MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus MSSA476 chromosome

Total Repeats: 66980

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_002953	CAT	2	6	41609	41614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_002953	TTC	2	6	41626	41631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	49484942
1004	NC_002953	ATA	2	6	41647	41652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	49484942
1005	NC_002953	A	6	6	41652	41657	100 %	0 %	0 %	0 %	49484942
1006	NC_002953	CAT	2	6	41664	41669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49484942
1007	NC_002953	T	6	6	41711	41716	0 %	100 %	0 %	0 %	49484942
1008	NC_002953	GTT	2	6	41754	41759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	49484942
1009	NC_002953	TG	3	6	41768	41773	0 %	50 %	50 %	0 %	49484942
1010	NC_002953	TCT	2	6	41792	41797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	49484942
1011	NC_002953	GTT	2	6	41889	41894	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	49484942
1012	NC_002953	GATT	2	8	41919	41926	25 %	50 %	25 %	0 %	49484942
1013	NC_002953	TCC	2	6	41939	41944	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1014	NC_002953	ATG	2	6	41961	41966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_002953	TAA	2	6	41980	41985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_002953	ATT	2	6	42023	42028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49484943
1017	NC_002953	CTC	2	6	42029	42034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	49484943
1018	NC_002953	TGA	2	6	42128	42133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49484943
1019	NC_002953	GATA	2	8	42161	42168	50 %	25 %	25 %	0 %	49484943
1020	NC_002953	TAG	2	6	42193	42198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49484943
1021	NC_002953	CTG	2	6	42266	42271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49484943
1022	NC_002953	CTT	2	6	42272	42277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	49484943
1023	NC_002953	TA	3	6	42330	42335	50 %	50 %	0 %	0 %	49484943
1024	NC_002953	GTT	2	6	42355	42360	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	49484943
1025	NC_002953	CCT	2	6	42373	42378	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1026	NC_002953	ATA	2	6	42417	42422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_002953	TA	3	6	42421	42426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_002953	TTA	2	6	42440	42445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_002953	TTG	2	6	42533	42538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_002953	TA	3	6	42550	42555	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_002953	TA	3	6	42558	42563	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_002953	ATTTGG	2	12	42566	42577	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_002953	TTA	2	6	42583	42588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_002953	ACTT	2	8	42591	42598	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1035	NC_002953	TAT	2	6	42609	42614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_002953	TTAT	3	12	42611	42622	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_002953	ATA	2	6	42625	42630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_002953	TTTTG	2	10	42707	42716	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_002953	AT	3	6	42779	42784	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_002953	ATATT	2	10	42828	42837	40 %	60 %	0 %	0 %	49484944
1041	NC_002953	GAG	2	6	42879	42884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	49484944
1042	NC_002953	TTA	3	9	42901	42909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49484944
1043	NC_002953	GTT	2	6	42914	42919	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	49484944
1044	NC_002953	TAA	2	6	42920	42925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	49484944
1045	NC_002953	ATT	2	6	42930	42935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49484944
1046	NC_002953	T	6	6	42960	42965	0 %	100 %	0 %	0 %	49484944
1047	NC_002953	TGC	2	6	43120	43125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49484944
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1050	NC_002953	TCA	2	6	43258	43263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49484944
1051	NC_002953	TTG	3	9	43266	43274	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	49484944
1052	NC_002953	TAC	2	6	43463	43468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49484944
1053	NC_002953	AAT	2	6	43472	43477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	49484944
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1057	NC_002953	TGAC	2	8	43609	43616	25 %	25 %	25 %	25 %	49484944
1058	NC_002953	T	6	6	43620	43625	0 %	100 %	0 %	0 %	49484944
1059	NC_002953	TAA	2	6	43658	43663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	49484944
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1061	NC_002953	ACG	2	6	43713	43718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49484944
1062	NC_002953	ATTGA	2	10	43792	43801	40 %	40 %	20 %	0 %	49484944
1063	NC_002953	T	6	6	43818	43823	0 %	100 %	0 %	0 %	49484944
1064	NC_002953	AT	3	6	43897	43902	50 %	50 %	0 %	0 %	49484944
1065	NC_002953	T	6	6	43941	43946	0 %	100 %	0 %	0 %	49484944
1066	NC_002953	TTA	2	6	43960	43965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49484944
