MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sinorhizobium fredii NGR234 plasmid pNGR234a

Total Repeats: 10803

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_000914	TCA	2	6	51914	51919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_000914	CGA	2	6	51927	51932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_000914	TCG	2	6	51942	51947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_000914	GCC	2	6	51961	51966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1005	NC_000914	GCA	2	6	51974	51979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_000914	CGG	2	6	51990	51995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_000914	G	6	6	51998	52003	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_000914	GCCT	2	8	52019	52026	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1009	NC_000914	CCG	2	6	52107	52112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1010	NC_000914	GCC	2	6	52132	52137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1011	NC_000914	AGC	2	6	52180	52185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_000914	CG	3	6	52222	52227	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1013	NC_000914	A	6	6	52240	52245	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_000914	CTC	2	6	52302	52307	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1015	NC_000914	A	6	6	52397	52402	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_000914	GTGCC	2	10	52525	52534	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1017	NC_000914	CG	4	8	52547	52554	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1018	NC_000914	A	6	6	52602	52607	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_000914	GAAC	2	8	52745	52752	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1020	NC_000914	CGC	2	6	52790	52795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1021	NC_000914	ATCGA	2	10	52846	52855	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1022	NC_000914	GC	4	8	52925	52932	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1023	NC_000914	CGA	2	6	52954	52959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_000914	CG	3	6	53047	53052	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1025	NC_000914	GAA	2	6	53122	53127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_000914	TAA	2	6	53138	53143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_000914	GTG	2	6	53148	53153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_000914	CG	3	6	53322	53327	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1029	NC_000914	GCC	3	9	53347	53355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1030	NC_000914	CAG	2	6	53402	53407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1031	NC_000914	CGA	2	6	53427	53432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_000914	AGCGGC	2	12	53448	53459	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	16519644
1033	NC_000914	CGT	2	6	53503	53508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16519644
1034	NC_000914	ATCC	2	8	53514	53521	25 %	25 %	0 %	50 %	16519644
1035	NC_000914	CCT	2	6	53627	53632	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16519644
1036	NC_000914	GCT	2	6	53642	53647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16519644
1037	NC_000914	GCC	2	6	53711	53716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16519644
1038	NC_000914	AGC	2	6	53764	53769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16519644
1039	NC_000914	ATT	2	6	53797	53802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16519644
1040	NC_000914	TGT	2	6	53884	53889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16519644
1041	NC_000914	ACC	2	6	53911	53916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16519644
1042	NC_000914	CG	3	6	53965	53970	0 %	0 %	50 %	50 %	16519644
1043	NC_000914	CAGC	2	8	53980	53987	25 %	0 %	25 %	50 %	16519644
1044	NC_000914	CT	3	6	54050	54055	0 %	50 %	0 %	50 %	16519644
1045	NC_000914	TGC	2	6	54073	54078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16519644
1046	NC_000914	CGC	2	6	54217	54222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16519644
1047	NC_000914	GCT	3	9	54227	54235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16519644
1048	NC_000914	CG	3	6	54266	54271	0 %	0 %	50 %	50 %	16519644
1049	NC_000914	GAC	2	6	54302	54307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16519644
1050	NC_000914	GGC	3	9	54328	54336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16519643
1051	NC_000914	ACC	2	6	54345	54350	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16519643
1052	NC_000914	CCG	2	6	54398	54403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16519643
1053	NC_000914	GCC	2	6	54441	54446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16519643
1054	NC_000914	CGA	2	6	54451	54456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16519643
1055	NC_000914	CGA	2	6	54469	54474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16519643
1056	NC_000914	CG	3	6	54477	54482	0 %	0 %	50 %	50 %	16519643
1057	NC_000914	TGC	2	6	54493	54498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16519643
1058	NC_000914	CCG	3	9	54545	54553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16519643
1059	NC_000914	TAC	2	6	54642	54647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16519643
1060	NC_000914	CG	3	6	54656	54661	0 %	0 %	50 %	50 %	16519643
1061	NC_000914	GT	3	6	54729	54734	0 %	50 %	50 %	0 %	16519643
