MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetMIM1e

Total Repeats: 2748

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_021909	GCCA	2	8	310261	310268	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1502	NC_021909	CGG	2	6	310314	310319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1503	NC_021909	TTC	2	6	310612	310617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1504	NC_021909	GC	3	6	310628	310633	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1505	NC_021909	GCC	2	6	310664	310669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1506	NC_021909	ATTG	2	8	313625	313632	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_021909	GC	3	6	313657	313662	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1508	NC_021909	ACC	2	6	313693	313698	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1509	NC_021909	TCG	2	6	313795	313800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1510	NC_021909	CCG	2	6	313817	313822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1511	NC_021909	GC	3	6	313851	313856	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1512	NC_021909	CGC	2	6	313863	313868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1513	NC_021909	CGA	2	6	313876	313881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1514	NC_021909	CGA	2	6	313976	313981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1515	NC_021909	CGC	2	6	313995	314000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1516	NC_021909	GGC	2	6	314009	314014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1517	NC_021909	CTG	2	6	314022	314027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1518	NC_021909	GAA	2	6	314039	314044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_021909	GCC	2	6	314054	314059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1520	NC_021909	GGC	2	6	314095	314100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1521	NC_021909	AAC	2	6	314150	314155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1522	NC_021909	CGGT	2	8	314213	314220	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1523	NC_021909	TCT	2	6	314243	314248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1524	NC_021909	CCG	2	6	314249	314254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1525	NC_021909	TCCCA	2	10	314270	314279	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
1526	NC_021909	GCCT	2	8	314355	314362	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1527	NC_021909	AAC	2	6	314398	314403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1528	NC_021909	ACGC	2	8	314523	314530	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1529	NC_021909	TTC	2	6	314551	314556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1530	NC_021909	TCG	2	6	314619	314624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1531	NC_021909	CGA	2	6	314801	314806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1532	NC_021909	GCC	2	6	314855	314860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1533	NC_021909	CTC	2	6	314989	314994	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1534	NC_021909	TCA	2	6	315078	315083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1535	NC_021909	TCA	2	6	315122	315127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1536	NC_021909	CGA	2	6	320775	320780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1537	NC_021909	CTTTT	2	10	320790	320799	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1538	NC_021909	CGC	2	6	320854	320859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1539	NC_021909	TGA	2	6	320913	320918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_021909	GCC	2	6	320987	320992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1541	NC_021909	GGC	2	6	321013	321018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1542	NC_021909	GCT	2	6	321132	321137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1543	NC_021909	GAC	2	6	321185	321190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1544	NC_021909	GGT	2	6	321201	321206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_021909	ACC	2	6	321230	321235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1546	NC_021909	CGAG	2	8	321240	321247	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1547	NC_021909	AGA	2	6	321259	321264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_021909	CGT	2	6	321278	321283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1549	NC_021909	GTGCG	2	10	321367	321376	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1550	NC_021909	CG	3	6	321375	321380	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1551	NC_021909	ATG	2	6	321411	321416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_021909	CGA	2	6	321427	321432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1553	NC_021909	T	6	6	321541	321546	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_021909	GTCA	2	8	321578	321585	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1555	NC_021909	CGGC	2	8	321609	321616	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1556	NC_021909	CTT	3	9	321671	321679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1557	NC_021909	GGC	2	6	321772	321777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1558	NC_021909	TG	3	6	321812	321817	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_021909	CGA	2	6	321841	321846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1560	NC_021909	GTGC	2	8	321863	321870	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1561	NC_021909	GCC	2	6	322086	322091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1562	NC_021909	TGG	2	6	322158	322163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_021909	GCG	2	6	322229	322234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1564	NC_021909	GCA	2	6	322261	322266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1565	NC_021909	CAT	2	6	322288	322293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1566	NC_021909	A	7	7	322357	322363	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_021909	CGC	2	6	322370	322375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1568	NC_021909	GCC	2	6	322415	322420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1569	NC_021909	CGT	2	6	322437	322442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1570	