MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sinorhizobium fredii NGR234 plasmid pNGR234a

Total Repeats: 10803

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_000914	AGG	2	6	498243	498248	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10002	NC_000914	CAGA	2	8	498313	498320	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10003	NC_000914	TCA	2	6	498326	498331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10004	NC_000914	GAA	2	6	498412	498417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16519719
10005	NC_000914	TTC	2	6	498464	498469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16519719
10006	NC_000914	GAA	2	6	498520	498525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16519719
10007	NC_000914	ATC	2	6	498542	498547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16519719
10008	NC_000914	GAC	2	6	498613	498618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16519719
10009	NC_000914	GCC	2	6	498626	498631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16519719
10010	NC_000914	CTC	2	6	498752	498757	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16519719
10011	NC_000914	GGA	2	6	498777	498782	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16519719
10012	NC_000914	GGC	2	6	498786	498791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16519719
10013	NC_000914	TC	3	6	498877	498882	0 %	50 %	0 %	50 %	16519719
10014	NC_000914	TCG	2	6	498927	498932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16519719
10015	NC_000914	GCT	2	6	498976	498981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16519719
10016	NC_000914	ACC	2	6	499001	499006	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16519719
10017	NC_000914	CCA	2	6	499026	499031	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16519719
10018	NC_000914	CGC	2	6	499089	499094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16519719
10019	NC_000914	AT	3	6	499156	499161	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10020	NC_000914	GCGTC	2	10	499217	499226	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
10021	NC_000914	CCG	2	6	499252	499257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10022	NC_000914	CGG	2	6	499262	499267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10023	NC_000914	TCGC	2	8	499351	499358	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10024	NC_000914	GGA	2	6	499374	499379	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10025	NC_000914	CGC	2	6	499381	499386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10026	NC_000914	AC	3	6	499400	499405	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10027	NC_000914	GTC	2	6	499417	499422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10028	NC_000914	CGC	2	6	499443	499448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10029	NC_000914	CCG	2	6	499499	499504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10030	NC_000914	GAG	2	6	499582	499587	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10031	NC_000914	CGG	2	6	499689	499694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10032	NC_000914	CCT	2	6	499744	499749	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10033	NC_000914	TCG	2	6	499770	499775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10034	NC_000914	TTGC	2	8	499795	499802	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10035	NC_000914	ATTGGT	2	12	499815	499826	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	16519718
10036	NC_000914	CTTC	2	8	499994	500001	0 %	50 %	0 %	50 %	16519718
10037	NC_000914	GCTC	2	8	500060	500067	0 %	25 %	25 %	50 %	16519718
10038	NC_000914	CGG	2	6	500070	500075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16519718
10039	NC_000914	CAG	2	6	500093	500098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16519718
10040	NC_000914	AGA	2	6	500335	500340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16519718
10041	NC_000914	TTG	2	6	500380	500385	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16519718
10042	NC_000914	AAGC	2	8	500391	500398	50 %	0 %	25 %	25 %	16519718
10043	NC_000914	CGT	2	6	500465	500470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16519718
10044	NC_000914	TAT	2	6	500519	500524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16519718
10045	NC_000914	TC	3	6	500582	500587	0 %	50 %	0 %	50 %	16519718
10046	NC_000914	GTA	2	6	500659	500664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16519718
10047	NC_000914	GCA	2	6	500689	500694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16519718
10048	NC_000914	TA	3	6	500703	500708	50 %	50 %	0 %	0 %	16519718
10049	NC_000914	CAGT	2	8	500788	500795	25 %	25 %	25 %	25 %	16519718
10050	NC_000914	GCTTG	2	10	500815	500824	0 %	40 %	40 %	20 %	16519718
10051	NC_000914	AG	3	6	500850	500855	50 %	0 %	50 %	0 %	16519718
10052	NC_000914	AG	3	6	500860	500865	50 %	0 %	50 %	0 %	16519718
10053	NC_000914	GCG	2	6	500943	500948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16519717
10054	NC_000914	GCA	2	6	500960	500965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16519717
10055	NC_000914	CAGT	2	8	500986	500993	25 %	25 %	25 %	25 %	16519717
10056	NC_000914	CGC	2	6	501035	501040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16519717
10057	NC_000914	ACA	2	6	501099	501104	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16519717
10058	NC_000914	ATA	2	6	501135	501140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16519717
10059	NC_000914	GGT	2	6	501369	501374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16519717
10060	NC_000914	GAT	2	6	501540	501545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16519717
10061	NC_000914	CAT	2	6	501563	501568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16519717
10062	NC_000914	AGT	2	6	501692	501697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16519717
10063	NC_000914	AAG	2	6	501709	501714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16519717
10064	NC_000914	CGG	2	6	501773	501778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16519717
10065	NC_000914	TAG	2	6	501885	501890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16519717
10066	NC_000914	AAC	2	6	502001	502006	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16519717
10067	NC_000914	AAC	2	6	502064	502069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10068	NC_000914	CGGC	2	8	502114	502121	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10069	NC_000914	CTGCCG	2	12	502137	502148	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
