MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhizobium sp. IRBG74 circular chromosome

Total Repeats: 6157

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_022535	T	6	6	513615	513620	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_022535	TGA	2	6	513629	513634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_022535	GCC	2	6	513682	513687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1004	NC_022535	TGC	2	6	513723	513728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_022535	TC	3	6	513782	513787	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1006	NC_022535	AGC	2	6	513789	513794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_022535	AAG	2	6	513816	513821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_022535	GC	3	6	513824	513829	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1009	NC_022535	TGC	2	6	513955	513960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_022535	TAA	2	6	515383	515388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_022535	CGA	2	6	515399	515404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_022535	A	6	6	515416	515421	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_022535	T	7	7	515450	515456	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_022535	A	6	6	516711	516716	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_022535	GC	3	6	516743	516748	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1016	NC_022535	GGC	2	6	516948	516953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_022535	CAGT	2	8	517029	517036	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1018	NC_022535	ATT	2	6	518369	518374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_022535	CTT	2	6	518505	518510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_022535	TTAT	2	8	518526	518533	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_022535	GCG	2	6	519899	519904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_022535	GCCT	2	8	522765	522772	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1023	NC_022535	CTG	2	6	523580	523585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_022535	CGA	2	6	524811	524816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_022535	A	6	6	524853	524858	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_022535	GC	3	6	524860	524865	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1027	NC_022535	CAG	2	6	524866	524871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_022535	CG	3	6	524876	524881	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1029	NC_022535	GAA	2	6	524893	524898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_022535	GCTT	2	8	528473	528480	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1031	NC_022535	CTGG	2	8	528489	528496	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1032	NC_022535	T	6	6	528544	528549	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_022535	GGC	2	6	528556	528561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_022535	TTTGGG	2	12	530436	530447	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_022535	AAT	2	6	530472	530477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_022535	CTG	2	6	532122	532127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_022535	GCC	2	6	532150	532155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1038	NC_022535	GAC	2	6	532170	532175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_022535	CGG	2	6	532189	532194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_022535	T	7	7	532198	532204	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_022535	CCG	2	6	533752	533757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1042	NC_022535	CGG	2	6	533793	533798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_022535	CG	3	6	533854	533859	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1044	NC_022535	GTT	3	9	533902	533910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_022535	AACG	2	8	533938	533945	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1046	NC_022535	ACC	2	6	533969	533974	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1047	NC_022535	ATG	2	6	533985	533990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_022535	ATT	2	6	534019	534024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_022535	TCC	2	6	535494	535499	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1050	NC_022535	GGT	2	6	535539	535544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_022535	GCC	2	6	535545	535550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1052	NC_022535	GCAG	2	8	535625	535632	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1053	NC_022535	A	6	6	540824	540829	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_022535	T	6	6	540843	540848	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_022535	AT	3	6	540886	540891	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_022535	TA	4	8	540905	540912	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_022535	ATT	2	6	540941	540946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_022535	GAT	2	6	540957	540962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_022535	GGC	2	6	545734	545739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_022535	CGG	2	6	547362	547367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_022535	GCG	2	6	547436	547441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_022535	TTG	2	6	550767	550772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_022535	T	7	7	550784	550790	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_022535	CG	3	6	550842	550847	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1065	NC_022535	GAG	2	6	551447	551452	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_022535	GCC	2	6	552371	552376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1067	NC_022535	ATTG	2	8	552466	552473	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_022535	CGGG	2	8	552547	552554	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1069	NC_022535	TTTG	2	8	553278	553285	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_022535	GTCC	2	8	553323	553330	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1071	NC_022535	GCGG	2	8	553331	553338	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1072	NC_022535	CGC	2	6	555140	555145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1073	NC_022535	GAG	2	6	555200	555205	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_022535	TCC	2	6	557165	557170	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1075	NC_022535	GC	4	8	557173	557180	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1076	NC_022535	CTC	2	6	557201	557206	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1077	NC_022535	GCC	2	6	557269	557274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1078	NC_022535	TGA	2	6	557345	557350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_022535	GGC	2	6	558812	558817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1080	NC_022535	CGCGG	2	10	558868	558877	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1081	NC_022535	AGGG	2	8	558886	558893	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_022535	GAGG	2	8	562771	562778	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_022535	CTGT	2	8	563905	563912	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1084	NC_022535	ATC	2	6	565918	565923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1085	NC_022535	CGTCG	2	10	568004	568013	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1086	NC_022535	CG	3	6	568716	568721	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1087	NC_022535	TC	3	6	570207	570212	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1088	NC_022535	AAT	2	6	570235	570240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_022535	TTTTGC	2	12	570286	570297	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1090	NC_022535	GCC	2	6	570308	570313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1091	NC_022535	CAT	2	6	573106	573111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1092	NC_022535	GCG	2	6	573156	573161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NC_022535	AGGAA	2	10	573175	573184	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_022535	CT	3	6	574412	574417	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1095	NC_022535	TGA	2	6	574537	574542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_022535	CCAA	2	8	574553	574560	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1097	NC_022535	T	6	6	574594	574599	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_022535	AAT	2	6	574600	574605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_022535	GAG	2	6	574618	574623	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_022535	ATG	2	6	574676	574681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_022535	CTT	2	6	575055	575060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_022535	ATG	2	6	575074	