MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechocystis sp. PCC 6803 chromosome

Total Repeats: 66870

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_000911	TA	3	6	53024	53029	50 %	50 %	0 %	0 %	16329212
1002	NC_000911	TCC	2	6	53052	53057	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16329212
1003	NC_000911	TA	3	6	53064	53069	50 %	50 %	0 %	0 %	16329212
1004	NC_000911	CTA	2	6	53072	53077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16329212
1005	NC_000911	TC	3	6	53155	53160	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1006	NC_000911	TTGAAA	2	12	53268	53279	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_000911	TTG	2	6	53330	53335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_000911	GGT	2	6	53339	53344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_000911	GGTC	2	8	53368	53375	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1010	NC_000911	AAT	2	6	53396	53401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_000911	GCTA	2	8	53452	53459	25 %	25 %	25 %	25 %	16329213
1012	NC_000911	ATG	2	6	53556	53561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16329213
1013	NC_000911	AAT	2	6	53569	53574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16329213
1014	NC_000911	CTA	2	6	53580	53585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16329213
1015	NC_000911	GAT	2	6	53599	53604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16329213
1016	NC_000911	AAGG	2	8	53606	53613	50 %	0 %	50 %	0 %	16329213
1017	NC_000911	GAT	2	6	53673	53678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16329213
1018	NC_000911	AAT	2	6	53699	53704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16329213
1019	NC_000911	GGTG	2	8	53755	53762	0 %	25 %	75 %	0 %	16329213
1020	NC_000911	AT	3	6	53796	53801	50 %	50 %	0 %	0 %	16329213
1021	NC_000911	CTT	2	6	53833	53838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16329213
1022	NC_000911	TAA	2	6	53890	53895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16329213
1023	NC_000911	T	6	6	53996	54001	0 %	100 %	0 %	0 %	16329213
1024	NC_000911	AACT	2	8	54007	54014	50 %	25 %	0 %	25 %	16329213
1025	NC_000911	TTTGG	2	10	54038	54047	0 %	60 %	40 %	0 %	16329213
1026	NC_000911	TGC	2	6	54072	54077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16329213
1027	NC_000911	TAC	2	6	54097	54102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16329213
1028	NC_000911	GGA	2	6	54152	54157	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_000911	AG	3	6	54173	54178	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_000911	CCA	2	6	54224	54229	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1031	NC_000911	A	6	6	54307	54312	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_000911	GGGTGG	2	12	54320	54331	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_000911	ATT	2	6	54342	54347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_000911	A	6	6	54354	54359	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_000911	TAC	2	6	54367	54372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_000911	GGA	2	6	54411	54416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_000911	TGA	2	6	54544	54549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16329214
1038	NC_000911	GCG	2	6	54633	54638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16329214
1039	NC_000911	GAA	2	6	54685	54690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16329214
1040	NC_000911	TG	3	6	54721	54726	0 %	50 %	50 %	0 %	16329214
1041	NC_000911	AATT	2	8	54741	54748	50 %	50 %	0 %	0 %	16329214
1042	NC_000911	T	6	6	54786	54791	0 %	100 %	0 %	0 %	16329214
1043	NC_000911	GCG	2	6	54858	54863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16329214
1044	NC_000911	CCA	2	6	54985	54990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16329214
1045	NC_000911	TTA	2	6	55064	55069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16329214
1046	NC_000911	GGC	2	6	55102	55107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16329214
1047	NC_000911	TCA	2	6	55179	55184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16329214
1048	NC_000911	TG	3	6	55226	55231	0 %	50 %	50 %	0 %	16329214
1049	NC_000911	CAA	2	6	55261	55266	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16329214
1050	NC_000911	ATT	2	6	55316	55321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16329214
1051	NC_000911	GT	3	6	55475	55480	0 %	50 %	50 %	0 %	16329214
1052	NC_000911	AAC	2	6	55554	55559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16329214
1053	NC_000911	GCC	2	6	55598	55603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16329214
1054	NC_000911	CAA	2	6	55619	55624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16329214
1055	NC_000911	AGTTT	2	10	55651	55660	20 %	60 %	20 %	0 %	16329214
1056	NC_000911	TGG	2	6	55694	55699	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16329215
1057	NC_000911	CTA	2	6	55752	55757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16329215
1058	NC_000911	T	6	6	55758	55763	0 %	100 %	0 %	0 %	16329215
1059	NC_000911	CAC	2	6	55828	55833	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16329215
1060	NC_000911	GTT	2	6	55947	55952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16329215
1061	NC_000911	GCG	2	6	55961	55966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16329215
1062	NC_000911	CCA	2	6	56000	56005	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16329215
1063	NC_000911	CCA	2	6	56016	56021	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16329215
1064	NC_000911	TGG	2	6	56190	56195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16329215
1065	NC_000911	CAC	2	6	56257	56262	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16329215
1066	NC_000911	CAG	2	6	56358	56363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16329215
1067	NC_000911	AAT	2	6	56383	56388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16329215
