MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus MSSA476 chromosome

Total Repeats: 66980

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_002953	TAT	2	6	19800	19805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49484926
502	NC_002953	GAT	2	6	19915	19920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49484926
503	NC_002953	AATT	2	8	19946	19953	50 %	50 %	0 %	0 %	49484926
504	NC_002953	ATC	2	6	20015	20020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49484926
505	NC_002953	AGC	2	6	20037	20042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49484926
506	NC_002953	CAT	2	6	20075	20080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49484926
507	NC_002953	TGT	2	6	20082	20087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	49484926
508	NC_002953	TGG	2	6	20169	20174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	49484926
509	NC_002953	ACA	2	6	20244	20249	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	49484926
510	NC_002953	TAAAGG	2	12	20312	20323	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	49484927
511	NC_002953	A	6	6	20325	20330	100 %	0 %	0 %	0 %	49484927
512	NC_002953	AAG	2	6	20341	20346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49484927
513	NC_002953	CTT	2	6	20369	20374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	49484927
514	NC_002953	A	6	6	20436	20441	100 %	0 %	0 %	0 %	49484927
515	NC_002953	CAA	2	6	20460	20465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	49484927
516	NC_002953	TTGAAG	2	12	20509	20520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49484927
517	NC_002953	GGT	2	6	20541	20546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	49484927
518	NC_002953	AGTA	2	8	20561	20568	50 %	25 %	25 %	0 %	49484927
519	NC_002953	ATTC	2	8	20646	20653	25 %	50 %	0 %	25 %	49484927
520	NC_002953	AAG	2	6	20689	20694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49484927
521	NC_002953	AC	3	6	20714	20719	50 %	0 %	0 %	50 %	49484927
522	NC_002953	GTCT	2	8	20817	20824	0 %	50 %	25 %	25 %	49484928
523	NC_002953	ATT	2	6	20833	20838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49484928
524	NC_002953	TAC	2	6	20859	20864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49484928
525	NC_002953	ATG	2	6	20926	20931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49484928
526	NC_002953	ATA	2	6	20945	20950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	49484928
527	NC_002953	TGT	2	6	20961	20966	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	49484928
528	NC_002953	TGAA	2	8	21002	21009	50 %	25 %	25 %	0 %	49484928
529	NC_002953	ACG	2	6	21055	21060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49484928
530	NC_002953	TAT	2	6	21073	21078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49484928
531	NC_002953	GCAT	2	8	21096	21103	25 %	25 %	25 %	25 %	49484928
532	NC_002953	GATT	2	8	21113	21120	25 %	50 %	25 %	0 %	49484928
533	NC_002953	ATG	2	6	21143	21148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49484928
534	NC_002953	ATG	2	6	21155	21160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49484928
535	NC_002953	ATC	2	6	21213	21218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49484928
536	NC_002953	CAG	2	6	21353	21358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49484928
537	NC_002953	GGTA	2	8	21603	21610	25 %	25 %	50 %	0 %	49484928
538	NC_002953	TGA	2	6	21636	21641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49484928
539	NC_002953	GTC	2	6	21680	21685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49484928
540	NC_002953	TGATTG	2	12	21713	21724	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	49484928
541	NC_002953	ACT	2	6	21725	21730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49484928
542	NC_002953	ACA	2	6	21774	21779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	49484928
543	NC_002953	TC	3	6	21794	21799	0 %	50 %	0 %	50 %	49484928
544	NC_002953	GTG	2	6	21863	21868	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	49484928
545	NC_002953	AAC	2	6	21872	21877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	49484928
546	NC_002953	ATG	2	6	21895	21900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49484928
547	NC_002953	TGA	2	6	21963	21968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49484928
548	NC_002953	GGC	2	6	21982	21987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	49484928
549	NC_002953	GAT	2	6	21994	21999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49484928
550	NC_002953	GAT	2	6	22003	22008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49484928
551	NC_002953	GGT	2	6	22009	22014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	49484928
552	NC_002953	ATG	2	6	22031	22036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49484928
553	NC_002953	ATC	2	6	22054	22059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49484928
554	NC_002953	AGTTA	2	10	22092	22101	40 %	40 %	20 %	0 %	49484928
555	NC_002953	ATA	2	6	22118	22123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	49484928
556	NC_002953	ATG	2	6	22156	22161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49484928
557	NC_002953	A	7	7	22163	22169	100 %	0 %	0 %	0 %	49484928
558	NC_002953	AAT	2	6	22182	22187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_002953	GAT	2	6	22194	22199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
560	NC_002953	AT	3	6	22237	22242	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_002953	TCA	2	6	22446	22451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49484929
562	NC_002953	GTA	2	6	22455	22460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49484929
563	NC_002953	AAGGAA	2	12	22483	22494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49484929
564	NC_002953	CG	3	6	22532	22537	0 %	0 %	50 %	50 %	49484929
565	NC_002953	GGT	2	6	22545	22550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	49484929
566	NC_002953	AAT	2	6	22551	22556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	49484929
567	NC_002953	GTT	2	6	22659	22664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	49484929
