MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Rhizobium sp. IRBG74 circular chromosome

Total Repeats: 6157

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_022535	GCC	2	6	1822381	1822386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4002	NC_022535	ATC	2	6	1822408	1822413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4003	NC_022535	TGA	2	6	1822433	1822438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_022535	TCA	2	6	1822472	1822477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4005	NC_022535	GCA	2	6	1825446	1825451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4006	NC_022535	ATG	2	6	1825864	1825869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_022535	GCC	2	6	1825892	1825897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4008	NC_022535	ATCG	2	8	1825908	1825915	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4009	NC_022535	GGTC	2	8	1825932	1825939	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4010	NC_022535	GAC	2	6	1825957	1825962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4011	NC_022535	GCC	2	6	1825988	1825993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4012	NC_022535	TCAG	2	8	1826018	1826025	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4013	NC_022535	GCC	2	6	1826687	1826692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4014	NC_022535	GCG	2	6	1827327	1827332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4015	NC_022535	GCT	2	6	1827583	1827588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4016	NC_022535	TTCAC	2	10	1827670	1827679	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
4017	NC_022535	GACG	2	8	1827732	1827739	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4018	NC_022535	GCG	2	6	1827753	1827758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4019	NC_022535	CT	3	6	1827763	1827768	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4020	NC_022535	GTA	2	6	1827769	1827774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_022535	GGA	2	6	1829099	1829104	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_022535	GCC	2	6	1831057	1831062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4023	NC_022535	CGG	2	6	1831100	1831105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4024	NC_022535	GTT	2	6	1831106	1831111	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_022535	CGC	2	6	1831113	1831118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4026	NC_022535	AGG	2	6	1831119	1831124	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_022535	CGT	2	6	1831159	1831164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4028	NC_022535	C	6	6	1831202	1831207	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4029	NC_022535	C	6	6	1833087	1833092	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4030	NC_022535	A	6	6	1833488	1833493	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_022535	CGTC	2	8	1833507	1833514	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4032	NC_022535	GGAT	2	8	1833565	1833572	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_022535	TCA	2	6	1834129	1834134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4034	NC_022535	GCT	2	6	1835879	1835884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4035	NC_022535	GAC	2	6	1835915	1835920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4036	NC_022535	CCT	2	6	1837211	1837216	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4037	NC_022535	TC	3	6	1838050	1838055	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4038	NC_022535	GCC	2	6	1839692	1839697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4039	NC_022535	CA	3	6	1839778	1839783	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4040	NC_022535	ACC	2	6	1841076	1841081	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4041	NC_022535	ATT	2	6	1841111	1841116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_022535	TCT	2	6	1841156	1841161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4043	NC_022535	GAA	2	6	1841167	1841172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_022535	A	6	6	1841188	1841193	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_022535	TAT	2	6	1841922	1841927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_022535	CGG	2	6	1841933	1841938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4047	NC_022535	C	6	6	1841949	1841954	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4048	NC_022535	CTGCC	2	10	1841956	1841965	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
4049	NC_022535	G	6	6	1841983	1841988	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_022535	CCT	2	6	1842051	1842056	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4051	NC_022535	C	6	6	1842065	1842070	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4052	NC_022535	GGCAG	2	10	1842088	1842097	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
4053	NC_022535	G	6	6	1842099	1842104	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_022535	A	6	6	1843324	1843329	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_022535	CGC	2	6	1848114	1848119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4056	NC_022535	GAC	2	6	1848243	1848248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4057	NC_022535	TA	3	6	1848261	1848266	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_022535	GAAA	2	8	1848300	1848307	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_022535	GA	4	8	1849705	1849712	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_022535	T	7	7	1851031	1851037	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_022535	GTT	2	6	1851121	1851126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_022535	TTC	2	6	1851225	1851230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4063	NC_022535	A	8	8	1853413	1853420	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_022535	AAAAT	2	10	1853646	1853655	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_022535	A	6	6	1853680	1853685	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_022535	CAA	2	6	1853696	1853701	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4067	NC_022535	CTT	2	6	1853783	1853788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4068	NC_022535	AGAA	2	8	1853803	1853810	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_022535	AGC	2	6	1853829	1853834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4070	NC_022535	CAA	2	6	1853874	1853879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4071	NC_022535	ATG	2	6	1853964	1853969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_022535	GAC	2	6	1853970	1853975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4073	NC_022535	ACA	2	6	1854028	1854033	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4074	NC_022535	CAGC	2	8	1855133	1855140	