10070	NC_000914	GCA	2	6	502170	502175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10071	NC_000914	GC	3	6	502193	502198	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10072	NC_000914	CGC	2	6	502205	502210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10073	NC_000914	GGCC	2	8	502251	502258	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10074	NC_000914	TGC	2	6	502433	502438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10075	NC_000914	GC	3	6	502459	502464	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10076	NC_000914	GGC	2	6	502485	502490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10077	NC_000914	CG	4	8	502494	502501	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10078	NC_000914	GCAG	2	8	502543	502550	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10079	NC_000914	TCC	2	6	502579	502584	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10080	NC_000914	CTG	3	9	502599	502607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10081	NC_000914	CGAACT	2	12	502613	502624	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10082	NC_000914	GGT	2	6	502652	502657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10083	NC_000914	TCA	2	6	502704	502709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10084	NC_000914	GCC	2	6	502731	502736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10085	NC_000914	GGA	2	6	503051	503056	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10086	NC_000914	GAT	2	6	503163	503168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10087	NC_000914	GCT	2	6	503239	503244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10088	NC_000914	GCC	2	6	503262	503267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10089	NC_000914	AAG	2	6	503382	503387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10090	NC_000914	TCC	2	6	503436	503441	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10091	NC_000914	ATG	2	6	503459	503464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10092	NC_000914	GAC	2	6	503633	503638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10093	NC_000914	GA	3	6	503646	503651	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10094	NC_000914	CAT	2	6	503658	503663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10095	NC_000914	CG	4	8	503679	503686	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10096	NC_000914	CCT	2	6	503703	503708	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10097	NC_000914	GGCC	2	8	503801	503808	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10098	NC_000914	AGG	2	6	503858	503863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10099	NC_000914	C	6	6	503885	503890	0 %	0 %	0 %	100 %	16519716
10100	NC_000914	CCGA	2	8	503896	503903	25 %	0 %	25 %	50 %	16519716
10101	NC_000914	CCAG	2	8	503921	503928	25 %	0 %	25 %	50 %	16519716
10102	NC_000914	ATC	2	6	503929	503934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16519716
10103	NC_000914	GCC	2	6	503935	503940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16519716
10104	NC_000914	GGCG	2	8	503946	503953	0 %	0 %	75 %	25 %	16519716
10105	NC_000914	ACG	2	6	503981	503986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16519716
10106	NC_000914	CAC	2	6	503997	504002	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16519716
10107	NC_000914	CAAG	2	8	504020	504027	50 %	0 %	25 %	25 %	16519716
10108	NC_000914	GCG	2	6	504064	504069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16519716
10109	NC_000914	GCC	2	6	504085	504090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16519716
10110	NC_000914	GAC	2	6	504177	504182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16519716
10111	NC_000914	CGG	2	6	504194	504199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16519716
10112	NC_000914	CGA	2	6	504213	504218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16519716
10113	NC_000914	GCCC	2	8	504231	504238	0 %	0 %	25 %	75 %	16519716
10114	NC_000914	CGC	2	6	504296	504301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16519716
10115	NC_000914	TGC	2	6	504314	504319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16519716
10116	NC_000914	CGG	2	6	504384	504389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16519716
10117	NC_000914	CCGT	2	8	504405	504412	0 %	25 %	25 %	50 %	16519716
10118	NC_000914	CTA	2	6	504465	504470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16519716
10119	NC_000914	TCGGC	2	10	504545	504554	0 %	20 %	40 %	40 %	16519716
10120	NC_000914	GGA	2	6	504567	504572	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16519716
10121	NC_000914	GTT	2	6	504585	504590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16519716
10122	NC_000914	GAT	2	6	504597	504602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16519716
10123	NC_000914	CCT	2	6	504659	504664	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16519716
10124	NC_000914	GCGCT	2	10	504673	504682	0 %	20 %	40 %	40 %	16519716
10125	NC_000914	GC	3	6	504690	504695	0 %	0 %	50 %	50 %	16519716
10126	NC_000914	GCG	2	6	504706	504711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16519716
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10131	NC_000914	ATG	2	6	504962	504967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10159	NC_000914	GCC	2	6	505935	505940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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10253	NC_000914	CTC	2	6	510212	510217	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10254	NC_000914	ACG	2	6	510220	510225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10255	NC_000914	GCG	2	6	510252	510257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10256	NC_000914	GC	3	6	510316	510321	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10257	NC_000914	CGC	3	9	510373	510381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16519711
10258	NC_000914	GCG	2	6	510430	510435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16519711
10259	NC_000914	GCCG	2	8	510440	510447	0 %	0 %	50 %	50 %	16519711
10260	NC_000914	GC	3	6	510468	510473	0 %	0 %	50 %	50 %	16519711
10261	NC_000914	CCG	2	6	510616	510621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16519711
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10263	NC_000914	ATG	2	6	510744	510749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16519711
10264	NC_000914	CG	3	6	510771	510776	0 %	0 %	50 %	50 %	16519711
10265	NC_000914	AGCCG	2	10	510796	510805	20 %	0 %	40 %	40 %	16519711
10266	NC_000914	CG	3	6	510804	510809	0 %	0 %	50 %	50 %	16519711
10267	NC_000914	AGA	2	6	510823	510828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16519711
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10313	NC_000914	CGGAG	2	10	512828	512837	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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