MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Rhizobium sp. IRBG74 linear chromosome

Total Repeats: 4077

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_022545	GCC	2	6	1256399	1256404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2502	NC_022545	GAAG	2	8	1256451	1256458	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2503	NC_022545	T	7	7	1260527	1260533	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2504	NC_022545	CGT	2	6	1260543	1260548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2505	NC_022545	GGCC	2	8	1260562	1260569	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2506	NC_022545	AAGA	2	8	1263337	1263344	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2507	NC_022545	GGC	2	6	1263506	1263511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2508	NC_022545	GCC	2	6	1263525	1263530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2509	NC_022545	T	6	6	1263533	1263538	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2510	NC_022545	GCT	2	6	1263559	1263564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2511	NC_022545	GGC	2	6	1263754	1263759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2512	NC_022545	TCC	2	6	1264205	1264210	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2513	NC_022545	CCTTT	2	10	1264471	1264480	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
2514	NC_022545	AG	3	6	1264484	1264489	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2515	NC_022545	C	6	6	1264525	1264530	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2516	NC_022545	ATA	2	6	1264554	1264559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2517	NC_022545	GGC	2	6	1268984	1268989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2518	NC_022545	CTT	2	6	1268999	1269004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2519	NC_022545	A	6	6	1269068	1269073	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2520	NC_022545	GAAT	2	8	1269093	1269100	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2521	NC_022545	GGC	2	6	1269549	1269554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2522	NC_022545	ATTTT	2	10	1269585	1269594	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2523	NC_022545	TGA	2	6	1270174	1270179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2524	NC_022545	TGG	2	6	1270198	1270203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2525	NC_022545	CATGC	2	10	1270235	1270244	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2526	NC_022545	TTCCGG	2	12	1270293	1270304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2527	NC_022545	GTT	3	9	1270316	1270324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2528	NC_022545	GGC	2	6	1270334	1270339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2529	NC_022545	TAC	2	6	1270341	1270346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2530	NC_022545	CGA	2	6	1270357	1270362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2531	NC_022545	A	6	6	1270373	1270378	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2532	NC_022545	T	7	7	1270392	1270398	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2533	NC_022545	GTC	2	6	1270399	1270404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2534	NC_022545	GT	3	6	1270845	1270850	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2535	NC_022545	CCT	2	6	1270938	1270943	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2536	NC_022545	TAT	2	6	1271002	1271007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2537	NC_022545	CAA	2	6	1271779	1271784	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2538	NC_022545	GAA	2	6	1273562	1273567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2539	NC_022545	CCG	2	6	1273569	1273574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2540	NC_022545	CGG	2	6	1273583	1273588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2541	NC_022545	T	6	6	1273590	1273595	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2542	NC_022545	CCG	2	6	1273606	1273611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2543	NC_022545	GCCGGC	2	12	1275190	1275201	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2544	NC_022545	CGC	2	6	1275266	1275271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2545	NC_022545	CA	3	6	1275350	1275355	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2546	NC_022545	ATC	2	6	1275358	1275363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2547	NC_022545	CAT	2	6	1275751	1275756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2548	NC_022545	GCC	2	6	1277032	1277037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2549	NC_022545	TCGG	2	8	1277797	1277804	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2550	NC_022545	CCG	2	6	1277806	1277811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2551	NC_022545	CGC	2	6	1277817	1277822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2552	NC_022545	GGTAG	2	10	1279271	1279280	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
2553	NC_022545	TGC	2	6	1279330	1279335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2554	NC_022545	ATC	2	6	1279383	1279388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2555	NC_022545	CTC	3	9	1279400	1279408	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2556	NC_022545	GGT	2	6	1279431	1279436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2557	NC_022545	CTC	3	9	1279438	1279446	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2558	NC_022545	CCT	2	6	1279479	1279484	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2559	NC_022545	T	6	6	1279516	1279521	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2560	NC_022545	GTG	2	6	1279524	1279529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2561	NC_022545	TCC	2	6	1279704	1279709	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2562	NC_022545	GGC	2	6	1279799	1279804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2563	NC_022545	GA	3	6	1279808	1279813	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2564	NC_022545	GCC	2	6	1281046	1281051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2565	NC_022545	AGA	2	6	1281059	1281064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2566	NC_022545	AAC	2	6	1282733	1282738	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2567	NC_022545	CG	3	6	1282743	1282748	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2568	NC_022545	GAA	2	6	1282749	1282754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2569	NC_022545	TTC	2	6	1282760	1282765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2570	NC_022545	CG	3	6	1282766	1282771	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2571	NC_022545	TCC	2	6	1287996	1288001	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2572	NC_022545	CAT	2	6	1288699	1288704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2574	NC_022545	T	6	6	1288753	1288758	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2575	NC_022545	GGA	2	6	1288814	1288819	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2578	NC_022545	TCC	2	6	1290134	1290139	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2579	NC_022545	GAT	2	6	1290259	1290264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2580	NC_022545	TCC	2	6	1291380	1291385	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2581	NC_022545	TGA	3	9	1292408	1292416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2582	NC_022545	AGA	2	6	1293775	1293780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2583	NC_022545	ATTTC	2	10	1303014	1303023	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
