MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetNIM1c

Total Repeats: 533

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021910	TTG	2	6	265	270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021910	ATT	2	6	604	609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021910	ACC	2	6	708	713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_021910	TGG	2	6	831	836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021910	GAG	2	6	970	975	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021910	GAC	2	6	1104	1109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_021910	GGT	2	6	1147	1152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021910	AGC	2	6	1211	1216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_021910	CAC	2	6	1862	1867	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_021910	GCC	2	6	2950	2955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_021910	GAA	2	6	3030	3035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021910	TGC	3	9	4223	4231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_021910	GGA	2	6	4304	4309	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021910	GAG	2	6	4310	4315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021910	GGA	2	6	8591	8596	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021910	GGA	2	6	10082	10087	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021910	TGC	2	6	10090	10095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_021910	GGA	2	6	10336	10341	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021910	TCC	2	6	13205	13210	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_021910	GTT	2	6	15270	15275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021910	ATC	2	6	16449	16454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_021910	CGA	2	6	16490	16495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_021910	AAT	2	6	16882	16887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021910	GGA	2	6	16917	16922	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021910	CGA	2	6	16981	16986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_021910	TGA	2	6	17512	17517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021910	TGA	2	6	17575	17580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021910	CAT	2	6	17828	17833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_021910	CCG	2	6	17872	17877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_021910	GAT	2	6	17909	17914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021910	CAG	2	6	17943	17948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_021910	CGT	2	6	18007	18012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_021910	CAG	2	6	18047	18052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_021910	ATG	2	6	18069	18074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021910	GAC	2	6	18095	18100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_021910	CGG	2	6	18109	18114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_021910	GCG	2	6	18138	18143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_021910	CCG	2	6	18146	18151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_021910	CCA	2	6	18175	18180	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_021910	CAA	2	6	18328	18333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_021910	GGA	2	6	18384	18389	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021910	TCC	2	6	18443	18448	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_021910	CTT	2	6	18451	18456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_021910	GCA	2	6	18497	18502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_021910	TCC	2	6	18505	18510	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_021910	GGC	2	6	18561	18566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_021910	GAT	2	6	18610	18615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021910	GCG	2	6	18646	18651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_021910	GCC	2	6	19357	19362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_021910	GCC	2	6	19369	19374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_021910	CTT	2	6	19394	19399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_021910	TCT	2	6	19412	19417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_021910	TCT	2	6	19975	19980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_021910	TGA	2	6	19987	19992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021910	GCC	2	6	19997	20002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_021910	ACA	2	6	23855	23860	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_021910	GGA	2	6	24079	24084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021910	GAG	2	6	28446	28451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021910	ACA	2	6	30047	30052	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_021910	TCA	2	6	30184	30189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_021910	CGA	2	6	30194	30199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_021910	GAC	2	6	30218	30223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_021910	GAT	2	6	30398	30403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021910	ATC	2	6	30408	30413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_021910	CAA	2	6	32152	32157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_021910	CCT	2	6	33308	33313	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_021910	GCC	2	6	33331	33336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_021910	GGA	2	6	33349	33354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021910	TCG	2	6	36993	36998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_021910	GCC	2	6	37040	37045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_021910	GCC	2	6	37317	37322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_021910	GGA	2	6	37350	37355	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021910	GCG	2	6	37424	37429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_021910	GCT	2	6	37445	37450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_021910	ACG	2	6	37511	37516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_021910	GTG	2	6	37539	37544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021910	CCG	2	6	37551	37556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_021910	AAC	2	6	37586	37591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_021910	ACC	2	6	37605	37610	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_021910	CGC	2	6	37611	37616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_021910	CAT	2	6	39468	39473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_021910	GCA	2	6	41010	41015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_021910	TGT	2	6	41085	41090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021910	ATC	2	6	41171	41176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_021910	CTG	2	6	42076	42081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_021910	ACA	2	6	42098	42103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_021910	AAG	2	6	44183	44188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021910	GCG	2	6	44242	44247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_021910	GAA	2	6	44289	44294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021910	TGC	2	6	44302	44307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_021910	GGA	2	6	44388	44393	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021910	CAG	2	6	44441	44446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_021910	AGG	2	6	44459	44464	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021910	TTC	2	6	45637	45642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_021910	CGA	2	6	45778	45783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_021910	ATT	2	6	45851	45856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021910	TCC	2	6	47429	47434	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_021910	GCG	2	6	50787	50792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_021910	GGA	2	6	50841	50846	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021910	CAC	2	6	50852	50857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_021910	TCC	2	6	51121	51126	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_021910	ACG	3	9	51291	51299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_021910	AGC	2	6	51336	51341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_021910	GGC	2	6	51358	51363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_021910	TCA	2	6	51372	51377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_021910	GAC	2	6	52716	52721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_021910	GGC	2	6	52728	52733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_021910	TCC	2	6	56075	56080	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_021910	GGA	2	6	56108	56113	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021910	CAA	2	6	56195	56200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_021910	TAG	2	6	56244	56249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021910	AGG	2	6	56300	56305	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021910	TGG	2	6	61785	61790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021910	GGA	2	6	61927	61932	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021910	TCC	2	6	62695	62700	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_021910	GAG	2	6	62703	62708	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021910	CGC	2	6	66839	66844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_021910	CGG	2	6	66894	66899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_021910	GGC	2	6	66906	66911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_021910	GAG	2	6	66945	66950	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021910	GCA	2	6	68837	68842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_021910	ATG	2	6	68869	68874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021910	GAG	2	6	68954	68959	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021910	GGC	2	6	69696	69701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_021910	GCC	2	6	71715	71720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_021910	ATC	2	6	72743	72748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_021910	CAA	2	6	73050	73055	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_021910	GGA	2	6	74217	74222	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021910	ACA	2	6	76724	76729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_021910	CGC	2	6	76737	76742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_021910	CCG	2	6	76799	76804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_021910	TGC	2	6	76856	76861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_021910	ATG	2	6	76898	76903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021910	AGC	2	6	82425	82430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_021910	CCA	2	6	84115	84120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_021910	TGC	2	6	84178	84183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_021910	GCA	2	6	84228	84233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_021910	CGC	2	6	84333	84338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_021910	GTC	2	6	84358	84363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_021910	TGC	2	6	84425	84430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_021910	TTG	2	6	87814	87819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021910	GTA	2	6	89783	89788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021910	GGC	2	6	89852	89857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_021910	GCC	2	6	89901	89906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
145	NC_021910	CGA	2	6	89915	89920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_021910	CAG	3	9	89979	89987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_021910	CTG	2	6	90029	90034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_021910	TAA	2	6	90044	90049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_021910	CGA	2	6	90292	90297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_021910	GGA	2	6	90405	90410	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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166	NC_021910	GTG	2	6	103905	103910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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173	NC_021910	TGG	2	6	106185	106190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
174	NC_021910	GTC	2	6	106987	106992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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183	NC_021910	GTC	2	6	108952	108957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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