MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sulfolobus solfataricus P2 chromosome

Total Repeats: 64915

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_002754	ACTT	2	8	222277	222284	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5002	NC_002754	A	6	6	222329	222334	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_002754	ATT	2	6	222415	222420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_002754	TCT	2	6	222444	222449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5005	NC_002754	TTAT	2	8	222478	222485	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_002754	AAT	2	6	222620	222625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_002754	TAG	2	6	222636	222641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_002754	TTTATT	2	12	222709	222720	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_002754	CCGG	2	8	222787	222794	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5010	NC_002754	GAT	2	6	222808	222813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15897202
5011	NC_002754	TA	3	6	222823	222828	50 %	50 %	0 %	0 %	15897202
5012	NC_002754	TC	3	6	222857	222862	0 %	50 %	0 %	50 %	15897202
5013	NC_002754	T	6	6	222969	222974	0 %	100 %	0 %	0 %	15897202
5014	NC_002754	TTA	2	6	222981	222986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15897202
5015	NC_002754	AT	3	6	222999	223004	50 %	50 %	0 %	0 %	15897202
5016	NC_002754	T	6	6	223032	223037	0 %	100 %	0 %	0 %	15897202
5017	NC_002754	AG	3	6	223041	223046	50 %	0 %	50 %	0 %	15897202
5018	NC_002754	ATGG	2	8	223149	223156	25 %	25 %	50 %	0 %	15897202
5019	NC_002754	CTA	2	6	223174	223179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15897202
5020	NC_002754	T	6	6	223191	223196	0 %	100 %	0 %	0 %	15897202
5021	NC_002754	AAT	2	6	223197	223202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15897202
5022	NC_002754	ATA	2	6	223243	223248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15897202
5023	NC_002754	AGT	2	6	223259	223264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15897202
5024	NC_002754	T	6	6	223302	223307	0 %	100 %	0 %	0 %	15897202
5025	NC_002754	T	6	6	223351	223356	0 %	100 %	0 %	0 %	15897202
5026	NC_002754	TGT	2	6	223449	223454	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15897202
5027	NC_002754	CTC	2	6	223462	223467	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15897202
5028	NC_002754	TCA	2	6	223563	223568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15897202
5029	NC_002754	TTTA	2	8	223586	223593	25 %	75 %	0 %	0 %	15897202
5030	NC_002754	T	6	6	223619	223624	0 %	100 %	0 %	0 %	15897202
5031	NC_002754	GTAA	2	8	223628	223635	50 %	25 %	25 %	0 %	15897202
5032	NC_002754	AAT	2	6	223685	223690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15897202
5033	NC_002754	T	6	6	223733	223738	0 %	100 %	0 %	0 %	15897202
5034	NC_002754	AT	3	6	223809	223814	50 %	50 %	0 %	0 %	15897202
5035	NC_002754	TTC	2	6	223846	223851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15897202
5036	NC_002754	CTAGTG	2	12	223858	223869	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	15897202
5037	NC_002754	A	6	6	223900	223905	100 %	0 %	0 %	0 %	15897202
5038	NC_002754	T	7	7	223922	223928	0 %	100 %	0 %	0 %	15897202
5039	NC_002754	CAA	2	6	223942	223947	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15897202
5040	NC_002754	AGGTA	2	10	224007	224016	40 %	20 %	40 %	0 %	15897202
5041	NC_002754	TAA	2	6	224021	224026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15897202
5042	NC_002754	TA	3	6	224044	224049	50 %	50 %	0 %	0 %	15897202
5043	NC_002754	AGG	2	6	224053	224058	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15897202
5044	NC_002754	GTC	2	6	224108	224113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15897202
5045	NC_002754	ATTTC	2	10	224128	224137	20 %	60 %	0 %	20 %	15897202
5046	NC_002754	CTT	2	6	224147	224152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15897203
5047	NC_002754	ATT	2	6	224159	224164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15897203
5048	NC_002754	TTA	2	6	224256	224261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15897203
5049	NC_002754	CTA	2	6	224295	224300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15897203
5050	NC_002754	TTCA	2	8	224302	224309	25 %	50 %	0 %	25 %	15897203
5051	NC_002754	T	6	6	224312	224317	0 %	100 %	0 %	0 %	15897203
5052	NC_002754	CTT	2	6	224331	224336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15897203
5053	NC_002754	CTC	2	6	224340	224345	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15897203
