MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetMIM1e

Total Repeats: 258

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021909	CG	3	6	64	69	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_021909	GA	3	6	2764	2769	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021909	GC	4	8	12957	12964	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_021909	TC	4	8	17688	17695	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_021909	GA	3	6	18388	18393	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021909	TC	3	6	18406	18411	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_021909	GC	3	6	18454	18459	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_021909	GT	3	6	18657	18662	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021909	TC	3	6	18751	18756	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_021909	GA	3	6	18888	18893	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021909	AC	3	6	19258	19263	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_021909	CG	3	6	19340	19345	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_021909	AG	3	6	26645	26650	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021909	GC	3	6	37965	37970	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_021909	GA	3	6	41697	41702	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021909	GC	3	6	50054	50059	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_021909	CG	3	6	50433	50438	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_021909	GC	4	8	55941	55948	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_021909	GC	3	6	56295	56300	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_021909	GA	3	6	57242	57247	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021909	CG	4	8	58031	58038	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_021909	TC	3	6	59221	59226	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_021909	CG	3	6	61808	61813	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_021909	TG	3	6	62245	62250	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021909	CG	3	6	71435	71440	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_021909	CG	3	6	71587	71592	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_021909	CG	3	6	72826	72831	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_021909	CG	4	8	73243	73250	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_021909	CG	3	6	73897	73902	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_021909	AG	3	6	74973	74978	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021909	GC	3	6	78297	78302	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_021909	GC	4	8	83214	83221	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_021909	GC	3	6	83225	83230	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_021909	AG	4	8	86518	86525	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021909	GT	3	6	96361	96366	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021909	CG	3	6	96729	96734	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_021909	GA	3	6	97424	97429	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021909	GC	3	6	97623	97628	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_021909	CG	3	6	98908	98913	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_021909	CG	3	6	108890	108895	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_021909	TA	3	6	117617	117622	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021909	AT	4	8	117693	117700	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021909	AG	3	6	117718	117723	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021909	AG	3	6	119463	119468	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021909	CA	3	6	126975	126980	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_021909	TC	3	6	133706	133711	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_021909	TC	3	6	140962	140967	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_021909	GC	3	6	141577	141582	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_021909	GC	3	6	141727	141732	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_021909	CG	4	8	142889	142896	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_021909	CG	3	6	149570	149575	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_021909	AG	3	6	150071	150076	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021909	GC	3	6	150725	150730	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_021909	CG	3	6	165823	165828	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_021909	AG	3	6	169010	169015	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021909	GC	3	6	169894	169899	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_021909	GA	3	6	176823	176828	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021909	CG	3	6	177150	177155	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_021909	GC	3	6	177492	177497	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_021909	CG	4	8	181731	181738	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_021909	CG	3	6	192023	192028	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_021909	CG	4	8	192229	192236	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_021909	TG	3	6	192375	192380	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021909	GC	3	6	193048	193053	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_021909	AG	3	6	193393	193398	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021909	CA	3	6	194922	194927	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_021909	CA	3	6	206995	207000	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_021909	CG	3	6	208190	208195	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_021909	GA	3	6	210196	210201	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021909	CG	3	6	212609	212614	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_021909	CG	5	10	214300	214309	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_021909	AC	3	6	216395	216400	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_021909	TC	3	6	219419	219424	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_021909	GC	3	6	219504	219509	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NC_021909	TC	3	6	220459	220464	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_021909	GA	3	6	220987	220992	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021909	AG	3	6	221348	221353	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021909	CT	3	6	222485	222490	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_021909	GA	3	6	222846	222851	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021909	CG	3	6	223573	223578	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_021909	GA	3	6	226892	226897	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021909	CG	3	6	227016	227021	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_021909	CA	3	6	228071	228076	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_021909	CG	3	6	228508	228513	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85	NC_021909	CT	3	6	230007	230012	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_021909	CG	3	6	231280	231285	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_021909	GC	3	6	235756	235761	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_021909	CG	3	6	237553	237558	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_021909	TC	3	6	237732	237737	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_021909	CA	3	6	245130	245135	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_021909	GA	3	6	245320	245325	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021909	GC	3	6	245582	245587	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_021909	CG	3	6	245656	245661	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
94	NC_021909	GC	3	6	245743	245748	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_021909	GC	3	6	245893	245898	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
96	NC_021909	AG	3	6	246968	246973	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021909	CG	3	6	247423	247428	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_021909	GA	3	6	247662	247667	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021909	CG	3	6	249260	249265	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_021909	AC	3	6	249286	249291	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_021909	GC	3	6	257071	257076	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_021909	AC	3	6	263843	263848	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_021909	AT	3	6	267457	267462	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021909	CG	3	6	278102	278107	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_021909	TC	3	6	286183	286188	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_021909	CG	3	6	286422	286427	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_021909	CT	3	6	286877	286882	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_021909	GC	3	6	287021	287026	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
109	NC_021909	GC	3	6	287739	287744	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_021909	AG	4	8	291027	291034	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021909	CG	3	6	293452	293457	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_021909	CG	3	6	293618	293623	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_021909	GC	3	6	298896	298901	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_021909	GC	3	6	298978	298983	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
115	NC_021909	GC	3	6	299017	299022	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_021909	GA	3	6	300787	300792	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021909	AT	3	6	301344	301349	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021909	GA	3	6	305298	305303	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021909	GC	3	6	308853	308858	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_021909	GC	3	6	309089	309094	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_021909	GT	3	6	309200	309205	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021909	CG	3	6	309861	309866	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_021909	GC	3	6	310628	310633	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_021909	GC	3	6	313657	313662	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125	NC_021909	GC	3	6	313851	313856	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_021909	CG	3	6	321375	321380	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NC_021909	TG	3	6	321812	321817	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021909	CG	3	6	322800	322805	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_021909	CT	3	6	323526	323531	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_021909	CG	3	6	324873	324878	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_021909	TG	3	6	326366	326371	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021909	CT	3	6	328400	328405	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_021909	GC	3	6	332439	332444	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
134	NC_021909	GA	5	10	336915	336924	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021909	AC	3	6	338192	338197	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_021909	TC	3	6	343967	343972	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_021909	TG	3	6	344785	344790	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021909	GA	4	8	357615	357622	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021909	GA	3	6	357704	357709	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021909	GC	4	8	361843	361850	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
141	NC_021909	CG	3	6	363506	363511	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_021909	GT	3	6	375200	375205	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021909	CG	3	6	375258	375263	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
144	NC_021909	CG	3	6	375728	375733	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
145	NC_021909	AT	3	6	384221	384226	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_021909	GA	3	6	386752	386757	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_021909	TC	3	6	386762	386767	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_021909	GC	3	6	387415	387420	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
149	NC_021909	CG	3	6	387527	387532	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
150	NC_021909	GA	3	6	391005	391010	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_021909	GC	3	6	392398	392403	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
152	NC_021909	CG	3	6	393019	393024	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
153	NC_021909	GC	3	6	393083	393088	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
154	NC_021909	AG	3	6	396190	396195	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.