1062	NC_000914	GAG	2	6	54746	54751	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16519643
1063	NC_000914	GCTGG	2	10	54827	54836	0 %	20 %	60 %	20 %	16519643
1064	NC_000914	TA	3	6	54845	54850	50 %	50 %	0 %	0 %	16519643
1065	NC_000914	CAG	2	6	54883	54888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16519643
1066	NC_000914	CG	3	6	54950	54955	0 %	0 %	50 %	50 %	16519643
1067	NC_000914	ATG	2	6	54956	54961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16519643
1068	NC_000914	CGA	2	6	54976	54981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16519643
1069	NC_000914	CAT	2	6	55024	55029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16519643
1070	NC_000914	CG	3	6	55043	55048	0 %	0 %	50 %	50 %	16519643
1071	NC_000914	CTG	3	9	55058	55066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16519643
1072	NC_000914	GC	3	6	55120	55125	0 %	0 %	50 %	50 %	16519643
1073	NC_000914	TGT	2	6	55149	55154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16519643
1074	NC_000914	A	6	6	55161	55166	100 %	0 %	0 %	0 %	16519642
1075	NC_000914	CGG	2	6	55266	55271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16519642
1076	NC_000914	CGGAA	2	10	55377	55386	40 %	0 %	40 %	20 %	16519642
1077	NC_000914	CGA	2	6	55403	55408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16519642
1078	NC_000914	TCG	2	6	55424	55429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16519642
1079	NC_000914	CGG	3	9	55464	55472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16519642
1080	NC_000914	GCGTC	2	10	55503	55512	0 %	20 %	40 %	40 %	16519642
1081	NC_000914	GCT	3	9	55632	55640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16519642
1082	NC_000914	CGC	2	6	55641	55646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16519642
1083	NC_000914	CCG	2	6	55660	55665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16519642
1084	NC_000914	GCT	2	6	55707	55712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16519642
1085	NC_000914	GCG	2	6	55718	55723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16519642
1086	NC_000914	CG	4	8	55743	55750	0 %	0 %	50 %	50 %	16519642
1087	NC_000914	CGG	2	6	55778	55783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16519642
1088	NC_000914	ATC	2	6	55858	55863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16519642
1089	NC_000914	GAC	2	6	55882	55887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16519642
1090	NC_000914	CGA	2	6	55905	55910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16519642
1091	NC_000914	GCC	2	6	55929	55934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16519642
1092	NC_000914	GGC	2	6	55938	55943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16519642
1093	NC_000914	CCGA	2	8	55972	55979	25 %	0 %	25 %	50 %	16519642
1094	NC_000914	CGT	2	6	55989	55994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16519642
1095	NC_000914	GATCC	2	10	56032	56041	20 %	20 %	20 %	40 %	16519642
1096	NC_000914	CGG	2	6	56052	56057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16519642
1097	NC_000914	GAG	2	6	56140	56145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16519642
1098	NC_000914	GCC	2	6	56202	56207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16519642
1099	NC_000914	GT	3	6	56218	56223	0 %	50 %	50 %	0 %	16519642
1100	NC_000914	GCC	2	6	56374	56379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16519642
1101	NC_000914	TTGA	2	8	56406	56413	25 %	50 %	25 %	0 %	16519642
1102	NC_000914	CGC	2	6	56496	56501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16519641
1103	NC_000914	GCT	2	6	56535	56540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16519641
1104	NC_000914	CCA	2	6	56591	56596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16519641
1105	NC_000914	CGT	2	6	56646	56651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16519641
1106	NC_000914	GC	3	6	56693	56698	0 %	0 %	50 %	50 %	16519641
1107	NC_000914	CGG	2	6	56700	56705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16519641
1108	NC_000914	GAT	2	6	56772	56777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16519641
1109	NC_000914	GC	3	6	56812	56817	0 %	0 %	50 %	50 %	16519641
1110	NC_000914	CG	5	10	56827	56836	0 %	0 %	50 %	50 %	16519641
1111	NC_000914	GCG	3	9	56834	56842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16519641
1112	NC_000914	GC	3	6	56901	56906	0 %	0 %	50 %	50 %	16519641
1113	NC_000914	GC	3	6	56983	56988	0 %	0 %	50 %	50 %	16519641
1114	NC_000914	GAA	2	6	57036	57041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16519641
1115	NC_000914	GAA	2	6	57061	57066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16519641
1116	NC_000914	GAA	2	6	57189	57194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16519641
1117	NC_000914	GC	3	6	57204	57209	0 %	0 %	50 %	50 %	16519641
1118	NC_000914	TGA	2	6	57296	57301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16519641
1119	NC_000914	CCG	2	6	57334	57339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16519641
1120	NC_000914	CG	4	8	57338	57345	0 %	0 %	50 %	50 %	16519641
1121	NC_000914	CCTG	2	8	57407	57414	0 %	25 %	25 %	50 %	16519641
1122	NC_000914	AGG	2	6	57455	57460	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16519641
1123	NC_000914	GCG	2	6	57464	57469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16519641
1124	NC_000914	CGG	2	6	57573	57578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16519641
