MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Rhizobium sp. IRBG74 circular chromosome

Total Repeats: 6157

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_022535	TCC	2	6	1619429	1619434	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3502	NC_022535	CG	3	6	1619505	1619510	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3503	NC_022535	GTT	2	6	1620896	1620901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_022535	GAG	2	6	1620948	1620953	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_022535	GCG	2	6	1620963	1620968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3506	NC_022535	CG	3	6	1622552	1622557	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3507	NC_022535	CAAAC	2	10	1622565	1622574	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
3508	NC_022535	ACA	2	6	1622852	1622857	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3509	NC_022535	CGT	2	6	1622896	1622901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3510	NC_022535	CG	3	6	1622908	1622913	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3511	NC_022535	CCG	2	6	1624504	1624509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3512	NC_022535	GCC	2	6	1624539	1624544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3513	NC_022535	GAA	2	6	1625596	1625601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3514	NC_022535	CTC	2	6	1625611	1625616	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3515	NC_022535	CCGT	2	8	1625643	1625650	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3516	NC_022535	GCT	2	6	1625769	1625774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3517	NC_022535	TAC	2	6	1625807	1625812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3518	NC_022535	AAT	2	6	1628924	1628929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_022535	TGT	2	6	1631998	1632003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_022535	TTCA	2	8	1632058	1632065	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3521	NC_022535	CAT	2	6	1632099	1632104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3522	NC_022535	CGC	2	6	1632105	1632110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3523	NC_022535	CA	3	6	1632122	1632127	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3524	NC_022535	ATT	2	6	1632173	1632178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_022535	AGG	2	6	1632202	1632207	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_022535	CGC	2	6	1632627	1632632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3527	NC_022535	CG	3	6	1632638	1632643	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3528	NC_022535	CCA	2	6	1632737	1632742	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3529	NC_022535	CCA	2	6	1632751	1632756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3530	NC_022535	TTC	2	6	1634785	1634790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3531	NC_022535	A	6	6	1634957	1634962	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_022535	ATC	2	6	1636328	1636333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3533	NC_022535	T	6	6	1636404	1636409	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_022535	CGACA	2	10	1636476	1636485	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
3535	NC_022535	CA	3	6	1636534	1636539	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3536	NC_022535	CG	3	6	1636540	1636545	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3537	NC_022535	GAA	2	6	1636552	1636557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3538	NC_022535	T	6	6	1636586	1636591	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_022535	TCG	2	6	1636658	1636663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3540	NC_022535	GCA	2	6	1636671	1636676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3541	NC_022535	CCTGA	2	10	1639611	1639620	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3542	NC_022535	TG	3	6	1639634	1639639	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3543	NC_022535	T	6	6	1639642	1639647	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_022535	A	6	6	1639750	1639755	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_022535	GCC	2	6	1639756	1639761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3546	NC_022535	GGC	2	6	1639771	1639776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3547	NC_022535	GGCG	2	8	1639808	1639815	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3548	NC_022535	CT	3	6	1640828	1640833	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3549	NC_022535	CGGCAG	2	12	1640898	1640909	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
3550	NC_022535	CCG	2	6	1640920	1640925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3551	NC_022535	TGA	2	6	1641076	1641081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3552	NC_022535	ATG	2	6	1641187	1641192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3553	NC_022535	AAT	2	6	1641960	1641965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_022535	GC	3	6	1641983	1641988	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3555	NC_022535	TTC	2	6	1642040	1642045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3556	NC_022535	ATC	2	6	1642094	1642099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3557	NC_022535	CAC	2	6	1642171	1642176	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3558	NC_022535	TCA	2	6	1642199	1642204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3559	NC_022535	T	6	6	1642273	1642278	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3560	NC_022535	GCT	2	6	1642352	1642357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3561	NC_022535	CAG	2	6	1642658	1642663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3562	NC_022535	ATG	2	6	1642722	1642727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_022535	CCGG	2	8	1642730	1642737	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3564	NC_022535	CG	3	6	1642811	1642816	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3565	NC_022535	CATC	2	8	1642820	1642827	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3566	