NC_021909	AGC	2	6	322453	322458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1571	NC_021909	TGCT	2	8	322503	322510	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1572	NC_021909	GTC	2	6	322517	322522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1573	NC_021909	CTG	2	6	322531	322536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1574	NC_021909	GGC	2	6	322571	322576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1575	NC_021909	GAC	2	6	322666	322671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1576	NC_021909	CTG	2	6	322690	322695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1577	NC_021909	GAAGCA	2	12	322726	322737	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1578	NC_021909	GCC	2	6	322756	322761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1579	NC_021909	CG	3	6	322800	322805	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1580	NC_021909	GAG	2	6	322900	322905	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_021909	GGC	2	6	322935	322940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1582	NC_021909	CGTC	2	8	322987	322994	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1583	NC_021909	CGT	2	6	323027	323032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1584	NC_021909	CGC	2	6	323036	323041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1585	NC_021909	TGT	2	6	323058	323063	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_021909	CTG	2	6	323241	323246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1587	NC_021909	GAT	2	6	323249	323254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_021909	AGCG	2	8	323298	323305	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1589	NC_021909	TGC	2	6	323414	323419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1590	NC_021909	CGA	2	6	323435	323440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1591	NC_021909	CT	3	6	323526	323531	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1592	NC_021909	CCG	2	6	323532	323537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1593	NC_021909	GGC	2	6	323631	323636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1594	NC_021909	AGGC	2	8	323679	323686	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1595	NC_021909	GCCCC	2	10	323717	323726	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
1596	NC_021909	GGC	2	6	324687	324692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1597	NC_021909	GGC	2	6	324746	324751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1598	NC_021909	ACG	2	6	324864	324869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1599	NC_021909	CG	3	6	324873	324878	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1600	NC_021909	CTTG	2	8	326357	326364	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1601	NC_021909	TG	3	6	326366	326371	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_021909	GACG	2	8	326415	326422	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1603	NC_021909	ACT	2	6	326467	326472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1604	NC_021909	CAC	2	6	326501	326506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1605	NC_021909	CGA	2	6	326818	326823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1606	NC_021909	GGA	2	6	326895	326900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_021909	CAC	2	6	327781	327786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1608	NC_021909	GTC	2	6	327789	327794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1609	NC_021909	GCA	2	6	327801	327806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1610	NC_021909	CT	3	6	328400	328405	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1611	NC_021909	CGC	2	6	328409	328414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1612	NC_021909	TCT	2	6	328441	328446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1613	NC_021909	GCA	2	6	328534	328539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1614	NC_021909	CTT	2	6	328548	328553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1615	NC_021909	GCT	2	6	328556	328561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1616	NC_021909	GAT	2	6	328576	328581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_021909	TCC	2	6	328587	328592	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1618	NC_021909	GC	3	6	332439	332444	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1619	NC_021909	CGGC	2	8	332466	332473	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1620	NC_021909	CCG	2	6	332488	332493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1621	NC_021909	CTTT	2	8	334049	334056	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1622	NC_021909	CGC	2	6	334063	334068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1623	NC_021909	GGC	2	6	334075	334080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1624	NC_021909	GCCTG	2	10	334126	334135	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1625	NC_021909	GCCCCT	2	12	335667	335678	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
1626	NC_021909	CGT	3	9	335695	335703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1627	NC_021909	CGA	2	6	335704	335709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1628	NC_021909	CCTT	2	8	336671	336678	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1629	NC_021909	CGC	2	6	336721	336726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1630	NC_021909	GAAG	2	8	336774	336781	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_021909	CAAA	2	8	336835	336842	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1632	NC_021909	GA	5	10	336915	336924	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_021909	GAC	2	6	336926	336931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1634	NC_021909	CAG	2	6	336938	336943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1904	NC_021909	CGT	2	6	402322	402327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1937	NC_021909	TTG	2	6	406164	406169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1938	NC_021909	TCC	2	6	406314	406319	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1992	NC_021909	CTC	2	6	417333	417338	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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