	2	6	199149	199154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15900157
4110	NC_003028	ACT	2	6	199178	199183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15900157
4111	NC_003028	GCT	2	6	199273	199278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15900157
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4113	NC_003028	A	6	6	199327	199332	100 %	0 %	0 %	0 %	15900157
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4119	NC_003028	AGG	2	6	199660	199665	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_003028	A	6	6	199680	199685	100 %	0 %	0 %	0 %	15900158
4121	NC_003028	AG	3	6	199698	199703	50 %	0 %	50 %	0 %	15900158
4122	NC_003028	A	6	6	199714	199719	100 %	0 %	0 %	0 %	15900158
4123	NC_003028	TTG	2	6	199720	199725	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15900158
4124	NC_003028	TGC	2	6	199745	199750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15900158
4125	NC_003028	GGC	2	6	199757	199762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15900158
4126	NC_003028	GAA	2	6	199994	199999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15900159
4127	NC_003028	CA	3	6	200030	200035	50 %	0 %	0 %	50 %	15900159
4128	NC_003028	A	6	6	200093	200098	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_003028	ACT	2	6	200202	200207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4130	NC_003028	TGAC	2	8	200235	200242	25 %	25 %	25 %	25 %	15900160
4131	NC_003028	A	6	6	200324	200329	100 %	0 %	0 %	0 %	15900160
4132	NC_003028	A	6	6	200365	200370	100 %	0 %	0 %	0 %	15900160
4133	NC_003028	ACAA	2	8	200391	200398	75 %	0 %	0 %	25 %	15900160
4134	NC_003028	A	6	6	200492	200497	100 %	0 %	0 %	0 %	15900160
4135	NC_003028	AAG	2	6	200574	200579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15900160
4136	NC_003028	TGG	2	6	200596	200601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15900160
4137	NC_003028	GTTT	2	8	200679	200686	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4138	NC_003028	ACAA	2	8	200687	200694	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4139	NC_003028	GTTCA	2	10	200730	200739	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4140	NC_003028	TAA	2	6	200832	200837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15900161
4141	NC_003028	CTG	2	6	200852	200857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15900161
4142	NC_003028	ACT	2	6	201016	201021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15900161
4143	NC_003028	AAC	2	6	201034	201039	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15900161
4144	NC_003028	GTT	2	6	201043	201048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15900161
4145	NC_003028	AAGA	2	8	201067	201074	75 %	0 %	25 %	0 %	15900161
4146	NC_003028	GGTT	2	8	201090	201097	0 %	50 %	50 %	0 %	15900161
4147	NC_003028	CAA	3	9	201200	201208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15900161
4148	NC_003028	GTT	2	6	201211	201216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15900161
4149	NC_003028	AGT	2	6	201234	201239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15900161
4150	NC_003028	GCT	2	6	201250	201255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15900161
4151	NC_003028	TACG	2	8	201256	201263	25 %	25 %	25 %	25 %	15900161
4152	NC_003028	TAAAGG	2	12	201288	201299	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	15900161
4153	NC_003028	TTCG	2	8	201319	201326	0 %	50 %	25 %	25 %	15900161
4154	NC_003028	AAG	2	6	201332	201337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15900161
4155	NC_003028	AAT	2	6	201350	201355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15900161
4156	NC_003028	ATC	2	6	201368	201373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4157	NC_003028	ACC	2	6	201375	201380	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4158	NC_003028	AAAC	2	8	201458	201465	75 %	0 %	0 %	25 %	15900162
4159	NC_003028	CT	3	6	201501	201506	0 %	50 %	0 %	50 %	15900162
4160	NC_003028	CTG	2	6	201511	201516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15900162
4161	NC_003028	TGAT	2	8	201568	201575	25 %	50 %	25 %	0 %	15900162
4162	NC_003028	AAG	2	6	201619	201624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15900162
4163	NC_003028	GTG	2	6	201708	201713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15900162
4164	NC_003028	AGG	2	6	201796	201801	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4165	NC_003028	AGA	2	6	201841	201846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15900163
4166	NC_003028	GTT	2	6	201878	201883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15900163
4167	NC_003028	CGT	2	6	201893	201898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15900163
4168	NC_003028	TTG	4	12	201915	201926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15900163
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4179	NC_003028	ACTTGG	2	12	202394	202405	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	15900164
4180	NC_003028	TTA	2	6	202423	202428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15900164
4181	NC_003028	AAG	2	6	202429	202434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15900164
4182	NC_003028	GCT	2	6	202440	202445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15900164
4183	NC_003028	CAG	2	6	202462	202467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15900164
4184	NC_003028	GAA	2	6	202488	202493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15900164
4185	NC_003028	ATG	2	6	202558	202563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4186	NC_003028	TCA	2	6	202716	202721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15900165
4187	NC_003028	CGT	2	6	202821	202826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15900165
4188	NC_003028	GTT	2	6	202926	202931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15900165
4189	NC_003028	AGC	2	6	203018	203023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15900165
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4191	NC_003028	GGT	2	6	203064	203069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15900165
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4193	NC_003028	T	6	6	203103	203108	0 %	100 %	0 %	0 %	15900166
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4198	NC_003028	TTG	2	6	203347	203352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15900166
4199	NC_003028	GAA	2	6	203419	203424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15900166
4200	NC_003028	ATC	2	6	203565	203570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15900166
4201	NC_003028	GTA	2	6	203581	203586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15900166
4202	NC_003028	TTGG	2	8	203597	203604	0 %	50 %	50 %	0 %	15900166
4203	NC_003028	GAT	2	6	203684	203689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15900166
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4207	NC_003028	ATT	2	6	203787	203792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15900166
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4210	NC_003028	CTG	2	6	203899	203904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15900166
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4220	NC_003028	CTT	2	6	204195	204200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15900166
4221	NC_003028	CGT	2	6	204201	204206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15900166
4222	NC_003028	TGT	2	6	204287	204292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15900166
4223	NC_003028	TGG	2	6	204299	204304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15900166
4224	NC_003028	ACAGA	2	10	204397	204406	60 %	0 %	20 %	20 %	15900166
4225	NC_003028	AAAAT	2	10	204537	204546	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4226	NC_003028	AGC	2	6	204608	204613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15900167
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4228	NC_003028	GAT	2	6	204783	204788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15900167
4229	NC_003028	ATC	2	6	204945	204950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15900167
4230	NC_003028	CCA	2	6	204990	204995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15900167
4231	NC_003028	AGA	3	9	205007	205015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15900167
4232	NC_003028	TAC	2	6	205017	205022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15900167
4233	NC_003028	GAT	2	6	205032	205037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15900167
4234	NC_003028	CGT	2	6	205056	205061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15900167
4235	NC_003028	ATG	2	6	205153	205158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15900167
4236	NC_003028	TCT	2	6	205159	205164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15900167
4237	NC_003028	TTG	2	6	205262	205267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4238	NC_003028	ATCGA	2	10	205285	205294	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4239	NC_003028	TTGAAG	2	12	205335	205346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15900168
4240	NC_003028	AGT	2	6	205351	205356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15900168
4241	NC_003028	AAT	2	6	205530	205535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15900168
4242	NC_003028	TCG	2	6	205609	205614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15900169
4243	NC_003028	ACAA	2	8	205656	205663	75 %	0 %	0 %	25 %	15900169
4244	NC_003028	GTA	2	6	205735	205740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15900170
4245	NC_003028	GCT	3	9	205795	205803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15900170
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4247	NC_003028	AAG	2	6	205847	205852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15900170
4248	NC_003028	CGT	2	6	205861	205866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15900170
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