MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sinorhizobium fredii NGR234 plasmid pNGR234a

Total Repeats: 10803

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_000914	TGT	2	6	26985	26990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16519667
502	NC_000914	TGGC	2	8	27130	27137	0 %	25 %	50 %	25 %	16519667
503	NC_000914	CGG	2	6	27175	27180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16519667
504	NC_000914	TTC	2	6	27256	27261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16519667
505	NC_000914	GCC	2	6	27266	27271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16519667
506	NC_000914	CTC	2	6	27276	27281	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16519667
507	NC_000914	TCA	2	6	27347	27352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16519667
508	NC_000914	AGA	2	6	27443	27448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16519667
509	NC_000914	CCG	2	6	27459	27464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16519667
510	NC_000914	CGC	2	6	27490	27495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16519667
511	NC_000914	AGT	2	6	27497	27502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16519667
512	NC_000914	AG	3	6	27532	27537	50 %	0 %	50 %	0 %	16519667
513	NC_000914	GCG	2	6	27589	27594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_000914	C	6	6	27649	27654	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
515	NC_000914	GCC	2	6	27780	27785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16519666
516	NC_000914	CG	4	8	27799	27806	0 %	0 %	50 %	50 %	16519666
517	NC_000914	CGA	2	6	27844	27849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16519666
518	NC_000914	GGC	2	6	27859	27864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16519666
519	NC_000914	CCA	2	6	27874	27879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16519666
520	NC_000914	AGG	2	6	27882	27887	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16519666
521	NC_000914	CGCGTC	2	12	27917	27928	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	16519666
522	NC_000914	TGC	2	6	27931	27936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16519666
523	NC_000914	GGA	2	6	27937	27942	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16519666
524	NC_000914	GAG	2	6	28040	28045	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16519666
525	NC_000914	ACG	2	6	28146	28151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16519665
526	NC_000914	TCG	2	6	28156	28161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16519665
527	NC_000914	CG	3	6	28196	28201	0 %	0 %	50 %	50 %	16519665
528	NC_000914	ATG	2	6	28241	28246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16519665
529	NC_000914	CGA	2	6	28260	28265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16519665
530	NC_000914	CAG	2	6	28279	28284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16519665
531	NC_000914	GCC	2	6	28333	28338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16519665
532	NC_000914	CGA	2	6	28362	28367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16519665
533	NC_000914	CCT	2	6	28396	28401	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16519665
534	NC_000914	GCGA	2	8	28404	28411	25 %	0 %	50 %	25 %	16519665
535	NC_000914	CCA	2	6	28429	28434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
536	NC_000914	TCG	2	6	28482	28487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_000914	GCTCA	2	10	28556	28565	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
538	NC_000914	CGG	3	9	28657	28665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_000914	TGC	2	6	28681	28686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_000914	CGA	2	6	28793	28798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_000914	TCA	2	6	28848	28853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_000914	CG	3	6	28865	28870	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
543	NC_000914	TCC	2	6	28911	28916	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
544	NC_000914	GCA	2	6	28972	28977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_000914	CG	3	6	29036	29041	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
546	NC_000914	CGG	2	6	29052	29057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_000914	CG	3	6	29092	29097	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
548	NC_000914	GCT	2	6	29118	29123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_000914	GCAGTT	2	12	29222	29233	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
550	NC_000914	GC	3	6	29282	29287	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
551	NC_000914	TTG	2	6	29357	29362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
552	NC_000914	ACGA	2	8	29386	29393	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
553	NC_000914	GCT	2	6	29455	29460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_000914	GAA	2	6	29612	29617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
555	NC_000914	G	6	6	29672	29677	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
556	NC_000914	GGT	2	6	29689	29694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
557	NC_000914	CA	3	6	29740	29745	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
558	NC_000914	GTC	2	6	29795	29800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_000914	TGA	2	6	29811	29816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
560	NC_000914	A	7	7	29835	29841	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_000914	GGC	2	6	29864	29869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_000914	GCA	2	6	29871	29876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_000914	CTTG	2	8	29877	29884	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
564	NC_000914	AATTCA	2	12	29906	29917	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
565	NC_000914	TTG	2	6	29971	29976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
566	NC_000914	GTG	2	6	30069	30074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
567	NC_000914	GTC	2	6	30094	30099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_000914	T	7	7	30101	30107	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_000914	ACT	2	6	30122	30127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_000914	ATT	2	6	30130	30135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_000914	AAC	2	6	30152	30157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_000914	TGG	2	6	30168	30173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
573	NC_000914	TAAG	2	8	30189	30196	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
574	NC_000914	GGTG	2	8	30311	30318	0 %	25 %	75 %	0 %	16519664
575	NC_000914	CGA	2	6	30362	30367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16519664
