MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae TIGR4 chromosome

Total Repeats: 44298

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_003028	CAA	2	6	23411	23416	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15899967
502	NC_003028	GATA	2	8	23431	23438	50 %	25 %	25 %	0 %	15899967
503	NC_003028	ATG	2	6	23454	23459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15899967
504	NC_003028	TCA	2	6	23546	23551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15899967
505	NC_003028	TGG	2	6	23563	23568	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15899967
506	NC_003028	CAAG	2	8	23595	23602	50 %	0 %	25 %	25 %	15899967
507	NC_003028	GTT	2	6	23671	23676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15899967
508	NC_003028	TGA	2	6	23677	23682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15899967
509	NC_003028	ACA	2	6	23723	23728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15899967
510	NC_003028	GTC	2	6	23733	23738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15899967
511	NC_003028	CGT	2	6	23741	23746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15899967
512	NC_003028	GGTT	2	8	23750	23757	0 %	50 %	50 %	0 %	15899967
513	NC_003028	CGT	2	6	23783	23788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15899967
514	NC_003028	CTTT	2	8	23807	23814	0 %	75 %	0 %	25 %	15899967
515	NC_003028	TG	3	6	23858	23863	0 %	50 %	50 %	0 %	15899967
516	NC_003028	ACT	2	6	23892	23897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15899967
517	NC_003028	CTAT	2	8	23934	23941	25 %	50 %	0 %	25 %	15899967
518	NC_003028	AGA	2	6	23962	23967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15899967
519	NC_003028	TCG	2	6	24022	24027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15899967
520	NC_003028	TTGG	2	8	24038	24045	0 %	50 %	50 %	0 %	15899967
521	NC_003028	AACA	2	8	24084	24091	75 %	0 %	0 %	25 %	15899967
522	NC_003028	AAG	2	6	24170	24175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
523	NC_003028	CCT	2	6	24177	24182	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
524	NC_003028	TTG	2	6	24186	24191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
525	NC_003028	CTTTT	2	10	24208	24217	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
526	NC_003028	ATA	2	6	24220	24225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_003028	T	7	7	24257	24263	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_003028	ATA	3	9	24281	24289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_003028	TAT	2	6	24322	24327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15899968
530	NC_003028	GAA	2	6	24334	24339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15899968
531	NC_003028	AAG	2	6	24341	24346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15899968
532	NC_003028	GAGG	2	8	24354	24361	25 %	0 %	75 %	0 %	15899968
533	NC_003028	GA	3	6	24366	24371	50 %	0 %	50 %	0 %	15899968
534	NC_003028	TG	3	6	24412	24417	0 %	50 %	50 %	0 %	15899968
535	NC_003028	AGCG	2	8	24473	24480	25 %	0 %	50 %	25 %	15899968
536	NC_003028	ATGC	2	8	24484	24491	25 %	25 %	25 %	25 %	15899968
537	NC_003028	TGAG	2	8	24521	24528	25 %	25 %	50 %	0 %	15899968
538	NC_003028	GCT	2	6	24655	24660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15899968
539	NC_003028	ATC	2	6	24698	24703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15899968
540	NC_003028	T	7	7	24759	24765	0 %	100 %	0 %	0 %	15899968
541	NC_003028	A	6	6	24778	24783	100 %	0 %	0 %	0 %	15899968
542	NC_003028	ATA	2	6	24817	24822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_003028	GGA	2	6	24860	24865	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
544	NC_003028	CAG	2	6	24869	24874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_003028	TG	3	6	24892	24897	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
546	NC_003028	T	7	7	24901	24907	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_003028	AATA	2	8	24921	24928	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_003028	AAT	2	6	24935	24940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_003028	ATA	2	6	24953	24958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_003028	GTT	2	6	25084	25089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15899969
551	NC_003028	GA	3	6	25097	25102	50 %	0 %	50 %	0 %	15899969
552	NC_003028	TTC	2	6	25170	25175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15899969
553	NC_003028	AAG	2	6	25186	25191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15899969
554	NC_003028	TTAA	2	8	25201	25208	50 %	50 %	0 %	0 %	15899969
555	NC_003028	ATT	2	6	25232	25237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15899969
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557	NC_003028	GTT	2	6	25300	25305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15899969
558	NC_003028	TGG	2	6	25389	25394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15899969
559	NC_003028	TA	3	6	25478	25483	50 %	50 %	0 %	0 %	15899970
560	NC_003028	GCA	2	6	25525	25530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15899970
561	NC_003028	AAT	2	6	25573	25578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15899970
562	NC_003028	TCT	2	6	25583	25588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15899970
563	NC_003028	TTA	2	6	25661	25666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15899970
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565	NC_003028	ATGT	2	8	25807	25814	25 %	50 %	25 %	0 %	15899970
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567	NC_003028	GATT	2	8	25891	25898	25 %	50 %	25 %	0 %	15899970
568	NC_003028	A	6	6	25956	25961	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_003028	TCT	2	6	26037	26042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_003028	AGGTTG	2	12	26053	26064	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
571	NC_003028	GT	3	6	26083	26088	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
572	NC_003028	GGA	2	6	26168	26173	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
573	NC_003028	GAG	2	6	26316	26321	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
574	NC_003028	CAG	2	6	26328	26333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_003028	CCAG	2	8	26432	26439	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
576	NC_003028	ATT	2	6	26448	26453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_003028	TCCA	2	8	26457	26464	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
578	NC_003028	CAT	2	6	26468	26473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_003028	AAG	2	6	26593	26598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
580	NC_003028	TGG	2	6	26632	26637	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
581	NC_003028	CAC	2	6	26667	26672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
582	NC_003028	GGC	2	6	26748	26753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_003028	AGA	2	6	26789	26794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
584	NC_003028	TCC	2	6	26817	26822	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
585	NC_003028	TAC	2	6	26909	26914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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587	NC_003028	GTG	2	6	27016	27021	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
588	NC_003028	GA	3	6	27136	27141	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
589	NC_003028	GCT	2	6	27180	27185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_003028	AGG	2	6	27370	27375	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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592	NC_003028	CAA	2	6	27609	27614	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15899971
593	NC_003028	CAT	2	6	27642	27647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15899971
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599	NC_003028	TATT	2	8	27922	27929	25 %	75 %	0 %	0 %	15899972
600	NC_003028	TTTAT	2	10	27930	27939	20 %	80 %	0 %	0 %	15899972
601	NC_003028	CTA	2	6	27971	27976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15899972
602	NC_003028	ACGG	2	8	27978	27985	25 %	0 %	50 %	25 %	15899972
603	NC_003028	CT	3	6	28036	28041	0 %	50 %	0 %	50 %	15899972
604	NC_003028	AAG	2	6	28100	28105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15899972
605	NC_003028	GGGA	2	8	28126	28133	25 %	0 %	75 %	0 %	15899973
606	NC_003028	AGA	2	6	28255	28260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15899973
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612	NC_003028	CT	3	6	28656	28661	0 %	50 %	0 %	50 %	15899973
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616	NC_003028	CTT	2	6	28761	28766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_003028	TTGA	2	8	28773	28780	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
618	NC_003028	AT	3	6	28843	28848	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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620	NC_003028	TCT	2	6	28895	28900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15899974
621	NC_003028	GA	3	6	28980	28985	50 %	0 %	50 %	0 %	15899974
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