5054	NC_002754	TA	3	6	224406	224411	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_002754	TGAT	2	8	224448	224455	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_002754	AGA	2	6	224463	224468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_002754	AT	3	6	224469	224474	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_002754	GAG	2	6	224520	224525	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_002754	AG	3	6	224545	224550	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_002754	TAAT	2	8	224555	224562	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_002754	AT	3	6	224561	224566	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_002754	ATA	2	6	224625	224630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_002754	AT	3	6	224635	224640	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_002754	ATA	2	6	224645	224650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_002754	CATA	2	8	224665	224672	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5066	NC_002754	TA	3	6	224720	224725	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_002754	TAG	2	6	224727	224732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_002754	TAC	2	6	224872	224877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5069	NC_002754	TAG	2	6	224892	224897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_002754	ATC	2	6	224903	224908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5071	NC_002754	GTA	2	6	224936	224941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_002754	ATAA	2	8	225038	225045	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_002754	T	6	6	225205	225210	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_002754	CTT	2	6	225211	225216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5075	NC_002754	CTTT	2	8	225242	225249	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5076	NC_002754	TAT	2	6	225251	225256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15897204
5077	NC_002754	TTA	2	6	225273	225278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15897204
5078	NC_002754	TTA	2	6	225290	225295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15897204
5079	NC_002754	CTT	2	6	225371	225376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15897204
5080	NC_002754	CTA	2	6	225387	225392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15897204
5081	NC_002754	AGC	2	6	225646	225651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15897204
5082	NC_002754	TAT	2	6	225667	225672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15897204
5083	NC_002754	ATA	2	6	225673	225678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15897204
5084	NC_002754	ATC	2	6	225682	225687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15897204
5085	NC_002754	ATAA	2	8	225704	225711	75 %	25 %	0 %	0 %	15897204
5086	NC_002754	ATA	2	6	225732	225737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15897204
5087	NC_002754	ATC	2	6	225778	225783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15897204
5088	NC_002754	AT	3	6	225881	225886	50 %	50 %	0 %	0 %	15897204
5089	NC_002754	TCA	2	6	225893	225898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15897204
5090	NC_002754	AATT	2	8	225903	225910	50 %	50 %	0 %	0 %	15897204
5091	NC_002754	GA	3	6	225925	225930	50 %	0 %	50 %	0 %	15897204
5092	NC_002754	TTC	2	6	225974	225979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15897204
5093	NC_002754	TCT	2	6	226002	226007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15897204
5094	NC_002754	CT	3	6	226026	226031	0 %	50 %	0 %	50 %	15897205
5095	NC_002754	CTTC	2	8	226044	226051	0 %	50 %	0 %	50 %	15897205
5096	NC_002754	AGG	2	6	226100	226105	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15897205
5097	NC_002754	ACTTCA	2	12	226107	226118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15897205
5098	NC_002754	TTG	2	6	226147	226152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15897205
5099	NC_002754	TCC	2	6	226265	226270	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15897205
5100	NC_002754	TATT	2	8	226284	226291	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_002754	TAT	2	6	226358	226363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_002754	ATT	2	6	226368	226373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_002754	TTC	2	6	226452	226457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15897206
5104	NC_002754	TCAG	2	8	226490	226497	25 %	25 %	25 %	25 %	15897206
5105	NC_002754	ATC	2	6	226510	226515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15897206
5106	NC_002754	AT	3	6	226617	226622	50 %	50 %	0 %	0 %	15897206
5107	NC_002754	AAC	2	6	226629	226634	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15897206
5108	NC_002754	TTA	2	6	226664	226669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15897206
5109	NC_002754	TAAA	2	8	226679	226686	75 %	25 %	0 %	0 %	15897206
5110	NC_002754	CAT	2	6	226701	226706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15897206
5111	NC_002754	ACT	2	6	226739	226744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15897206
5112	NC_002754	TTTGA	2	10	226773	226782	20 %	60 %	20 %	0 %	15897206