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4075	NC_022535	GGC	2	6	1855158	1855163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4076	NC_022535	CTG	2	6	1855188	1855193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4077	NC_022535	GAG	2	6	1855248	1855253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_022535	CCG	2	6	1855946	1855951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4079	NC_022535	G	6	6	1855987	1855992	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_022535	GCC	2	6	1857928	1857933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4081	NC_022535	CGG	2	6	1857947	1857952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4082	NC_022535	GCC	2	6	1858544	1858549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4083	NC_022535	C	6	6	1858567	1858572	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4084	NC_022535	CGG	2	6	1858610	1858615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4085	NC_022535	CCA	2	6	1858708	1858713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4086	NC_022535	ATA	2	6	1859523	1859528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4087	NC_022535	GCC	2	6	1859815	1859820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4088	NC_022535	CGGG	2	8	1860501	1860508	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4089	NC_022535	T	6	6	1860522	1860527	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_022535	CGT	2	6	1860543	1860548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4091	NC_022535	CT	3	6	1860556	1860561	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4092	NC_022535	GTA	2	6	1860987	1860992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_022535	AAG	2	6	1861096	1861101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_022535	GCT	2	6	1861135	1861140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4095	NC_022535	TAAA	2	8	1861151	1861158	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_022535	A	7	7	1861156	1861162	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_022535	TGGCG	2	10	1861184	1861193	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
4098	NC_022535	AAG	2	6	1861224	1861229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_022535	A	6	6	1861245	1861250	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_022535	AATA	2	8	1861602	1861609	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_022535	AGC	2	6	1863779	1863784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4102	NC_022535	GAA	2	6	1866415	1866420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_022535	AAAG	2	8	1866422	1866429	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_022535	ATTT	2	8	1867719	1867726	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_022535	T	6	6	1868005	1868010	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_022535	AGG	2	6	1868028	1868033	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_022535	T	6	6	1868040	1868045	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_022535	AGC	2	6	1868099	1868104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4109	NC_022535	T	6	6	1869863	1869868	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_022535	TGG	2	6	1869875	1869880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_022535	CCAG	2	8	1869920	1869927	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4112	NC_022535	TTC	2	6	1869952	1869957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4113	NC_022535	CGC	2	6	1869958	1869963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4114	NC_022535	CGCT	2	8	1872669	1872676	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4115	NC_022535	CAAA	2	8	1873675	1873682	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4116	NC_022535	A	6	6	1873680	1873685	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_022535	GCC	2	6	1873686	1873691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4118	NC_022535	GGC	2	6	1873698	1873703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4119	NC_022535	TTG	2	6	1874376	1874381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_022535	CTC	2	6	1874407	1874412	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4121	NC_022535	CCG	2	6	1874489	1874494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4122	NC_022535	CAA	2	6	1874523	1874528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4123	NC_022535	AC	3	6	1874530	1874535	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4124	NC_022535	GGC	2	6	1874559	1874564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4125	NC_022535	T	6	6	1874607	1874612	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_022535	CCCA	2	8	1874642	1874649	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
4127	NC_022535	TC	3	6	1874650	1874655	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4128	NC_022535	ACA	2	6	1874696	1874701	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4129	NC_022535	GAG	2	6	1875792	1875797	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_022535	CCT	2	6	1875807	1875812	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4131	NC_022535	ACG	2	6	1875884	1875889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4132	NC_022535	CAAA	2	8	1875949	1875956	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4133	NC_022535	CGC	2	6	1875959	1875964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4395	NC_022535	ATGT	2	8	1983841	1983848	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4396	NC_022535	CAGG	2	8	1983851	1983858	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4397	NC_022535	GAT	3	9	1983878	1983886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4398	NC_022535	C	6	6	1983906	1983911	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4399	NC_022535	C	7	7	1983929	1983935	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4400	NC_022535	G	6	6	1983940	1983945	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4401	NC_022535	AAG	2	6	1983954	1983959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4402	NC_022535	G	6	6	1984053	1984058	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4403	NC_022535	CGC	2	6	1984094	1984099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4405	NC_022535	CAT	2	6	1985598	1985603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4422	NC_022535	GT	3	6	1990330	1990335	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4423	NC_022535	ATCT	2	8	1990344	1990351	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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4445	NC_022535	GATC	2	8	1998477	1998484	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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4499	NC_022535	CAG	2	6	2027161	2027166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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