NC_022535	CGG	2	6	1642928	1642933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3567	NC_022535	GA	3	6	1642940	1642945	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3568	NC_022535	TC	3	6	1642972	1642977	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3569	NC_022535	CCCT	2	8	1642983	1642990	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3570	NC_022535	AGG	2	6	1643013	1643018	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3571	NC_022535	CGA	2	6	1643039	1643044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3572	NC_022535	GGGA	2	8	1643099	1643106	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3573	NC_022535	GGAA	2	8	1643228	1643235	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3574	NC_022535	CCG	2	6	1643250	1643255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3575	NC_022535	GGA	2	6	1643303	1643308	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3576	NC_022535	CCG	2	6	1643635	1643640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3577	NC_022535	AT	3	6	1644016	1644021	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3578	NC_022535	A	6	6	1644023	1644028	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3579	NC_022535	TCTT	2	8	1644039	1644046	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3580	NC_022535	CCTG	2	8	1644051	1644058	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3581	NC_022535	TCG	2	6	1644081	1644086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3582	NC_022535	TCG	2	6	1644093	1644098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3583	NC_022535	CTG	2	6	1644150	1644155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3584	NC_022535	TCGA	2	8	1644191	1644198	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3585	NC_022535	AGG	2	6	1644202	1644207	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3586	NC_022535	GAT	2	6	1644249	1644254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3587	NC_022535	TGA	2	6	1644346	1644351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3588	NC_022535	TGA	3	9	1645076	1645084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3589	NC_022535	GCG	2	6	1645088	1645093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3590	NC_022535	TGA	2	6	1645110	1645115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3591	NC_022535	T	6	6	1645220	1645225	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3592	NC_022535	ATC	2	6	1645241	1645246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3593	NC_022535	GGC	2	6	1646128	1646133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3594	NC_022535	GGC	2	6	1646141	1646146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3595	NC_022535	GAG	2	6	1646176	1646181	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3596	NC_022535	GCG	2	6	1647042	1647047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3597	NC_022535	T	6	6	1647858	1647863	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3598	NC_022535	TC	3	6	1647922	1647927	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3599	NC_022535	T	6	6	1648051	1648056	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3600	NC_022535	GCG	2	6	1648330	1648335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3601	NC_022535	TTC	2	6	1648364	1648369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3602	NC_022535	GC	3	6	1648380	1648385	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3603	NC_022535	GCA	2	6	1648476	1648481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3604	NC_022535	TA	4	8	1648497	1648504	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3605	NC_022535	CAA	2	6	1648575	1648580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3606	NC_022535	ACC	2	6	1652495	1652500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3607	NC_022535	A	6	6	1652501	1652506	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3608	NC_022535	CTT	3	9	1652545	1652553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3609	NC_022535	ACT	2	6	1652573	1652578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3611	NC_022535	CG	3	6	1654700	1654705	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3612	NC_022535	GAG	2	6	1654780	1654785	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3613	NC_022535	TCA	2	6	1655198	1655203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3614	NC_022535	CCAC	2	8	1655212	1655219	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3615	NC_022535	CGC	2	6	1657289	1657294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3616	NC_022535	GC	4	8	1657328	1657335	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3617	NC_022535	AC	3	6	1657387	1657392	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3618	NC_022535	CGC	2	6	1658735	1658740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3619	NC_022535	TTCA	2	8	1658873	1658880	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3620	NC_022535	AC	3	6	1658987	1658992	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3621	NC_022535	TCGC	2	8	1659025	1659032	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3622	NC_022535	CCG	2	6	1659096	1659101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3623	NC_022535	TGCC	2	8	1659565	1659572	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3624	NC_022535	TC	3	6	1659574	1659579	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3625	NC_022535	A	7	7	1659580	1659586	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3626	NC_022535	TCG	2	6	1659595	1659600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3627	NC_022535	AC	4	8	1659658	1659665	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3628	NC_022535	CG	3	6	1660140	1660145	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3629	NC_022535	GCG	2	6	1660151	1660156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3630	NC_022535	GATGAG	2	12	1660204	1660215	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3632	NC_022535	AAT	2	6	1662744	1662749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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