MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus MSSA476 chromosome

Total Repeats: 43146

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002953	ATT	2	6	125	130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_002953	GTC	2	6	318	323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_002953	TAA	2	6	384	389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_002953	TTA	2	6	415	420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_002953	ATT	2	6	432	437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_002953	TAT	2	6	641	646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49484913
7	NC_002953	CAA	2	6	679	684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	49484913
8	NC_002953	TGT	2	6	717	722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	49484913
9	NC_002953	TAC	2	6	750	755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49484913
10	NC_002953	GAA	2	6	757	762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49484913
11	NC_002953	TAA	2	6	777	782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	49484913
12	NC_002953	ACA	2	6	805	810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	49484913
13	NC_002953	AAC	2	6	825	830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	49484913
14	NC_002953	GCA	2	6	922	927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49484913
15	NC_002953	ATT	2	6	969	974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49484913
16	NC_002953	TCA	2	6	1026	1031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49484913
17	NC_002953	ATA	2	6	1040	1045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	49484913
18	NC_002953	TTA	2	6	1097	1102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49484913
19	NC_002953	TTA	2	6	1162	1167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49484913
20	NC_002953	GAT	2	6	1171	1176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49484913
21	NC_002953	AAG	2	6	1208	1213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49484913
22	NC_002953	ACC	2	6	1278	1283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	49484913
23	NC_002953	AGA	2	6	1302	1307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49484913
24	NC_002953	TTG	2	6	1340	1345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	49484913
25	NC_002953	CCA	2	6	1354	1359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	49484913
26	NC_002953	AGA	2	6	1388	1393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49484913
27	NC_002953	GAA	3	9	1399	1407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49484913
28	NC_002953	CCA	2	6	1420	1425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	49484913
29	NC_002953	ATT	2	6	1512	1517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49484913
30	NC_002953	CTG	2	6	1544	1549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49484913
31	NC_002953	GAA	2	6	1750	1755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49484913
32	NC_002953	TGG	2	6	1758	1763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	49484913
33	NC_002953	AGA	2	6	1818	1823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49484913
34	NC_002953	AAG	2	6	1838	1843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49484913
35	NC_002953	CCA	2	6	2071	2076	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_002953	CTA	3	9	2088	2096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_002953	ATT	2	6	2181	2186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49484914
38	NC_002953	TTA	2	6	2187	2192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49484914
39	NC_002953	AAC	2	6	2230	2235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	49484914
40	NC_002953	AGT	2	6	2380	2385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49484914
41	NC_002953	TTG	2	6	2403	2408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	49484914
42	NC_002953	TTA	2	6	2531	2536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49484914
43	NC_002953	AGA	2	6	2731	2736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49484914
44	NC_002953	TCA	2	6	2757	2762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49484914
45	NC_002953	GAA	2	6	2810	2815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49484914
46	NC_002953	TCT	2	6	2826	2831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	49484914
47	NC_002953	ATT	2	6	2884	2889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49484914
48	NC_002953	ACA	2	6	2909	2914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	49484914
49	NC_002953	TTA	2	6	2993	2998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49484914
50	NC_002953	GGT	2	6	3008	3013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	49484914
51	NC_002953	AAC	2	6	3014	3019	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	49484914
52	NC_002953	TTA	2	6	3021	3026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49484914
53	NC_002953	TGA	2	6	3040	3045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49484914
54	NC_002953	GTT	2	6	3047	3052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	49484914
55	NC_002953	TCT	2	6	3059	3064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	49484914
56	NC_002953	AGA	2	6	3091	3096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49484914
57	NC_002953	GGT	2	6	3119	3124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	49484914
58	NC_002953	ATG	2	6	3183	3188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49484914
59	NC_002953	TTC	2	6	3203	3208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	49484914
60	NC_002953	GAC	2	6	3245	3250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49484914
61	NC_002953	AAT	2	6	3352	3357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_002953	GCA	2	6	3385	3390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_002953	TAA	2	6	3447	3452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_002953	ATT	2	6	3673	3678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49484915
65	NC_002953	AAG	2	6	3686	3691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49484915
66	NC_002953	GTA	2	6	3694	3699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49484915
67	NC_002953	ATT	2	6	3742	3747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49484915
68	NC_002953	TGG	2	6	3753	3758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	49484915
69	NC_002953	ATG	2	6	3952	3957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49484916
70	NC_002953	GTC	2	6	4216	4221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49484916
71	NC_002953	AGA	2	6	4265	4270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49484916
72	NC_002953	CTC	2	6	4291	4296	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	49484916
73	NC_002953	GAC	2	6	4303	4308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49484916
74	NC_002953	CTG	2	6	4339	4344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49484916
75	NC_002953	AAT	2	6	4392	4397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	49484916
