MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Sinorhizobium fredii NGR234 plasmid pNGR234a

Total Repeats: 7543

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000914	ATA	2	6	42	47	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_000914	CGC	2	6	114	119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16519683
3	NC_000914	GCA	2	6	208	213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16519683
4	NC_000914	GAA	2	6	298	303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16519683
5	NC_000914	TCG	3	9	341	349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16519683
6	NC_000914	GAC	3	9	505	513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16519683
7	NC_000914	GCC	2	6	515	520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16519683
8	NC_000914	TCG	2	6	593	598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16519683
9	NC_000914	ATC	2	6	686	691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16519683
10	NC_000914	CTT	2	6	805	810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16519683
11	NC_000914	GTC	2	6	860	865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16519683
12	NC_000914	TGC	2	6	1024	1029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16519683
13	NC_000914	TGG	2	6	1098	1103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16519683
14	NC_000914	CCA	2	6	1123	1128	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16519683
15	NC_000914	GAA	2	6	1138	1143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16519683
16	NC_000914	TCG	2	6	1278	1283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16519683
17	NC_000914	GGA	2	6	1305	1310	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16519683
18	NC_000914	GTC	2	6	1540	1545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16519682
19	NC_000914	CCG	2	6	1716	1721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16519682
20	NC_000914	GTC	2	6	1762	1767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16519682
21	NC_000914	TGC	2	6	1911	1916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16519682
22	NC_000914	CGG	2	6	1997	2002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16519682
23	NC_000914	GCG	2	6	2149	2154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16519682
24	NC_000914	GAC	2	6	2169	2174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16519682
25	NC_000914	CGG	2	6	2201	2206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16519682
26	NC_000914	AGC	2	6	2418	2423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_000914	AGA	2	6	2511	2516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16519681
28	NC_000914	GAC	2	6	2533	2538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16519681
29	NC_000914	GCG	2	6	2548	2553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16519681
30	NC_000914	GAC	2	6	2725	2730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16519681
31	NC_000914	TCG	2	6	2835	2840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16519681
32	NC_000914	GAG	2	6	3077	3082	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16519681
33	NC_000914	TAG	2	6	3129	3134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16519681
34	NC_000914	GTC	2	6	3491	3496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16519681
35	NC_000914	CGG	2	6	3616	3621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16519681
36	NC_000914	CTG	2	6	3689	3694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16519681
37	NC_000914	CCT	2	6	3723	3728	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16519681
38	NC_000914	GAA	2	6	3733	3738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_000914	CGG	2	6	3749	3754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_000914	TTG	2	6	3786	3791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_000914	GAC	2	6	3944	3949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_000914	ACC	2	6	4450	4455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_000914	TCA	2	6	4532	4537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_000914	TCG	3	9	4542	4550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_000914	TCG	2	6	4601	4606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_000914	GGT	2	6	4671	4676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_000914	CGG	2	6	4802	4807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_000914	CAC	2	6	4878	4883	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_000914	AGG	2	6	4904	4909	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_000914	CGA	3	9	4984	4992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_000914	AGC	2	6	5024	5029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_000914	AAG	2	6	5104	5109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_000914	CGG	2	6	5112	5117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_000914	CGA	2	6	5348	5353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_000914	TAG	2	6	5430	5435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_000914	CGC	2	6	5476	5481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_000914	CTG	2	6	5540	5545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_000914	GGA	2	6	5586	5591	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_000914	CGA	3	9	5912	5920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_000914	GCC	2	6	5926	5931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_000914	CGA	2	6	6150	6155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_000914	GCT	2	6	6196	6201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_000914	ATG	2	6	6296	6301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16519680
64	NC_000914	CGA	2	6	6330	6335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16519680
65	NC_000914	GAC	2	6	6359	6364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16519680
66	NC_000914	AGA	2	6	6435	6440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16519680
67	NC_000914	GGC	2	6	6505	6510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16519680
68	NC_000914	GCG	2	6	6580	6585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_000914	CGC	2	6	6616	6621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_000914	AGT	2	6	6691	6696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16519679
71	NC_000914	GCC	2	6	6726	6731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16519679
72	NC_000914	GGC	2	6	6765	6770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16519679
73	NC_000914	GAT	2	6	6830	6835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16519679
74	NC_000914	GGC	2	6	7140	7145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16519679
75	NC_000914	GCG	2	6	7232	7237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16519679
76	NC_000914	CGC	2	6	7277	7282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16519679
77	NC_000914	ACG	3	9	7348	7356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16519679
78	NC_000914	AAG	2	6	7383	7388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16519679
79	NC_000914	TGG	2	6	7435	7440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16519679
80	NC_000914	GCC	2	6	7456	7461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16519679
81	NC_000914	TCG	2	6	7468	7473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16519679
82	NC_000914	CGT	2	6	7481	7486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16519679
83	NC_000914	TGC	2	6	7531	7536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16519679
84	NC_000914	ACC	2	6	7785	7790	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_000914	GAT	2	6	7812	7817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_000914	GGA	2	6	7827	7832	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_000914	CGA	2	6	8183	8188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16519678
88	NC_000914	TCC	2	6	8299	8304	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16519678
89	NC_000914	ACG	2	6	8305	8310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16519678
90	NC_000914	CCG	2	6	8372	8377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16519678
91	NC_000914	ACG	2	6	8542	8547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16519678
92	NC_000914	GCC	2	6	8574	8579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16519678
93	NC_000914	TGG	2	6	8713	8718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16519678
94	NC_000914	TGC	2	6	8731	8736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16519678
95	NC_000914	CGG	2	6	8755	8760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16519678
96	NC_000914	TGC	2	6	8761	8766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16519678
97	NC_000914	TCG	2	6	8773	8778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16519678