1125	NC_000914	ACA	2	6	57593	57598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16519641
1126	NC_000914	GTG	2	6	57631	57636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16519641
1127	NC_000914	CG	3	6	57652	57657	0 %	0 %	50 %	50 %	16519641
1128	NC_000914	GCA	2	6	57671	57676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16519641
1129	NC_000914	GGC	2	6	57739	57744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16519641
1130	NC_000914	GCC	2	6	57748	57753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16519641
1131	NC_000914	CAA	2	6	57762	57767	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16519641
1132	NC_000914	TAC	2	6	57775	57780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16519641
1133	NC_000914	GC	3	6	57809	57814	0 %	0 %	50 %	50 %	16519641
1134	NC_000914	CCGA	2	8	57826	57833	25 %	0 %	25 %	50 %	16519641
1135	NC_000914	GC	3	6	58004	58009	0 %	0 %	50 %	50 %	16519641
1136	NC_000914	GATC	2	8	58023	58030	25 %	25 %	25 %	25 %	16519641
1137	NC_000914	AAGG	2	8	58047	58054	50 %	0 %	50 %	0 %	16519641
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1141	NC_000914	TCC	2	6	58159	58164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16519641
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1143	NC_000914	GGC	2	6	58194	58199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16519641
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1147	NC_000914	TGA	2	6	58399	58404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16519641
1148	NC_000914	TGT	2	6	58513	58518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1149	NC_000914	CTGA	2	8	58538	58545	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1150	NC_000914	GAT	2	6	58552	58557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1151	NC_000914	CGC	2	6	58560	58565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1152	NC_000914	AGG	2	6	58688	58693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1153	NC_000914	GGT	2	6	58865	58870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1154	NC_000914	GTC	2	6	58982	58987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1155	NC_000914	CGT	2	6	59056	59061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1156	NC_000914	AGCG	2	8	59119	59126	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1157	NC_000914	CG	3	6	59125	59130	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1158	NC_000914	TGG	2	6	59161	59166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1159	NC_000914	TTG	2	6	59184	59189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1160	NC_000914	GCC	2	6	59416	59421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16520056
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1165	NC_000914	GCA	2	6	59584	59589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16520056
1166	NC_000914	TCGGT	2	10	59612	59621	0 %	40 %	40 %	20 %	16520056
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1186	NC_000914	CGC	2	6	60865	60870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1188	NC_000914	CGGA	2	8	60921	60928	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1189	NC_000914	ATC	2	6	61040	61045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1191	NC_000914	GGAA	2	8	61141	61148	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1192	NC_000914	CCA	2	6	61219	61224	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1196	NC_000914	TGA	2	6	61439	61444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1203	NC_000914	ACG	2	6	61874	61879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1244	NC_000914	ATG	2	6	64225	64230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1245	NC_000914	ATG	2	6	64302	64307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1246	NC_000914	TCTT	2	8	64444	64451	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1247	NC_000914	GGC	2	6	64478	64483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1248	NC_000914	GCT	2	6	64491	64496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1249	NC_000914	CGA	2	6	64499	64504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1250	NC_000914	AGC	2	6	64529	64534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1251	NC_000914	TCG	2	6	64553	64558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1253	NC_000914	CGG	2	6	64820	64825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1254	NC_000914	CTG	2	6	64854	64859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1255	NC_000914	CCGC	2	8	64868	64875	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1256	NC_000914	CGG	2	6	64896	64901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1257	NC_000914	CCG	2	6	64917	64922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1258	NC_000914	GCG	2	6	64965	64970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1259	NC_000914	ACC	2	6	64997	65002	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1260	NC_000914	AGC	2	6	65009	65014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1261	NC_000914	ACG	2	6	65086	65091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1262	NC_000914	GAA	2	6	65135	65140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1263	NC_000914	GTC	2	6	65238	65243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1399	NC_000914	GAT	2	6	72157	72162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16520049
1400	NC_000914	CTG	2	6	72170	72175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16520049
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