MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Rhizobium sp. IRBG74 linear chromosome

Total Repeats: 4077

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_022545	CTTT	2	8	980975	980982	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2002	NC_022545	ATG	2	6	980985	980990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2003	NC_022545	GCT	2	6	980991	980996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2004	NC_022545	GTT	2	6	981014	981019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2005	NC_022545	GTT	2	6	981081	981086	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2006	NC_022545	ACG	2	6	981096	981101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2007	NC_022545	GT	3	6	981118	981123	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2008	NC_022545	CTC	2	6	981137	981142	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2009	NC_022545	AACT	2	8	981403	981410	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2010	NC_022545	TCG	2	6	981571	981576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2011	NC_022545	TCA	2	6	981768	981773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2012	NC_022545	TCGC	2	8	981796	981803	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2013	NC_022545	ACT	2	6	981805	981810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2014	NC_022545	CTT	2	6	981873	981878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2015	NC_022545	CGTT	2	8	981933	981940	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2016	NC_022545	CTT	2	6	982048	982053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2017	NC_022545	CCA	2	6	982075	982080	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2018	NC_022545	CTT	2	6	982096	982101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2019	NC_022545	TGA	2	6	982180	982185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2022	NC_022545	ACA	2	6	982337	982342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2023	NC_022545	CCTA	2	8	982364	982371	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2024	NC_022545	CCA	2	6	982384	982389	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2025	NC_022545	TCT	2	6	982486	982491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2026	NC_022545	TTC	2	6	982549	982554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2029	NC_022545	TGG	2	6	982734	982739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2033	NC_022545	AGG	2	6	983157	983162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2034	NC_022545	CCT	2	6	983239	983244	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2035	NC_022545	GT	3	6	983298	983303	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2036	NC_022545	GCA	2	6	983328	983333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2038	NC_022545	GT	3	6	983466	983471	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2039	NC_022545	AGCCC	2	10	983472	983481	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
2040	NC_022545	CACGA	2	10	983617	983626	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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2045	NC_022545	AAC	2	6	984144	984149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2046	NC_022545	GCT	2	6	984174	984179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2050	NC_022545	ATC	2	6	984367	984372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2051	NC_022545	TCG	2	6	984392	984397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2052	NC_022545	CCA	2	6	984416	984421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2053	NC_022545	GCC	2	6	984597	984602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2054	NC_022545	CGTT	2	8	984605	984612	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2055	NC_022545	CGT	2	6	984663	984668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2056	NC_022545	CGA	2	6	984676	984681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2057	NC_022545	CAT	2	6	984693	984698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2059	NC_022545	TCTT	2	8	984816	984823	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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2061	NC_022545	A	6	6	984865	984870	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2062	NC_022545	ATTT	2	8	984928	984935	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2063	NC_022545	TCG	2	6	984949	984954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2064	NC_022545	CAG	2	6	984956	984961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2065	NC_022545	CGC	3	9	984962	984970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2066	NC_022545	A	7	7	985039	985045	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2067	NC_022545	ATA	2	6	985061	985066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2068	NC_022545	ATTA	2	8	985090	985097	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2069	NC_022545	AGCAT	2	10	985133	985142	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2070	NC_022545	TTCTCG	2	12	985951	985962	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2072	NC_022545	CTC	2	6	987329	987334	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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2074	NC_022545	TA	3	6	987399	987404	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2075	NC_022545	AAAGG	2	10	987417	987426	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
2076	NC_022545	GCG	2	6	987463	987468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2077	NC_022545	AG	3	6	990296	990301	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2078	NC_022545	CG	3	6	992807	992812	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2079	NC_022545	CGC	2	6	992819	992824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2080	NC_022545	GTT	2	6	992907	992912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2081	NC_022545	GGTC	2	8	992920	992927	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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2090	NC_022545	ATG	2	6	997785	997790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2091	NC_022545	ATTC	2	8	997793	997800	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2092	NC_022545	T	6	6	997814	997819	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2093	NC_022545	CGGC	2	8	997843	997850	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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2096	