MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sinorhizobium fredii NGR234 plasmid pNGR234a

Total Repeats: 10803

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_000914	AGA	2	6	200399	200404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16519941
4002	NC_000914	ATT	2	6	200498	200503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16519941
4003	NC_000914	CATC	2	8	200542	200549	25 %	25 %	0 %	50 %	16519941
4004	NC_000914	TCCG	2	8	200586	200593	0 %	25 %	25 %	50 %	16519941
4005	NC_000914	GAC	2	6	200637	200642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16519941
4006	NC_000914	TC	3	6	200677	200682	0 %	50 %	0 %	50 %	16519941
4007	NC_000914	CTA	2	6	200757	200762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16519941
4008	NC_000914	TGC	2	6	200780	200785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16519941
4009	NC_000914	TCG	2	6	200823	200828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16519941
4010	NC_000914	CTCCAT	2	12	200843	200854	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	16519941
4011	NC_000914	TCC	2	6	200901	200906	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16519941
4012	NC_000914	GCA	2	6	200907	200912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16519941
4013	NC_000914	TCG	2	6	200970	200975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16519941
4014	NC_000914	ATA	2	6	201030	201035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16519941
4015	NC_000914	ACA	2	6	201159	201164	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16519941
4016	NC_000914	GTT	2	6	201217	201222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16519941
4017	NC_000914	AGAA	2	8	201230	201237	75 %	0 %	25 %	0 %	16519941
4018	NC_000914	GAC	2	6	201293	201298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16519941
4019	NC_000914	GAC	2	6	201327	201332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16519941
4020	NC_000914	TG	3	6	201376	201381	0 %	50 %	50 %	0 %	16519941
4021	NC_000914	TCA	2	6	201541	201546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16519941
4022	NC_000914	CCT	2	6	201550	201555	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16519941
4023	NC_000914	GATC	2	8	201587	201594	25 %	25 %	25 %	25 %	16519941
4024	NC_000914	GAT	2	6	201638	201643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16519941
4025	NC_000914	GGC	2	6	201689	201694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16519941
4026	NC_000914	TGGT	2	8	201748	201755	0 %	50 %	50 %	0 %	16519941
4027	NC_000914	CCG	2	6	201826	201831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16519941
4028	NC_000914	TAT	2	6	201847	201852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16519941
4029	NC_000914	AGC	2	6	201864	201869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16519941
4030	NC_000914	CTTCGA	2	12	201889	201900	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16519941
4031	NC_000914	GAG	2	6	201923	201928	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16519941
4032	NC_000914	GTT	2	6	201984	201989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16519941
4033	NC_000914	CGT	2	6	202022	202027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16519941
4034	NC_000914	C	6	6	202119	202124	0 %	0 %	0 %	100 %	16519941
4035	NC_000914	GT	3	6	202139	202144	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_000914	T	6	6	202221	202226	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_000914	CGC	2	6	202287	202292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4038	NC_000914	TTG	2	6	202297	202302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_000914	CTG	2	6	202307	202312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4040	NC_000914	CAT	2	6	202324	202329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4041	NC_000914	TGC	2	6	202351	202356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4042	NC_000914	GC	3	6	202439	202444	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4043	NC_000914	TGT	2	6	202449	202454	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_000914	CGG	2	6	202499	202504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4045	NC_000914	GGC	2	6	202586	202591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4046	NC_000914	GGC	2	6	202630	202635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4047	NC_000914	CGAC	2	8	202713	202720	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4048	NC_000914	AGCG	2	8	202840	202847	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4049	NC_000914	GCC	2	6	202942	202947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4050	NC_000914	AGC	2	6	203049	203054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4051	NC_000914	CCGAA	2	10	203086	203095	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
