MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Rhizobium sp. IRBG74 circular chromosome

Total Repeats: 6157

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_022535	CGG	2	6	1425700	1425705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3002	NC_022535	TCC	2	6	1426069	1426074	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3003	NC_022535	CGG	2	6	1426087	1426092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3004	NC_022535	GTTT	2	8	1426099	1426106	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_022535	GCT	2	6	1426129	1426134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3006	NC_022535	GGA	2	6	1426158	1426163	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_022535	CGG	2	6	1426168	1426173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3008	NC_022535	AGC	2	6	1426361	1426366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3009	NC_022535	CCG	2	6	1427483	1427488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3010	NC_022535	CA	3	6	1428782	1428787	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3011	NC_022535	GCT	2	6	1430728	1430733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3012	NC_022535	A	6	6	1430763	1430768	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_022535	CGC	2	6	1434045	1434050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3014	NC_022535	GCG	2	6	1435880	1435885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3015	NC_022535	ATG	2	6	1435893	1435898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_022535	ATCT	2	8	1435964	1435971	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3017	NC_022535	ATT	2	6	1435978	1435983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_022535	ATGC	2	8	1435986	1435993	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3019	NC_022535	GA	3	6	1436094	1436099	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_022535	TCGC	2	8	1436107	1436114	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3021	NC_022535	CTGT	2	8	1437329	1437336	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3022	NC_022535	TATT	2	8	1437427	1437434	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_022535	GTC	2	6	1437461	1437466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3024	NC_022535	GCC	2	6	1437489	1437494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3025	NC_022535	CGC	2	6	1437606	1437611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3026	NC_022535	GTG	2	6	1437629	1437634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_022535	CAC	2	6	1437696	1437701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3028	NC_022535	TGG	2	6	1437752	1437757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_022535	C	6	6	1439139	1439144	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3030	NC_022535	AAC	2	6	1439195	1439200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3031	NC_022535	GCG	2	6	1439998	1440003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3032	NC_022535	CAT	2	6	1440007	1440012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3033	NC_022535	CAT	2	6	1440018	1440023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3034	NC_022535	T	6	6	1441795	1441800	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_022535	GCGG	2	8	1442664	1442671	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3036	NC_022535	CGC	2	6	1442682	1442687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3037	NC_022535	AGA	2	6	1443249	1443254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_022535	GC	3	6	1443270	1443275	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3039	NC_022535	TGA	2	6	1443834	1443839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_022535	TCG	2	6	1443840	1443845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3041	NC_022535	TCGG	2	8	1444671	1444678	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3042	NC_022535	TC	3	6	1446364	1446369	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3043	NC_022535	GC	3	6	1446397	1446402	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3044	NC_022535	CAA	2	6	1446936	1446941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3045	NC_022535	AGCG	2	8	1447430	1447437	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3046	NC_022535	CCG	2	6	1447449	1447454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3047	NC_022535	TGTC	2	8	1448515	1448522	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3048	NC_022535	AGC	2	6	1448550	1448555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3049	NC_022535	TTG	2	6	1448559	1448564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_022535	CGG	2	6	1448574	1448579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3051	NC_022535	GAT	2	6	1448581	1448586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_022535	CGC	2	6	1449103	1449108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3053	NC_022535	GGC	2	6	1449111	1449116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3054	NC_022535	CCATT	2	10	1449357	1449366	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
3055	NC_022535	ATG	2	6	1449374	1449379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_022535	CGT	2	6	1449400	1449405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3057	NC_022535	GA	4	8	1449409	1449416	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_022535	GAT	2	6	1449422	1449427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_022535	CAT	2	6	1449508	1449513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3060	NC_022535	GAC	2	6	1449590	1449595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3061	NC_022535	GA	3	6	1449605	1449610	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_022535	CG	3	6	1449712	1449717	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3063	NC_022535	GA	3	6	1450901	1450906	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_022535	TTCG	2	8	1454146	1454153	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3065	NC_022535	CCGTC	2	10	1454192	1454201	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
3066	NC_022535	GC	3	6	1454224	1454229	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3067	NC_022535	T	7	7	1454260	1454266	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3069	NC_022535	TGAT	2	8	1455047	1455054	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_022535	CA	3	6	1455082	1455087	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3071	NC_022535	TCC	2	6	1456494	1456499	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3073	NC_022535	CTG	2	6	1456537	1456542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3074	NC_022535	AGG	2	6	1457938	1457943	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_022535	CCT	2	6	1457952	1457957	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3076	NC_022535	TTC	2	6	1461129	1461134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3078	NC_022535	CAT	2	6	1464707	1464712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3081	NC_022535	CCGA	2	8	1468194	1468201	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3082	NC_022535	AAAGC	2	10	1468300	1468309	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