5113	NC_002754	TAA	2	6	226816	226821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_002754	TAA	2	6	226831	226836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_002754	TTA	2	6	226897	226902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_002754	AGA	2	6	227120	227125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_002754	TACGT	2	10	227173	227182	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5118	NC_002754	AT	3	6	227188	227193	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_002754	AAG	2	6	227246	227251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_002754	ACT	2	6	227321	227326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15897207
5121	NC_002754	GAAA	2	8	227348	227355	75 %	0 %	25 %	0 %	15897207
5122	NC_002754	TAT	2	6	227363	227368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15897207
5123	NC_002754	CCG	2	6	227525	227530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15897207
5124	NC_002754	GAC	2	6	227558	227563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15897207
5125	NC_002754	CTA	2	6	227610	227615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15897208
5126	NC_002754	AAG	2	6	227636	227641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15897208
5127	NC_002754	TCT	2	6	227675	227680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15897208
5128	NC_002754	ACC	2	6	227725	227730	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15897208
5129	NC_002754	TATCA	2	10	227773	227782	40 %	40 %	0 %	20 %	15897208
5130	NC_002754	TAA	2	6	227839	227844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15897208
5131	NC_002754	GTTT	2	8	227904	227911	0 %	75 %	25 %	0 %	15897208
5132	NC_002754	GCT	2	6	227933	227938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15897208
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5134	NC_002754	CTT	2	6	228300	228305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15897209
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5137	NC_002754	TTA	2	6	228396	228401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15897209
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5139	NC_002754	T	6	6	228454	228459	0 %	100 %	0 %	0 %	15897209
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5142	NC_002754	GTCT	2	8	228718	228725	0 %	50 %	25 %	25 %	15897209
5143	NC_002754	TAC	2	6	228788	228793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15897209
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5145	NC_002754	TCC	2	6	228827	228832	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15897209
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5149	NC_002754	TCC	2	6	228965	228970	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15897209
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5158	NC_002754	AGT	2	6	229286	229291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15897210
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5173	NC_002754	ATCT	2	8	229755	229762	25 %	50 %	0 %	25 %	15897211
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5175	NC_002754	CATA	2	8	229785	229792	50 %	25 %	0 %	25 %	15897211
5176	NC_002754	TAT	2	6	229801	229806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15897211
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5179	NC_002754	A	6	6	229868	229873	100 %	0 %	0 %	0 %	15897211
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5183	NC_002754	T	6	6	229923	229928	0 %	100 %	0 %	0 %	15897211
5184	NC_002754	TA	3	6	229942	229947	50 %	50 %	0 %	0 %	15897211
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5187	NC_002754	TA	3	6	230039	230044	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5188	NC_002754	TAA	2	6	230088	230093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15897212
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5234	NC_002754	ATT	2	6	232058	232063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15897214
5235	NC_002754	AGA	2	6	232102	232107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15897214
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5239	NC_002754	AAAG	2	8	232356	232363	75 %	0 %	25 %	0 %	15897214
5240	NC_002754	AAT	2	6	232372	232377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15897214
5241	NC_002754	TGA	2	6	232384	232389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15897214
5242	NC_002754	GATA	2	8	232414	232421	50 %	25 %	25 %	0 %	15897214
5243	NC_002754	AG	3	6	232439	232444	50 %	0 %	50 %	0 %	15897214
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5245	NC_002754	GATA	2	8	232531	232538	50 %	25 %	25 %	0 %	15897214
5246	NC_002754	ATA	2	6	232580	232585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15897214
5247	NC_002754	AT	4	8	232629	232636	50 %	50 %	0 %	0 %	15897214
5248	NC_002754	GAAAAT	2	12	232642	232653	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	15897214
5249	NC_002754	TAT	2	6	232677	232682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15897214
5250	NC_002754	GTG	2	6	232704	232709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15897214
5251	NC_002754	AT	3	6	232741	232746	50 %	50 %	0 %	0 %	15897214
5252	NC_002754	AG	3	6	232843	232848	50 %	0 %	50 %	0 %	15897214
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5500	NC_002754	CTAT	2	8	243213	243220	25 %	50 %	0 %	25 %	15897228

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