MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Rhizobium sp. IRBG74 circular chromosome

Total Repeats: 6157

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_022535	GAA	2	6	243561	243566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
502	NC_022535	GCC	2	6	243582	243587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
503	NC_022535	T	6	6	243593	243598	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_022535	CTA	2	6	245948	245953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_022535	GC	3	6	245997	246002	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
506	NC_022535	GCG	2	6	246009	246014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_022535	CGC	2	6	246572	246577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
508	NC_022535	GCG	2	6	246596	246601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_022535	ATT	2	6	246617	246622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_022535	ATT	2	6	246664	246669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_022535	G	6	6	248385	248390	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
512	NC_022535	CAAT	2	8	248408	248415	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
513	NC_022535	GC	3	6	248417	248422	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
514	NC_022535	CAA	2	6	249278	249283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_022535	CGG	2	6	249284	249289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_022535	ACA	2	6	249309	249314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_022535	CCG	2	6	249370	249375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
518	NC_022535	T	6	6	249394	249399	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_022535	AGG	2	6	249472	249477	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
520	NC_022535	TGA	2	6	249524	249529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
521	NC_022535	GC	3	6	250059	250064	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
522	NC_022535	TGT	2	6	250825	250830	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
523	NC_022535	T	7	7	250864	250870	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_022535	T	6	6	250901	250906	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_022535	AGA	2	6	250920	250925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
526	NC_022535	TGG	2	6	250960	250965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
527	NC_022535	A	6	6	255390	255395	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_022535	ACC	2	6	255405	255410	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
529	NC_022535	TCA	2	6	256457	256462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_022535	AAT	2	6	256499	256504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_022535	GTT	2	6	256523	256528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
532	NC_022535	CCG	2	6	258874	258879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
533	NC_022535	ATC	2	6	258908	258913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_022535	AGC	2	6	260540	260545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_022535	GT	3	6	260611	260616	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
536	NC_022535	CCT	2	6	262274	262279	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
537	NC_022535	TCC	2	6	262340	262345	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
538	NC_022535	A	6	6	262396	262401	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_022535	TCC	2	6	265265	265270	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
540	NC_022535	CAGT	2	8	265276	265283	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
541	NC_022535	A	6	6	265304	265309	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_022535	TCC	2	6	266021	266026	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
543	NC_022535	GTA	2	6	266032	266037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
544	NC_022535	TCC	2	6	268859	268864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
545	NC_022535	GC	3	6	268885	268890	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
546	NC_022535	CCG	2	6	269797	269802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
547	NC_022535	CAT	2	6	269909	269914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_022535	GA	3	6	269963	269968	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
549	NC_022535	GGC	2	6	270161	270166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_022535	CTCG	2	8	270172	270179	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
551	NC_022535	CGG	2	6	270206	270211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_022535	TTG	2	6	270230	270235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
553	NC_022535	CAG	2	6	270255	270260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_022535	ATC	2	6	271064	271069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_022535	GAA	2	6	271084	271089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
556	NC_022535	GACC	2	8	272060	272067	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
557	NC_022535	GCT	2	6	272082	272087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_022535	ACC	2	6	272122	272127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
559	NC_022535	CGT	2	6	272654	272659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_022535	TTC	2	6	272662	272667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_022535	GCA	2	6	272689	272694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_022535	GGC	2	6	274316	274321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_022535	GCCT	3	12	275464	275475	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
564	NC_022535	GGCA	2	8	275512	275519	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
565	NC_022535	GC	3	6	275564	275569	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
566	NC_022535	T	6	6	276087	276092	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_022535	GGC	2	6	282671	282676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_022535	GATT	2	8	283086	283093	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
569	NC_022535	A	7	7	283169	283175	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_022535	ATC	2	6	283219	283224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_022535	GAA	2	6	283255	283260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
572	NC_022535	A	6	6	283265	283270	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_022535	TAA	2	6	283391	283396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_022535	TCA	2	6	286347	286352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_022535	AAG	2	6	286425	286430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
576	NC_022535	GAAAAA	2	12	287266	287277	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
577	NC_022535	CGG	2	6	287292	287297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
578	NC_022535	T	8	8	287301	287308	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_022535	CGTT	2	8	287501	287508	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