3083	NC_022535	GAAG	2	8	1468938	1468945	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_022535	CCTG	2	8	1469079	1469086	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3085	NC_022535	GAA	2	6	1469141	1469146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_022535	GTC	2	6	1469247	1469252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3088	NC_022535	GCC	3	9	1469350	1469358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3089	NC_022535	TTGCC	2	10	1469360	1469369	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
3090	NC_022535	GCAG	2	8	1471157	1471164	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3091	NC_022535	TCC	2	6	1471190	1471195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3092	NC_022535	TCG	2	6	1471293	1471298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3093	NC_022535	ATT	3	9	1471828	1471836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_022535	GCC	2	6	1471865	1471870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3096	NC_022535	ATG	2	6	1473564	1473569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3097	NC_022535	CAA	2	6	1473589	1473594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3098	NC_022535	AACG	2	8	1476297	1476304	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3099	NC_022535	CG	3	6	1477262	1477267	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3100	NC_022535	A	6	6	1477555	1477560	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_022535	GGC	2	6	1477561	1477566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3102	NC_022535	GCC	2	6	1477571	1477576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3103	NC_022535	T	6	6	1477579	1477584	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_022535	ATT	2	6	1477993	1477998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_022535	G	6	6	1478049	1478054	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_022535	TTG	2	6	1478113	1478118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_022535	GAC	2	6	1478134	1478139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3109	NC_022535	GAG	2	6	1478201	1478206	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_022535	GAT	2	6	1478212	1478217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_022535	GCC	2	6	1478222	1478227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3112	NC_022535	ATGG	2	8	1478324	1478331	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_022535	GGAC	2	8	1478350	1478357	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3114	NC_022535	GCG	2	6	1478398	1478403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3116	NC_022535	A	6	6	1478523	1478528	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_022535	A	6	6	1478530	1478535	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3123	NC_022535	AGG	2	6	1479613	1479618	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_022535	TC	3	6	1480726	1480731	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3125	NC_022535	CAT	2	6	1482207	1482212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3126	NC_022535	CGAA	2	8	1482224	1482231	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3127	NC_022535	CGA	2	6	1482301	1482306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3128	NC_022535	CG	3	6	1483160	1483165	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3129	NC_022535	CTC	2	6	1486567	1486572	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3131	NC_022535	GCC	2	6	1486614	1486619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3132	NC_022535	GAA	2	6	1486757	1486762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3133	NC_022535	TGC	2	6	1487729	1487734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3134	NC_022535	GGA	2	6	1487757	1487762	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3135	NC_022535	GGA	2	6	1487788	1487793	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3136	NC_022535	CCGC	2	8	1489022	1489029	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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3139	NC_022535	AAAGT	2	10	1491548	1491557	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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3163	NC_022535	CCACA	2	10	1501236	1501245	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
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3240	NC_022535	TATT	2	8	1535492	1535499	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3242	NC_022535	GCCC	2	8	1535520	1535527	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3243	NC_022535	GTA	2	6	1535562	1535567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3248	NC_022535	CTTT	2	8	1535666	1535673	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3249	NC_022535	GCC	2	6	1535674	1535679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3250	NC_022535	GAT	2	6	1535682	1535687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3252	NC_022535	GGCG	2	8	1535708	1535715	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3253	NC_022535	GGA	2	6	1535732	1535737	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3255	NC_022535	CGC	2	6	1537220	1537225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3257	NC_022535	TTG	2	6	1537264	1537269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3258	NC_022535	TA	3	6	1537294	1537299	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3259	NC_022535	GGA	2	6	1537349	1537354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3322	NC_022535	CGG	2	6	1557744	1557749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3371	NC_022535	G	6	6	1577407	1577412	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3372	NC_022535	CCCA	2	8	1577461	1577468	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3373	NC_022535	TTGCA	2	10	1577517	1577526	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3374	NC_022535	GGCAA	2	10	1577535	1577544	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
3375	NC_022535	GGC	2	6	1579068	1579073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3383	NC_022535	GAA	2	6	1580935	1580940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3386	NC_022535	GCG	2	6	1582752	1582757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3387	NC_022535	TTTCG	2	10	1582804	1582813	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
3388	NC_022535	AGG	2	6	1582847	1582852	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3389	NC_022535	GCG	2	6	1582931	1582936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3390	NC_022535	GC	3	6	1582939	1582944	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3391	NC_022535	TCC	2	6	1582950	1582955	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3392	NC_022535	C	6	6	1582967	1582972	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3393	NC_022535	TA	4	8	1583016	1583023	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3394	NC_022535	CGG	2	6	1583032	1583037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3397	NC_022535	GCC	2	6	1583069	1583074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3398	NC_022535	CCG	2	6	1583085	1583090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3432	NC_022535	ACTC	2	8	1584570	1584577	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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3465	NC_022535	CA	3	6	1600771	1600776	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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3499	NC_022535	AG	3	6	1617896	1617901	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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