76	NC_002953	CAG	2	6	4458	4463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49484916
77	NC_002953	AAG	2	6	4564	4569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49484916
78	NC_002953	ATT	2	6	4582	4587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49484916
79	NC_002953	GAA	2	6	4635	4640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49484916
80	NC_002953	ATA	2	6	4660	4665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	49484916
81	NC_002953	GAT	2	6	4713	4718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49484916
82	NC_002953	TTA	3	9	4848	4856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49484916
83	NC_002953	GAT	2	6	4878	4883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49484916
84	NC_002953	TTA	2	6	4899	4904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49484916
85	NC_002953	ACA	2	6	5059	5064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	49484917
86	NC_002953	ATA	2	6	5191	5196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	49484917
87	NC_002953	GTT	2	6	5238	5243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	49484917
88	NC_002953	TGG	2	6	5357	5362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	49484917
89	NC_002953	TGG	2	6	5393	5398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	49484917
90	NC_002953	TCA	2	6	5415	5420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49484917
91	NC_002953	TCA	2	6	5480	5485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49484917
92	NC_002953	AAG	2	6	5521	5526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49484917
93	NC_002953	CAG	2	6	5619	5624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49484917
94	NC_002953	TGA	2	6	5684	5689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49484917
95	NC_002953	AGA	2	6	5702	5707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49484917
96	NC_002953	ATG	2	6	5776	5781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49484917
97	NC_002953	TCA	2	6	5795	5800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49484917
98	NC_002953	GAT	2	6	5808	5813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49484917
99	NC_002953	GGT	2	6	5898	5903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	49484917
100	NC_002953	AGA	2	6	5978	5983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49484917
101	NC_002953	ATT	2	6	6119	6124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49484917
102	NC_002953	TAT	2	6	6191	6196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49484917
103	NC_002953	GGC	2	6	6197	6202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	49484917
104	NC_002953	TGC	2	6	6215	6220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49484917
105	NC_002953	CGT	2	6	6243	6248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49484917
106	NC_002953	GAA	2	6	6312	6317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49484917
107	NC_002953	TTA	2	6	6591	6596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49484917
108	NC_002953	TTC	2	6	6600	6605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	49484917
109	NC_002953	TAT	2	6	6693	6698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49484917
110	NC_002953	ACA	2	6	6813	6818	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	49484917
111	NC_002953	TGT	2	6	6905	6910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	49484917
112	NC_002953	AGA	2	6	6932	6937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49484917
113	NC_002953	AGG	2	6	6991	6996	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_002953	TCG	2	6	7142	7147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49484918
115	NC_002953	TTG	2	6	7312	7317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	49484918
116	NC_002953	GCA	3	9	7356	7364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49484918
117	NC_002953	TAA	2	6	7421	7426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	49484918
118	NC_002953	ATG	2	6	7453	7458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49484918
119	NC_002953	CCA	2	6	7554	7559	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	49484918
120	NC_002953	GGA	2	6	7634	7639	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	49484918
121	NC_002953	CTG	2	6	7663	7668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49484918
122	NC_002953	GAA	2	6	7752	7757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49484918
123	NC_002953	TTG	2	6	7780	7785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	49484918
124	NC_002953	TGA	2	6	7883	7888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49484918
125	NC_002953	CAT	2	6	7990	7995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49484918
126	NC_002953	TTA	2	6	8038	8043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49484918
127	NC_002953	AAG	2	6	8050	8055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49484918
128	NC_002953	ATT	2	6	8065	8070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49484918
129	NC_002953	GTT	2	6	8088	8093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	49484918
130	NC_002953	AGA	2	6	8094	8099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49484918
131	NC_002953	ATT	2	6	8184	8189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49484918
132	NC_002953	CAA	2	6	8238	8243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	49484918
133	NC_002953	TTA	2	6	8346	8351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49484918
134	NC_002953	TGA	2	6	8384	8389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49484918
135	NC_002953	TTA	2	6	8397	8402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49484918
136	NC_002953	TGA	2	6	8447	8452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49484918
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264	NC_002953	GTT	2	6	14903	14908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	49484922
265	NC_002953	ATT	2	6	15306	15311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49484922
266	NC_002953	ATG	2	6	15324	15329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49484922
267	NC_002953	CAG	2	6	15388	15393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49484922
268	NC_002953	TGA	2	6	15403	15408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49484922
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271	NC_002953	ATT	2	6	15698	15703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49484923
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299	NC_002953	TTA	2	6	17279	17284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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379	NC_002953	ATG	2	6	22156	22161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49484928
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381	NC_002953	GAT	2	6	22194	22199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
382	NC_002953	TCA	2	6	22446	22451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49484929
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