MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae TIGR4 chromosome

Total Repeats: 44298

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_003028	GAA	2	6	243274	243279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15900202
5002	NC_003028	AAATT	2	10	243417	243426	60 %	40 %	0 %	0 %	15900202
5003	NC_003028	TGA	2	6	243541	243546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15900202
5004	NC_003028	TTG	2	6	243693	243698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15900202
5005	NC_003028	CAA	2	6	243770	243775	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15900202
5006	NC_003028	TTTG	2	8	243782	243789	0 %	75 %	25 %	0 %	15900202
5007	NC_003028	ACG	2	6	243920	243925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15900202
5008	NC_003028	CTTG	2	8	243950	243957	0 %	50 %	25 %	25 %	15900202
5009	NC_003028	T	6	6	243962	243967	0 %	100 %	0 %	0 %	15900202
5010	NC_003028	ATG	2	6	243981	243986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15900202
5011	NC_003028	AGTT	2	8	244054	244061	25 %	50 %	25 %	0 %	15900202
5012	NC_003028	GTT	2	6	244157	244162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15900202
5013	NC_003028	CAG	2	6	244219	244224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15900202
5014	NC_003028	TAG	2	6	244228	244233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15900202
5015	NC_003028	TCA	2	6	244242	244247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15900202
5016	NC_003028	ATG	2	6	244278	244283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15900202
5017	NC_003028	CTT	2	6	244318	244323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15900202
5018	NC_003028	GCG	2	6	244332	244337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15900202
5019	NC_003028	CAT	2	6	244349	244354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15900202
5020	NC_003028	TGG	2	6	244431	244436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15900202
5021	NC_003028	CCA	3	9	244452	244460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15900202
5022	NC_003028	GTA	2	6	244499	244504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15900202
5023	NC_003028	TG	3	6	244541	244546	0 %	50 %	50 %	0 %	15900202
5024	NC_003028	TGA	2	6	244597	244602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15900202
5025	NC_003028	AGT	2	6	244672	244677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15900202
5026	NC_003028	GTTGCT	2	12	244703	244714	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	15900202
5027	NC_003028	AGT	2	6	244762	244767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15900202
5028	NC_003028	AAGAC	2	10	244768	244777	60 %	0 %	20 %	20 %	15900202
5029	NC_003028	AAGTC	2	10	244963	244972	40 %	20 %	20 %	20 %	15900202
5030	NC_003028	GGC	2	6	245003	245008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15900202
5031	NC_003028	TCG	2	6	245043	245048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15900202
5032	NC_003028	AGC	2	6	245057	245062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15900202
5033	NC_003028	ATA	2	6	245126	245131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15900202
5034	NC_003028	GTTT	2	8	245158	245165	0 %	75 %	25 %	0 %	15900202
5035	NC_003028	GTTT	2	8	245178	245185	0 %	75 %	25 %	0 %	15900202
5036	NC_003028	ACT	2	6	245226	245231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15900202
5037	NC_003028	ACA	3	9	245256	245264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15900202
5038	NC_003028	CTT	3	9	245314	245322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15900202
5039	NC_003028	CAT	2	6	245344	245349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15900202
5040	NC_003028	TCT	2	6	245547	245552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15900202
5041	NC_003028	T	6	6	245552	245557	0 %	100 %	0 %	0 %	15900202
5042	NC_003028	TCA	2	6	245664	245669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15900202
5043	NC_003028	CGT	2	6	245740	245745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15900202
5044	NC_003028	TAA	2	6	245768	245773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15900202
5045	NC_003028	AG	3	6	245902	245907	50 %	0 %	50 %	0 %	15900202
5046	NC_003028	GTA	2	6	245936	245941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15900202
5047	NC_003028	T	6	6	246060	246065	0 %	100 %	0 %	0 %	15900202
5048	NC_003028	TTG	2	6	246075	246080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15900202
5049	NC_003028	TCTT	2	8	246147	246154	0 %	75 %	0 %	25 %	15900202
5050	NC_003028	TTC	2	6	246245	246250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15900202
5051	NC_003028	T	6	6	246257	246262	0 %	100 %	0 %	0 %	15900202
5052	NC_003028	AGT	2	6	246277	246282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15900202
5053	NC_003028	GTT	2	6	246315	246320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15900202
5054	NC_003028	TAG	2	6	246328	246333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15900202
5055	NC_003028	AGT	2	6	246335	246340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15900202
5056	NC_003028	GCA	2	6	246393	246398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15900202
5057	NC_003028	TCT	2	6	246405	246410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15900202
5058	NC_003028	GAA	2	6	246444	246449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15900202
5059	NC_003028	GCT	2	6	246477	246482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15900202
5060	NC_003028	GGT	2	6	246506	246511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15900202
5061	NC_003028	TGT	2	6	246520	246525	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15900202
5062	NC_003028	TGGT	2	8	246538	246545	0 %	50 %	50 %	0 %	15900202
5063	NC_003028	TCG	2	6	246552	246557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15900202
5064	NC_003028	GCAA	2	8	246582	246589	50 %	0 %	25 %	25 %	15900202
5065	NC_003028	T	7	7	246655	246661	0 %	100 %	0 %	0 %	15900202