576	NC_000914	GTC	2	6	30439	30444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16519664
577	NC_000914	CGC	2	6	30456	30461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16519664
578	NC_000914	TGA	2	6	30474	30479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16519664
579	NC_000914	AGC	2	6	30509	30514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16519664
580	NC_000914	TTG	2	6	30522	30527	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16519664
581	NC_000914	GTC	2	6	30604	30609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16519664
582	NC_000914	TGC	2	6	30619	30624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16519664
583	NC_000914	TGG	2	6	30696	30701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16519664
584	NC_000914	TC	3	6	30712	30717	0 %	50 %	0 %	50 %	16519664
585	NC_000914	GAAAC	2	10	30789	30798	60 %	0 %	20 %	20 %	16519664
586	NC_000914	GCT	2	6	30838	30843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16519664
587	NC_000914	ATC	2	6	30919	30924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16519664
588	NC_000914	GT	3	6	30968	30973	0 %	50 %	50 %	0 %	16519664
589	NC_000914	AAC	2	6	31046	31051	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16519664
590	NC_000914	TC	3	6	31052	31057	0 %	50 %	0 %	50 %	16519664
591	NC_000914	GTA	2	6	31085	31090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
592	NC_000914	TTGTA	2	10	31091	31100	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
593	NC_000914	C	6	6	31119	31124	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
594	NC_000914	GAC	2	6	31137	31142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_000914	CGG	2	6	31179	31184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_000914	CCG	2	6	31231	31236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
597	NC_000914	CTGA	2	8	31247	31254	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
598	NC_000914	GCCG	2	8	31277	31284	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
599	NC_000914	ATG	2	6	31333	31338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
600	NC_000914	G	6	6	31349	31354	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
601	NC_000914	A	6	6	31428	31433	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_000914	GGC	2	6	31437	31442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_000914	CGA	2	6	31503	31508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_000914	GCC	3	9	31638	31646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16519663
605	NC_000914	TCCG	2	8	31676	31683	0 %	25 %	25 %	50 %	16519663
606	NC_000914	CG	3	6	31701	31706	0 %	0 %	50 %	50 %	16519663
607	NC_000914	TTC	2	6	31718	31723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16519663
608	NC_000914	GCCG	2	8	31748	31755	0 %	0 %	50 %	50 %	16519663
609	NC_000914	GAT	2	6	31810	31815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16519663
610	NC_000914	CGC	2	6	31816	31821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16519663
611	NC_000914	GCCG	2	8	31890	31897	0 %	0 %	50 %	50 %	16519663
612	NC_000914	CGAC	2	8	31925	31932	25 %	0 %	25 %	50 %	16519663
613	NC_000914	CG	3	6	31938	31943	0 %	0 %	50 %	50 %	16519663
614	NC_000914	CGAA	2	8	31980	31987	50 %	0 %	25 %	25 %	16519663
615	NC_000914	GCT	2	6	32013	32018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16519663
616	NC_000914	ATC	2	6	32077	32082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16519663
617	NC_000914	CGT	2	6	32151	32156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16519663
618	NC_000914	CTTGG	2	10	32236	32245	0 %	40 %	40 %	20 %	16519663
619	NC_000914	GCC	2	6	32314	32319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16519663
620	NC_000914	CTT	2	6	32329	32334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16519663
621	NC_000914	CGC	2	6	32573	32578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16519663
622	NC_000914	TGA	2	6	32588	32593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16519663
623	NC_000914	CCG	2	6	32599	32604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16519663
624	NC_000914	CCAT	2	8	32637	32644	25 %	25 %	0 %	50 %	16519663
625	NC_000914	CG	3	6	32658	32663	0 %	0 %	50 %	50 %	16519663
626	NC_000914	GCC	2	6	32699	32704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16519663
627	NC_000914	CGC	2	6	32818	32823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16519663
628	NC_000914	GATCC	2	10	32836	32845	20 %	20 %	20 %	40 %	16519663
629	NC_000914	AGC	2	6	32846	32851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16519663
630	NC_000914	GCC	2	6	32888	32893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16519663
631	NC_000914	CGCT	2	8	32954	32961	0 %	25 %	25 %	50 %	16519663
632	NC_000914	CAAT	2	8	32967	32974	50 %	25 %	0 %	25 %	16519663
633	NC_000914	A	6	6	33062	33067	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_000914	CAT	2	6	33117	33122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_000914	AT	3	6	33153	33158	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_000914	GCC	2	6	33180	33185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
637	NC_000914	CGG	3	9	33222	33230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
638	NC_000914	CCG	2	6	33278	33283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
639	NC_000914	TGC	2	6	33304	33309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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642	NC_000914	GCCC	2	8	33443	33450	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
643	NC_000914	TGC	2	6	33452	33457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
644	NC_000914	TCA	2	6	33505	33510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
645	NC_000914	ACC	2	6	33526	33531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
646	NC_000914	CTT	2	6	33636	33641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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648	NC_000914	GCG	2	6	33803	33808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
649	NC_000914	CGA	2	6	33820	33825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
650	NC_000914	GCC	2	6	33862	33867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
651	NC_000914	GC	3	6	33931	33936	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
652	NC_000914	CTT	2	6	33948	33953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
653	NC_000914	ACG	2	6	34095	34100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16519662
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677	NC_000914	A	9	9	34884	34892	100 %	0 %	0 %	0 %	16519661
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883	NC_000914	GCC	2	6	45186	45191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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