MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhizobium sp. IRBG74 linear chromosome

Total Repeats: 4077

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_022545	CT	3	6	2025584	2025589	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4002	NC_022545	CGCC	2	8	2025605	2025612	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4003	NC_022545	CTT	2	6	2025613	2025618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4004	NC_022545	GAC	2	6	2025642	2025647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4005	NC_022545	GGCGC	2	10	2025692	2025701	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
4006	NC_022545	GCT	2	6	2025703	2025708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4007	NC_022545	TTG	2	6	2025789	2025794	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_022545	CCA	2	6	2025866	2025871	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4009	NC_022545	TTC	2	6	2026345	2026350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4010	NC_022545	AGC	2	6	2026419	2026424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4011	NC_022545	AG	3	6	2026441	2026446	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_022545	ATG	2	6	2026474	2026479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_022545	GAG	2	6	2026499	2026504	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_022545	TGCG	2	8	2026618	2026625	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4015	NC_022545	GGCAA	2	10	2026732	2026741	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
4016	NC_022545	CCG	2	6	2026803	2026808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4017	NC_022545	GC	3	6	2026836	2026841	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4018	NC_022545	CGC	2	6	2027135	2027140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4019	NC_022545	GGGC	2	8	2027244	2027251	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4020	NC_022545	GCC	2	6	2027262	2027267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4021	NC_022545	GCA	2	6	2027353	2027358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4022	NC_022545	TG	3	6	2027793	2027798	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_022545	GGA	2	6	2027829	2027834	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_022545	GCTC	2	8	2027911	2027918	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4025	NC_022545	GTC	2	6	2028019	2028024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4026	NC_022545	CCG	2	6	2028553	2028558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4027	NC_022545	CGGTGA	2	12	2029184	2029195	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
4028	NC_022545	TGC	2	6	2029210	2029215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4029	NC_022545	CGA	2	6	2029294	2029299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4030	NC_022545	CGG	2	6	2029300	2029305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4031	NC_022545	CTTA	2	8	2029367	2029374	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4032	NC_022545	ATG	2	6	2029385	2029390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_022545	CTC	2	6	2029486	2029491	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4034	NC_022545	AATT	2	8	2029729	2029736	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_022545	GCC	2	6	2029770	2029775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4036	NC_022545	CCT	2	6	2030657	2030662	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4037	NC_022545	GTTACC	2	12	2030935	2030946	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4038	NC_022545	GCG	2	6	2030950	2030955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4039	NC_022545	TGT	2	6	2030966	2030971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_022545	TGT	2	6	2030981	2030986	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_022545	TCTT	2	8	2031013	2031020	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4042	NC_022545	GCTG	2	8	2031025	2031032	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4043	NC_022545	AAC	2	6	2031078	2031083	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4044	NC_022545	GAGGCG	2	12	2031094	2031105	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
4045	NC_022545	CCA	2	6	2031133	2031138	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4046	NC_022545	GTG	2	6	2031163	2031168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_022545	GAC	2	6	2031176	2031181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4048	NC_022545	TGC	2	6	2031218	2031223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4049	NC_022545	TGA	2	6	2031232	2031237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_022545	ATC	2	6	2031242	2031247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4051	NC_022545	TCA	2	6	2031303	2031308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4052	NC_022545	AGC	2	6	2031318	2031323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4053	NC_022545	TGA	2	6	2031340	2031345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_022545	TCG	2	6	2031351	2031356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4055	NC_022545	CGA	2	6	2031370	2031375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4056	NC_022545	TGC	2	6	2031444	2031449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4057	NC_022545	GCT	2	6	2031554	2031559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4058	NC_022545	GAC	2	6	2031608	2031613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4059	NC_022545	CCG	2	6	2031614	2031619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4060	NC_022545	GGT	2	6	2032408	2032413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_022545	ACC	2	6	2032464	2032469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4062	NC_022545	CGG	2	6	2032487	2032492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4063	NC_022545	GAT	2	6	2032511	2032516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_022545	ATCG	2	8	2032520	2032527	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4065	NC_022545	AGC	2	6	2032536	2032541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4066	NC_022545	GGA	2	6	2032605	2032610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_022545	TGCT	2	8	2032620	2032627	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4068	NC_022545	GCA	2	6	2032650	2032655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4069	NC_022545	TTA	2	6	2032693	2032698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_022545	TTGA	2	8	2032706	2032713	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_022545	ATG	2	6	2032718	2032723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_022545	ATT	2	6	2032757	2032762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_022545	AT	4	8	2035221	2035228	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_022545	AT	3	6	2035240	2035245	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_022545	TAT	3	9	2035243	2035251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4076	NC_022545	GC	3	6	2035313	2035318	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4077	NC_022545	AGGG	2	8	2035417	2035424	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.