575079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_022535	T	6	6	575087	575092	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_022535	TC	4	8	577649	577656	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1105	NC_022535	CAT	2	6	577695	577700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_022535	TACATT	2	12	577721	577732	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1107	NC_022535	A	6	6	577753	577758	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_022535	T	6	6	579332	579337	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_022535	TGCTG	2	10	579364	579373	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1110	NC_022535	TC	3	6	579412	579417	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1111	NC_022535	A	6	6	579420	579425	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_022535	CGT	2	6	579440	579445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_022535	CCGC	2	8	580573	580580	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1114	NC_022535	CGGC	2	8	580592	580599	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1115	NC_022535	GCCC	2	8	580650	580657	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1116	NC_022535	ATCG	2	8	580664	580671	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1117	NC_022535	AGGGT	2	10	580690	580699	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_022535	GA	3	6	583600	583605	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_022535	T	6	6	583615	583620	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_022535	TCG	2	6	583700	583705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_022535	TGAT	2	8	583707	583714	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_022535	GTC	2	6	583773	583778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_022535	TC	3	6	583832	583837	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1124	NC_022535	GGC	2	6	583860	583865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1125	NC_022535	GCC	2	6	583872	583877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1126	NC_022535	T	7	7	583882	583888	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_022535	CCG	2	6	589457	589462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1128	NC_022535	T	6	6	589615	589620	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_022535	C	6	6	589671	589676	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1130	NC_022535	GGT	2	6	589751	589756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_022535	AAT	2	6	589873	589878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_022535	GC	3	6	589894	589899	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1133	NC_022535	CTGC	2	8	593761	593768	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1134	NC_022535	CCGT	2	8	593796	593803	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1135	NC_022535	CTG	2	6	594971	594976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1136	NC_022535	GCA	2	6	594981	594986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1137	NC_022535	T	6	6	595016	595021	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1138	NC_022535	ATG	2	6	597244	597249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1139	NC_022535	GCG	2	6	598361	598366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1140	NC_022535	TG	3	6	598377	598382	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1141	NC_022535	TCC	2	6	598428	598433	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1142	NC_022535	AGG	2	6	598450	598455	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1143	NC_022535	TTC	2	6	599362	599367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1144	NC_022535	TGT	2	6	599400	599405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1146	NC_022535	CTGCC	2	10	599446	599455	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
1147	NC_022535	G	6	6	599473	599478	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1148	NC_022535	C	6	6	599553	599558	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1149	NC_022535	GGCAG	2	10	599576	599585	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1150	NC_022535	G	6	6	599587	599592	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1151	NC_022535	T	6	6	603015	603020	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1152	NC_022535	GCCTG	2	10	603120	603129	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1153	NC_022535	ACG	2	6	604494	604499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1155	NC_022535	GATT	2	8	605382	605389	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1156	NC_022535	TGCTT	2	10	606619	606628	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1157	NC_022535	CGC	2	6	607660	607665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1159	NC_022535	TCC	2	6	607739	607744	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1160	NC_022535	CGC	2	6	607748	607753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1162	NC_022535	TG	3	6	608784	608789	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1163	NC_022535	GCT	2	6	609214	609219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1172	NC_022535	CG	3	6	618085	618090	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1173	NC_022535	ATG	2	6	618121	618126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1177	NC_022535	CGG	2	6	618254	618259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1181	NC_022535	G	6	6	620359	620364	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1182	NC_022535	CG	3	6	620396	620401	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1183	NC_022535	CTC	2	6	620431	620436	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1252	NC_022535	ATG	2	6	652322	652327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1254	NC_022535	ATCGG	2	10	653843	653852	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1255	NC_022535	AAC	2	6	658181	658186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1256	NC_022535	AGA	2	6	658187	658192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1258	NC_022535	GCC	2	6	658616	658621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1260	NC_022535	TCT	2	6	658825	658830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1261	NC_022535	ACA	2	6	658835	658840	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1262	NC_022535	CAGT	2	8	658843	658850	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1263	NC_022535	TCT	2	6	658876	658881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1264	NC_022535	GTG	2	6	658958	658963	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1265	NC_022535	ATG	2	6	658964	658969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1266	NC_022535	GCA	2	6	658974	658979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1267	NC_022535	A	7	7	659007	659013	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1268	NC_022535	CGG	2	6	659014	659019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1269	NC_022535	GCG	2	6	659027	659032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1270	NC_022535	TC	3	6	659111	659116	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1271	NC_022535	GCC	2	6	659251	659256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1272	NC_022535	GC	3	6	659264	659269	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1273	NC_022535	GGC	2	6	659299	659304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1275	NC_022535	GCC	2	6	659373	659378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1409	NC_022535	GAG	2	6	714839	714844	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1413	NC_022535	ATG	2	6	720120	720125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1414	NC_022535	TCT	2	6	720129	720134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1415	NC_022535	GA	3	6	720195	720200	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1416	NC_022535	GTT	2	6	723290	723295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1417	NC_022535	TCCA	2	8	723296	723303	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1419	NC_022535	GGC	2	6	723369	723374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1420	NC_022535	TGC	2	6	723383	723388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1432	NC_022535	TCC	2	6	730381	730386	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1438	NC_022535	TCT	2	6	733681	733686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1439	NC_022535	CCG	2	6	733689	733694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1442	NC_022535	GCG	2	6	733835	733840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1444	NC_022535	CCT	2	6	736791	736796	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1445	NC_022535	TCT	2	6	736824	736829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1446	NC_022535	GA	3	6	736932	736937	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1449	NC_022535	ATC	2	6	740354	740359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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