MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhizobium sp. IRBG74 linear chromosome

Total Repeats: 51

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022545	TGGCGT	2	12	4120	4131	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_022545	TTCGCT	2	12	33023	33034	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_022545	TCGCTG	2	12	154804	154815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_022545	TCGATT	2	12	182183	182194	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_022545	GCCCAA	2	12	246691	246702	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
6	NC_022545	AGCGGC	2	12	287920	287931	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_022545	ATAGAA	2	12	381721	381732	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022545	AGACGC	2	12	387388	387399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_022545	CCAGCG	2	12	390976	390987	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
10	NC_022545	ACGAGA	2	12	458205	458216	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_022545	CGTTTC	2	12	525848	525859	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_022545	TGCCAA	2	12	577677	577688	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_022545	ATAAAA	2	12	581597	581608	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022545	TTTAAA	2	12	622066	622077	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022545	AAAAAC	2	12	665955	665966	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_022545	GACTGC	2	12	716781	716792	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_022545	CGGTGG	2	12	733067	733078	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_022545	AGCCAT	2	12	756587	756598	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_022545	CGCTTG	2	12	835707	835718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_022545	TTGTTT	2	12	868061	868072	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022545	GCCGGC	2	12	872627	872638	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_022545	GGTTTT	2	12	905774	905785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022545	TGACGG	2	12	909751	909762	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_022545	AGGCGC	2	12	926915	926926	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_022545	ATGCAT	2	12	972289	972300	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_022545	CCGGAT	2	12	979969	979980	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_022545	TTCTCG	2	12	985951	985962	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_022545	GCACCC	2	12	1007332	1007343	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_022545	CTTTTT	2	12	1178913	1178924	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_022545	CACAAA	2	12	1230364	1230375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_022545	TTCCGG	2	12	1270293	1270304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_022545	GCCGGC	2	12	1275190	1275201	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_022545	TAAAAA	2	12	1288740	1288751	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022545	GCGGCC	2	12	1311547	1311558	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_022545	ATCCGG	2	12	1362876	1362887	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_022545	CGCTTT	2	12	1376593	1376604	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_022545	CGGTGG	2	12	1392528	1392539	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_022545	TTGAAA	2	12	1412959	1412970	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022545	CATCCG	2	12	1428551	1428562	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
40	NC_022545	GCGGGG	2	12	1449167	1449178	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_022545	GCGGGG	2	12	1456645	1456656	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_022545	TGTCCT	2	12	1519989	1520000	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_022545	CAGACG	2	12	1634374	1634385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_022545	TGGCTG	2	12	1657112	1657123	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_022545	AGCGGA	2	12	1793161	1793172	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_022545	GCCTCG	2	12	1822469	1822480	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
47	NC_022545	CGGGGC	2	12	1992172	1992183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_022545	TGCCGC	2	12	2003708	2003719	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
49	NC_022545	CGGTGA	2	12	2029184	2029195	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_022545	GTTACC	2	12	2030935	2030946	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_022545	GAGGCG	2	12	2031094	2031105	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.