4052	NC_000914	CCG	2	6	203116	203121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4053	NC_000914	TGC	2	6	203140	203145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4054	NC_000914	AGC	2	6	203181	203186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4055	NC_000914	GCT	2	6	203252	203257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4056	NC_000914	TGG	2	6	203263	203268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_000914	GCC	2	6	203424	203429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4058	NC_000914	CGA	2	6	203450	203455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4059	NC_000914	GCC	2	6	203493	203498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4060	NC_000914	GCC	2	6	203566	203571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4061	NC_000914	CCG	2	6	203608	203613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4062	NC_000914	TGA	2	6	203636	203641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_000914	GCC	2	6	203659	203664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4064	NC_000914	TGC	2	6	203681	203686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4065	NC_000914	GAC	2	6	203820	203825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4066	NC_000914	TCC	2	6	203849	203854	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4067	NC_000914	GAG	2	6	203872	203877	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_000914	GAA	2	6	203901	203906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_000914	TGC	2	6	204011	204016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4070	NC_000914	CG	3	6	204059	204064	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4071	NC_000914	GGC	2	6	204066	204071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4072	NC_000914	CTG	2	6	204188	204193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4073	NC_000914	CAA	2	6	204201	204206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4074	NC_000914	TGGC	2	8	204210	204217	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4075	NC_000914	GGGC	2	8	204223	204230	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4076	NC_000914	CTG	2	6	204236	204241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4077	NC_000914	GCC	3	9	204253	204261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4078	NC_000914	GCG	2	6	204293	204298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4079	NC_000914	ACC	2	6	204312	204317	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4080	NC_000914	GC	3	6	204349	204354	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4081	NC_000914	CGC	2	6	204378	204383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4082	NC_000914	CCG	2	6	204492	204497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4083	NC_000914	TGC	2	6	204512	204517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4084	NC_000914	CTT	2	6	204519	204524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4085	NC_000914	CAT	2	6	204536	204541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4086	NC_000914	GC	3	6	204559	204564	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4087	NC_000914	CAT	2	6	204574	204579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4088	NC_000914	CGA	2	6	204697	204702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4089	NC_000914	GAC	2	6	204719	204724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4090	NC_000914	AGC	2	6	204730	204735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4091	NC_000914	CG	4	8	204756	204763	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4092	NC_000914	GCA	2	6	204869	204874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4093	NC_000914	GCAC	2	8	204907	204914	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4094	NC_000914	GCTC	2	8	205000	205007	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4095	NC_000914	ACGA	2	8	205047	205054	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4096	NC_000914	TAA	2	6	205215	205220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16519940
4097	NC_000914	CGA	2	6	205416	205421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16519940
4098	NC_000914	GC	3	6	205449	205454	0 %	0 %	50 %	50 %	16519940
4099	NC_000914	TTC	2	6	205489	205494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16519940
4100	NC_000914	TCA	2	6	205580	205585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16519940
4101	NC_000914	AAG	2	6	205589	205594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16519940
4102	NC_000914	AGA	2	6	205608	205613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16519940
4103	NC_000914	CGGC	2	8	205722	205729	0 %	0 %	50 %	50 %	16519940
4104	NC_000914	TTGC	2	8	205789	205796	0 %	50 %	25 %	25 %	16519940
4105	NC_000914	ATC	2	6	205909	205914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16519940
4106	NC_000914	TCTT	2	8	205950	205957	0 %	75 %	0 %	25 %	16519940
4107	NC_000914	CGA	3	9	205980	205988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16519940
4108	NC_000914	TC	3	6	205993	205998	0 %	50 %	0 %	50 %	16519940
4109	NC_000914	CTGG	2	8	206024	206031	0 %	25 %	50 %	25 %	16519940
4110	NC_000914	GCGAC	2	10	206096	206105	20 %	0 %	40 %	40 %	16519940
4111	NC_000914	GAT	2	6	206170	206175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16519940
4112	NC_000914	GTT	2	6	206239	206244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16519940
4113	NC_000914	ATA	2	6	206255	206260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16519940
4114	NC_000914	C	7	7	206316	206322	0 %	0 %	0 %	100 %	16519940
4115	NC_000914	CGA	2	6	206415	206420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16519940
4116	NC_000914	CCA	2	6	206484	206489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16519940
4117	NC_000914	ACG	2	6	206504	206509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16519940
4118	NC_000914	TCG	2	6	206511	206516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16519940