1067	NC_002953	ATA	2	6	43989	43994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	49484944
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1069	NC_002953	A	6	6	44133	44138	100 %	0 %	0 %	0 %	49484944
1070	NC_002953	TTC	2	6	44160	44165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	49484944
1071	NC_002953	GTAA	2	8	44173	44180	50 %	25 %	25 %	0 %	49484944
1072	NC_002953	CAT	2	6	44249	44254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49484944
1073	NC_002953	AT	4	8	44313	44320	50 %	50 %	0 %	0 %	49484944
1074	NC_002953	TC	3	6	44400	44405	0 %	50 %	0 %	50 %	49484944
1075	NC_002953	CCT	2	6	44425	44430	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	49484944
1076	NC_002953	TTC	2	6	44440	44445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	49484944
1077	NC_002953	ATCC	2	8	44461	44468	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1078	NC_002953	TCA	2	6	44575	44580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49484945
1079	NC_002953	ACA	2	6	44591	44596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	49484945
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1081	NC_002953	ATG	2	6	44620	44625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49484945
1082	NC_002953	TGAT	2	8	44657	44664	25 %	50 %	25 %	0 %	49484945
1083	NC_002953	TTG	2	6	44679	44684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	49484945
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1086	NC_002953	AAG	2	6	44854	44859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49484945
1087	NC_002953	CAAA	2	8	44920	44927	75 %	0 %	0 %	25 %	49484945
1088	NC_002953	GACA	2	8	44951	44958	50 %	0 %	25 %	25 %	49484945
1089	NC_002953	AATG	2	8	44968	44975	50 %	25 %	25 %	0 %	49484945
1090	NC_002953	T	6	6	45032	45037	0 %	100 %	0 %	0 %	49484945
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1092	NC_002953	ATTG	2	8	45155	45162	25 %	50 %	25 %	0 %	49484945
1093	NC_002953	ATA	2	6	45193	45198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	49484945
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1096	NC_002953	ATAACC	2	12	45267	45278	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	49484945
1097	NC_002953	TAA	2	6	45286	45291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	49484945
1098	NC_002953	TGT	2	6	45375	45380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	49484945
1099	NC_002953	TAT	2	6	45437	45442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49484945
1100	NC_002953	TGA	2	6	45464	45469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49484945
1101	NC_002953	CAT	2	6	45518	45523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49484945
1102	NC_002953	T	6	6	45580	45585	0 %	100 %	0 %	0 %	49484945
1103	NC_002953	ATA	2	6	45620	45625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	49484945
1104	NC_002953	TTG	2	6	45639	45644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	49484945
1105	NC_002953	TCAGT	2	10	45647	45656	20 %	40 %	20 %	20 %	49484945
1106	NC_002953	TTG	2	6	45660	45665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	49484945
1107	NC_002953	GTTT	2	8	45757	45764	0 %	75 %	25 %	0 %	49484945
1108	NC_002953	TGC	2	6	45768	45773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49484945
1109	NC_002953	TTG	2	6	45780	45785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	49484945
1110	NC_002953	GTAA	2	8	45803	45810	50 %	25 %	25 %	0 %	49484945
1111	NC_002953	TCC	2	6	45834	45839	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1112	NC_002953	ATA	2	6	45850	45855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_002953	TA	3	6	45854	45859	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_002953	CTG	2	6	45892	45897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_002953	TTA	3	9	45908	45916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_002953	TCA	2	6	45918	45923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_002953	CAA	2	6	45940	45945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_002953	TCAA	2	8	45963	45970	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1119	NC_002953	TTA	2	6	46012	46017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49484946
1120	NC_002953	ATC	2	6	46030	46035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49484946
1121	NC_002953	T	6	6	46042	46047	0 %	100 %	0 %	0 %	49484946
1122	NC_002953	TTAG	2	8	46109	46116	25 %	50 %	25 %	0 %	49484946
1123	NC_002953	A	6	6	46158	46163	100 %	0 %	0 %	0 %	49484946
1124	NC_002953	TTG	2	6	46268	46273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	49484946
1125	NC_002953	GTT	2	6	46287	46292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	49484946
1126	NC_002953	ATC	2	6	46342	46347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49484946
1127	NC_002953	TCA	2	6	46397	46402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49484946
1128	NC_002953	GTATGA	2	12	46481	46492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49484946
1129	NC_002953	AGT	2	6	46503	46508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49484946
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1131	NC_002953	ATG	2	6	46645	46650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49484946
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