5066	NC_003028	CAAT	2	8	246699	246706	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5067	NC_003028	GTA	2	6	246730	246735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_003028	GAAA	2	8	246767	246774	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_003028	TA	3	6	246807	246812	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_003028	AAGCC	2	10	246846	246855	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
5071	NC_003028	TTA	2	6	246859	246864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_003028	GAT	2	6	246869	246874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_003028	A	6	6	246923	246928	100 %	0 %	0 %	0 %	15900203
5074	NC_003028	CAAG	2	8	246943	246950	50 %	0 %	25 %	25 %	15900203
5075	NC_003028	AAT	2	6	246966	246971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15900203
5076	NC_003028	TC	3	6	246994	246999	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5077	NC_003028	AC	3	6	247039	247044	50 %	0 %	0 %	50 %	15900204
5078	NC_003028	GAT	2	6	247046	247051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15900204
5079	NC_003028	ATC	2	6	247068	247073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15900204
5080	NC_003028	A	7	7	247083	247089	100 %	0 %	0 %	0 %	15900204
5081	NC_003028	A	6	6	247198	247203	100 %	0 %	0 %	0 %	15900205
5082	NC_003028	CAAA	2	8	247207	247214	75 %	0 %	0 %	25 %	15900205
5083	NC_003028	CAC	2	6	247223	247228	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15900205
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5085	NC_003028	A	6	6	247270	247275	100 %	0 %	0 %	0 %	15900205
5086	NC_003028	GTG	2	6	247378	247383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15900205
5087	NC_003028	CTT	2	6	247384	247389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15900205
5088	NC_003028	GTG	2	6	247439	247444	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15900205
5089	NC_003028	CTG	2	6	247650	247655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15900206
5090	NC_003028	AAG	2	6	247689	247694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15900206
5091	NC_003028	CAT	2	6	247741	247746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15900206
5092	NC_003028	CGT	2	6	247769	247774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15900206
5093	NC_003028	TGG	2	6	247777	247782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15900206
5094	NC_003028	CGT	2	6	247820	247825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15900206
5095	NC_003028	ACA	2	6	247826	247831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15900206
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5097	NC_003028	GTG	2	6	247869	247874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15900206
5098	NC_003028	AC	3	6	247876	247881	50 %	0 %	0 %	50 %	15900206
5099	NC_003028	TGC	2	6	247915	247920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15900206
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5102	NC_003028	GGTTGC	2	12	248062	248073	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
5103	NC_003028	ATG	2	6	248128	248133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_003028	CGA	2	6	248183	248188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5105	NC_003028	GCA	2	6	248214	248219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5106	NC_003028	CTAA	2	8	248241	248248	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5107	NC_003028	CAA	2	6	248324	248329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5108	NC_003028	TTA	2	6	248374	248379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_003028	AATAG	2	10	248392	248401	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_003028	AAAT	2	8	248409	248416	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_003028	AAAC	2	8	248422	248429	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5112	NC_003028	A	6	6	248455	248460	100 %	0 %	0 %	0 %	15900207
5113	NC_003028	ACA	2	6	248502	248507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15900207
5114	NC_003028	ACT	2	6	248508	248513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15900207
5115	NC_003028	TAC	2	6	248526	248531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15900207
5116	NC_003028	TGGA	2	8	248586	248593	25 %	25 %	50 %	0 %	15900207
5117	NC_003028	GCAAGA	2	12	248594	248605	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	15900207
5118	NC_003028	CTG	2	6	248626	248631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15900207
5119	NC_003028	CGA	2	6	248632	248637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15900207
5120	NC_003028	AAC	2	6	248649	248654	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15900207
5121	NC_003028	CAT	2	6	248666	248671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15900207
5122	NC_003028	AC	3	6	248674	248679	50 %	0 %	0 %	50 %	15900207
5123	NC_003028	CGTAT	2	10	248820	248829	20 %	40 %	20 %	20 %	15900207
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5125	NC_003028	CCAAT	2	10	248913	248922	40 %	20 %	0 %	40 %	15900207
5126	NC_003028	GAA	2	6	249018	249023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15900207
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5138	NC_003028	GCT	2	6	249552	249557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15900207
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5142	NC_003028	CAAGA	2	10	249687	249696	60 %	0 %	20 %	20 %	15900207
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5145	NC_003028	TTG	2	6	249811	249816	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15900207
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5240	NC_003028	CT	3	6	254881	254886	0 %	50 %	0 %	50 %	15900208
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5246	NC_003028	A	6	6	255008	255013	100 %	0 %	0 %	0 %	15900208
5247	NC_003028	TAA	2	6	255019	255024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5249	NC_003028	T	6	6	255073	255078	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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