580	NC_022535	CG	3	6	287509	287514	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
581	NC_022535	GCC	2	6	287521	287526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
582	NC_022535	GT	3	6	287527	287532	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
583	NC_022535	AGC	2	6	287579	287584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_022535	TTG	2	6	287585	287590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
585	NC_022535	CCG	2	6	287658	287663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
586	NC_022535	GTC	2	6	287702	287707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_022535	TCC	2	6	287708	287713	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
588	NC_022535	GAA	2	6	287758	287763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
589	NC_022535	A	7	7	287769	287775	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_022535	TAG	2	6	287798	287803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
591	NC_022535	GGC	2	6	287813	287818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_022535	CTC	2	6	288811	288816	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
593	NC_022535	CG	3	6	288860	288865	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
594	NC_022535	GAC	2	6	288917	288922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_022535	TCC	2	6	289219	289224	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
596	NC_022535	GTC	2	6	289226	289231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_022535	A	6	6	291241	291246	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_022535	GGC	2	6	291326	291331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_022535	CGG	2	6	291352	291357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_022535	GAAA	2	8	291387	291394	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
601	NC_022535	CCG	2	6	292558	292563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
602	NC_022535	AAG	2	6	292571	292576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
603	NC_022535	TGC	2	6	292673	292678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_022535	GCC	2	6	292704	292709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
605	NC_022535	CCGG	2	8	292765	292772	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
606	NC_022535	CCG	2	6	294669	294674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
607	NC_022535	TAA	2	6	294678	294683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_022535	CT	3	6	294720	294725	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
609	NC_022535	TGG	2	6	294749	294754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
610	NC_022535	CCT	2	6	296098	296103	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
611	NC_022535	AGG	2	6	296135	296140	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
612	NC_022535	CGG	3	9	299719	299727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_022535	CGC	2	6	299743	299748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
614	NC_022535	GCA	2	6	299792	299797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_022535	TGC	2	6	299921	299926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_022535	GCG	2	6	301062	301067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_022535	TGCC	2	8	302655	302662	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
618	NC_022535	GCC	2	6	302756	302761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
619	NC_022535	GGC	2	6	302770	302775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_022535	AAT	2	6	303889	303894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_022535	CTC	2	6	304612	304617	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
622	NC_022535	CAT	2	6	309469	309474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_022535	AGC	2	6	309510	309515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_022535	TTA	2	6	309558	309563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_022535	GTCT	2	8	311998	312005	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
626	NC_022535	GCCC	2	8	313903	313910	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
627	NC_022535	AG	3	6	314021	314026	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
628	NC_022535	ATT	2	6	314318	314323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_022535	TCC	2	6	314379	314384	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
630	NC_022535	TCT	2	6	314454	314459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_022535	AAG	2	6	314507	314512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
632	NC_022535	ATTTTT	2	12	314513	314524	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_022535	T	7	7	314520	314526	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_022535	A	6	6	314543	314548	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_022535	A	6	6	314652	314657	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_022535	TC	3	6	314667	314672	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
637	NC_022535	CAA	2	6	314698	314703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
638	NC_022535	CGA	2	6	314746	314751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
639	NC_022535	CTT	2	6	314759	314764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
640	NC_022535	T	6	6	314788	314793	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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642	NC_022535	GGC	2	6	315143	315148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
643	NC_022535	T	6	6	316650	316655	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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649	NC_022535	AAGG	2	8	321324	321331	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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651	NC_022535	GCG	2	6	322610	322615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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653	NC_022535	GAC	2	6	324302	324307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
654	NC_022535	T	6	6	324329	324334	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
655	NC_022535	TTTG	2	8	324337	324344	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
656	NC_022535	AGGGC	2	10	324355	324364	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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662	NC_022535	GCT	3	9	343167	343175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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671	NC_022535	T	6	6	351406	351411	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
672	NC_022535	GCT	2	6	353135	353140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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683	NC_022535	TCC	2	6	358286	358291	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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777	NC_022535	GCC	2	6	410110	410115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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