568	NC_002953	GAA	2	6	22788	22793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49484929
569	NC_002953	A	6	6	22827	22832	100 %	0 %	0 %	0 %	49484929
570	NC_002953	ATT	2	6	22916	22921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49484929
571	NC_002953	CAT	2	6	22981	22986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49484929
572	NC_002953	TGA	2	6	22988	22993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49484929
573	NC_002953	GAA	2	6	23001	23006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49484929
574	NC_002953	TGC	2	6	23012	23017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49484929
575	NC_002953	ATT	2	6	23282	23287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49484929
576	NC_002953	CAT	2	6	23301	23306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49484929
577	NC_002953	AG	3	6	23310	23315	50 %	0 %	50 %	0 %	49484929
578	NC_002953	ACA	3	9	23334	23342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	49484929
579	NC_002953	CGT	2	6	23352	23357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49484929
580	NC_002953	GGTT	2	8	23361	23368	0 %	50 %	50 %	0 %	49484929
581	NC_002953	TCG	2	6	23393	23398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49484929
582	NC_002953	AGA	2	6	23573	23578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49484929
583	NC_002953	AGA	2	6	23600	23605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49484929
584	NC_002953	ATGTA	2	10	23651	23660	40 %	40 %	20 %	0 %	49484929
585	NC_002953	TCT	2	6	23671	23676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	49484929
586	NC_002953	AACA	2	8	23695	23702	75 %	0 %	0 %	25 %	49484929
587	NC_002953	TA	3	6	23732	23737	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_002953	AGG	2	6	23786	23791	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
589	NC_002953	TGCT	2	8	23801	23808	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
590	NC_002953	TCGAT	2	10	23815	23824	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
591	NC_002953	A	6	6	23834	23839	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_002953	AGA	2	6	23876	23881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
593	NC_002953	GAT	2	6	23885	23890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
594	NC_002953	AAG	2	6	23925	23930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
595	NC_002953	ATT	2	6	24017	24022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_002953	ATA	2	6	24023	24028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_002953	TTC	2	6	24068	24073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_002953	A	6	6	24074	24079	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_002953	A	6	6	24097	24102	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_002953	ATCT	2	8	24135	24142	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
601	NC_002953	CGG	2	6	24193	24198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_002953	T	6	6	24231	24236	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_002953	GCCT	2	8	24263	24270	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
604	NC_002953	T	7	7	24339	24345	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_002953	ATATT	2	10	24353	24362	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_002953	AT	3	6	24371	24376	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_002953	TTA	2	6	24488	24493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_002953	TTC	2	6	24525	24530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_002953	CCA	2	6	24542	24547	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
610	NC_002953	TCC	2	6	24549	24554	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
611	NC_002953	AAT	2	6	24586	24591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_002953	ATTT	2	8	24595	24602	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_002953	TAT	2	6	24647	24652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_002953	TCA	2	6	24666	24671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_002953	CCG	2	6	24697	24702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
616	NC_002953	TAA	2	6	24711	24716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_002953	A	6	6	24715	24720	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_002953	AT	3	6	24726	24731	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_002953	TA	3	6	24777	24782	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_002953	T	6	6	24851	24856	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_002953	A	6	6	24881	24886	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_002953	ATA	2	6	24894	24899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_002953	GTT	2	6	24942	24947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	49484930
624	NC_002953	TGA	3	9	24953	24961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49484930
625	NC_002953	A	7	7	24995	25001	100 %	0 %	0 %	0 %	49484930
626	NC_002953	ATG	2	6	25036	25041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49484930
627	NC_002953	GAA	3	9	25059	25067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49484930
628	NC_002953	A	6	6	25137	25142	100 %	0 %	0 %	0 %	49484930
629	NC_002953	CGT	2	6	25281	25286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49484930
630	NC_002953	A	6	6	25377	25382	100 %	0 %	0 %	0 %	49484930
631	NC_002953	TGAATT	2	12	25412	25423	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	49484930
632	NC_002953	ATT	2	6	25429	25434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49484930
633	NC_002953	TTA	2	6	25473	25478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49484930
634	NC_002953	GTAC	2	8	25512	25519	25 %	25 %	25 %	25 %	49484930
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758	NC_002953	AAT	2	6	30922	30927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
759	NC_002953	ATCA	2	8	30937	30944	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
760	NC_002953	ATA	2	6	30964	30969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	49484935
761	NC_002953	TTA	2	6	31012	31017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49484935
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