NC_022545	TTG	2	6	997990	997995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2097	NC_022545	TCC	2	6	999401	999406	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2098	NC_022545	CTG	2	6	999566	999571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2102	NC_022545	CTTT	2	8	1002125	1002132	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2103	NC_022545	GAA	2	6	1002146	1002151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2105	NC_022545	GCG	2	6	1003532	1003537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2106	NC_022545	GCT	2	6	1003613	1003618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2108	NC_022545	TCC	2	6	1003848	1003853	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2109	NC_022545	A	6	6	1003858	1003863	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2110	NC_022545	CGA	2	6	1003902	1003907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2111	NC_022545	GAT	2	6	1004537	1004542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2112	NC_022545	AAAC	2	8	1007319	1007326	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2113	NC_022545	GCACCC	2	12	1007332	1007343	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
2114	NC_022545	C	6	6	1007341	1007346	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2115	NC_022545	T	7	7	1009544	1009550	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2116	NC_022545	GCT	2	6	1009596	1009601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2117	NC_022545	TTG	2	6	1010136	1010141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2118	NC_022545	GCG	2	6	1011728	1011733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2119	NC_022545	CAA	2	6	1018041	1018046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2120	NC_022545	ATA	2	6	1018050	1018055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2121	NC_022545	TTG	2	6	1018078	1018083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2122	NC_022545	T	7	7	1018110	1018116	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2123	NC_022545	TGC	2	6	1018189	1018194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2124	NC_022545	GCGG	2	8	1018888	1018895	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2125	NC_022545	TGC	2	6	1018955	1018960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2126	NC_022545	TCA	2	6	1018967	1018972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2127	NC_022545	CTTT	2	8	1021019	1021026	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2128	NC_022545	AGCA	2	8	1021103	1021110	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2129	NC_022545	GCG	2	6	1021196	1021201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2130	NC_022545	T	8	8	1021202	1021209	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2131	NC_022545	T	6	6	1021219	1021224	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2132	NC_022545	CCG	2	6	1022594	1022599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2133	NC_022545	C	6	6	1027200	1027205	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2134	NC_022545	G	6	6	1027234	1027239	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2135	NC_022545	CTC	2	6	1027258	1027263	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2136	NC_022545	CGA	2	6	1027280	1027285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2137	NC_022545	C	6	6	1027324	1027329	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2138	NC_022545	GGCAG	2	10	1027347	1027356	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
2139	NC_022545	G	6	6	1027358	1027363	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2140	NC_022545	GGC	2	6	1027381	1027386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2141	NC_022545	CGC	2	6	1031513	1031518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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2143	NC_022545	CCAC	2	8	1031555	1031562	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
2144	NC_022545	T	6	6	1031592	1031597	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2151	NC_022545	GGA	2	6	1038396	1038401	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2161	NC_022545	T	6	6	1044531	1044536	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2254	NC_022545	CCT	2	6	1109435	1109440	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2255	NC_022545	ATA	2	6	1110105	1110110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2256	NC_022545	CGGT	2	8	1110172	1110179	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2257	NC_022545	TCA	2	6	1110208	1110213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2258	NC_022545	AGG	2	6	1110317	1110322	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2259	NC_022545	GCA	2	6	1111928	1111933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2260	NC_022545	ATCGC	2	10	1111986	1111995	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2261	NC_022545	AAT	2	6	1112001	1112006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2262	NC_022545	GGC	2	6	1113960	1113965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2263	NC_022545	CTGCC	2	10	1113981	1113990	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
2264	NC_022545	T	6	6	1119040	1119045	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2266	NC_022545	CTTT	2	8	1122892	1122899	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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2398	NC_022545	GCG	2	6	1196606	1196611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2399	NC_022545	CTTC	2	8	1196612	1196619	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2400	NC_022545	GAA	2	6	1197900	1197905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2403	NC_022545	CGG	2	6	1201010	1201015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2482	NC_022545	CTG	2	6	1252902	1252907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2494	NC_022545	TTG	2	6	1256080	1256085	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2495	NC_022545	ATC	2	6	1256116	1256121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2497	NC_022545	GA	3	6	1256185	1256190	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2498	NC_022545	GCTG	2	8	1256214	1256221	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2499	NC_022545	GACG	2	8	1256258	1256265	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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