4119	NC_000914	CCG	2	6	206553	206558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16519940
4120	NC_000914	GAC	2	6	206562	206567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16519940
4121	NC_000914	TTC	2	6	206595	206600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4122	NC_000914	ACG	2	6	206631	206636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4123	NC_000914	CCG	2	6	206650	206655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4124	NC_000914	TC	3	6	206778	206783	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4125	NC_000914	GCT	2	6	206857	206862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4126	NC_000914	GTC	2	6	206965	206970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4127	NC_000914	CTC	2	6	206981	206986	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4128	NC_000914	GCGACC	2	12	207027	207038	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
4129	NC_000914	GCG	2	6	207039	207044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4130	NC_000914	CCG	2	6	207124	207129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4131	NC_000914	GCT	2	6	207193	207198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4132	NC_000914	GCC	2	6	207244	207249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4133	NC_000914	ATG	2	6	207261	207266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4134	NC_000914	ACC	2	6	207272	207277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4135	NC_000914	GAGT	2	8	207388	207395	25 %	25 %	50 %	0 %	16519939
4136	NC_000914	GCA	2	6	207518	207523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16519939
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4138	NC_000914	GCC	2	6	207577	207582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16519939
4139	NC_000914	AGA	2	6	207604	207609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16519939
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4141	NC_000914	CTT	2	6	207659	207664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16519939
4142	NC_000914	TTC	2	6	207708	207713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16519939
4143	NC_000914	TGCT	2	8	207756	207763	0 %	50 %	25 %	25 %	16519939
4144	NC_000914	TGT	2	6	207803	207808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16519939
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4152	NC_000914	GCC	2	6	208168	208173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16519939
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4154	NC_000914	ACCGA	2	10	208233	208242	40 %	0 %	20 %	40 %	16519939
4155	NC_000914	AC	3	6	208269	208274	50 %	0 %	0 %	50 %	16519939
4156	NC_000914	T	6	6	208442	208447	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4157	NC_000914	GCC	2	6	208626	208631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4158	NC_000914	TGC	2	6	208674	208679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4159	NC_000914	GCGG	2	8	208743	208750	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4160	NC_000914	CGC	2	6	208816	208821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4161	NC_000914	GC	3	6	208850	208855	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4162	NC_000914	GGC	2	6	208869	208874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4163	NC_000914	TCC	2	6	208907	208912	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4164	NC_000914	AGG	2	6	208940	208945	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4165	NC_000914	CGT	2	6	209019	209024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4166	NC_000914	GGTT	2	8	209057	209064	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4167	NC_000914	TTC	2	6	209088	209093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4168	NC_000914	GC	4	8	209094	209101	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4169	NC_000914	ATC	2	6	209238	209243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4172	NC_000914	ATCA	2	8	209376	209383	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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4237	NC_000914	GTC	3	9	212550	212558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4252	NC_000914	CGC	2	6	213296	213301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16519900
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4254	NC_000914	CGA	2	6	213359	213364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16519900
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4380	NC_000914	ACGG	2	8	220133	220140	25 %	0 %	50 %	25 %	16519931
4381	NC_000914	ATC	2	6	220155	220160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16519931
4382	NC_000914	ATCG	2	8	220168	220175	25 %	25 %	25 %	25 %	16519931
4383	NC_000914	TCG	2	6	220213	220218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16519931
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4385	NC_000914	TGG	2	6	220333	220338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16519931
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4496	NC_000914	CGG	2	6	225048	225053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4498	NC_000914	GCC	2	6	225111	225116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4499	NC_000914	GCC	3	9	225135	225143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4500	NC_000914	CTCG	2	8	225149	225156	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding

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