1068	NC_000911	CTT	2	6	56460	56465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16329215
1069	NC_000911	TAA	2	6	56527	56532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_000911	CTAA	2	8	56552	56559	50 %	25 %	0 %	25 %	16329216
1071	NC_000911	C	6	6	56605	56610	0 %	0 %	0 %	100 %	16329216
1072	NC_000911	TTG	2	6	56646	56651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16329216
1073	NC_000911	TAA	2	6	56668	56673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16329216
1074	NC_000911	GCCT	2	8	56715	56722	0 %	25 %	25 %	50 %	16329216
1075	NC_000911	GCTT	2	8	56743	56750	0 %	50 %	25 %	25 %	16329216
1076	NC_000911	TGT	2	6	56767	56772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16329216
1077	NC_000911	CAT	2	6	56819	56824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16329216
1078	NC_000911	CTA	2	6	56912	56917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16329216
1079	NC_000911	CTT	2	6	56954	56959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16329216
1080	NC_000911	T	7	7	57194	57200	0 %	100 %	0 %	0 %	16329216
1081	NC_000911	GAA	2	6	57213	57218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16329216
1082	NC_000911	GTT	3	9	57234	57242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_000911	ATA	2	6	57259	57264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_000911	AGT	2	6	57396	57401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16329217
1085	NC_000911	ATC	2	6	57445	57450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16329217
1086	NC_000911	AAAAC	2	10	57512	57521	80 %	0 %	0 %	20 %	16329217
1087	NC_000911	CAC	2	6	57598	57603	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16329217
1088	NC_000911	CAC	2	6	57667	57672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16329217
1089	NC_000911	AAT	2	6	57673	57678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16329217
1090	NC_000911	CCG	2	6	57681	57686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16329217
1091	NC_000911	CTC	2	6	57709	57714	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16329217
1092	NC_000911	TGT	2	6	57758	57763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16329217
1093	NC_000911	GTA	2	6	57844	57849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16329217
1094	NC_000911	TCCA	2	8	57883	57890	25 %	25 %	0 %	50 %	16329217
1095	NC_000911	T	6	6	57916	57921	0 %	100 %	0 %	0 %	16329217
1096	NC_000911	ATC	2	6	57922	57927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16329217
1097	NC_000911	GCTT	2	8	57956	57963	0 %	50 %	25 %	25 %	16329217
1098	NC_000911	T	6	6	57965	57970	0 %	100 %	0 %	0 %	16329217
1099	NC_000911	CCG	2	6	58064	58069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16329217
1100	NC_000911	TGG	2	6	58142	58147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16329217
1101	NC_000911	G	6	6	58146	58151	0 %	0 %	100 %	0 %	16329217
1102	NC_000911	C	6	6	58184	58189	0 %	0 %	0 %	100 %	16329217
1103	NC_000911	ATA	2	6	58246	58251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16329217
1104	NC_000911	ATT	2	6	58258	58263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16329217
1105	NC_000911	CCATG	2	10	58347	58356	20 %	20 %	20 %	40 %	16329217
1106	NC_000911	ACA	3	9	58374	58382	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16329217
1107	NC_000911	GCC	2	6	58460	58465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16329217
1108	NC_000911	GTC	2	6	58492	58497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16329217
1109	NC_000911	ATA	2	6	58507	58512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16329217
1110	NC_000911	AGA	2	6	58537	58542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16329217
1111	NC_000911	TGAA	2	8	58550	58557	50 %	25 %	25 %	0 %	16329217
1112	NC_000911	A	6	6	58587	58592	100 %	0 %	0 %	0 %	16329217
1113	NC_000911	AGA	2	6	58599	58604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16329217
1114	NC_000911	CCCT	2	8	58890	58897	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1115	NC_000911	GGA	2	6	58908	58913	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_000911	T	7	7	59015	59021	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_000911	TGA	2	6	59049	59054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16329218
1118	NC_000911	CCA	2	6	59074	59079	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16329218
1119	NC_000911	GGC	2	6	59129	59134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16329218
1120	NC_000911	CGG	2	6	59209	59214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16329218
1121	NC_000911	GGTCA	2	10	59261	59270	20 %	20 %	40 %	20 %	16329218
1122	NC_000911	CTG	2	6	59324	59329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16329218
1123	NC_000911	CGA	2	6	59356	59361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16329218
1124	NC_000911	ATT	2	6	59375	59380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16329218
1125	NC_000911	TTC	2	6	59420	59425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16329218
1126	NC_000911	CGA	2	6	59434	59439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16329218
1127	NC_000911	TGA	2	6	59475	59480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16329218
1128	NC_000911	TTC	2	6	59519	59524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16329218
1129	NC_000911	GGC	2	6	59534	59539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16329218
1130	NC_000911	TGG	2	6	59548	59553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16329218
1131	NC_000911	GCG	2	6	59585	59590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16329218
1132	NC_000911	TGG	2	6	59632	59637	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16329218
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1259	NC_000911	A	7	7	65801	65807	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1260	NC_000911	ATTT	2	8	65825	65832	25 %	75 %	0 %	0 %	16329225
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