2584	NC_022545	ACG	2	6	1305403	1305408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2586	NC_022545	AAAC	2	8	1306022	1306029	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2587	NC_022545	GCT	2	6	1306035	1306040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2588	NC_022545	CGGTT	2	10	1306051	1306060	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
2589	NC_022545	GAG	2	6	1306130	1306135	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2590	NC_022545	GCC	2	6	1309456	1309461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2591	NC_022545	CAA	2	6	1311394	1311399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2592	NC_022545	TCG	2	6	1311416	1311421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2593	NC_022545	T	8	8	1311481	1311488	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2594	NC_022545	GCGGCC	2	12	1311547	1311558	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2595	NC_022545	GGC	2	6	1311561	1311566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2596	NC_022545	CGA	2	6	1311577	1311582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2597	NC_022545	TGAT	2	8	1311599	1311606	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2598	NC_022545	A	6	6	1311640	1311645	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2599	NC_022545	TAAAA	2	10	1311650	1311659	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2600	NC_022545	A	6	6	1311656	1311661	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2601	NC_022545	AATT	2	8	1311681	1311688	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2602	NC_022545	T	7	7	1312331	1312337	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2603	NC_022545	AGC	2	6	1312366	1312371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2604	NC_022545	AGC	2	6	1312410	1312415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2605	NC_022545	GCA	2	6	1312427	1312432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2606	NC_022545	CGC	2	6	1313280	1313285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2607	NC_022545	CGCGG	2	10	1313288	1313297	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
2608	NC_022545	TAT	2	6	1313368	1313373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2609	NC_022545	ATA	2	6	1313386	1313391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2610	NC_022545	AT	3	6	1313412	1313417	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2611	NC_022545	GGCT	2	8	1313425	1313432	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2612	NC_022545	TAAT	2	8	1313554	1313561	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2613	NC_022545	T	6	6	1313582	1313587	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2614	NC_022545	T	6	6	1313598	1313603	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2615	NC_022545	TCC	2	6	1314262	1314267	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2616	NC_022545	A	6	6	1314269	1314274	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2617	NC_022545	GCC	2	6	1314277	1314282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2618	NC_022545	CGG	2	6	1314289	1314294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2619	NC_022545	TG	4	8	1315129	1315136	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2620	NC_022545	AAG	2	6	1315167	1315172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2623	NC_022545	CGG	2	6	1315252	1315257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2624	NC_022545	CCT	2	6	1315259	1315264	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2625	NC_022545	AAC	2	6	1315270	1315275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2626	NC_022545	T	6	6	1315302	1315307	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2627	NC_022545	TGC	2	6	1315321	1315326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2628	NC_022545	CG	3	6	1315339	1315344	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2629	NC_022545	TGA	2	6	1320238	1320243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2630	NC_022545	GGC	2	6	1320253	1320258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2632	NC_022545	ATC	2	6	1321650	1321655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2633	NC_022545	ATA	2	6	1321672	1321677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2634	NC_022545	GCC	2	6	1321682	1321687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2635	NC_022545	CTGT	2	8	1321891	1321898	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2636	NC_022545	TTGCG	2	10	1321949	1321958	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
2637	NC_022545	AT	3	6	1323836	1323841	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2642	NC_022545	TCC	2	6	1325579	1325584	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2643	NC_022545	GAT	2	6	1325627	1325632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2645	NC_022545	GCC	2	6	1328393	1328398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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2759	NC_022545	GT	3	6	1360277	1360282	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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2761	NC_022545	GAAGA	2	10	1360361	1360370	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
2762	NC_022545	TGG	2	6	1360467	1360472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2764	NC_022545	TGT	2	6	1360514	1360519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2769	NC_022545	TGG	2	6	1360776	1360781	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2772	NC_022545	AAG	2	6	1360978	1360983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2775	NC_022545	ATG	2	6	1361082	1361087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2780	NC_022545	CGTC	2	8	1361751	1361758	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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2799	NC_022545	CTGAA	2	10	1362545	1362554	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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2877	NC_022545	CCA	2	6	1393726	1393731	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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2884	NC_022545	ACAT	2	8	1398524	1398531	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2885	NC_022545	AATG	2	8	1398578	1398585	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2886	NC_022545	GC	3	6	1398645	1398650	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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2890	NC_022545	CTC	2	6	1401186	1401191	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2891	NC_022545	TCG	2	6	1403393	1403398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2892	NC_022545	TCCC	2	8	1403428	1403435	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
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2894	NC_022545	GACA	2	8	1403507	1403514	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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