98	NC_000914	GCA	2	6	8810	8815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16519678
99	NC_000914	CAC	2	6	8870	8875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16519678
100	NC_000914	GCC	2	6	8889	8894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16519678
101	NC_000914	GCC	2	6	8932	8937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16519678
102	NC_000914	GCT	2	6	8957	8962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16519678
103	NC_000914	GGC	2	6	8984	8989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16519678
104	NC_000914	GAT	2	6	9038	9043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16519678
105	NC_000914	GGC	2	6	9164	9169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16519678
106	NC_000914	GCG	2	6	9170	9175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16519678
107	NC_000914	CGG	2	6	9263	9268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_000914	TGT	2	6	9333	9338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16519677
109	NC_000914	GTT	2	6	9462	9467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16519677
110	NC_000914	CGG	2	6	9665	9670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16519677
111	NC_000914	CCG	2	6	9689	9694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16519677
112	NC_000914	TTG	2	6	9781	9786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16519677
113	NC_000914	CGT	2	6	9801	9806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16519677
114	NC_000914	TGC	2	6	9962	9967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16519677
115	NC_000914	AGC	2	6	9976	9981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16519677
116	NC_000914	ATC	2	6	10022	10027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16519677
117	NC_000914	GTC	2	6	10051	10056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16519677
118	NC_000914	TGG	2	6	10113	10118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16519677
119	NC_000914	CGG	2	6	10211	10216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16519677
120	NC_000914	ATC	2	6	10237	10242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16519677
121	NC_000914	GAA	2	6	10246	10251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16519677
122	NC_000914	TGG	2	6	10260	10265	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16519677
123	NC_000914	CGC	2	6	10409	10414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16519677
124	NC_000914	GGC	2	6	10454	10459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_000914	GAG	2	6	10491	10496	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_000914	ATG	2	6	10497	10502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_000914	GTT	2	6	10822	10827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_000914	CAT	2	6	10891	10896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_000914	ATC	2	6	11054	11059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16519676
130	NC_000914	GAA	2	6	11117	11122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16519676
131	NC_000914	CGA	2	6	11134	11139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16519676
132	NC_000914	GAC	2	6	11164	11169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16519676
133	NC_000914	GAC	2	6	11258	11263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16519676
134	NC_000914	GTC	2	6	11348	11353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16519676
135	NC_000914	CGG	2	6	11382	11387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16519676
136	NC_000914	GCC	2	6	11416	11421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16519676
137	NC_000914	CGA	3	9	11494	11502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16519676
138	NC_000914	AGC	2	6	11669	11674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16519676
139	NC_000914	GAC	2	6	11681	11686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16519676
140	NC_000914	GCA	2	6	11868	11873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16519676
141	NC_000914	GAT	2	6	11881	11886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16519676
142	NC_000914	ATC	2	6	11930	11935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16519676
143	NC_000914	GGT	2	6	12104	12109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16519676
144	NC_000914	GGC	2	6	12191	12196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16519676
145	NC_000914	AAG	2	6	12254	12259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16519676
146	NC_000914	ACT	2	6	12270	12275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16519676
147	NC_000914	GAA	2	6	12385	12390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16519676
148	NC_000914	TGC	2	6	12402	12407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16519676
149	NC_000914	TTG	2	6	12534	12539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16519676
150	NC_000914	CGA	2	6	12541	12546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16519676
151	NC_000914	AAG	2	6	12551	12556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16519676
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153	NC_000914	GGC	2	6	12612	12617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16519676
154	NC_000914	TTC	2	6	12738	12743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16519676
155	NC_000914	GGC	2	6	12792	12797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16519676
156	NC_000914	TGA	2	6	12805	12810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16519676
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158	NC_000914	AGA	2	6	12893	12898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16519675
159	NC_000914	GAG	2	6	13267	13272	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16519675
160	NC_000914	AAG	2	6	13378	13383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16519675
161	NC_000914	AGA	2	6	13385	13390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16519675
162	NC_000914	TAT	2	6	13419	13424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16519675
163	NC_000914	GTG	2	6	13433	13438	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16519675
164	NC_000914	GAC	2	6	13450	13455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16519675
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167	NC_000914	GCG	2	6	13741	13746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16519675
168	NC_000914	GTG	2	6	13784	13789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16519675
169	NC_000914	CCT	2	6	13851	13856	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16519675
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171	NC_000914	GAC	2	6	14103	14108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16519675
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174	NC_000914	TTA	2	6	14422	14427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16519674
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188	NC_000914	TCG	3	9	15653	15661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16519673
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229	NC_000914	GGC	2	6	18447	18452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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258	NC_000914	TTC	2	6	21610	21615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16519671
259	NC_000914	GTC	2	6	21664	21669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
260	NC_000914	GCC	2	6	21673	21678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
261	NC_000914	GGC	2	6	21763	21768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
262	NC_000914	TGC	2	6	21834	21839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
263	NC_000914	CTC	2	6	22163	22168	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16519948
264	NC_000914	GCT	2	6	22192	22197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16519948
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270	NC_000914	GTA	2	6	22747	22752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16519669
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388	NC_000914	GAC	2	6	31137	31142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
389	NC_000914	CGG	2	6	31179	31184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
390	NC_000914	CCG	2	6	31231	31236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
391	NC_000914	ATG	2	6	31333	31338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
392	NC_000914	GGC	2	6	31437	31442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
393	NC_000914	CGA	2	6	31503	31508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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